Spesifikasjon overføring av cytologi-, histologi– og HPV

Transcription

Spesifikasjon overføring av cytologi-, histologi– og HPV
Spesifikasjon overføring av cytologi-,
histologi– og HPV-data – med Lab Svar 1.3
Utarbeidet i forbindelse med Masseundersøkelsen mot livmorhalskreft
juni 2015
1
Meldepliktige diagnoser
Alle cervixremisser skal overføres. Dette gjelder uavhengig av pasientens alder eller årsak til at
prøven er tatt.
Alle T83XXX.
Forøvrig henvises til Forskrift om innsamling og behandling av helseopplysninger i Kreftregisteret
(Kreftregisterforskriften), fremmet av Sosial- og helsedepartementet og fastsatt ved kgl. Res. 21.
desember 2001 § 1-9.
Oversendelse av Laboratoriesvar
Det skal benyttes meldingen ”Lab svar”, versjon 1.3 eller 1.4
http://www.kith.no/templates/kith_WebPage____1018.aspx
Se dokumentet ” Specification Submission of Pathology Reports 20150611.pdf” for hvordan melding skal sendes
til Kreftregisteret.
Detaljert gjennomgang av de forskjellige feltene i filformatet
Spesifikasjonen kan brukes til å innrapportere prøvesvar på følgende måter:
Cytologi: Felles + Cyt
HPV: Felles + HPV
Histologi: Felles + Hist
Cytologi og HPV: Felles + Cyt + HPV
Histologi og HPV: Felles + Hist + HPV
Felles er felter som skal innrapporteres for alle typer prøvesvar, og må være med på alle meldinger. Felles består
av følgende elementer:
-
Type undersøkelse
Laboratorium nummer
Fødselsnummer
Navn
Prøvetakingsdato
Besvart dato
Preparatnummer
2
Felt i KITH
Eksempler og forklaring
Lab Svar 1.3
av koder internt KRG
Kommentarer
Internt KRG
Felles
Message/
ServReport/
Patient/
Verdi angir hvilke typer
Hvis en melding inneholder cytologi og HPV,
Type
eller
histologi
og
HPV,
kommer
Id
i
Investigationundersøkelser som er inneholdt
undersøkelse
elementet to ganger.
i XML.
ResultItem/
Vi godtar koder med ID = 8219.
Investigation/
Id
Kodeverk:
Anatomiskpatologisk
undersøkelse
(Id=8219)
Message/
"12"
Organisasjonsnummer fra
Laboratorium
ServReport/
"01"
enhetsregisteret skal benyttes
nummer
ServProvider/
ved bruk av Lab Svar.
HCP/
Inst/
Det gjøres en mapping fra org.nr til
Id
KRGs interne labnr.
Se tabell 1.
Må brukes sammen
med
Message/
ServReport/
ServProvider/
HCP/
Inst/
TypeId
Kodeverk: 8268
Type identifikator
Kodeverdi: ENH
Message/
Lagres kryptert
Ved registreringen i den sentrale
ServReport/
databasen kontrolleres at fødselsdato
Patient/
er en eksisterende dato.
OffId
Ved registreringen i den sentrale
Skal benyttes med:
databasen kontrolleres at sjekksifrene
Message/
er riktige og at personen er registrert i
3
Fødselsnummer
ServReport/
personregisteret.
Patient/
Dersom fødselsnummeret er
TypeOffId
konstruert (f.eks. for personer som
ikke er bosatt i Norge) må
Kodeverk:
sentralenheten behandle remissen
Kodeverk: 8327
spesielt. I slike tilfeller skal personnummerdelen
settes til ‘99999’.
Offisiell
personidentifikasjon
Konstruerte personnumre skal ikke
overføres til sentralenheten.
Godtar kodene:
-
FNR
-
DNR
-
HNR
Message/
Lagres ikke
Slektsnavn, Fornavn
Navn
ServReport/
Patient/
Brukes til å verifisere
Name
personopplysninger.
Message/
"20.01.2015"
Dato for prøvetaking hos rekvirent,
Prøve-takings
ServReport/
hvis ikke oppgitt benytt mottaksdato
dato
Patient/
på laboratorium.
