PubMed - BioKemika
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Gliederung PubMed Suchanfrage aufbauen Einführung Volltext Wiederholung Bonus Literatur auf NCBI: PubMed, MEDLINE, PMC PubMed Suche -------------------------------------MeSH Datenbank Journal Datenbank Autor Tabellen -------------------------------------Advanced Search, Felder, Limits, Filter -------------------------------------Entrez Link-Out Pubmed Central Volltext-Datenbanken -------------------------------------Zusätzliche Features und My NCBI 1 Gliederung PubMed Suchanfrage aufbauen Einführung Volltext Wiederholung Bonus Literatur auf NCBI: PubMed, MEDLINE, PMC PubMed Suche -------------------------------------MeSH Datenbank Journal Datenbank Autor Tabellen -------------------------------------Advanced Search, Felder, Limits, Filter -------------------------------------Entrez Link-Out Pubmed Central Volltext-Datenbanken -------------------------------------Zusätzliche Features und My NCBI 2 Literatur auf NCBI PMC PubMed Central • Öffentlich frei zugängliche Volltext-Literatur => Volltext-Datenbank. • Alle durch NIH-Mittel (National Institutes of Health) geförderte Forschungen müssen in PMC frei zugänglich gemacht werden (Open Access-Gesetz seit 2008). MEDLINE Medical Literature Analysis and Retrieval System Online • Von NCBI entwickelte bibliographische Datenbank der NLM (National Library of Medizine). • umfasst bibliographische „Zitate“ aus allen Bereichen der Biomedizin. • Wahl der indexierten Journals durch Literature Selection Technical Review Committee. • Statistik: >19 Millionen Zitate aus >5600 Journals. ~2k neue Referenzen pro Tag. • Die Zitate umfassen zum großen Teil auch Zusammenfassungen der Artikel (Abstracts). • seit 1966 OLDMEDLINE • Zwischen 1946-1965. • Etwa 2 Millionen Zitate. 3 Literatur auf NCBI PubMed • Primäres System für Literatur-Suche im biomedizinischen Bereich => Suchmaschine • Kostenlose Recherche von Zitaten in verschiedenen Datenbanken. • MEDLINE • OLDMEDLINE • PMC • Journal-Archive • PubMed enthält Verlinkungen zu den Volltext-Artikeln in PMC (kostenlos) oder den LifeScience Journals (teilweise kostenpflichtig). • PubMed verwaltet Kreuz-Referenzen zu anderen Datenbanken => Referenz-Datenbank. Assoziierte Daten: Nucleotide Gene Protein PubChem … PubMed Verlinkungen Referenz-Datenbank Volltext: PMC Journal Archive Suche Suchmaschine Zitation: MEDLINE OLDMEDLINE PMC Journal Archive 4 Das MEDLINE Format PMID = PubMed ID VI = Volume | IP = Issue DP = Date Published (Veröffentlichungsdatum) TI = Title PG = Pages AB = Abstract In PubMed suchbare Felder* 5 *nicht alle Felder sind in PubMed durchsuchbar Das MEDLINE Format AD = Affiliation (Instituts-Zugehörigkeit) AU = Author PT = Pubilkations-Art (Artikel, Review, …) TA = Journal Titel (Kürzel) JT = Journal Titel JID = Journal ID AID = Artikel ID (doi) PST = Publication status • ppublish – Print-Version publiziert. • epublish – ausschließlich elektronische Version publiziert. • aheadofprint – elektronische Version publiziert, Print-Version folgt. Kreuz-Referenzen sind im SI = Secondary Source ID Feld, z.B. • SI - GENBANK/AF306859 • SI - SWISSPROT/P13209 6 Gliederung PubMed Suchanfrage aufbauen Einführung Volltext Wiederholung Bonus Literatur auf NCBI: PubMed, MEDLINE, PMC PubMed Suche -------------------------------------MeSH Datenbank Journal Datenbank Autor Tabellen -------------------------------------Advanced Search, Felder, Limits, Filter -------------------------------------Entrez Link-Out Pubmed Central Volltext-Datenbanken -------------------------------------Zusätzliche Features und My NCBI 7 Suchen mit PubMed trial-and-error willkürliche, unstrukturierte Eingabe von Stichworten, Autoren, Jahreszahlen etc. Google-ähnliche Methode, mit der man oft schon sehr weit kommt. 