Laboratoire d`accueil - Les formations à l`université de Bourgogne

Transcription

MASTER SCIENCES-TECHNOLOGIES-SANTE
MENTION SCIENCES-VIE-SANTE (SVS)
M2 RECHERCHE
spécialité
SIGNALISATION CELLULAIRE et MOLECULAIRE (SCM)
(ex BIOCHIMIE, BIOLOGIE CELLULAIRE et MOLECULAIRE)
SUJETS DE STAGES et REFERENCES BIBLIOGRAPHIQUES
des LABORATOIRES D’ACCUEIL
2014-2015
UNIVERSITES DE BOURGOGNE et FRANCHE-COMTE
1
Résumé des possibilités et laboratoires/équipes d’accueil
Laboratoires site de Dijon
Equipe
Possibilités
d’accueil
page
UMR INSERM U866 / Université de
Bourgogne
Lipides , Nutrition, Cancer
- Protéines de choc thermique
- Chimiothérapie, métabolisme des lipides et réponse immunitaire antitumorale
- Régulation génique dans l’hématopoïèse et la leucémogenèse
- Physiopathologie et pharmacologie cardio-métaboliques
- Physiopathologie des dyslipidémies
- Protéines de transfert des lipides et métabolisme des lipoprotéines
- Détection, métabolisme des lipides et des contaminants alimentaires
dans la sphère oro-digestive
9
7
4
6
2
2
1
3
3
7
8
9
9
10
EPHE – Monoxyde d'azote
et Cancer
3
11
EA7270 Biochimie du Peroxysome,
Inflammation et Métabolisme
Lipidique (Bio-PeroxIL)
1
12
Pôle Interactions plantes-microorganismes - ERL CNRS 6300
- Mycorhizes : mécanismes et gestion
- Monoxyde d'azote et immunité chez les plantes
- Dynamique membranaire et interactions plantes/microorganismes
- Resistance induite
1
3
2
1
13
14
15
16
Pôle Microbiologie Environnementale et Risque Sanitaire
- Interaction Candida albicans-hôte
- Ventilation pulmoné innée poumon
2
1
17
17
2
18
2
1
6
3
1
1
19
20
21
22
23
24
3
24
1
26
UMR 1347 INRA/Université de
Bourgogne/AgroSup Dijon
Pôle déterminismes Génétiques et Environnementaux de l’Adaptation
des Plantes à des Systèmes de culture Innovants
- Etude des mécanismes moléculaires contrôlant le rendement et la
qualité des graines de légumineuses
Centre des Sciences du Goût et de
l'Alimentation (CSGA)
UMR 6265 CNRS, INRA, Université
de Bourgogne,
AgroSup Dijon
- Equipe Perception Sensorielle, Interactions Glie/Neurones
- Equipe plasticité fonctionnelle des neurones olfactifs
- Mécanismes de plasticité et perception chimiosensorielle
- Œil, nutrition et signalisation cellulaire
- Détection cérébrale des nutriments et homéostasie énergétique
- Plasticité des circuits neuronaux de la prise alimentaire
EA4271 Génétique des Anomalies
du développement, IFR Santé STIC
/Université de Bourgogne
Unité INSERM U1093 Cognition,
Action et Plasticité sensorimotrice
/Université de Bourgogne
- Equipe Plasticité cérébrale et BDNF
2
Possibilité
d’accueil
page
EA3181/Université
de Franche-Comté
Carcinogenèse épithéliale :
facteurs prédictifs et pronostiques
4
29
EA3922/ Université
de Franche-Comté
Estrogènes, Expression Génique et
Pathologies du Système Nerveux
Central
2
30
- Virologie
- Bactériologie médicale
1
1
31
32
UMR 6249 Chrono-environnement
- Hygiène hospitalière et épidémiologie
1
33
UMR Inserm 1098/
Université de Franche Comté
Interaction Hôte-Greffon-Tumeur
et Ingénierie Cellulaire et Génique
- Immunorégulation et Immunopathologie (équipe localisée à l'UB)
1
27 &
34
Laboratoires site Besançon
EA 4266/Université
de Franche-Comté
Agents Pathogènes &
Inflammation
Equipe
Contacts
Responsable du M2R SCM, site de Dijon: Pr. David WENDEHENNE
Tel: 03 80 69 37 22; Fax: 03 80 69 37 53
Email: [email protected]
Secrétariat du site de Dijon :
Tel : 03 80 39 50 32
Email : [email protected]
Responsable du M2R SCM, site de Besançon: Pr. Régis DELAGE-MOURROUX
Tél: 03 81 66 66 24
Secrétariat site de Besançon:
Tel: 03 81 66 65 67 (matin); Fax : 03 81 66 62 67
IMPORTANT
Les étudiants postulant au M2R SCM doivent obligatoirement préciser dans leur dossier de
candidature le laboratoire d'accueil où ils choisissent de réaliser leur stage ainsi que le sujet de
recherche sur lequel ils travailleront. Il est donc vivement conseillé de prendre contact avec les
équipes de recherche avant de déposer le sujet de candidature (les adresses emails et n° de
télephone des encadrants sont indiquées dans le présent document).
3
Sujets de stage, site de l'Université de Bourgogne (Dijon)
___________________________________________________________________________
Laboratoire d’accueil
UMR Inserm U866/Université de Bourgogne
Lipides, Nutrition, Cancer
7 boulevard Jeanne d’Arc,
BP 87900
21079 Dijon Cedex
Responsable
Laurent Lagrost
Coordonnées
Tél. : 33 80 39 33 53
Fax : 33 80 39 34 34
ou [email protected]
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Equipe Protéines de choc thermique: mort cellulaire, différenciation cellulaire et propriétés
tumorigéniques
Responsable: Carmen Garrido ([email protected])
Possibilités d’accueil: 9
Sujet de Stage 1: Signalisation pro-motile induite par TRAIL
Maître de stage: Olivier Micheau
Tel: 03 80 39 34 68
Fax : 03 80 39 34 34
E-mail: [email protected]
Sujet de Stage 2: Le rôle de la suppression conditionnelle de Wip1 et de HSP110 dans l'épithélium et
les tumeurs intestinales.
Maître de stage: Oleg Demidov et Carmen Garrido
Tel: 03 80 39 34 17
Fax : 03 80 39 34 34
Sujet de Stage 3: Rôle chaperon de la protéine de stress alphaB-crystallin sur Le facteur nucléaire
TIF1γ dans la fibrose et le cancer pulmonaire
Maitre de stage : Philippe Bonniaud
Tel : 06 74 53 68 98
Fax : 03 80 39 34 34
E-mail [email protected]
Sujet de Stage 4: Etude in vivo et in vitro de l’apoptose des lymphocytes T induite par les molécules
de la famille de la toxine du choléra : rôle du stress du réticulum endoplasmique et des HSPs
Maître de stage: Christelle Basset
Tel: 03 80 39 32 19
Fax : 03 80 39 33 00
4
Sujet de Stage 5: Rôle de la protéine de choc thermique gp96 dans l’effet bénéfique des probiotiques
sur l’épithélium intestinal
Maître de stage : Evelyne Kohli
Tel: 03 80 39 32 03/04
Fax : 03 80 39 34 56
Sujet de Stage 6: Etude de l’interactome de HSP70 chez l’humain.
Maître de stage : Renaud Seigneuric
Tél: 03 80 39 34 17
Fax : 03 80 39 34 34
Sujet de Stage 7: Etude de l’implication du système beta-3 adrénergique dans la régulation de la
prolifération des adénocarcinomes colorectaux humains
Maître de stage: Frédéric Lirussi
Tel:03 80 39 34 77
Sujet de Stage 8 : Rôle des « Chaperokines » et des exosomes dans la polarisation des macrophages
humains, Application aux TAM (Tumor-Associated macrophages)
Maître de stage: Carmen Garrido, Co-encadrant M. Wendremaire
Tel: 03 80 39 32 56
Fax : 03 80 39 34 34
Sujet de Stage 9 : Etude du rôle des hsp dans l’érythropoïèse chez le poisson zèbre
Maître de stage: Johanna Chluba
Tel: 03 80 39 62 23
Fax : 03 80 39 62 23
Références bibliographiques
Edmond V, Dufour F, Poiroux G, Shoji K, Malleter M, Fouqué A, Tauzin S, Rimokh R, Sergent O, Penna
A, Dupuy A, Levade T, Theret N, Micheau O, Ségui B, Legembre P. Downregulation of ceramide
synthase-6 during epithelial-to-mesenchymal transition reduces plasma membrane fluidity and
cancer cell motility.. Oncogene doi: 10.1038/onc.2014.55, 2014
Bellaye PS, Wettstein G, Burgy O, Besnard V, Joannes A, Colas J, Causse S, Marchal-Somme J, Fabre
A, Crestani B, Kolb M, Gauldie J, Camus P, Garrido C, Bonniaud P. The small heat-shock protein αBcrystallin is essential for the nuclear localization of Smad4: impact on pulmonary fibrosis. J.
Pathol. 232, 458-472, 2014
Rérole AL, Gobbo J, Schmitt E, Pais de Barros JP, Lanneau D, De Thonel A, Hammann A, Fourmaux E,
Demidov O, Micheau O, Lagrost L, Colas P, Kroemer G, Garrido C. Peptides and aptamers targeting
HSP70: a novel approach for anti-cancer chemotherapy. Cancer Res 71, 484-95, 2011
De Thonel A, Vandekerckhove J, Lanneau D, Selvakuma S, Courtois G, Brunet M, Maurel S, An Ribeil J,
Zermati Y, Gabet A, Boyes J, Solary E, Hermine O, Garrido C. HSP27-mediated control of GATA-1
protein during erythroid cell differentiation. Blood 116, 85-96, 2010
5
Ribeil JA, Zermati Y, Kersual J, Varet B, Solary E, Garrido C and Hermine O. Hsp70 is a new major
regulator of erythropoiesis by preventing caspase-3-mediated cleavage of GATA-1. Nature 445, 102106, 2007

