docUtdrag ur Ackrediteringens omfattning MIK3241-14
download 
Report Transcription
Utdrag ur Ackrediteringens omfattning MIK3241-14
1 (13) 2015-10-06 Klinisk mikrobiologi Utdrag ur Ackrediteringens omfattning MIK3241-14 Komponent System Metod B. pertussis IgG- och IgA-Ak S/P EIA Borrelia IgG- och IgM-Ak S/P EIA Borrelia IgG- och IgM-Ak S/P/Csv EIA Chlamydophila IgG- och IgM-Ak S EIA Difteri toxin-Ak S NT Helicobacter pylori IgG-Ak S Mycoplasma pneumoniae IgG- och IgM-Ak Enhet Nivå/Mätosäkerhet Ort Bakteriologisk diagnostik Antikroppsbestämning PT-IgG Immunitet CV<10% Övriga: Påvisade/Gränsvärde/Negativ Påvisade/Gränsvärde/Negativ Serum Borr IgG CV < 20%, IgM 30 %; csv Borr IgG CV <15%, IgM CV =15% S S S Påvisade/Gränsvärde/Negativ S +/- 1 titersteg S EIA Positiv/Gränsvärde/Negativ S S EIA Påvisade/Gränsvärde/Negativ S Syfilis IgG- och IgM-Ak S/P CMIA CV <20% H, S Syfilis IgM-Ak S EIA CV < 10% S Syfilis TPPA S/P/Csv AGGL +/- 1 titersteg S Syfilis VDRL S/P/Csv FLOCKN +/- 1 titersteg S Tetanus IgG-Ak S EIA CV < 10 % S IU/ml IU/ml 2 (13) Komponent System Metod Enhet Nivå/Mätosäkerhet Ort Bakterier och svamp Blod ODL AE+AN Växt/Ingen växt H, S Bakterier och svamp Csv ODL AE+AN Växt/Ingen växt H, S Svamp Blod ODL Växt/Ingen växt H, S Meningitbakterier DNA CSV/ isolat PCR Positiv/Negativ H, S F PCR Positiv/Negativ H, S S Blod/Cerebrospinalvätska Faeces Clostridium difficile-toxin B-DNA EHEC-, EPEC-, ETEC- och EIEC-DNA F PCR Positiv/negativ, vt1- och/eller vt2-, eaeA- och bfpA-, eltBoch/eller estA-, ial-generna har påvisats/ej påvisats Helicobacter pylori-Ag F IMKR Positiv/Negativ S Patogena tarmbakterier (Salmonella, Shigella, Yersinia, Campylobacter, Aeromonas, Plesiomonas, Vibrio, Clostridium difficile) F ODL Växt/Ingen växt H, S Cervix/Uretra ODL Växt/Ingen växt H, S NAT; SDA Positiv/Negativ H Genitala prov Bakterier och svamp Chlamydia trachomatis-/Neisseria gonorrhoeae- Cervix/Uretra/U/ DNA Vaginalsekret Mycoplasma genitalium-DNA U/ Cervix- och uretrasekret i urin PCR Positiv/Negativ H Neisseria gonorrhoeae Sekret/cervix/Uretra/ Rektum ODL Växt/Ingen växt H Neisseria gonorrhoeae-DNA Sekret/cervix/Uretra/ Rektum PCR Positiv/Negativ H 3 (13) Komponent System Metod Enhet Nivå/Mätosäkerhet Ort Arcanobacterium haemolyticum Sekret/ svalg ODL Växt/Ingen växt Bordetella pertussis/ parapertussis-DNA Nf-aspirat/Nfsekret/Svalgsekret/Trakealsekret/Br onksekret/BAL/CSV/Sputu m PCR Påvisad/ej påvisad S Chlamydophila pneumoniae-DNA Nf-aspirat/Nfsekret/Svalgsekret/Trakealsekret/Br onksekret/BAL/CSV/Sputu m PCR Påvisad/Ej påvisad S Corynebacterium diphtheriae Sekret/svalg/sår ODL Växt/Ingen växt S Legionella BAL/luftvägar/sekret/vä vnad/ kultur ODL och/eller MIKR, IF Växt/Ingen växt S Legionella species-DNA Sekret/BAL/Sputum PCR Påvisad/Ej påvisad S Legionella pneumophila-DNA Nf-aspirat/Nfsekret/Svalgsekret/Trakealsekret/Br onksekret/BAL/CSV/Sputu m PCR Påvisad/Ej påvisad S Icke-tuberkulösa mykobakterier Kultur SEKV Artbestämning S Mycobacterium tuberculosis-komplexet- och Mykobakterier-DNA Kultur PCR/ HYBR Art och resistensbestämning S Mycobaterium tuberculosis-DNA Sekret/vävnader/kropps PCR vätskor