8 Ergebnis Ausgabe Summary-Format • Ergebnis-Filter: zeigt nur Reviews oder nur Zitationen mit Links zu kostenlosem Volltext an. • Titles with your search terms: zeigt Ergebnisse, bei denen Suchbegriffe im Titel vorkommen. • Search Details: zeigt die Interpretation der Suchanfrage an. • Find related data: Kreuz-Referenzen zwischen Ergebnissen und anderen NCBI-Datenbanken. • Recent activity: zeigt den Suchverlauf an. 9 Ergebnis Ausgabe Andere Formate wählbar Ergebnis markieren Ergebnis Nr. Journal (Abkürzung) PubMed ID Link zur Liste verwandter Artikel Summary Format Titel der Publikation Autoren Seitenzahl Volume(Issue) Nummer Datum der Publikation 10 Ergebnis Ausgabe Abstract-Format Related Citations: Liste mit verwandten Artikeln, die neuer sein können als der ausgewählte. Option: Reviews zeigen. Zusammenfassung (Abstract) MeSH Terms: Keywords, die Inhalte der Artikels beschreiben Liste mit PMC-Artikeln, die ausgewählten Artikel zitieren. LinkOut: Links zu Datenbanken, die den Volltext enthalten 11 Das kannst du mit PubMed nicht finden… • Namen, die mehr als 10 Buchstaben enthalten und in Autor-Listen älterer Paper stehen (vor 1995) • Abstracts und Referenzen für Einträge von älteren Papern (vor 1976) • Alte Paper können überhaupt nicht gefunden werden (vor 1965) Hier hilft nur der Weg in die Bibliothek! Dies ist allerdings meist nur beim Schreiben historischer Reviews notwendig. 12 Gliederung PubMed Suchanfrage aufbauen Einführung Volltext Wiederholung Bonus Literatur auf NCBI: PubMed, MEDLINE, PMC PubMed Suche -------------------------------------MeSH Datenbank Journal Datenbank ATM Autor Tabellen -------------------------------------Advanced Search, Felder, Limits, Filter -------------------------------------Entrez Link-Out Pubmed Central Volltext-Datenbanken -------------------------------------Zusätzliche Features und My NCBI 13 ATM • Eingabe von Keywords ohne Feld-Definition => ATM (automatic term mapping) • Vergleich der Suchbegriffe mit drei Datenbanken in definierter Reihenfolge. MeSH-Database (Medical Subject Headings) • standardisiertes System von Stichworten (Vokabular), nach denen alle MEDLINE/PubMedEinträge katalogisiert bzw. indexiert werden. • ermöglichen die inhaltliche Erschließung der Artikel. Journals-Database • Liste mit Journals aus PubMed und NCBI, deren Abkürzungen (abbrevations) und ISSNNummern sowie weitere Informationen wie der Zeitraum, in dem das Journal erschien. Autoren-Tabellen • 4 Verschiedene Tabellen mit Autoren-Namen. • Wenn alle Suchbegriffe gefunden wurden, wird das atm vorzeitig beendet. • Die entsprechenden Begriffe werden dann mit den Feldern erweitert • [MeSH Terms] [Journal] [Author] 14 ATM Die eigentliche Suche erfolgt dann mit den gefundenen standardisierten Einträgen oder der Sucheingabe im Feld [All Fields]. Tatsächliche Suchanfrage (Interpretation der Sucheingabe) ist unter „Search Details“ sichtbar. All Fields = Durchsucht wird ein Teil der Felder im MEDLINE-Format, dazu zählen u.a. • Titel • Abstract • Keywords • Autor • Journal • Dazu zählt nicht der Volltext! ATM bei einer Serie von Suchbegriffen (1) Suche nach der gesamten Begriffsfolge („“) und seinen MeSH-Termen. (2) Die Begriffsfolge wird von rechts um je einen Begriff verkürzt + Neue Suche der kürzeren Begriffsfolge (3) Suche der Einzelbegriffe mit UND-Verknüpfung. (4) Sortierung der Ergebnisse nach Gewichtung. 