Equipe Chimiothérapie, métabolisme des lipides et réponse immunitaire anti-tumorale
Responsable : Pr François Ghiringhelli ([email protected])
Possibilités d’accueil : 7
Sujet de Stage 1: Etude des isoformes alternatives du facteur de transcription IRF1 dans la
différenciation lymphocytaire Th1 et TFh
Maître de stage: Romain Boidot
Tel : 03 80 73 75 00 poste 3185
Fax : 03 80 39 34 34
Sujet de Stage 2: Rôle d'IRF8 dans la génération des lymphocytes T folliculaires
Maître de stage: François Ghiringhelli
Tel : 03 80 39 33 71
Sujet de Stage 3 : Rôle d’IRF7 dans la différenciation lymphocytaire TCD4
Maître de stage: Lionel Apetoh
Tel : 03 80 39 33 71
Sujet de Stage 4 : Sensibilisation des cellules tumorales coliques à la mort induite par l'oxaliplatine:
modélisation de la Chimiothérapie intra-péritonéale in vitro.
Maître de stage: Cédric Rébé
Tel: 03 80 39 33 53
Sujet de Stage 5 : Mécanismes de modulation de la perception gustative chez les animaux porteurs
des tumeurs.
Maître de stage: Aziz Hichami
Tel : 03 80 39 38 51
Sujet de Stage 6 : rôle de PPARγ dans le contrôle de la progression tumorale
Maître de stage: Mickaël Rialland
Tel: 03 80 39 63 14
E-mail: mickaë[email protected]
Sujet de Stage 7: Influence des cardiolipines dans les phénomènes de résistance aux agents
anticancéreux
Maître de stage : Dominique Delmas
Tel : 03 80 39 32 26
6
Références bibliographiques:
Végran F, Mary R, Gibeaud A, Mirjolet C, Collin B, Oudot A, Charon-Barra C, Arnould L, Lizard-Nacol S,
Boidot R. Survivin-3B potentiates immune escape in cancer but also inhibits the toxicity of cancer
chemotherapy. Cancer Res. 73: 5391-401, 2013
Bruchard M, Mignot G, Derangère V, Chalmin F, Chevriaux A, Végran F, Boireau W, Simon B, Ryffel B,
Connat JL, Kanellopoulos J, Martin F, Rébé C, Apetoh L, Ghiringhelli F. Chemotherapy-triggered
cathepsin B release in myeloid-derivedsuppressor cells activates the Nlrp3 inflammasome and
promotes tumor growth. Nat Med. 19(1):57-64, 2013
Berger H, Vegran F, Chikh M, Gilardi F, Ladoire S, Bugaut H, Mignot G, Chalmin F, Bruchard M,
Derangere V, Chevriaux A, Rebe C, Ryffel B, Pot C, Hichami A, Desvergne B, Ghiringhelli F, Apetoh L.
SOCS3 transactivation by PPARgamma prevents IL-17-driven cancer growth. Cancer Res. 73(12):
3578-3590, 2013
Pierre AS, Minville-Walz M, Fèvre C, Hichami A, Gresti J, Pichon L, Bellenger S, Bellenger J, Ghiringhelli
F, Narce M, Rialland M. Trans-10, cis-12 conjugated linoleic acid induced cell death in human colon
cancer cells through reactive oxygen species-mediated ER stress. Biochim Biophys Acta 1831(4):75968, 2013
Limagne E, Cottet V, Cotte A, Hamza S, Hillon P, Latruffe N, Delmas D. Potential role of oxidative DNA
damage in the impact of PNPLA3 variant (rs 738409 C<G) in hepatocellular carcinoma risk.
Hepatology, 2014

Equipe Régulation génique dans l'hématopoïèse et la leucémogenèse
Responsable: Laurent Delva ([email protected])
Sujet de Stage 1: Inhibition de la voie signalétique du GM-CSF avec un nouvel inhibiteur dans le
traitement des leucémies aiguës myéloblastiques
Maître de stage: Ronan Quéré
Tel: 03 80 39 34 40
Fax : 03 80 39 34 34
E-mail : [email protected]
Sujet de Stage 2: Régulation transcriptionnelle de E2F1 par cIAP1
Maîtresse de stage: Laurence Dubrez-Daloz
Tel: 03 80 39 34 56
Fax : 03 80 39 34 34
Quéré R, Saint Paul L, Carmignac V, Martin RZ, Chrétien ML, Largeot A, Hammann A, Bastie JN, Delva
L. TIF1gamma regulates the TGF-beta receptor 1 and promotes physiological aging of hematopoietic
stem cells. Proc Natl Acad Sci USA, en révision
Marivin A, Berthelet J, Cartier J, Paul C, Gemble S, Morizot A, Boireau W, Saleh M, Bertoglio J, Solary
E, Dubrez L. cIAP1 regulates TNF-mediated cdc42 activation and filopodia formation. Oncogene, 2014
7
Largeot A, Paggetti J, Broséus J, Aucagne R, Lagrange B, Martin RZ, Berthelet J, Quéré R, Lucchi G,
Ducoroy P, Bastie JN, Delva L. Symplekin, a polyadenylation factor, prevents MOZ and MLL activity on
HOXA9 in hematopoietic cells. Biochim Biophys Acta 1833, 3054-3063, 2013
Aucagne R, Droin N, Paggetti J, Lagrange B, Largeot A, Hammann A, Bataille A, Martin L, Yan KP, Fenaux
P, Losson R, Solary E, Bastie JN, Delva L. Transcription intermediary factor 1g is a tumor suppressor in
mouse and human chronic myelomonocytic leukemia. J Clin Invest 121, 2361-2370, 2011
Cartier J, Berthelet J, Marivin A, Gemble S, Edmond V, Plenchette S, Lagrange B, Hammann A, Dupoux A,
Delva L, Eymin B, Solary E, Dubrez L. Cellular inhibitor of apoptosis protein-1 (cIAP1) can regulate E2F1
transcription factor-mediated control of cyclin transcription. J Biol Chem 286, 26406-26417, 2011

Laboratoire de Physiopathologie et Pharmacologie Cardio-Métaboliques (LPPCM)
Responsables: Catherine Vergely ([email protected]) et Yves Cottin ([email protected])
Sujet de Stage 1: Conséquences cardio-métaboliques et oxydatives de la suralimentation post-natale.
Maîtres de stage: Catherine Vergely
Tel: 03 80 39 32 92 ou 03 80 39 34 60
Fax : 03 80 39 32 93
Sujet de Stage 2: Modulation de l'expression des protéines de l'inflammasome dans les monocytesmacrophages au cours du développement de l’athérosclérose
Maîtres de stage: Jean-Louis Connat & Patrick Dutartre
Tel: 03 80 39 32 92
E-mail : [email protected] & [email protected]
Zeller M., Korandji C., Guilland J. C., Sicard P., Vergely C., Lorgis L., Beer J. C., Duvillard L., Lagrost A.
C., Moreau D., Gambert P., Cottin Y., Rochette L. Impact of Asymmetric Dimethylarginine on
Mortality After Acute Myocardial Infarction. Arterioscler. Thromb. Vasc. Biol. 28, 954-960, 2008
Lauzier B., Delemasure S., Pesant M., Collin B., Duvillard L., Vergely C., Connat J. L., Rochette L. A
cholesterol-rich diet improves resistance to ischemic insult in mouse hearts but suppresses the
beneficial effect of post-conditioning. J. Heart Lung Transplant. 28, 821-826, 2009
Habbout A., Delemasure S., Goirand F., Guilland J.C., Chabod F., Sediki M., Rochette L., Vergely C.
Postnatal overfeeding in rats leads to moderate overweight and to cardiometabolic and oxidative
alterations in adulthood. Biochimie 94, 117-24, 2012
Habbout A, Guenancia C, Lorin J, Rigal E, Fassot C, Rochette L, Vergely C. Postnatal overfeeding
causes early heart-gene expression shifts and long-term cardiometabolic and oxidative alterations.
PloS one 2013, sous presse
Habbout A, Li N, Rochette L, Vergely C. Postnatal overfeeding in rodents by litter size reduction
induces major short- and long-term pathophysiological consequences. J. Nutr. 2013, sous presse

8
Equipe Physiopathologie des Dyslipidémies
Responsable: Bruno Vergès ([email protected])
Sujet de Stage 1: Effets des endocannabinoïdes sur la synthèse hépatique des lipoprotéines chez la
souris
Maître de stage: Laurent Demizieux & Pascal Degrace
Tel: 03 80 39 63 23 ou 03 80 39 37 36
Fax : 03 80 39 63 30
E-mail: [email protected] & pascal [email protected]
Jourdan T, Demizieux L, Gresti J, Djaouti L, Gaba L, Vergès B, Degrace P. Antagonism of peripheral
hepatic cannabinoid receptor-1 improves liver lipid metabolism in mice: evidence from cultured
explants. Hepatology 55, 790-799, 2012
Vergès B. Abnormal hepatic apolipoprotein B metabolism in type 2 diabetes. Atherosclerosis 211,
353-360, 2010
Jourdan T, Djaouti L, Demizieux L, Gresti J, Vergès B, Degrace P. CB1 antagonism exerts specific
molecular effects on visceral and subcutaneous fat and reverses liver steatosis in diet-induced obese
mice. Diabetes 59, 926-934, 2010
Vergès B. New insight into the pathophysiology of lipid abnormalities in type 2 diabetes. Diabetes
Metab. 31, 429-439, 2005
Vergès B. Insulin sensitivity and lipids. Diabetes Metab. 27, 223-227, 2001

Equipe Protéines de transfert des lipides et métabolisme des lipoprotéines
Responsable: Laurent Lagrost ([email protected])
Sujet de Stage 1: Acides gras polyinsaturés en n-3 et endotoxémie métabolique associée à l'obésité
Maîtres de stage : Jérôme Bellenger et Jacques Grober
Tel : 03 80 39 38 57
E-mail : [email protected] & [email protected]
Sujet de Stage 2: Impact la lysophosphatidylcholine acyltransferase 3 (LPCAT3) sur la composition
lipidique mitochondriale dans les macrophages : conséquences sur l’activation des macrophages
dans le contexte de l’inflammation stérile et septique
Maîtres de stage: Charles Thomas, David Masson & Michel Narce
Tel: 03 80 39 63 19
E-mail:
[email protected],
bourgogne.fr
[email protected]
&
michel.narce@u-
Sujet de Stage 3 : Neutralisation des lipopolysaccharides bactériens par les acides biliaires chez la
souris sauvage et déficiente pour le gène de la PLTP.
9
Maître de Stage: Stéphane Mandard
Tel : 03 80 39 32 66 ou 03 80 39 62 38
Zou Z, Bellenger S, Pierre AS, Walz M, Massey K, Nicolaou A, Bonnotte B, Rialland M, Kang JX, Narce
M and Bellenger J. Inhibition of the ErbB2 pathway by n-3 polyunsaturated fatty acids prevents
breast cancer in fat-1 transgenic mice.” J. Lipid Res. 54, 3453-63 2013
Bellenger J, Bellenger S, Bataille A, Massey KA, Nicolaou A, Rialland M, Tessier C, Kang JX, Narce M.
High pancreatic n-3 fatty acids prevent STZ-induced diabetes in fat-1 mice: inflammatory pathway
inhibition. Diabete 60, 1090-1099, 2011
Ishibashi M, Varin A, Filomenko R, Lopez T, Athias A, Gambert P, Blache D, Thomas C, Gautier T,
Lagrost L, Masson D. Liver x receptor regulates arachidonic acid distribution and eicosanoid release in
human macrophages: a key role for lysophosphatidylcholine acyltransferase 3. Arterioscler Thromb
Vasc Biol. 33, 1171-1179 2013
Nguyen AT, Mandard S, Dray C, Deckert V, Valet P, Besnard P, Drucker DJ, Lagrost L, Grober J.
Lipopolysaccharides-mediated increase in glucose-stimulated insulin secretion: involvement of the
GLP-1 pathway. Diabetes 63, 471-482, 2014
Ishibashi M, Filomenko R, Rébé C, Chevriaux A, Varin A, Derangère V, Bessède G, Gambert P, Lagrost
L, Masson D. Knock-down of the oxysterol receptor LXRα impairs cholesterol efflux in human primary
macrophages: lack of compensation by LXRβ activation. Biochem Pharmacol. 86, 122-129, 2013