AnalysedSubject/
CollectedSample/
CollectedDate
Message/
"28.01.2015"
Besvart dato hos laboratorium.
Besvart dato
Message/
"C14-234562"
Preparatnumer
ServReport/
"V15-012533"
KRG kan ta i mot laboratoriets interne
preparatnummer, og omforme til
Patient/
"H15-000456"
KRGs interne format:
ServReport/
Patient/
ResultItem/
InvDate
AnalysedSubject/
Første tegn er bokstaven “C”, ”V”
IdByServProvider
eller ”H”.
Neste to tegn er årstall. Deretter
bindestrek.
Til slutt angis sekssifret løpenummer
Innenfor året. Ledende nuller benyttes
slik at løpenummeret alltid angis med
seks sifre.
4
CYT
Message/
Godkjente verdier:
KRG foretar en intern mapping av
Årsak til
ServReport/
MU
verdier oppgitt her.
cytologisk prøve
ServReq/
FU
ReasonAsText/
KF
Heading
MU = 1 - screening (tidligere normale
celleprøver)
Kodeverk:
FU = 2 - symptom (oppgi kliniske
8231 Type tekstsvar
opplysninger)
KF = 3 - oppfølging/kontroll (oppgi
kliniske opplysninger)
Message/
"80752"
ServReport/
Kun standardiserte koder ifølge
standardisert cytologiremisse
Patient/
benyttes. (NB! Nye koder etter
ResultItem/
Bethesta-klassifisering) I helt
ResultItem/
spesielle tilfeller hvor det ikke
TextResult/
eksisterer dekkende
TextCode V=
diagnosekoder ifølge standardisert
cytologiremisse kan andre koder
(fortrinnsvis ifølge SNOMED)
”Mxxxxx”
Morfologi
(hoveddiagnose)
benyttes.
Kodeverk:
SNOMED (Id=7010) Anatomisk-
Feltet må alltid fylles ut.
patologiske
Dette feltet angir "den alvorligste"
undersøkelser
diagnosen.
Message/
"69001"
ServReport/
"
Patient/
benyttet
Her tillates også koder som ikke er standardisert
Morfologi
på
cytologiremissen
(underordnet
" = kun hoveddiagnose
under forutsetning av at tilsvarende
ResultItem/
standardiserte koder ikke eksisterer
ResultItem/
og under forutsetning av at
TextResult/
hoveddiagnose allerede er kodet.
diagnose)
TextCode V=
”Mxxxxx”
Kodeverk:
SNOMED (Id=7010) Anatomiskpatologiske
undersøkelser
Message/
"83000" = konvensjonell
Kun standardiserte koder ifølge
6
Topografi
ServReport/
prøvetakning
Patient/
"83100" = væskebasert
ResultItem/
prøvetaking
ResultItem/
"8x310" = konvensjonell
TextResult/
prøvetakning
TextCode V=”Txxxxx”
"8x312" = væskebasert
standardisert cytologiremisse benyttes.
prøvetaking
Kodeverk:
SNOMED (Id=7010) Anatomiskpatologiske
undersøkelser
Message/
"1" –
ServReport/
etter 1 måned
Dette feltet gjelder kun for cytologisk
kontrollprøve.
Kodeverk:
snarest på cytologiremissen skal det registreres
kode "1 ".
"3" –
etter 3 måneder
KITH:
Anbefaling om ny undersøkelse
"6" –
(Id = 8272)
etter 6 måneder
+
S, B (etter behandling) og M01 lagres
som etter 1 måned.
Dersom feltet ikke eksisterer, lagres
Message/
ServReport/
"12" –
CodedComment
etter 12 måneder
Kodeverk:
"
Hastegrad
før kontrollprøve
I de tilfeller hvor det er krysset av for
CodedComment V =
CYT
Antall måneder
prøven med «kontrollprøve skal ikke
tas».