Påvisad/ Ej påvisad S Luftvägar H, S 4 (13) Komponent System Metod Enhet Nivå/Mätosäkerhet Ort Mykobakterier Sekret/vävnader/kropps MIKR vätskor Förekomst/Ingen förekomst S Mykobakterier Sekret/vävnader/kropps ODL vätskor Växt/Ingen växt S Mykobacterium tuberculosis-komplexet Kultur RES S/R S Mycoplasma pneumoniae- DNA Nf-aspirat/Nfsekret/Svalgsekret/Trakealsekret/Br onksekret/BAL/CSV/Sputu m PCR Påvisad/ Ej påvisad S Patogena luftsvägbakterier Sekret/Nf/svalg ODL Växt/Ingen växt H, S Patogena bakterier och svamp BAL/Borste/Bronk/gingi va/sinus ODL Växt/Ingen växt H, S Patogena bakterier och svamp Sekret från bronk /trakea/trakealtub ODL Växt/Ingen växt H, S Patogena bakterier och svamp Sputum ODL Växt/Ingen växt H, S Sekret/pus/punktat/drän age/ Vävnad/pleura ODL AE+AN kateter/faeces Växt/Ingen växt H, S Legionella pneumophila-Ag U EIA Påvisat/Ej påvisat Patogena bakterier U ODL Växt/Ingen växt Kultur Maldi-TOF Sår/Sekret Patogena bakterier Urin S H, S Övrigt, bakteriologisk diagnostik Artbestämning av bakterier H, S 5 (13) Komponent System Metod Enhet Nivå/Mätosäkerhet Ort Bestämning av MIC, minsta hämmande koncentration antibiotika Resistensbestämning Kultur RES, mik mg/mL Resistensbestämning Kultur RES; DISK H, S Artbestämning av jästsvamp och mögelsvamp Kultur Maldi-TOF H, S Aspergillus-Ag S/BAL/Bronk EIA Påvisad/Ej påvisad S Aspergillus-DNA Blod/P/Sputum/Bal/ Vävnad PCR Positivt/Negativt H Cryptococcus-Ag S/Csv Lateral Flow Assay Negativt/Positivt/Påvisad/ Ej påvisad Dermatofyter, jästsvamp, mögelsvamp Hud-, nagelskrap/hår ODL Växt/Ingen växt S Dermatofyt-DNA Nagel/Hudskrap från fötter PCR Positivt/Negativt S Pneumocystis jiroveci-DNA BAL, sputum PCR Positivt/Negativt H Resistensbestämning Kultur EUCAST mg/L S Resistensbestämning Kultur NCCLS mg/L S Resistensbestämning Kultur RES, mik mg/L H, S Resistensbestämning av jästsvamp och Aspergillus mögelsvamp Isolat RES, mik mg/L H, S Svamp Sekret/vävnader/kropps MIKR vätskor Fynd/ Inga fynd H, S Svamp Sekret/vävnader/kropps ODL vätskor Växt/Ingen växt H, S Trichophyton interdigitale-DNA Nagel/Hudskrap från fötter Positivt/Negativt S H, S Mykologisk diagnostik PCR H, S 6 (13) Komponent System Metod Enhet Nivå/Mätosäkerhet Ort Trichophyton rubrum-DNA Nagel/Hudskrap från fötter PCR Positivt/Negativt Candida-arter Blod (från blod odlingsflaskor) PNA FISH Hybridisering Påvisat/Ej påvisat H, S Cryptosporidier F MIKR Påvisad/Ej påvisad H Cystor och maskägg F MIKR Påvisad/Ej påvisad H Leishmania Benmärg/sår MIKR Påvisad/Ej påvisad H Malaria Blod MIKR Påvisad/Ej påvisad H, S Mikrofilaria Blod MIKR Påvisad/Ej påvisad H Mikrofilaria Hud MIKR Påvisad/Ej påvisad H Schistosoma U, Rektal vävnad MIKR Påvisad/Ej påvisad H Springmask, Enterobius vermicularis Tapeprov MIKR Påvisad/Ej påvisad H Strongyloides F ODL Påvisad/Ej påvisad H Toxoplasma gondii IgG-Ak S/P CMIA Påvisade/Gränsvärde/Negativ S Toxoplasma gondii IgM-Ak S/P CMIA Påvisade/Gränsvärde/Negativ S Toxoplasma gondii-DNA Fostervatten PCR Positivt/Negativt H Trophozoiter F, färskprov MIKR Påvisad/Ej påvisad H Trypanosoma Blod MIKR Påvisad/Ej påvisad H Bacillus subtilis och Bacillus