Equipe Détection et métabolisme des lipides et des contaminants alimentaires dans la sphère orodigestive : effets sur la santé et le comportement alimentaire.
Responsable: Philippe Besnard ([email protected])
Sujet de Stage 1: Mécanismes de signalisation cellulaire via les récepteurs cannabinoïdes lors de la
perception gustative des lipides alimentaires.
Maître de stage: Naim Khan
Tel: 03 80 39 63 12
Fax : 03 80 39 63 30
Sujet de Stage 2: Le lipido-récepteur intestinal CD36 est-il un acteur de l’endotoxémie ?
Maîtres de stage: Isabelle Niot & Hélène Poirier
Tel: 03 80 77 40 95
Fax : 03 80 77 40 11
E-mail: [email protected] et [email protected]
Sujet de Stage 3: Mécanismes moléculaires impliqués dans la prolifération et la différenciation de
cellules humaines intestinales (Caco-2) par deux contaminants alimentaires (le BPA et le BPS)
Maîtres de stage: Marie-Christine Chagnon & Ludovic Le Corre
Tel: 03 80 77 40 19
Fax : 03 80 77 40 11
10
E-mail: [email protected] & [email protected]
Dramane G, Abdoul-Azize S, Hichami A, Vögtle T, Akpona S, Chouabe C, Sadou H, Nieswandt B,
Besnard P, Khan NA. STIM1 regulates calcium signaling in taste bud cells and preference for fat in
mice. J Clin Invest. 122, 2267-82, 2012
Ozdener MH, Subramaniam S, Sundaresan S, Sery O, Hashimoto T, Asakawa Y, Besnard P, Abumrad
NA, Khan NA. CD36- and GPR120-Mediated Ca2+ Signaling in Human Taste Bud Cells Mediates
Differential Responses to Fatty Acids and Is Altered in Obese Mice. Gastroenterology 146, 995-1005,
2014
Buttet M, Traynard V, Tran TT, Besnard P, Poirier H, Niot I. From fatty-acid sensing to chylomicron
synthesis: role of intestinal lipid-binding proteins. Biochimie 96, 37-47, 2014
Tran TT, Poirier H, Clément L, Nassir F, Pelsers MM, Petit V, Degrace P, Monnot MC, Glatz JF,
Abumrad NA, Besnard P, Niot I. Luminal lipid regulates CD36 levels and downstream signaling to
stimulate chylomicron synthesis. J Biol. Chem. 286 25201-25210, 2011
Le Corre L, Besnard P, Chagnon M-C. BPA, an endocrine balance disruptor. Critical review in Food
Sciences and Nutrition, 2013
________________________________________________________________
EPHE – Monoxyde d'Azote et Cancer
BP 87900
21079 Dijon Cedex
Responsable
Ali Bettaieb
Coordonnées
Tel: 03 80 39 34 51
Fax : 03 80 39 34 34
Sujet de Stage 1: Effet sensibilisateur du NO (monoxyde d’azote) à la mort des cellules cancéreuses
coliques résistantes à l’oxaliplatine.
Maître de stage: Catherine Paul
Tel: 03 80 39 34 19
Fax : 03 80 39 34 34
Sujet de Stage 2 : Etude de la sensibilisation à la mort des cellules tumorales par le NO: rôle des
modifications post-traductionnelles des protéines par S-nitrosylation
Maître de stage : Stéphanie Plenchette-Colas
Tel: 03 80 39 33 59
Fax : 03 80 39 34 34
Sujet de Stage 3 : Modulations par un donneur de monoxyde d'azote de biomarqueurs de
11
chimiorésistance au docétaxel
Maître de stage : Véronique Laurence-Calin
Tel: 03 80 39 33 59
Fax : 03 80 39 34 34
Magadoux L, Isambert N, Plenchette S, Jeannin JF and Laurens V. Emerging targets to monitor and
overcome docetaxel resistance in castration resistant prostate cancer. Int J Oncology, sous presse
Isambert N, Fumoleau P, Paul C, Ferrand C, Zanetta S, Bauer J, Ragot K, Lizard G, Jeannin J-F and
Bardou M. Phase I study of OM-174, an intravenous lipid A analogue, with assessment of
immunological response, in patients with refractory solid tumors. BMC cancer 13, 172, 2013
Reveneau, S., Petrakis, T., Goldring, C., Chantôme, A., Jeannin, J.F., and Pance, P. Oct-1 cooperates
with the TATA binding initiation complex to control rapid transcription of human iNOS. Cellular and
Molecular Life Sciences 69, 2609-2619, 2012
Leon L, Subramaniam S, Cauvard O, Plenchette-Colas S, Paul C, Godard C, Martinez-Ruiz A, Legembre
P, Jeannin JF, and Bettaieb A. S-nitrosylation of the death receptor Fas amplifies Fas ligand-mediated
cancer cell apoptosis. Gastroenterology 140, 2009-2019, 2011
Gautier T, Paul C, Deckert V, Desrumaux C, Klein A, Labbé J, Le Guern N, Athias A, Monier S,
Hammann A, Bettaïeb A, Jeannin JF, Lagrost L. Innate immune response triggered by triacyl lipid A is
dependent on phospholipid transfer protein (PLTP) gene expression. FASEB J 24, 3544-3554, 2010
________________________________________________________________
EA7270 Biochimie du Peroxysome, Inflammation et Métabolisme Lipidique
Bio-PeroxIL
6 Bd Gabriel,
BP 87900
21079 Dijon Cedex
Responsable
Gérard Lizard
Coordonnées
Tél: 33 80 39 62 56
Fax: 33 80 39 62 50
ou [email protected] (secrétariat)

Sujet de stage 1 : Déficience en acyl-CoA oxydase 1 peroxysomale dans les cellules microgliales BV :
conséquences sur le statut inflammatoire et sur les fonctions mitochondriales.
Maîtres de stage : Pierre Andreoletti & Mustapha Cherkaoui Malki
Tél : 03 80 39 62 05 & 03 80 39 62 55
E-mails : [email protected] & [email protected]
12
Baarine M, Andréoletti P, Athias A, Nury T, Zarrouk A, Ragot K, Vejux A, Riedinger JM, Kattan Z,
Bessede G, Trompier D, Savary S, Cherkaoui-Malki M, Lizard G. Evidence of oxidative stress in very
long chain fatty acid—treated oligodendrocytes and potentialization of ROS production using RNA
interference-directed knockdown of ABCD1 and ACOX1 peroxisomal proteins. Neuroscience 213, 118, 2012
El Hajj H. I, Vluggens A, Andreoletti P, Ragot K, Mandard S, Kersten S, Waterham H.R, Lizard G,
Wanders R.J.A, Reddy J.K, Cherkaoui-Malki M. The inflammatory response in acyl-CoA oxidase 1
deficiency (pseudo-neonatal adrenoleukodystrophy). Endocrinology 153, 2568-2575, 2012
Vamecq J, Dessein AF, Fontaine M, Briand G, Porchet N, Latruffe N, Andreolotti P, Cherkaoui-Malki
M. Mitochondrial dysfunction and lipid homeostasis. Curr Drug Metab. 13, 1388-400, 2012
El Kharrassi Y, Samadi M, Lopez T, Nury T, El Kebbaj R, Andreoletti P, El Hajj HI, Vamecq J, Moustaid K,
Latruffe N, El Kebbaj MS, Masson D, Lizard G, Nasser B, Cherkaoui-Malki M. Biological activities of
Schottenol and Spinasterol, two natural phytosterols present in argan oil and in cactus pear seed oil,
on murine miroglial BV2 cells. Biochem Biophys Res Commun, in press
Vamecq J, Cherkaoui-Malki M, Andreoletti P, Latruffe N. The human peroxisome in health and
disease: the story of an oddity becoming a vital organelle. Biochimie 98, 4-15, 2014
________________________________________________________________
Pôle Mécanisme des interactions plantes-microorganismes - ERL CNRS 6300
UMR 1347 INRA/Université de Bourgogne/AgroSup Dijon
17 rue Sully,
BP 86510
21065Dijon Cedex
Responsable pôle
Responsable UMR
D. Wipf
P. Lemanceau
Coordonnées
Tél: 03 80 69 32 75
Secrétariat: 03 80 69 36 45
Fax : 03 80 39 37 53

Equipe Mycorhizes: mécanismes et gestion
Responsable: Dirk Redecker ([email protected])
Sujet de stage 1: Approche intégrative de l'analyse du transfert de nutriments entre des plantes
connectées par le réseau mycélien de différents champignons mycorhiziens à arbuscules
Maître de stage: Daniel Wipf
Tel: 03 80 69 34 52
Fax : 03 80 39 37 53
13
Schüssler A., H. Martin, Cohen D., M. Fitz, and D. Wipf. Characterization of the first carbohydrate
transporter from symbiotic glomeromycotan fungi. Nature 444, 933-936, 2006
Doidy J., Grace E., C. Kühn, F. Simon-Plas, L. Casieri and D. Wipf. Sugar transporters in plants and in
their interactions with fungi. Trends in Plant Science 17, 413-422, 2012
Doidy J., D. van Tuinen, O. Lamotte, M. Corneillat, G. Alcaraz and D. Wipf. The Medicago truncatula
sucrose transporter family. Characterization and implication of key members in carbon partitioning
towards arbuscular mycorrhizal fungi. Molecular Plant 5, 1346-1358, 2012
Koegel S., N. Ait Lahmidi, C. Arnould, O. Chatagnier, F. Walder, K. Ineichen, T. Boller, D. Wipf, A.
Wiemken and P.E. Courty. The Family of Ammonium Transporters (AMT) in Sorghum bicolor: Two
AMTs are induced locally, but not systemically in roots colonized by arbuscular mycorrhizal fungi.
The New Phytologist 198, 853-865, 2013
Courty P.E., Smith P., Koegel S., Redecker D. and D. Wipf. Inorganic Nitrogen uptake and transport in
beneficial plant root-microbe interactions. Critical Reviews in Plant Sciences, sous presse