15 ATM Beispiel Eingabe: abergel c dUTPase Interpretation: abergel c[Author] AND ("dUTP pyrophosphatase"[Supplementary Concept] OR "dUTP pyrophosphatase"[All Fields] OR "dutpase"[All Fields]) “dUTP pyrophosphatase” stammt aus der MeSH-Übersetzungstabelle Die einzelnen Suchbegriffe werden AND-verknüpft Aus derselben Sucheingabe abgeleitete Terme werden OR-verknüpft Beachte: Klammersetzung 16 Gliederung PubMed Suchanfrage aufbauen Einführung Volltext Wiederholung Bonus Literatur auf NCBI: PubMed, MEDLINE, PMC PubMed Suche -------------------------------------MeSH Datenbank Journal Datenbank Autor Tabellen -------------------------------------Advanced Search, Felder, Limits, Filter -------------------------------------Entrez Link-Out Pubmed Central Volltext-Datenbanken -------------------------------------Zusätzliche Features und My NCBI 17 MeSH Database Medical Subject Headings Standardisiertes Vokabular für Literatur vgl. Gene Ontology für Gene/Proteine. Da MeSH-Begriffe PubMedArtikeln zugeordnet werden, können Artikel in PubMed über MeSH-Begriffe gesucht werden. 18 Ergebnis Ausgabe • Stichwort-Suche nach standardisiertem Vokabular (insgesamt ca. 25.000 Einträge) • Summary Format der Suchausgabe liefert MeSH-Begriffe mit Definition. 19 Ergebnis Ausgabe Abstract / Definition des MeSH Subheadings sind Unterbegriffe des MeSH, z.B. History, Trends, Methods Entry Terms sind alternative Bezeichnungen, über die der MeSH gefunden werden kann. Previous Indexing: veraltete Zuordnung des MeSH Die MeSH-Terme sind in 15 thematische Hauptkategorien geordnet und polyhierarchisch aufgebaut (eignet sich zur Suche von verwandten Themen und Unterthemen). Ein MeSH kann mehrmals innerhalb der Hierarchie auftauchen. 20 Suche in der MeSH-Datenbank Related Informations PubMed – zeigt alle PubMed-Einträge mit diesem MeSH. PubMed – Major Topic – zeigt alle PubMed-Einträge, die den MeSH als Hauptthema haben. NLM MeSH Browser – zeigt den MeSHEintrag auf NLM, inklusive einer vollständigeren Baum-Hierarchie 21 Suche in der MeSH-Datenbank Aufbau einer Suchanfrage für PubMed • Entsprechende Häkchen setzen, Operator auswählen, dann Add to Search Builder klicken. • Wenn Suchanfrage steht, Search PubMed klicken. Klickbare Häkchen: • verschiedene MeSH. • Subheadings – weitere Einschränkung eines gewählten MeSH (Spezifizierung). • Restrict Search to Major Topic – MeSH als Major Topic einschränken, wodurch nur Artikel gefunden werden, die diesen MeSH als zentralen Aspekt haben. • Do not explode this Term – MeSHEinträge unterhalb der Hierarchie des ausgewählten MeSH aus Suche ausschließen. Wichtig: Bei PubMed-Suchen mit MeSHBegriffen werden ältere Artikel nicht gefunden. Grund: fehlende Annotierung! 