" –
Kontrollprøve skal ikke tas
(Id = 8273)
Message/
"1" = histologisk undersøkelseOppfølging av anbefaling om
ServReport/
anbefales
histologisk undersøkelse er legens
CodedComment V =
" " = ingen anbefaling om
ansvar.
HIST
histologisk undersøkelse
Det lagres ingen tidsanbefaling for
undersøkelse.
Kodeverk:
Anbefaling om ny undersøkelse
KITH:
(Id = 8272)
Hvis elementet finnes anbefales det
Histologisk undersøkelse
Ellers er det ingen anbefaling.
7
Histologisk
undersøkelse
Message/
"411342689”
Identifikasjon av rekvirerende lege.
ServReport/
Fortrinnsvis HPRNR.
Requester/
Lokale rekvirentkoder kan benyttes.
Rekvirentkode
HCP/
Inst/
HCPerson/
Id
Må brukes sammen
med:
Message/
ServReport/
Requester/
HCP/
Inst/
HCPerson/
TypeId
Kodeverk: 8268
Type identifikator
Message/
"1" = HPV-test anbefales.
Parameteren angir om cytologen
ServReport/
"0" = HPV-test anbefales
CodedComment V =
ikke.
anbefaler en HPV-test på grunnlag av cytologien
Anbefales
(”1”) eller ikke (”0”).
HPV
Kodeverk:
Anbefaling om ny undersøkelse
(Id = 8272)
8
HPV-test
HPV
Message/
Godkjente verdier:
KRG foretar en intern mapping av
Årsak til
ServReport/
MU
verdier oppgitt her.
cytologisk prøve
ServReq/
FU
ReasonAsText/
KF
Heading
MU = 1 - screening (tidligere normale
celleprøver)
Kodeverk:
FU = 2 - symptom (oppgi kliniske
8231 Type tekstsvar
opplysninger)
KF = 3 - oppfølging/kontroll (oppgi
kliniske opplysninger)
Message/
"01"
Feltet angir hva slags type HPV-test
ServReport/
som er benyttet. For å se hvilken test
Patient/
som korresponderer med hvilket
Testtype
nummer, se tabell 2.
ResultItem/
Investigation/
Det gjøres en sjekk på om
Comment
HPV-testtype er en gyldig og
godkjent HPV-test.
Message/
"0" = Negativ
Dersom det er testet positivt for minst
ServReport/
"1" = Positiv
en HPV-type skal verdien være 1.
Patient/
"9" = Uegnet
Dersom det ikke er testet positivt for
ResultItem/
Test-resultat
noen HPV-typer skal verdien være 0.
ResultItem/
TextResult/
TextCode
SNOMED koder
E00040
E33450
M0900H
Kodeverk:
SNOMED (Id=7010) Anatomiskpatologiske
undersøkelser
Message/
"16"
HPV-type det er testet positivt for.
ServReport/
Hvis det er testet positivt for én
Patient/
HPV-type registreres denne her og
9
HPV-type 1
ResultItem/
HPV-type 2-8 har tomt innhold.
ResultItem/
Hvis det er testet positivt for to
TextResult/
HPV-typer registreres en HPV-type i
TextResultValue
HPV-type 1, og den andre HPV-typen
i HPV-type 2. HPV-type 3-8 har da
Eks. HPV16
tomt innhold. Osv.
Hvis SNOMED kode brukes for å
trekke ut HPV-type kan det gjøres på
bakgrunn av disse
SNOMED kodene:
E33416 (HPV16)
E33418 (HPV18)
E334xx hvor de to siste sifrene angir
HPVtype
Andre høy risk HPV typer (for
eksempel med Cobas testen)
HR
KITH:
Feltet kan repeteres så mange ganger
som ønskelig, men det vil maks bli
lagret 8 genotyper.
Det er kun HPV typer det har blitt
testet positivt for, som lagres hos
KRG.
10
HPV-type 2-8
HIST
Message/
"80702"
Kun standardiserte koder ifølge
Kvalitetsmanualen benyttes.