Equipe Monoxyde d'azote et immunité chez les plantes
Responsable: David Wendehenne ([email protected])
Sujet de stage 1: identification des protéines cibles des histones déacétylase de type 2, des acteurs
clé de l'immunité des plantes
Maître de stage: Valérie Nicolas-Francès et Stéphane Bourque
Tel: 03 80 69 31 78 & 03 80 69 34 76
Fax : 03 80 39 37 53
Sujet de stage 2: interactions nitrates/monoxyde d'azote dans la signalisation moléculaire des
réponses immunes chez la plante Medicago truncatula
Maître de stage: Hoai-Nam Truong-Cellier et Sylvain Jeandroz
Tel: 03 80 69 31 78 & 03 80 69 34 76
Email : [email protected], [email protected]
Sujet de stage 3: Caractérisation biochimique et fonctionnelle des partenaires de la protéine
chaperonne CDC48 dans l'immunité chez les plantes
Maître de stage: Claire Rosnoblet
Tel: 03 80 69 34 24
Kulik A., Noirot E., Grandperret V., Bourque S., Fromentin J., Salloignon P., Truntzer C., Dobrowolska
G., Simon-Plas F. and Wendehenne D. Interplays between nitric oxide and reactive oxygen species in
cryptogein signaling. Plant Cell Environ., 2014, in press (DOI: 10.1111/pce.12295)
Grandperret V., Nicolas-Francès V., Wendehenne D. and Bourque S. 2014. Type-II Histone
DeACetylases: elusive plant nuclear signal transducers. Plant Cell Environ., 2014, in press (DOI:
10.1111/pce.12236)
14
Jeandroz S., Lamotte O., Astier J., Rasul S., Trapet P., Besson-Bard A., Bourque S., Nicolas-Francès V.,
Ma W., Berkowitz G.A. and Wendehenne D. There's more to the picture than meets the eye: Nitric
oxide cross-talk with Ca2+ signaling. Plant Physiol. 163, 459-470, 2013
Astier J., Kulik A., Koen E., Besson-Bard A., Bourque S., Jeandroz S., Lamotte O. and Wendehenne D.
Protein S-nitrosylation: what's going on in plants? Free Radic. Biol. Med. 53, 1101–1110, 2012
Astier J., Besson-Bard A., Lamotte O., Bertoldo J., Bourque S., Terenzi H. and Wendehenne D. Nitric
oxide inhibits the ATPase activity of the chaperone-like AAA+ATPase CDC48, a target for Snitrosylation in cryptogein signaling in tobacco cells. Biochem. J. 447, 249–260, 2012

Equipe Dynamique membranaire et interactions plantes-microorganismes
Responsable: Nathalie Leborgne-Castel ([email protected])
Sujet de Stage 1: Implication de la dynamique des microdomaines membranaires dans la
signalisation de la cellule végétale en réponse aux modifications de son environnement
Maître de stage : Patricia Gerbeau-Pissot
Tel: 03 80 69 34 59
Fax : 03 80 69 37 53
Sujet de Stage 2 : Dynamique subcellulaire de la protéine RBOHD et signalisation médiée par les
formes actives de l’oxygène en réponse aux stress de l’environnement
Maître de stage : Karim Bouhidel
Tel: 03 80 69 34 62
Fax : 03 80 69 37 53
Noirot E, Der C., Lherminier J, Robert F, Moricova P, Kiêu K, Leborgne-Castel N, Simon-Plas F,
Bouhidel K. Dynamic changes in the subcellular distribution of the tobacco ROS-producing enzyme
RBOHD in response to the oomycete elicitor cryptogein. J. Exp Bot (minor revisions)
Gerbeau-Pissot P, Der C, Thomas D, Anca IA, Grosjean K, Roche Y, Perrier-Cornet JM, Mongrand S,
Simon-Plas F. Modification of plasma membrane organization in tobacco cells elicited by cryptogein.
Plant Physiol 164, 273-286, 2014
Cacas JL, Furt F, Le Guédard M, Schmitter JM, Buré C, Gerbeau-Pissot P, Moreau P, Bessoule JJ,
Simon-Plas F, Mongrand S. Lipids of plant membrane rafts. Prog Lipid Res 51, 272-299, 2012
Adam T, Bouhidel K, Der C, Robert F, Najid A, Simon-Plas F, Leborgne-Castel N. Constitutive
expression of clathrin hub hinders elicitor-induced clathrin-mediated endocytosis and defense gene
expression in plant cells. FEBS lett 586, 3293-3298, 2012
Bonneau L, Gerbeau-Pissot P, Thomas D, Der C, Lherminier J, Bourque S, Roche Y, Simon-Plas F.
Plasma membrane sterol complexation, generated by filipin, triggers signaling responses in tobacco
cells. Biochim Biophys Acta 798, 2150-2159, 2010

15
Equipe Résistance Induite
Responsable: Marielle Adrian ([email protected])
Sujet de Stage 1: Etude du mode d’action de nouveaux éliciteurs stimulant l’immunité de la vigne.
Maître de stage: Benoît Poinssot et Marie-Claire Héloir
Tel : 03 80 69 34 58
Gauthier A, Trouvelot S, Kelloniemi J, Frettinger P, Wendehenne D, Daire X, Joubert JM, Ferrarini A,
Delledone M, Flors V, Poinssot B. The sulfated laminarin triggers a stress transcriptome before
priming the SA- and ROS-dependent defenses during grapevine’s induced resistance against
Plasmopara viticola. Plos ONE 9:e88145, 2014
Trdá L., Fernandez O., Boutrot F., Héloir M.-C., Kelloniemi J., Daire X., Adrian M., Clément C., Zipfel C.,
Dorey S., Poinssot B. The grapevine flagellin receptor VvFLS2 differentially recognizes flagellinderived epitopes from the endophytic growth promoting bacterium Burkholderia phytofirmans and
plant pathogenic bacteria. New Phytol. 201, 1371-1384, 2014
Manzoor H., Kelloniemi J., Chiltz A., Wendehenne D., Pugin A., Poinssot B., Garcia-Brugger A.
Involvement of the glutamate receptor AtGLR3.3 in plant defense signaling and resistance to
Hyaloperonospora arabidopsidis. Plant J. 76, 466-480, 2013
Rasul S., Dubreuil-Maurizi C., Lamotte O., Poinssot B., Alcaraz G., Wendehenne D., Jeandroz S. Nitric
oxide production mediates oligogalacturonides-triggered immunity and resistance to Botrytis cinerea
in Arabidopsis thaliana. Plant Cell Environ. 35, 1483-1499, 2012
Dubreuil-Maurizi C., Vitecek J., Marty L., Branciard L., Frettinger P., Wendehenne D., Meyer A.,
Mauch F. and Poinssot B. The glutathione depletion in the Arabidopsis pad2 mutant depends on the
low amount of glutamate-cysteine ligase protein which disturbs defence gene expression, reactive
oxygen species production and hypersensitive response. Plant Physiol. 157, 2000-2012, 2011
________________________________________________________________
Pôle Microbiologie Environnementale et Risque Sanitaire (MERS)
UMR 1347 AgroSup/INRA/Université de Bourgogne
Bâtiment B2, CHU Bocage,
2 bd de Lattre de Tassigny
21079 DIJON CEDEX
Responsable Pôle
Responsable UMR
Alain Hartmann
Philippe Lemanceau
Coordonnées
Tél. : 33 80 29 50 14
Fax : 33 80 39 32 55

16
Equipe Interaction Candida albicans - Hôte
Responsable: Frédéric Dalle ([email protected])
Sujet de Stage 1: Etude de la réponse entérocytaire au cours de l’infection à Candida albicans dans
un modèle in vitro, en particulier caractérisation du rôle des jonctions serrées.
Maîtres de stage: Fabienne Bon et Frédéric Dalle
Tel: 03 80 39 33 47 & 06 88 98 99 51
Fax : 03 80 39 32 55
Sujet de Stage 2: Etude de la réponse inflammatoire induite lors de l’interaction entre la levure
Candida albicans et les cellules entérocytaires.
Maîtres de stage: Marc Sautour & Frédéric Dalle
Tel: 03 80 39 33 47
Fax : 03 80 39 32 55
Wächtler B, Citiulo F, Jablonowski N, Förster S, Dalle F, Schaller M, Wilson D, Hube B. Candida
albicans-epithelial interactions: dissecting the roles of active penetration, induced endocytosis and
host factors on the infection process. PLoS One 7, 2012
L'ollivier C, Labruère C, Jebrane A, Bougnoux ME, d'Enfert C, Bonnin A, Dalle F. Using a Multi-Locus
Microsatellite Typing method improved phylogenetic distribution of Candida albicans isolates but
failed to demonstrate association of some genotype with the commensal or clinical origin of the
isolates. Infect Genet Evol 12, 1949-57, 2012
Wächtler B, Wilson D, Haedicke K, Dalle F, Hube B. From attachment to damage: defined genes of
Candida albicans mediate adhesion, invasion and damage during interaction with oral epithelial cells.
PLoS One 23 6(2):e17046, 2011
Dalle F, Wächtler B, L'Ollivier C, Holland G, Bannert N, Wilson D, Labruère C, Bonnin A, Hube B.
Cellular interactions of Candida albicans with human oral epithelial cells and enterocytes. Cell
Microbiol 12, 248-271, 2010
Dalle F, Jouault T, Trinel PA, Esnault J, Mallet JM, d'Athis P, Poulain D, Bonnin A. Beta-1,2- and Alpha1,2-linked oligomannosides mediate adherence of Candida albicans blastospores to human
enterocytes in vitro. Infection and Immunity 71, 7061-7068, 2003