22 Gliederung PubMed Suchanfrage aufbauen Einführung Volltext Wiederholung Bonus Literatur auf NCBI: PubMed, MEDLINE, PMC PubMed Suche -------------------------------------MeSH Datenbank Journal Datenbank Autor Tabellen -------------------------------------Advanced Search, Felder, Limits, Filter -------------------------------------Entrez Link-Out Pubmed Central Volltext-Datenbanken -------------------------------------Zusätzliche Features und My NCBI 23 NLM Katalog • Zur erfolgreichen PubMed-Suche werden entweder die korrekten Journal Bezeichnungen oder offiziellen Kürzel benötigt. • Der NLM Katalog enthält bibliographische Daten für Journals, Bücher, Software, elektronische Ressourcen etc. pp. 24 NLM Katalog • Einschränkungen möglich, für PubMed-Suchen nach aktueller Literatur sinnvoll: • Material Type / Journals (Currently Published) • Journal Subsets / Only PubMed Journals • Links to Full Text 25 NLM Katalog • Sucht in NLM Katalog mit Limit: Material Type / Journals (All) • Einfachere Suche nach Journals: Autocomplete Funktion Journals nach Themen-Gebieten • Browsing von Themen-Gebieten • Weiterleitung zur Liste aller Journals zum Thema in NLMKatalog Ergebnis Übersicht. 26 NLM Katalog Sortierung nach Publikationsdatum: Neue Journals vorne! Aufbau einer Suchanfrage für PubMed • Entsprechende Häkchen setzen, dann Add to Search Builder klicken. • Wenn Suchanfrage steht, Search PubMed klicken. 27 NLM Katalog Katalog-Eintrag • Titel und offizielle Abkürzung des Journals • Erste Veröffentlichung • Frequenz der Veröffentlichung • Publisher • ISSN • • • • Link zur Homepage des Journals Indexierung in MEDLINE, PubMed… Assoziierte MeSH Art der Publikationen 28 Gliederung PubMed Suchanfrage aufbauen Einführung Volltext Wiederholung Bonus Literatur auf NCBI: PubMed, MEDLINE, PMC PubMed Suche -------------------------------------MeSH Datenbank Journal Datenbank Autor Tabellen -------------------------------------Advanced Search, Felder, Limits, Filter -------------------------------------Entrez Link-Out Pubmed Central Volltext-Datenbanken -------------------------------------Zusätzliche Features und My NCBI 29 Suche nach Autoren Nomenklatur für Autoren-Namen Vor 2002 [Nachname] [Initialen der ersten beiden Vornamen] [Suffix-Abkürzung] Meyer DJ jr Seit 2002 zusätzlich [Nachname], [Vorname] Abele, Rupert Trunkierung Gottschalk A findet auch Gottschalk AR „Gottschalk A“ unterbindet Trunkierung Umlaute Dötsch => Dotsch; Doetsch wird daher nicht gefunden. Beide Varianten sollten ausprobiert werden, da Journals Namen unterschiedlich speichern. 30 Suche nach Autoren Für das ATM dienen vier Datenbanken • Full Author translation table (ab 2002) • Author-Index • Full Investigator translation table (ab 2002) • Investigator Index Dies hat Konsequenzen bei der Suche von Artikeln auf Basis von Autoren-Namen: „Rupert Abele“ oder „Abele, Rupert“ „Abele R“ =ATM=> Abele, Rupert[Full Author Name] =ATM=> Abele R[Author] Im ersten Fall werden nur Artikel gefunden, die seit 2002 veröffentlicht wurden. Im zweiten Fall werden auch Artikel von Rupert Abele gefunden, die älter sind. 31 Gliederung PubMed Suchanfrage aufbauen Einführung Volltext Wiederholung Bonus Literatur auf NCBI: PubMed, MEDLINE, PMC PubMed Suche -------------------------------------MeSH Datenbank Journal Datenbank Autor Tabellen -------------------------------------Advanced Search, Felder, Limits, Filter -------------------------------------Entrez Link-Out Pubmed Central Volltext-Datenbanken -------------------------------------Zusätzliche Features und My NCBI 32 PubMed: Advanced Search Advanced Search Builder baut Suchanfrage stetig auf. Auswahl des Feldes für den Suchbegriff Auswahl des Operators zur Verknüpfung der Suchbegriffe Autocomplete-Funktion / Show index list je nach Feld wird auf verschiedene Indices zurück gegriffen und alle Begriffe gelistet, die den eingegebenen Wortstamm haben. Tipp: Wenn zuvor Teil-Suchanfragen für PubMed in MeSHDatenbank oder NLM-Katalog aufgebaut wurden, nutze die Nummer in der History, um diese miteinzubeziehen. 