stearotermophilus Sportest, autoklav och torrsterilisator ODL Sterilt/Osterilt H Bakterier Bassängvatten ODL S Parasitologisk diagnostik Vårdhygienisk diagnostik cfu/mL S 7 (13) Komponent System Metod Enhet Nivå/Mätosäkerhet Ort Bakterier Cellodlingsmedier mm, med och utan antibiotika, samt graft, benbitar mm ODL cfu/mL H, S Bakterier Modersmjölk ODL cfu/mL H Bakterier Övrigt vatten ODL cfu/mL S Bakterier Trombocytkoncentrat och andra blodprodukter ODL cfu/mL H, S Bakterier och svamp Renat vatten, hemodialysvätska ODL cfu/mL S Bakterier och svamp Hemofiltrationsvätska ODL cfu/mL S Bakterier och svamp Sköljvätska från endoskopdiskdesinfekt or, ODL cfu/mL S Endotoxin Vatten EndoSafeMCS system EU/mL S ESBL, screening F/Sekret/U ODL Växt/Ingen växt H, S Legionella Vatten ODL Växt/Ingen växt S MRSA, nuc screening Näsa/Sekret/U PCR Påvisad/Ej påvisad/ Positiv/Negativ H, S MRSA, verifiering Kultur PCR Påvisad/Ej påvisad/ Positiv/Negativ H, S VRE, screening F/Sekret/U PCR Positiv/Misstänkt positiv/Negativ H VRE verifiering Kultur PCR Positiv/Negativ H 8 (13) Komponent System Metod Enhet Nivå/Mätosäkerhet Ort Nf/ Nf-aspirat/ BAL/ trakealsekret PCR Positiv/Negativ S Nf/ Nf-aspirat / BAL/ trakealsekret PCR Positiv/Negativ H, S Adenovirus-DNA P PCR; kvant Adenovirus-DNA F/Ögonsekret/svalg PCR kval CMV-DNA S/Vävnad PCR CMV-DNA BAL/Helblod/U/bröstmjölk/Csv EIA CMV IgG-Ak S/P CMIA CMV IgM-Ak S/P Virologisk diagnostik Stora luftvägsviruspaketet Adenovirus, bocavirus, coronavirus OC43, coronavirus NL63, coronavirus HKU1, coronavirus 229E, enterovirus-RNA, influensa-virus A typ H1N1 och H3, metapneumovirus, parainfluensavirus 1, 2 och 3, rhinovirus, Lilla luftvägsviruspaketet Influensa-virus A och B, RS-virus Adenovirus Kopior/mL 8 500-1x10 (CV <50%) Positiv/Negativ H H, S CMV Positiv/Negativ Påvisade/Gränsvärde/Negativ Au/mL CV <15% H S H, S CMIA Påvisade/Gränsvärde/Negativ S EIA Påvisade/Gränsvärde/Negativ S EBV EBV-DNA S/P PCR; kvant Kopior/mL 8 500 - 1x10 CV <40% H 9 (13) Komponent System Metod EBV EBNA IgG-Ak S/P CMIA Påvisade/Gränsvärde/Negativ S ELFA Påvisade/Gränsvärde/Negativ S EBV VCA IgG-Ak S/P CMIA Påvisade/Gränsvärde/Negativ S ELFA Påvisade/Gränsvärde/Negativ S CMIA Påvisade/Gränsvärde/Negativ S Csv/F PCR Positiv/Negativ H, S Hepatit A IgG-Ak S CMIA Positiv/Negativ H, S Hepatit A IgM-Ak S/P CMIA Positiv/Gränsvärde/Negativ H, S CMIA Positiv/Negativ H, S Hepatit B core-Ak (anti-HBcII) S/P ChLIA Positiv/Negativ H EBV VCA IgM-Ak Enhet Nivå/Mätosäkerhet Ort S/P Enterovirus Enterovirus-RNA Hepatit A-, B-, C- och D-virus Hepatit B core IgM-Ak (anti-HBc IgM) S/P CMIA Positiv/Negativ H, S Hepatit B e-Ak (anti-HBe) S/P CMIA Positiv/Negativ H, S Hepatit B yt-Ak (anti-HBs) S/P CMIA 0 – 1000, CV <15% H, S Hepatit B e-Ag (HBeAg) S/P CMIA Positiv/Negativ H, S Hepatit B-DNA S/P PCR; kvant IU/L IU/mL Ej påvisat - >1.00E9, CV <25% H 10 (13) Komponent System Hepatit B yt-Ag (HBsAg Qualitative II) S/P Hepatit C-Ak Metod Enhet Nivå/Mätosäkerhet Ort CMIA Positiv/Negativ H, S ChLIA Positiv/Negativ H CMIA Positiv/Negativ H, S ChLIA Positiv/Negativ H Positiv/Gränsvärde/Negativ/ S/P Hepatit C-Ak konfirmation S INNO-LIA