Equipe Ventilation Immunité innée Poumon
Responsable: Pierre Emmanuel Charles [email protected]
Sujet de Stage: Modulation de l’activité pro-inflammatoire des alarmines mitochondriales dans un
modèle animal de pneumopathie bactérienne sous ventilation mécanique.
Maître de stage: Pierre Emmanuel Charles
17
Tél. : 33 80 29 31 27
Fax : 33 80 29 38 34
Ladoire S, Pauchard LA, Barbar SD, Tissières P, Croisier D, Charles PE. Impact of the prone position in
an animal model of unilateral bacterial pneumonia undergoing mechanical ventilation.
Anesthesiology 118, 1150-1159, 2013
Charles PE, Tissières P, Barbar SD, Croisier D, Dufour J, Dunn-Siegrist I, Chavanet P, Pugin J. Mildstretch mechanical ventilation up-regulates toll-like receptor 2 and sensitizes the lung to bacterial
lipopeptide. Crit Care 15, R181, 2011
Pugin J, Dunn-Siegriest I, Dufour J, Tissières P, Charles PE, Comte R. Cyclic stretch of human lung cells
induces an acidification and promotes bacterial growth. Am J Respir Cell Mol Biol 38, 362-370, 2008
Charles PE, Etienne M, Croisier D, Piroth L, Lequeu C, Pugin J, Portier H, Chavanet P. The impact of
mechanical ventilation on the moxifloxacin (MXF) treatment of experimental pneumonia caused by
Streptococcus pneumoniae. Crit Care Med 33, 1029-1035, 2005
Charles PE, Martin L, Etienne M, Croisier D, Piroth L, Lequeu C, Pugin J, Portier H, Chavanet P.
Influence of positive end-expiratory pressure on histopathological and bacteriological aspects of
pneumonia during low tidal volume mechanical ventilation. Intensive Care Med 30, 2263-2270, 2004
_________________________________________________________________
Pôle déterminismes Génétiques et Environnementaux de l’Adaptation des
Plantes à des Systèmes de culture Innovants
UMR 1347 AgroSup/INRA/Université de Bourgogne
17 rue Sully,
BP 86510
21065Dijon Cedex
Responsable
Christophe Salon
Coordonnées
Tél. : 33 80 69 32 38
Fax : 33 80 69 32 63

Equipe Etude des Mécanismes Moléculaires contrôlant le rendement et la qualité des graines de
légumineuses
Responsables: Richard Thompson
([email protected])
([email protected])
et
Karine
Gallardo
Sujet de Stage 1 : Etude de la contribution du sulfate vacuolaire aux mécanismes de tolérance contre
le stress hydrique par une approche de génomique fonctionnelle exploitant des mutants TILLING
chez le pois protéagineux.
Maître de stage : Karine Gallardo
18
Tel: 03 80 69 33 91
Fax : 03 80 69 32 63
Sujet de Stage 2 : Etude de la réponse transcriptomique et métabolomique du pois à un stress
hydrique appliqué lors de la phase de remplissage des graines.
Maître de stage: Vanessa Vernoud
Tel: 03 80 69 32 54
Fax : 03 80 69 32 63
D'Hooghe P, Dubousset L, Gallardo K, Kopriva S, Avice J-C, Trouverie J. Evidence for proteomic and
metabolic adaptations associated to alterations of seed yield and quality in sulphur-limited Brassica
napus L. Molecular & Cellular Proteomics, sous presse, 2014
Zuber H, Poignavent G, Le Signor C, Aimé D, Vieren E, Tadla C, Belghazi M, Labas V, Santoni A-L, Wipf
D, Buitink J, Avice J-C, Salon C, Gallardo K. Legume adaptation to sulfur deficiency revealed by
comparing nutrient allocation and seed traits in Medicago truncatula. Plant Journal 76, 982-96, 2013
D'Erfurth I, Le Signor C, Aubert G, Sanchez M, Vernoud V, Darchy B, Lherminier J, Bourion V,
Bouteiller N, Bendahmane A, Buitink J, Prosperi JM, Thompson R, Burstin J, Gallardo K. A role for an
endosperm-localized subtilase in the control of seed size in legumes. New Phytologist 196, 738-751,
2012.
Zuber H, Davidian JC, Aubert G, Aimé D, Belghazi M, Lugan R, Heintz D, Wirtz M, Hell R, Thompson R,
Gallardo K. The seed composition of Arabidopsis mutants for the group 3 sulfate transporters
indicates a role in sulfate translocation within developing seeds. Plant Physiology 154, 13-26, 2010
Thompson R, Burstin J, Gallardo K. Post-genomics studies of developmental processes in legume
seeds. Plant Physiology, 151, 1023-1029, 2009
________________________________________________________________
UMR 6265 CNRS , 1324 INRA, Université de Bourgogne
Centre des Sciences du Goût et de l’Alimentation
9E boulevard Jeanne d’Arc,
21000 Dijon
Responsable
Luc Pénicaud
Coordonnées
Tél. : 03 80 68 16 49
Fax : 03 80 68 16 01

Equipe Perception Sensorielle, Interactions Glie/Neurones
Responsable: Yaël Grosjean ([email protected])
19
Sujet de Stage 1: Identification des partenaires moléculaires de CD98hc, et rôle dans le transport
d’acides aminés en utilisant un modèle de culture cellulaire.
Maîtres de stage: Georges Alves et Flore Geillon
Tel: 03 80 39 62 21 ou 03 80 39 62 91
Fax : 03 80 39 62 89
Sujet de Stage 2 : Contrôle de la sécrétion d’insuline par deux transporteurs d’acides aminés en
fonction du régime alimentaire.
Maîtres de stage : Gérard Manière et Yaël Grosjean
Tel: 03 80 39 62 15
Fax : 03 80 39 62 89
Ziegler AB, Berthelot-Grosjean M, Grosjean Y. The smell of love in Drosophila. Frontiers in Physiology
4:72, 2013
Grosjean Y, Rytz R, Farine JP, Abuin L, Cortot J, Jefferis GS, Benton R. An olfactory receptor for foodderived odours promotes male courtship in Drosophila. Nature 236-40, 2011
Ai M, Min S, Grosjean Y, Leblanc C, Bell R, Benton R, Suh GS. Acid sensing by the Drosophila olfactory
system. Nature 468, 691-695, 2010
Grosjean Y, Grillet M, Augustin H, Ferveur JF, Featherstone DE. A glial amino-acid transporter
controls synapse strength and courtship in Drosophila. Nature Neuroscience 11, 54-61, 2008
Augustin H, Grosjean Y, Chen K, Sheng Q, Featherstone DE. Nonvesicular release of glutamate by glial
xCT transporters suppresses glutamate receptor clustering in vivo. Journal of Neuroscience, 27, 111123, 2007

Equipe Plasticité fonctionnelle des neurones olfactifs
Responsable: Xavier Grosmaitre ([email protected])
Sujet de Stage 1: Impact des lipides membranaires sur la fonctionnalité des récepteurs olfactifs
Maître de stage: Anne-Marie Le Bon
Tel: 03 80 68 16 13
Audouze K, Tromelin A, Le Bon AM, Belloir C, Petersen RK, Kristiansen K, Brunak S, Taboureau O.
Identification of odorant-receptor interactions by global mapping of the human odorome. PLoS One
9, e93037, 2014
Cadiou H, Aoudé I, Tazir B, Molinas A, Fenech C, Meunier N, Grosmaitre X. Postnatal odorant
exposure induces peripheral olfactory plasticity at the cellular level. J Neuroscience 34, 4857-4870,
2014
20
Thiebaud N, Veloso Da Silva S, Jakob I, Sicard G, Chevalier J, Ménétrier F, Berdeaux O, Artur Y, Heydel
JM, Le Bon AM. Odorant metabolism catalyzed by olfactory mucosal enzymes influences peripheral
olfactory responses in rats. PLoS One 8, e59547, 2013.
Omura, M, Grosmaitre, X, Ma, M, Mombaerts, P. The β2-adrenergic receptor as a surrogate odorant
receptor in mouse olfactory sensory neurons. Mol. Cell. Neuroscience 6, 1-10, 2013
Chaput MA, El Mountassir F, Atanasova B, Thomas-Danguin T, Le Bon AM, Perrut A, Ferry B,
Duchamp-Viret P. Interactions of odorants with olfactory receptors and receptor neurons match the
perceptual dynamics observed for woody and fruity odorant mixtures. Eur. J. Neurosci. 35, 584-97,
2012

Equipe Mécanismes de Plasticité et Perception Chimiosensorielle
Responsable: Jean-François Ferveur ([email protected])
Sujet de Stage 1: Sauvegarde nutrigénétique de défauts métaboliques par des acides gras
Maître de stage: Jean-François Ferveur et François Bousquet
Tel: 03 80 39 37 82
Fax : 03 80 39 62 89
Sujet de Stage 2 Effet de l'exposition sensorielle précoce à un odorant régulant les interactions
sociales
Maître de stage : Claude Everaerts
Tel: 03 80 39 63 00
Fax : 03 80 39 62 89
Sujet de Stage 3: Influence des phéromones sur les préférences alimentaires
Maîtres de stage : Jean-Pierre Farine & Dehbia Abed-Vieillard
Tel: 03 80 39 62 95
Fax : 03 80 39 62 89
Sujet de Stage 4: Détection périphérique d'une phéromone associée à la nourriture
Maîtres de stage : Jean-François Ferveur & Sébastien Malpel
Tel: 03 80 39 63 00
Fax : 03 80 39 62 89
Sujet de Stage 5: Manipulation de neurones régulant la prise alimentaire
Maître de stage: Jean-Philippe Charles
Tel: 03 80 39 62 14
Fax : 03 80 39 62 89
Sujet de Stage 6: Odorant-Binding Proteins et détection d'odorants
21
Maîtres de stage : Stéphane Fraichard
Tel: 03 80 39 62 10
Fax : 03 80 39 62 89
Farine JP, Cortot J, Ferveur JF. Drosophila adult and larval pheromones modulate larval food choice.
Proc R Soc Lond B, sous presse, 2014
Flaven-Pouchon J, Farine JP, Ferveur JF, Everaerts C. Transient and permanent experience with fattyacids changes Drosophila melanogaster behaviour and fitness. PLOS ONE 9, e92352, 2014
Bousquet F, Nojima T, Houot B, Chauvel I, Chaudy S, Dupas S, Yamamoto D, Ferveur JF. Desat
expression in neural and non-neural tissues separately affects perception and emission of sex
pheromones in Drosophila. Proc Natl Acad Sci USA 109, 249-254, 2012
Charles JP, Iwema T, Epa VC, Takaki K, Rynes J, Jindra M. Ligand-binding properties of a juvenile
hormone receptor, Methoprene-tolerant. Proc Natl Acad Sci USA 108, 21128-33, 2011
Grosjean Y, Grillet M, Augustin H, Ferveur JF, Featherstone DE. A glial amino-acid transporter controls
synapse strength and courtship in Drosophila. Nature Neuroscience 11, 54-61, 2008