ServReport/
Morfologi
(hoveddiagnose)
I helt spesielle tilfeller hvor det ikke
eksisterer dekkende diagnosekoder
Patient/
ResultItem/
ifølge standardisert
ResultItem/
TextResult/
histologiremisse kan andre koder
(fortrinnsvis ifølge SNOMED)
TextCode V=
benyttes.
”Mxxxxx”
Feltet må alltid fylles ut.
Dette feltet angir "den alvorligste"
Kodeverk:
diagnose. F.eks. vil man ved "HPV" og
SNOMED (Id=7010) Anatomisk-
"grov dysplasi" kode "grov dysplasi"
patologiske
som hoveddiagnose.
undersøkelser
Message/
"76700"
ServReport/
"
Patient/
hoveddiagnose benyttet
Her tillates også koder som ikke er standardisert
Morfologi
i Kvalitetsmanualen
(underordnet
" = kun
under forutsetning av at tilsvarende
ResultItem/
standardiserte koder ikke eksisterer
ResultItem/
og under forutsetning av at
TextResult/
hoveddiagnose allerede er kodet.
diagnose)
TextCode V=
”Mxxxxx”
Kodeverk:
SNOMED (Id=7010) Anatomiskpatologiske
undersøkelser
Message/
”76701”
ServReport/
”
Patient/
hoveddiagnose benyttet
Her tillates også koder som ikke er standardisert
Morfologi
i Kvalitetsmanualen
(Underordnet
” = kun
under forutsetning av at tilsvarende
ResultItem/
standardiserte koder ikke eksisterer
ResultItem/
og under forutsetning av at
TextResult/
hoveddiagnose allerede er kodet.
TextCode V=
”Mxxxxx”
Kodeverk:
SNOMED (Id=7010) Anatomiskpatologiske
undersøkelser
11
diagnose 2)
Message/
"83000"
ServReport/
"83010"
Patient/
"83030"
ResultItem/
"83100"
ResultItem/
"83110"
TextResult/
"83150"
TextCode V=”Txxxxx”
"83200"
#
Kun standardiserte koder.
Topografi
# anbefalt koder
#
"83210"
Kodeverk:
"83220"
#
"83300"
SNOMED (Id=7010) Anatomisk"83320"
patologiske
undersøkelser
Message/
"83400"
"83500"
"83700"
#
"83701"
#
"411342689”
Identifikasjon av rekvirerende lege.
ServReport/
Fortrinnsvis HPRNR.
Requester/
Lokale rekvirentkoder kan benyttes.
HCP/
Inst/
HCPerson/
Id
Må brukes sammen
med:
Message/
ServReport/
Requester/
HCP/
Inst/
HCPerson/
TypeId
Kodeverk: 8268
Type identifikator
12
Rekvirentkode
Eksempler
Koding av ‘Type undersøkelse’ når XML inneholder resultater fra cytologi og HPV-test:
<Investigation>
<Id V="C" S="2.16.578.1.12.4.1.1.8219" DN="Cytologisk undersøkelse" />
<Id V="HPV" S="2.16.578.1.12.4.1.1.8219" DN="HPV-test" />
</Investigation>
Koding av ‘Type undersøkelse’ når XML inneholder resultater fra histologi og HPV-test:
<Investigation>
<Id V="A" S="2.16.578.1.12.4.1.1.8219" DN="Histologisk undersøkelse" />
<Id V="HPV" S="2.16.578.1.12.4.1.1.8219" DN="HPV-test" />
</Investigation>
Eksempel på koding av ‘Antall måneder før cytologisk kontrollprøve’:
<CodedComment V="CYT" S="2.16.578.1.12.4.1.1.8272"
DN="Ny cytologiprøve anbefales" />
<CodedComment V="M01" S="2.16.578.1.12.4.1.1.8273"
DN="Etter 1 måned" />
Koding av anbefaling av ‘Histologisk undersøkelse’:
<CodedComment V="HIST" S="2.16.578.1.12.4.1.1.8272"
DN="Histologisk undersøkelse anbefales" />
Koding av ‘HPV-test anbefales’:
<CodedComment V="HPV" S="2.16.578.1.12.4.1.1.8272"