33 Felder in PubMed Eine kleine Auswahl • [ALL] = [all fields] – alle Terme, die im automatic term mapping zu keinem spezifischen tag passen erhalten diesen tag. Der Suchbegriff wird in der gesamten MEDLINE-Zitation gesucht. • [TW] = [Text Word] • [TI] = [Title] – Der Begriff muss im Titel der Publikation vorkommen. • [TIAB] – Der Begriff muss im Titel oder Abstract der Publikation vorkommen. • [RN] = [EC/RN Number] – sucht Publikationen über das Enzym mit dieser EC-Klassifizierung. • [MH] = [MeSH Terms] • [MAJR] = [MeSH Major Topic] • [SH] = [MeSH Subheadings] • [AU] = [Author] – findet Autoren (Nomenklatur: Meyer DJ jr) • [Full Author Name] – findet Autoren (Nomenklatur: Meyer, James) • [PT] = [Publication Type] – Beispiele: Review, Biography, Comment, Journal Article, Letter etc. • [IP] – Issue (Heft) • [VI] – Volume (Band) • [TA] – Titel des Journals (Format: Title Abbreviation, voller Titel oder ISSN Nummer) • [DP] – Pubilationsdatum (Formate: YYYY/MM/DD, YYYY/MM, YYYY, „last x days“, „last x months“, „last x year“) 34 Suchen mit Limits Sinnvolle Einschränkungen: • Sprache des Artikels • Filter (z.B. nur Artikel mit freiem Volltext) Limit-Funktion ist teilweise redundant • Artikel-Typ (Paper, Review…) mit der Advanced-Search Funktion… • Publikationsdatum • sogar Such-Felder! Achtung! Wird für alle Suchbegriffe angewendet! 35 Filter als Feld in PubMed (Ersatz und Erweiterung der Limits) [SB] = [Filter] Viele Möglichkeiten die Ergebnisse zu filtern, hier eine winzige Auswahl: Literatur mit Link-Out Ressourcen • loall – Zitationen mit LinkOut Links in PubMed. • free full text – Zitationen mit einem Link zu einem freien Volltext. • full text – Zitationen mit einem Link zu einem Volltext. Artikel-Typ: • Comment | Review | Letter | News … Aktuelle Literatur • Entered last month – Artikel, die im letzten Monat in MEDLINE aufgenommen wurden. • future ppdat – Artikel, die noch nicht in Print Version publiziert wurden. Alte Literatur • oldmedline – Artikel vor 1966 36 Gliederung PubMed Suchanfrage aufbauen Einführung Volltext Wiederholung Bonus Literatur auf NCBI: PubMed, MEDLINE, PMC PubMed Suche -------------------------------------MeSH Datenbank Journal Datenbank Autor Tabellen -------------------------------------Advanced Search, Felder, Limits, Filter -------------------------------------Entrez Link-Out Pubmed Central Volltext-Datenbanken -------------------------------------Zusätzliche Features und My NCBI 37 Link-Out Merke: Alle Verlinkungen auf NCBI zu externen Ressourcen werden über das Link-Out System verwaltet • LinkOut ist eine Entrez Datenbank, die Verlinkungen enthält. • LinkOut-Einträge müssen von den NCBI-externen Datenbanken beantragt werden. • Verlinkung von Entrez-Datenbanken zu anderen Informationssystemen. • Vernetzung von Informationen – keine erneute Suche notwendig. 38 Link-Out • Link-Out Ressourcen sind mit vielen PubMed-Einträgen verknüpft. • Link-Out / Full Text Sources häufig kostenpflichtig • Wenn keine Link-Out Ressource vorhanden, heißt dies nicht, dass kein digitaler Volltext existiert. Verlinkungen auf NCBI-externen Ressourcen Volltexte, Kommentare zum Artikel, Support-Infos, BioDatenbanken… 39 Link-Out Schnell-Link zum Volltext Tipp: Von welchem Journal das Icon angezeigt wird, kann eingestellt werden, sodass bevorzugt die Journals verlinkt werden, welche die Goethe Uni abonniert hat (MyNCBI). 