Equipe Œil, Nutrition et Signalisation Cellulaire
Responsable: Lionel Bretillon ([email protected])
([email protected])
et
Catherine
Creuzot-Garcher
Sujet de Stage 1: Distribution lipidique et protéique au sein des rafts des monocytes chez des
patients diabétiques en fonction de la sévérité de la rétinopathie
Maître de stage: Ségolène Gambert-Nicot
Tel: 03 80 69 35 36
Fax: 03 80 69 32 23
Sujet de Stage 2: Cholestérol-24S-hydroxylase et Neuropathie Optique Ischémique Antérieure
Maître de stage : Lionel Bretillon & Cynthia Fourgeux
Tel: 03 80 39 31 21
Fax: 03 80 69 32 23
Sujet de Stage 3: Métabolisme des plasmalogènes et physiopathologie de la rétinopathie du
prématuré : étude clinique chez le nouveau-né et rôle des cellules gliales au cours du développement
vasculaire de la rétine
Maître de stage : Niyazi Acar
Tel: 03 80 39 32 69
Fax: 03 80 69 32 23
22
Acar N, Berdeaux O, Gregoire S, Cabaret S, Martine L, Gain P, Thuret G, Creuzot-Garcher C, Bron A,
Bretillon L. Lipid Composition of the Human Eye: Are Red Blood Cells a Good Mirror of Retinal and
Optic Nerve Fatty Acids? PLoS ONE 7, e35102, 2012
Fares-Taie L, Gerber S, Chassaing N, Clayton-Smith J, Hanein S, Silva E, Serey M, Serre V, Gérard X,
Baumann C, Plessis G, Demeer B, Bretillon L, Bole C, Nitschke P, Munnich A, Lyonnet S, Calvas P,
Kaplan J, Ragge N, Rozet J-M. ALDH1A3 Mutations Cause Recessive Anophthalmia and
Microphthalmia. Am J Hum Genet 92, 265-270, 2013
Fourgeux C, Dugas B, Richard F, Björkhem I, Acar N, Bron AM, Korobelnik J-F, Leveziel N, Zerbib J,
Puche N, Creuzot-Garcher CP, Souied E, Bretillon L. Single Nucleotide Polymorphism in the
Cholesterol-24S-Hydroxylase (CYP46A1) Gene and its Association with CFH and LOC387715 Gene
Polymorphisms in Age-Related Macular Degeneration. Invest Ophthalmol Vis Sci 53, 7026-7033,
2012
Fourgeux C, Martine L, Björkhem I, Diczfalusy U, Joffre C, Acar N, Creuzot-Garcher C, Bron A, Bretillon
L. Primary Open-Angle Glaucoma: Association with Cholesterol 24S-Hydroxylase (CYP46A1) Gene
Polymorphism and Plasma 24-Hydroxycholesterol Levels. Invest Ophthalmol Vis Sci 50, 5712-5717,
2009
Salvary, T., S. Gambert-Nicot, M. C. Brindisi, N. Meneveau, F. Schiele, M. F. Seronde, L. Lorgis, M.
Zeller, Y. Cottin, J. P. Kantelip, P. Gambert, S. Davani. Pravastatin reverses the membrane cholesterol
reorganization induced by myocardial infarction within lipid rafts in CD14(+)/CD16(-) circulating
monocytes. Biochim Biophys Acta 1821, 1287-1294, 2012

Equipe Détection cérébrale des nutriments et homéostasie énergétique
Responsable: Corinne Leloup ([email protected])
Sujet de Stage 1: Etude des caractéristiques de la chaîne respiratoire mitochondriale des astrocytes
comparée à celle des neurones de l’hypothalamus et leurs modifications chez le rat soumis à un
régime normal vs. gras et sucré.
Maître de stage: Corinne Leloup
Tel: 33 80 68 16 65
Fax : 33 80 68 16 01
Allard C, Carneiro L, Grall S, Cline BH, Fioramonti X, Chrétien C, Baba-Aissa F, Giaume C, Pénicaud
L, Leloup C. Hypothalamic astroglial connexins are required for brain glucose sensing-induced insulin
secretion. J Cereb Blood Flow Metab 34, 339-46, 2014
Allard C, Carneiro L, Collins SC, Chrétien C, Grall S, Pénicaud L, Leloup C. Alteration of hypothalamic
glucose and lactate sensing in 48h hyperglycemic rats. Neurosci Lett 534, 75-9, 2013
Carneiro L, Allard C, Guissard C, Fioramonti X, Tourrel-Cuzin C, Bailbé D, Barreau C, Offer G, Nédelec
E, Salin B, Rigoulet M, Belenguer P, Pénicaud L, Leloup C. Importance of Mitochondrial DynaminRelated Protein 1 in Hypothalamic Glucose Sensitivity in Rats. Antioxid Redox Signal, 17, 43344, 2012
23
Leloup C, Casteilla L, Carrière A, Galinier A, Benani A, Carneiro L, Pénicaud L. Balancing mitochondrial
redox signaling: A key point in metabolic regulation. Antioxid Redox Signal, 14, 519-30, 2011
Colombani A-L, Carneiro L, Benani A, Galinier A, Jaillard T, Duparc T, Offer G, Lorsignol A, Magnan C,
Casteilla L, Pénicaud L, Leloup C. Enhanced hypothalamic glucose sensing in obesity : alteration of
redox signaling. Diabetes, 58, 2189-97, 2009

Equipe Plasticité des circuits neuronaux de la prise alimentaire
Responsable: Alexandre Benani ([email protected])
Sujet de Stage 1: Rôle de la plasticité cérébrale dans l’établissement du rythme des repas (étude chez
la souris)
Maître de stage: Alexandre Benani
Tel: 03 80 68 16 27
Fax : 03 80 68 16 01
Maurin AC, Benani A, Lorsignol A, Brenachot X, Parry L, Carraro V, Guissard C, Averous J, Jousse C,
Bruhat A, Chaveroux C, B'chir W, Muranishi Y, Ron D, Pénicaud L, Fafournoux P. Hypothalamic eIF2α
Signaling Regulates Food Intake. Cell Rep 6, 438-444, 2014
Drougard A, Duparc T, Brenachot X, Carneiro L, Gouazé A, Fournel A, Geurts L, Cadoudal T, Prats AC,
Pénicaud L, Vieau D, Lesage J, Leloup C, Benani A, Cani PD, Valet P, Knauf C. Hypothalamic
apelin/reactive oxygen species signaling controls hepatic glucose metabolism in the onset of
diabetes. Antioxid Redox Signal. 20, 557-573, 2014
Gouazé A, Brenachot X, Rigault C, Krezymon A, Rauch C, Nédélec E, Lemoine A, Gascuel J, Bauer S,
Pénicaud L, Benani A. Cerebral cell renewal in adult mice controls the onset of obesity. PLoS One
8:e72029, 2013
Matarazzo V, Schaller F, Nédélec E, Benani A, Pénicaud L, Muscatelli F, Moyse E, Bauer S. Inactivation
of Socs3 in the Hypothalamus Enhances the Hindbrain Response to Endogenous Satiety Signals via
Oxytocin Signaling. J Neurosci. 32, 17097-17107, 2012
Benani A, Hryhroczuk C, Gouazé A, Fioramonti X, Guissard C, Krezymon A, Brenachot X, Duparc T,
Colom A, Nédélec E, Rigault C, Lemoine A, Gascuel J, Gerardy-Schahn R, Valet P, Knauf C, Lorsignol A,
Pénicaud L. Food intake adaptation to dietary fat involves PSA-dependent rewiring of the arcuate
melanocortin system in mice. J Neurosci. 32, 11970-11979, 2012
________________________________________________________________
EA4271 GAD Génétique des Anomalies du développement
IFR Santé STIC/Université de Bourgogne
BP 87900
21079 Dijon Cedex
Responsable
Laurence Olivier-Faivre
24
Coordonnées
Tél: 33 80 39 33 53
Fax: 33 80 39 34 34

Sujet de Stage 1: Identification des bases génétiques et des mécanismes moléculaires à l'origine
d'anomalies du développement avec atteinte cutanée en mosaïque.
Maître de stage: Jean-Baptiste Rivière
Tel: 03 80 28 13 19
Fax : 03 80 29 35 66
Sujet de Stage 2: Identification de bases moléculaires de pathologies cliniquement et génétiquement
hétérogènes par séquençage haut débit d'exome: exemple des encéphalopathies épileptiques.
Maître de stage: Julien Thevenon
Tel: 03 80 39 32 38
Sujet de Stage 3: Caractérisation du phénotype rétinien de la souris Vps13b-/- dans le cadre de l’étude
de la compréhension des mécanismes cellulaires et moléculaires de la rétinopathie pigmentaire du
syndrome de Cohen.
Maître de stage: Laurence Jego-Duplomb
Tel: 03 80 29 53 13
Fax : 03 80 29 32 66
Duplomb L, Duvet S, Picot D, Jego G, El Chehadeh-Djebbar S, Marle N, Gigot N, Aral B, Carmignac V,
Thevenon J, Lopez E, Rivière JB, Klein A, Philippe C, Droin N, Blair E, Girodon F, Donadieu J, BellannéChantelot C, Delva L, Michalski JC, Solary E, Faivre L, Foulquier F, Thauvin-Robinet C. Cohen syndrome
is associated with major glycosylation defects. Hum Mol Genet., 2013
Thauvin-Robinet C, Auclair M, Duplomb L, Caron-Debarle M, Avila M, St-Onge J, Le Merrer M, Le
Luyer B, Héron D, Mathieu-Dramard M, Bitoun P, Petit JM, Odent S, Amiel J, Picot D, Carmignac V,
Thevenon J, Callier P, Laville M, Reznik Y, Fagour C, Nunes ML, Capeau J, Lascols O, Huet F, Faivre L,
Vigouroux C, Rivière JB. PIK3R1 mutations cause syndromic insulin resistance with lipoatrophy. Am J
Hum Genet. 93, 141-149, 2013
Thevenon J, Bourredjem A, Faivre L, Cardot-Bauters C, Calender A, Murat A, Giraud S, Niccoli P, Odou
MF, Borson-Chazot F, Barlier A, Lombard-Bohas C, Clauser E, Tabarin A, Parfait B, Chabre O,
Castermans E, Beckers A, Ruszniewski P, Le Bras M, Delemer B, Bouchard P, Guilhem I, Rohmer V,
Goichot B, Caron P, Baudin E, Chanson P, Groussin L, Du Boullay H, Weryha G, Lecomte P, Penfornis
A, Bihan H, Archambeaud F, Kerlan V, Duron F, Kuhn JM, Vergès B, Rodier M, Renard M, Sadoul JL,
Binquet C, Goudet P. Higher risk of death among MEN1 patients with mutations in the JunD
interacting domain: a Groupe d'etude des Tumeurs Endocrines (GTE) cohort study. Hum Mol Genet.
22, 1940-1948, 2013
25
Carmignac V, Thevenon J, Adès L, Callewaert B, Julia S, Thauvin-Robinet C, Gueneau L, Courcet JB,
Lopez E, Holman K, Renard M, Plauchu H, Plessis G, De Backer J, Child A, Arno G, Duplomb L, Callier P,
Aral B, Vabres P, Gigot N, Arbustini E, Grasso M, Robinson PN, Goizet C, Baumann C, Di Rocco M,
Sanchez Del Pozo J, Huet F, Jondeau G, Collod-Beroud G, Beroud C, Amiel J, Cormier-Daire V, Rivière
JB, Boileau C, De Paepe A, Faivre L. In-frame mutations in exon 1 of SKI cause dominant ShprintzenGoldberg syndrome. Am J Hum Genet. 91, 950-957, 2012
J. Thevenon, E. Lopez, B. Keren, D. Heron, C. Mignot, C. Altuzara, M. Béri-Dexheimer, C. Bonnet, E.
Magnin, L. Burglen, D. Minot, J. Vigneron, S. Morle, M. Anheim, P. Charles, A. Brice, L. Gallagher, J.
Amiel, E. Haffen, C. Mach, C. Depienne, D. Doummar, M. Bonnet, L. Duplomb, V. Carmignac, P.
Callier, A.L. Mosca-Boidron, V. Roze, B. Aral, F. Razavi, P. Jonveaux, L. Faivre, C. Thauvin-Robinet.
Clinical spectrum of intragenic CAMTA1 rearrangements: From non- progressive congenital ataxia to
intellectual disability. J Med Genet. 49, 400-408, 2012
________________________________________________________________
Unité INSERM U1093 Cognition, Action et Plasticité
sensorimotrice/Université de Bourgogne
Faculté de Pharmacie
BP 87900
21079 Dijon Cedex
Responsable
Charambolos Papaxanthis
Coordonnées
Tél. : 03 80 39 67 48
Fax : 03 80 39 67 49