DN="HPV-test anbefales" />
Eksempel på koding av HPV testtype og HPV-genotype:
<ResultItem>
<TextResult>
<TextResultValue>Positiv</TextResultValue>
</TextResult>
<Investigation>
<Id V="HPV16" DN="HPV_16 "
S="2.16.578.1.12.4.1.1.8212" OT="HPV 16" />
</Investigation>
<Comment>Cobas==11</Comment>
</ResultItem>
13
Tabell 1 Mapping KRG labnummer - Organisasjonsnummer
Patologi laboratorier
Nummer
Organisasjonsnummer
Lab for patologi
Oslo Universitets sykehus OUS
02
Furst (Lab. for patologi A/S) cytologi og histologi
03
Gades Institutt
Haukeland sykehus
983974724
07
Avd. for patologi
St. Olavs Hospital
08
Avd. for patologi
Molde Sjukehus
10
Unilabs Laboratoriemedisin AS (Gynlab)
11
Avd. for patologi
Sykehuset Østfold Fredrikstad
12
Patologisk-Anatomisk Avdeling
Universitetssykehuset i Nord-Norge UNN
13
Avd. for patologi
Sykehuset Telemark
14
Avd. for patologi
Sykehuset Innlandet, Lillehammer
15
Avd. for patologi
Vestre Viken, Drammen sykehus
16
Avd. for patologi
Ålesund Sykehus
17
Avd. for patologi
Nordlandssykehuset, Bodø
18
Avd. for patologi
Stavanger universitetssykehus SUS
19
Avd. for patologi
Sykehuset Sørlandet, Kristiansand
20
Avd. for patologi
Akershus universitetssykehus (Ahus)
21
Avd. for patologi
Sykehuset i Vestfold
23
Avdeling for patologi,
26
Førde sentralsjukehus
Avdeling for patologi,
34
Haugesund sjukehus
14
Mikrobiologi laboratorier
Nummer
Avd for mikrobiologi
Oslo Universitets sykehus OUS
31
Avd for mikrobiologi
Oslo Universitets sykehus OUS
32
Fürst, Molekylærbiologisk avd
36
Avd. for mikrobiologi
Haukeland sykehus
37
Avd. for mikrobiologi
St. Olavs Hospital
38
Avd. for mikrobiologi
Molde Sjukehus
40
Avd. for mikrobiologi
Sykehuset Østfold Fredrikstad
42
Avd. for mikrobiologi
Universitetssykehuset i Nord-Norge
43
Telelab
44
Avd. for mikrobiologi
Sykehuset Innlandet, Lillehammer
45
Avd. for mikrobiologi
Sykehuset Buskerud
46
Avd. for mikrobiologi
Ålesund Sykehus
47
Avd. for mikrobiologi
Nordlandssykehuset, Bodø
48
Avd. for mikrobiologi
Stavanger universitetssykehus
49
Avd. for mikrobiologi
Sykehuset Sørlandet, Kristiansand
50
Avd. for mikrobiologi
Akershus universitetssykehus (Ahus)
51
Avd. for mikrobiologi
Sykehuset i Vestfold
53
15
Tabell 2 Mapping HPV-testtype
Nummer
HPV-testtype
01
HCII
02
HCIII
03
PreTect HPV-Proofer, NORCHIP
04
Amplicor, Roche Diagnostics
05
PCR- primer, må oppgis første gang
06
Real time PCR
07
Ventana Inform HPV (ISH)
08
ISH andre, må oppgis første gang
09
PAP 13 Tele-lab
11
Cobas
12
Abbott RealTime High Risk HPV
13
BD Onclarity HPV Assay
Hvis man benytter andre tester enn de nevnt overfor, må man kontakte Gry Baadstrand Skare
([email protected]) eller Randi Waage ([email protected]) for å få tildelt nummer.
Hvilke HPV-tester som til enhver tid kan benyttes i Masseundersøkelsen mot livmorhalskreft finnes på
Kreftregisterets nettside:
http://www.kreftregisteret.no/no/Forebyggende/Masseundersokelsen-motlivmorhalskreft/Helsepersonell/Flytdiagram/
16