3 Typen von Icon-Volltext-Links Priorität der Anzeige PMC Free full text Full text kostenlos auf PMC kostenlos auf Journal-Seite kostenpflichtig auf Journal-Seite 40 Link-Out Link-Out Startseite Link-Out Provider verlinken zwischen Entrez und der externen Ressource. Sie sind für die Verlinkungen verantwortlich. Alphabetische Liste nach Journal-Titel oder Provider möglich 41 Link-Out Sortiert nach Provider Liste von Providern mit zugeordneten Journals Provider Kürzel in Klammern Vom Provider in LinkOut verlinkte Journals. Merke: Ein Provider verlinkt mehrere Journals und dasselbe Journal kann durch mehrere Provider verlinkt werden! Sortiert nach Titel Liste von Journals mit zugeordneten Providern Journal-Titel Provider, welche das Journal verlinken. 42 Link-Out PubMed-Suche mit Link-Out Filter Such-Einschränkung über LinkOut-Ressourcen möglich: loprovNameAbbr [filter] NameAbbr = Kürzel des Providers Alle Ergebnisse enthalten Links zu Volltext-Artikeln von diesem LinkOut-Provider! 43 Gliederung PubMed Suchanfrage aufbauen Einführung Volltext Wiederholung Bonus Literatur auf NCBI: PubMed, MEDLINE, PMC PubMed Suche -------------------------------------MeSH Datenbank Journal Datenbank Autor Tabellen -------------------------------------Advanced Search, Felder, Limits, Filter -------------------------------------Entrez Link-Out Pubmed Central Volltext-Datenbanken -------------------------------------Zusätzliche Features und My NCBI 44 PubMed Central • >10% der PubMed indexierten Artikel haben in PMC den Volltext hinterlegt. Dieser ist dann frei zugänglich. • Eine Suche in PMC ist nicht notwendig, da Kreuz-Referenzen in PubMed existieren. 45 Freier Volltext aus PMC LinkOut-Icons für PMC-Artikel 46 Freier Volltext aus PMC Author-Manuscript in PMC Warum? • Durch NIH geförderte Wissenschaftler müssen Ergebnisse in PMC veröffentlichen. • Viele publizieren jedoch in Journals, die nicht in PMC verfügbar sind. • In PMC wird ersatzweise das finale Manuskript des Artikels veröffentlicht. Was ist das? • Ergebnis des Review-Prozesses durch Gutachter und Editoren des Journals • Das finale Manuskript vor der Publikation => Dieselben Inhalte wie der publizierte Artikel. • Formatierung und Style unterscheiden sich im Vergleich zum publizierten Artikel. 47 Freier Volltext aus PMC Bei Autor Manuskript: => Verweis auf den publizierten Artikel. Bei PMC-Artikel: => Link zur Journal-Seite auf PMC. Anzeige im HTML-Format, Download im pdf-Format möglich Zeigt PubMed Artikel der Autoren Struktur eines PMC-Artikels Zeigt Eintrag des Artikels in PubMed Keywords: Die hier angezeigten Begriffe werden zusätzlich von der Suche indexiert. Anzeige verwandter Artikel, auch zu Inhalten von Artikel-Abschnitten. 48 Gliederung PubMed Suchanfrage aufbauen Einführung Volltext Wiederholung Bonus Literatur auf NCBI: PubMed, MEDLINE, PMC PubMed Suche -------------------------------------MeSH Datenbank Journal Datenbank Autor Tabellen -------------------------------------Advanced Search, Felder, Limits, Filter -------------------------------------Entrez Link-Out Pubmed Central Volltext-Datenbanken -------------------------------------Zusätzliche Features und My NCBI 49 STM-Bereich Science, Technology, Medicine Überblick: Wichtige Volltext-Datenbanken ScienceDirect http://www.sciencedirect.com >2000 Journals | >20.000 Bücher | >11 