Equipe Plasticité cérébrale et BDNF
Responsable: Christine Marie ([email protected])
Sujet de Stage 1: Caractérisation du rôle potentiellement pro-neuroplastique de l'endothélium
cérébral. Etude de l'expression du BDNF (Brain-derived neurotrophic factor).
Maître de stage: Philippe Garnier
Tel: 03 80 39 34 94
Fax : 03 80 39 32 27
Rodier, M., Prigent-Tessier, A., Bejot, Y., Jacquin, A., Mossiat, C., Marie, C. and Garnier, P. Exogenous
t-PA Administration Increases Hippocampal Mature BDNF Levels. Plasmin- or NMDA-Dependent
Mechanism? PloS one 9, e92416, 2014
Madinier, A., Bertrand, N., Rodier, M., Quirie, A., Mossiat, C., Prigent-Tessier, A., Marie, C. and
Garnier, P. Ipsilateral versus contralateral spontaneous post-stroke neuroplastic changes:
involvement of BDNF? Neuroscience 231, 169-181, 2013
26
Quirie, A., Hervieu, M., Garnier, P., Demougeot, C., Mossiat, C., Bertrand, N., Martin, A., Marie, C. and
Prigent-Tessier, A. Comparative effect of treadmill exercise on mature BDNF production in control
versus stroke rats. PloS one 7, e44218, 2012
Bejot, Y., Prigent-Tessier, A., Cachia, C., Giroud, M., Mossiat, C., Bertrand, N., Garnier, P. and Marie,
C. Time-dependent contribution of non neuronal cells to BDNF production after ischemic stroke in
rats. Neurochemistry international 58, 102-111, 2011
Madinier, A., Bertrand, N., Mossiat, C., Prigent-Tessier, A., Beley, A., Marie, C. and Garnier, P.
Microglial involvement in neuroplastic changes following focal brain ischemia in rats. PloS one 4,
e8101, 2009
________________________________________________________________
UMR Inserm 1098/Université de Franche Comté
Interaction Hôte-Greffon-Tumeur et Ingénierie Cellulaire et Génique
1 boulevard Maréchal De Lattre De Tassigny,
21000 Dijon Cedex
Responsable
Philippe Saas
Coordonnées
Tél. : 33 (0)3 81 66 90 63
Fax : 33 (0)3 81 66 90 89

Equipe Immunorégulation et Immunopathologie (Equipe localisée à la Faculté de Médecine de
Dijon)
Responsable: Bernard Bonnotte ([email protected])
Sujet de Stage 1: Caractérisations phénotypique et fonctionnelle des cellules immunosuppressives
dérivées des monocytes circulants chez l’homme, appelées HuMoSC
Maître de stage: Bernard Bonnotte
Laboratoire localisé à la faculté de Médecine de Dijon
Tel: 03 80 39 33 55
Fax : 03 80 39 32 55
Alizadeh D, Trad M, Hanke NT, Larmonier CB, Janikashvili N, Bonnotte B, Katsanis E, Larmonier N.
Doxorubicin eliminates myeloid-derived suppressor cells and enhances the efficacy of adoptive T-cell
transfer in breast cancer. Cancer Res, 2014
Audia S, Samson M, Mahévas M, Ferrand C, Trad M, Ciudad M, Gautheron A, Seaphanh F, Leguy V,
Berthier S, Salles B, Martin L, Lorcerie B, Ortega-Deballon P, Facy O, Caillot D, Soudry-Faure A, Michel
27
M, Godeau B, Larmonier N, Saas P, Janikashvili N, Bonnotte B. Preferential splenic CD8(+) T-cell
activation in rituximab-non responder patients with immune thrombocytopenia. Blood, 2013
Trad M*, Centuori SM*, LaCasse CJ, Alizadeh D, Larmonier CB, Hanke NT, Kartchner J, Janikashvili N,
Bonnotte B, Larmonier N, Katsanis E. Myeloid-derived suppressor cells from tumor-bearing mice
impair TGF-β-induced differentiation of CD4+CD25+FoxP3+ Tregs from CD4+CD25-FoxP3- T cells. J
Leukoc Biol, 2012
Samson M, Audia S, Janikashvili N, Ciudad M, Trad M, Fraszczak J, Ornetti P, Maillefert JF, Miossec P,
Bonnotte B. Brief report: inhibition of interleukin-6 function corrects Th17/Treg cell imbalance in
patients with rheumatoid arthritis. Arthritis Rheum, 2012
Samson M, Audia S, Fraszczak J, Trad M, Ornetti P, Lakomy D, Ciudad M, Leguy V, Berthier S, Vinit J,
Manckoundia P, Maillefert JF, Besancenot JF, Aho-Glele S, Olsson NO, Lorcerie B, Guillevin L,
Mouthon L, Saas P, Bateman A, Martin L, Janikashvili N, Larmonier N, Bonnotte B. Th1 and Th17
lymphocytes expressing CD161 are implicated in Giant Cell Arteritis and Polymyalgia Rheumatica
Pathogenesis. Arthritis Rheum, 2012
28
Sujets de stage, site de l'Université de Franche-Comté (Besançon)
___________________________________________________________________________
EA3181/Université de Franche-Comté
Carcinogenèse épithéliale : facteurs prédictifs et pronostiques
Les Hauts du Chazal
19 rue Ambroise Paré
25000 Besançon
Responsable
Pr. Christiane Mougin
Coordonnées
Tél: 03 81 66 91 11
Fax: 03 81 66 83 42

Sujet de Stage 1 : Caractérisation des réponses immunitaires anti-HPV et anti-hTERT dans la réponse
des tumeurs HPV16 à une chimiothérapie induisant une apoptose immunogène
Maître de stage: Jean-Luc Prétet
Tel: 03 81 66 91 11
Fax: 03 81 66 93 70
Sujet de Stage 2 : Régulation épigénétique de l’expression des oncogènes d’HPV16
Maître de stage: Christiane Mougin
Tel: 03 81 66 91 11
Fax: 03 81 66 93 70
Sujet de Stage 3: Rôle de la A-FABP (Adipocyte-Fatty Acid Binding Protein) dans la régulation du VEGF
par les PPAR au cours de la carcinogenèse épithéliale.
Maître de stage : Sylvie Fauconnet
Tel: 03 63 08 22 29
Fax: 03 63 08 22 80
Sujet de Stage 4: Mécanisme d’épissage alternatif du transcrit E6/E7 d’HPV16
Maître de stage : Aurélie Baguet
Tel: 03 63 08 22 65
Fax: 03 63 08 22 80
Gaiffe E, Prétet JL, Launay S, Jacquin E, Saunier M, Hetzel G, Oudet P, Mougin C. Apoptotic HPV
positive cancer cells exhibit transforming properties. PLoS One, 7:e36766, 2012
29
Valmary-Degano S, Jacquin E, Prétet JL, Monnien F, Girardo B, Arbez-Gindre F, Joly M, Bosset JF,
Kantelip B, Mougin C. Signature pattern of human papillomavirus type 16 in anal carcinoma. Hum
Pathol, 44, 992-1002, 2013
Jacquin E, Baraquin A, Ramanah R, Carcopino X, Morel A, Valmary-Degano S, Bravo IG, de Sanjosé S,
Riethmuller D, Mougin C, Prétet JL. Specific methylation of HPV16 promoter region in cervical cancer
samples determined with HRM PCR method. J Clin Microbiol, 51, 3207-15, 2013
Roche E, Lascombe I, Bittard H, Mougin C, Fauconnet S. The PPARβ agonist L-165041 promotes VEGF
mRNA stabilization in HPV18-harboring HeLa cells through a receptor-independent mechanism. Cell
Signal 26, 433-443, 2014
Culjkovic-Kraljacic B1, Baguet A, Volpon L, Amri A, Borden KL. The oncogene eIF4E reprograms the
nuclear pore complex to promote mRNA export and oncogenic transformation. Cell Rep 30, 207-15,
2012
_________________________________________________________________
EA3922/ Université de Franche-Comté
Estrogènes, Expression Génique et Pathologies du Système Nerveux Central
UFR Sciences et Techniques
16, route de Gray
Bâtiment DF
25030 BESANCON cedex
Responsable
Pr. Régis Delage-Mourroux
Coordonnées
Tél: 03 81 66 66 24
Fax: 03 81 66 62 67

Sujet de Stage 1: Rôle de l’acétylation dans la régulation de l’autophagie
Maîtres de stage : Pascale Adami et Régis Delage-Mourroux
Tel: 03 81 66 62 54/66 24
Fax: 03 81 66 62 67
Sujet de Stage 2 : Caractérisation des modifications épigénétiques associées la transition épithéliomésenchymateuse
Maîtres de stage: Eric Hervouet & Christophe Borg
Tel: 03 81 66 65 42/ 03 81 61 56 15
Fax: 03 81 66 62 67/ 03 81 61 56 17
30
Pernodet N, Hermetet F, Adami P, Vejux A, Descotes F, Borg C, Adams M, Pallandre JR, Viennet G,
Esnard F, Jouvenot M, Despouy G. High expression of QSOX1 reduces tumorogenesis, and is
associated with a better outcome for breast cancer patients. Breast Cancer Res 14, R136, 2012
Le Grand JN, Bon K, Fraichard A, Zhang J, Jouvenot M, Risold PY, Boyer-Guittaut M, Delage-Mourroux
R. Specific distribution of the autophagic protein GABARAPL1/GEC1 in the developing and adult
mouse brain and identification of neuronal populations expressing GABARAPL1/GEC1. PLoS One
8(5):e63133, 2013
Boyer-Guittaut M, Poillet L, Liang Q, Bôle-Richard E, Ouyang X, Benavides GA, Chakrama FZ, Despouy
G, Fraichard A, Darley-Usmar VM, Jouvenot M, Delage-Mourroux R and Zhang J. The role of
GABARAPL1 (GEC1) in autophagic flux and mitochondrial quality control in MDA-MB-436 breast
cancer cells. Autophagy 2014, sous presse
Grandclement C, Pallandre JR, Valmary Degano S, Viel E, Bouard A, Balland J, Rémy-Martin JP, Simon
B, Rouleau A, Boireau W, Klagsbrun M, Ferrand C, Borg C. Neuropilin-2 expression promotes TGF-β1mediated epithelial to mesenchymal transition in colorectal cancer cells. PLoS One 6(7):e20444, 2011
Hervouet E, Nadaradjane A, Gueguen M, Vallette FM, Cartron PF. Kinetics of DNA methylation
inheritance by the Dnmt1-including complexes during the cell cycle. Cell Div. 7:5, 2012
_________________________________________________________________
EA 4266/Université de Franche-Comté
Agents Pathogènes & Inflammation
Laboratoire de Virologie
2 place Saint-Jacques
25030 Besançon Cedex
Responsable
Pr. Georges Herbein
Coordonnées
Tél: 03 81 21 88 77
Fax: 03 81 66 56 95

Equipe Virologie
Responsable: Georges Herbein ([email protected])
Sujet de Stage 1: Activation de la voie de signalisation AKT dans les macrophages infectés par le VIH.
Maître de stage: Georges Herbein
Tel: 03 81 21 88 77
Fax: 03 81 66 56 95
Abbas W, Khan KA, Kumar A, Tripathy MK, Dichamp I, Keita M, Mahlknecht U, Rohr O, Herbein G.
Blockade of BFA-mediated apoptosis in macrophages by the HIV-1 Nef protein. Cell Death Dis 5:
e1080, 2014
31
Cherrier T, Le Douce V, Eilebrecht S, Riclet R, Marban C, Dequiedt F, Goumon Y, Paillart JC, Mericskay
M, Parlakian A, Bausero P, Abbas W, Herbein G, Kurdistani S, Grana X, Benecke A, Van Driessche B,
Schwartz C, Candolfi E, Van Lint C, Rohr O. CTIP2 is a negative regulator of P-TEFb. PNAS 110, 1265512660, 2013
Herbein G, Audrey V. The macrophage in HIV-1 infection: from activation to deactivation?
Retrovirology 7, 33, 2010
Varin A, Mukhopadhyay S, Herbein G, Gordon S. Alternative activation of macrophages by IL-4
impairs phagocytosis of pathogens but potentiates microbial-induced signalling and cytokine
secretion. Blood 115, 353-362, 2010
Khan KA, Coaquette A, Davrinche C, Herbein G. Bcl-3 regulated transcription of major immediate
early promoter of human cytomegalovirus (HCMV) in monocyte-derived macrophages. The Journal
of Immunology 182, 7784-7794, 2009

Equipe Bactériologie Médicale
Responsable: Patrick Plésiat ([email protected])
Sujet de Stage 1: Etude de nouveaux mécanismes de régulation de la résistance aux antibiotiques
chez la bactérie, Pseudomonas aeruginosa
Maître de stage: Katy Jeannot
Tel: 03 63 08 22 41
Fax: 03 63 08 22 32
Muller C, Plésiat P, Jeannot K. A two-component regulatory system interconnects resistance to
polymyxins, aminoglycosides, fluoroquinolones, and ß-lactams in Pseudomonas aeruginosa.
Antimicrobial Agents and Chemotherapy 55, 1211-21, 2011
de Bentzmann S, Giraud,C, Bernard C, Calderon V, Ewald F, Plésiat P, Nguyen C, Grunwald D, Attrée I,
Jeannot K, Fauvarque MO, Bordi C. Unique biofilm signature, drug susceptibility and decreased
virulence in Drosophila through the Pseudomonas aeruginosa two-component system PprAB. PLos
Pathogens 2012
Buyck JM, Plésiat P, Traore T , Vanderbist F,Tulkens P, Van Bambeke F. Increased susceptibility of
Pseudomonas aeruginosa to macrolides and ketolides in eukaryotic cell culture media and biological
fluids due to decreased expression of oprM and increased outer-membrane permeability.Clinical
Infectious Diseases 5, 534-42, 2012
Fournier D, Richardot C, Müller E, Robert-Nicoud M, Llanes C, Plésiat P, Jeannot K. Complexity of
resistance mechanisms to imipenem in intensive care unit strains of Pseudomonas aeruginosa.
Journal of Antimicrobial Chemotherapy 68, 1772-80, 2013
Guénard S, Muller C, Monluzun L, Broutin I, Benas B, Jeannot K, Plésiat P. Multiple mutations lead to
MexXY/OprM-dependent aminoglycoside resistance in clinical strains of Pseudomonas aeruginosa
Antimicrobial Agents and Chemotherapy 58, 221-8, 2014
_________________________________________________________________
32
UMR 6249 Chrono-environnement
Université de Franche-Comté
La Bouloie UFR Sciences et Techniques
16 route de Gray 25030 Besançon cedex.
Responsable
Daniel Gilbert
Coordonnées
Tel : 03-81-66-62-55
Fax : 03-81-66-65-68

Equipe Hygiène hospitalière et épidémiologie
UFR Sciences Médicales et Pharmaceutiques
Les Hauts du Chazal
25030 Besançon cedex
Responsable: Xavier Bertrand ([email protected])
Sujet de Stage: Rôle des anticancéreux dans l’émergence de la résistance aux antibiotiques, via
l’activation de la réponse SOS
Maître de stage: Didier Hocquet
Tél: 33 3 81 66 91 81
Fax: 33 3 81 66 89 14
Hocquet D, Llanes C, Thouverez M, Kulasekara HD, Bertrand X, Plésiat P, Mazel D, Miller SI. Evidence
for induction of integron-based antibiotic resistance by the SOS response in a clinical setting. Plos
Pathogens 8(6):e1002778, 2012
Slekovec C, Plantin J, Cholley P, Talon D, Bertrand X, Hocquet D. Tracking down hospital resistant
Pseudomonas aeruginosa in the wastewater. PLoS One 7(12):e49300, 2012
Rohmer L, Hocquet D, Miller SI. Are pathogenic bacteria just looking for food? Metabolism and
microbial pathogenesis. Trends Microbiol. 19(7), 341-348, 2011
Hocquet D, Plésiat P, Dehecq B, Mariotte P, Talon D, Bertrand X. Nationwide investigation of
extended-spectrum -lactamases, metallo--lactamases, and extended-spectrum oxacillinases
produced by ceftazidime-resistant P. aeruginosa strains in France. Antimicrob Agents Chemother.
54(8), 3512-355, 2010
Hocquet D, Muller A, Blanc K, Plésiat P, Talon D, Monnet DL, Bertrand X. Relationship between
antibiotic use and incidence of MexXY-OprM overproducers among clinical isolates of Pseudomonas
aeruginosa. Antimicrob Agents Chemother. 52, 1173-1175, 2008
_________________________________________________________________
33
UMR Inserm 1098/Université de Franche Comté
Interaction Hôte-Greffon-Tumeur et Ingénierie Cellulaire et Génique
1 Boulevard Alexandre Fleming
BP1937, F-25020 Besançon Cedex
Bâtiment I.B.C.T
20, Rue Françoise Dolto
25000 Besancon
Responsable
Philippe Saas
Coordonnées
Tél: 03 81 66 90 63
Fax : 03 81 66 90 89

Equipe Immunorégulation et Immunopathologie (Equipe localisée à la Faculté de Médecine de
Dijon)
Responsable: Bernard Bonnotte ([email protected])
Sujet de Stage 1: Caractérisations phénotypique et fonctionnelle des cellules immunosuppressives
dérivées des monocytes circulants chez l’homme, appelées HuMoSC
Maître de stage: Bernard Bonnotte
Laboratoire localisé à la faculté de Médecine de Dijon
Tel: 03 80 39 33 55
Fax : 03 80 39 32 55
Alizadeh D, Trad M, Hanke NT, Larmonier CB, Janikashvili N, Bonnotte B, Katsanis E, Larmonier N.
Doxorubicin eliminates myeloid-derived suppressor cells and enhances the efficacy of adoptive T-cell
transfer in breast cancer. Cancer Res, 2014
Audia S, Samson M, Mahévas M, Ferrand C, Trad M, Ciudad M, Gautheron A, Seaphanh F, Leguy V,
Berthier S, Salles B, Martin L, Lorcerie B, Ortega-Deballon P, Facy O, Caillot D, Soudry-Faure A, Michel
M, Godeau B, Larmonier N, Saas P, Janikashvili N, Bonnotte B. Preferential splenic CD8(+) T-cell
activation in rituximab-non responder patients with immune thrombocytopenia. Blood, 2013
Trad M, Centuori SM, LaCasse CJ, Alizadeh D, Larmonier CB, Hanke NT, Kartchner J, Janikashvili N,
Bonnotte B, Larmonier N, Katsanis E. Myeloid-derived suppressor cells from tumor-bearing mice
impair TGF-β-induced differentiation of CD4+CD25+FoxP3+ Tregs from CD4+CD25-FoxP3- T cells. J
Leukoc Biol, 2012
Samson M, Audia S, Janikashvili N, Ciudad M, Trad M, Fraszczak J, Ornetti P, Maillefert JF, Miossec P,
Bonnotte B. Brief report: inhibition of interleukin-6 function corrects Th17/Treg cell imbalance in
patients with rheumatoid arthritis. Arthritis Rheum, 2012
Samson M, Audia S, Fraszczak J, Trad M, Ornetti P, Lakomy D, Ciudad M, Leguy V, Berthier S, Vinit J,
Manckoundia P, Maillefert JF, Besancenot JF, Aho-Glele S, Olsson NO, Lorcerie B, Guillevin L,
34
Mouthon L, Saas P, Bateman A, Martin L, Janikashvili N, Larmonier N, Bonnotte B. Th1 and Th17
lymphocytes expressing CD161 are implicated in Giant Cell Arteritis and Polymyalgia Rheumatica
Pathogenesis. Arthritis Rheum, 2012
35

Laboratoire d`accueil - Les formations à l`université de Bourgogne

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