Millionen Artikel Nature Publishing Group http://www.nature.com Science AAAS Wiley Interscience http://onlinelibrary.wiley.com >2000 Journals | >11.000 Bücher http://www.sciencemag.org Thieme Connect http://www.thieme-connect.de Springer Online http://www.springerlink.com/books >30.000 Bücher | Jährlich 4500 neue Bücher Thomson Scientific http://www.thieme-connect.de Merke: Die Volltext-Datenbanken beschränken sich nicht nur auf den Bereich Biomedizin Merke: Volltext-Datenbanken enthalten selten kostenfreie Inhalte. Es sind Logins über Instituts-Accounts nötig, die Lizenzen für ihre Mitarbeiter gekauft haben – oder über Universitäts-Account für Studenten. 50 Die Volltextdatenbanken können auch direkt durchsucht werden. PubMed ist nur ein Umweg. Gründe FÜR diesen Umweg: • Jede Volltextdatenbank „funktioniert“ anders. • Wozu all das Lernen, wenn man alles über PubMed erreichen kann? Man muss an vielen Stellen suchen • Meist keine Spezialisierung auf biomedizinische Artikel. • Nur Artikel aus dem jeweiligen Verlag/Journal. Das was man sucht ist nicht vorhanden • Größtenteils kostenpflichtige Artikel. • Oft weniger Möglichkeiten der Spezifizierung von Suchanfragen. Das was man sucht findet man nicht oder der Zugang wird verwehrt • Keine Verlinkungen zu anderen Ressourcen. Ähnliche Artikel? Struktur des Proteins? Fehlanzeige! 51 Gliederung PubMed Suchanfrage aufbauen Einführung Volltext Wiederholung Bonus Literatur auf NCBI: PubMed, MEDLINE, PMC PubMed Suche -------------------------------------MeSH Datenbank Journal Datenbank Autor Tabellen -------------------------------------Advanced Search, Felder, Limits, Filter -------------------------------------Entrez Link-Out Pubmed Central Volltext-Datenbanken -------------------------------------Zusätzliche Features und My NCBI 52 PubMed: Clipboard • Im Clipboard können Suchergebnisse (max. 500) zwischengespeichert werden. • Nach 8h Inaktivität wird das Clipboard gelöscht. • Auswahl der Zitate über Check-Boxen „Send to“ Clipboard • Das Clipboard ist dann auf jeder Seite innerhalb der PubMed-Suchmaschine erreichbar. • Einzelne Einträge können dann wieder aus dem Clipboard gelöscht werden. 53 PubMed: Speichern der Ergebnisse • Über das Menü „Send to“ können aus dem Clipboard oder der normalen Ergebnis-Anzeige markierte Zitationen in eine Datei gespeichert werden. • Um Zitation in eine persönliche Literaturdatenbank (wie Citavi) aufzunehmen ist MEDLINE Format erforderlich. 54 PubMed: Kreuz-Referenzen Related Information Von PubMed aus erhält man sämtliche mit dem Artikel assoziierte Daten. Artikel mit sehr viele Kreuz-Referenzen Tipp: Notiere immer die PMID. Über diese kannst du in anderen Datenbanken direkt assoziierte Informationen finden! 55 My NCBI • Jede NCBI-Seite ermöglicht das Login zu My NCBI. My NCBI umfasst alle NCBI-Datenbanken. • Registrierung erfordert lediglich Benutzername/Passwort und eMailAdresse. Sehr schnell… Features (Auswahl): • Speicherung von Suchanfragen (Recent Activity: 6 Monate) • Speicherung von Suchergebnissen in einer selbst verwaltbaren OrdnerStruktur (Collections). • Veröffentlichung der Collections möglich (Direkt-Link kann per email versandt werden). • eMail Benachrichtigung, wenn Suchanfrage Ergebnis liefert (z.B. neues Review zu einem spezifischen Thema). • Personifizierte Such-Filter anlegen (z.B. sodass nur Artikel aus Journals angezeigt werden, 56 die entweder in PMC oder von der Uni FFM abonniert wurden).