Hepatit C-RNA S/P PCR; kvant Hepatit D-Ak S Herpes simplex 1- och 2-DNA IU/mL H, S Ej påvisat - >1.00E8, CV <25% H EIA Positiv/Negativ H Csv PCR Positiv/Negativ H, S Herpes simplex 1- och 2-DNA Blåsa NAT; SDA Positiv/Negativ H, S Herpes simplex 1- och 2-DNA Sekret/ögon PCR Positiv/Negativ S Herpes simplex 1 och 2 IgG-Ak S/P EIA Påvisade/Gränsvärde/Negativ S Herpes simplexvirus IgG-Ak S/P EIA Påvisade/Gränsvärde/Negativ P/S/Benmärg PCR; kvant Herpes simplex Herpesvirus 6 Herpesvirus 6 (HHV-6)-DNA Kopior/mL 8 Negativt, <500-1x10 , (CV <15%) H HIV och HTLV HIV-1/HIV-2-Ag/Ak CMIA Positiv/Negativ H, S ChLIA Postiv/Negativ H S/P HIV-1-/HIV-2-Ak konfirmation S/P IMKR Positiv/Gränsvärde/Negativ H, S HIV p24 antigen och HIV p24 antigen neutralisationstest S/P EIA Positiv/Negativ H, S 11 (13) Komponent System HTLV-1/HTLV-2-Ak S/P HIV-1-RNA Metod Enhet Nivå/Mätosäkerhet Ort CMIA Positiv/Negativ H, S ChLIA Positiv/Negativ H P PCR; kvant kopior/mL Ej påvisat =<20 - >1.00E7, CV<25% H Morbillivirus IgG-Ak S/P EIA mIU/mL CV <20% S Morbillivirus IgM-Ak S/P EIA Påvisade/Gränsvärde/Negativ S Morbillivirus-RNA Serum/nasofarynxaspirat/ PCR Positiv/Negativ S F/kräkningar PCR Positiv/Negativ H, S Csv/F PCR Positiv/Negativ H, S Parotitvirus IgG-Ak S/P EIA Påvisade/Gränsvärde/Negativ S Parotitvirus IgM-Ak S/P EIA Påvisade/Gränsvärde/Negativ S Benmärg PCR Positiv/Negativ H Morbillivirus nasofarynxsekret/ urin Norovirus Norovirus G1 och G2 RNA Parechovirus Parechovirus-RNA Parotitvirus Parvovirus B19 Parvovirus B19-DNA Parvovirus B19-DNA S/P PCR; kvant Parvovirus B19 IgG- och IgM-Ak S/P EIA Kopior/mL 8 500-1x10 CV<50% H Påvisade/Gränsvärde/Negativ S 12 (13) Komponent System Metod Enhet Nivå/Mätosäkerhet F PCR Positiv/Negativ EIA Påvisade/Gränsvärde/Negativ Ort Rotavirus Rotavirus-RNA H, S Rubellavirus Rubellavirus IgG-Ak S S/P CMIA IU/mL CV <10 % H, S ELFA Påvisade/Gränsvärde/Negativ S EIA Påvisade/Gränsvärde/Negativ S F/kräkning PCR Positiv/Negativ TBE-virus IgG-Ak S/P EIA Påvisade/Gränsvärde/Negativ S TBE-virus IgM-Ak S/P EIA Påvisade/Gränsvärde/Negativ S Varicella zoster-virus-DNA Blåssekret, Csv PCR Positiv/Negativ Varicella zoster-virus IgG-Ak S/P Rubellavirus IgM-Ak S/P Sapovirus Sapovirus-RNA H, S TBE-virus Varicella zoster-virus EIA Varicella zoster-virus IgM-Ak S/P mIU/mL H, S CV <15% S ELFA Påvisade/Gränsvärde/Negativ S EIA Påvisade/Gränsvärde/Negativ S 13 (13) System: BAL = Bronkoalveolärt lavage, Lkc = Leukocyter, F = Feces, Nf = Nasofarynx, P = Plasma, S = Serum, Csv = Cerobrospinalvätska, U = Urin, Bi = Biopsi Metoder: AGGL = Agglutination, ChLIA = Chemiluminescent Immuno Assay, CMIA = Chemiluminescent Microparticle Immuno Assay, CYTOTOX = Cytotoxintest, EIA = Enzyme Immuno Assay, ELFA = enzymelinked fluorescent antibody assay, FLOCKN = Flockning, FPIA = Fluorescence Polarisation Immuno Assay, IF = Immunfluorescens, IMKR = Immunkromatografi, KB = Komplementbindning, MEIA = Microparticle Enzyme Immuno Assay, RES, mik = Resistensbestämning vid mikrospädningsmetod, MIF = Immunfluorescens, mikro-, MIKR = Mikroskopi, NAAT= Nucleic Acid Amplification Test, SDA = Strand Displacement Amplification ( Nukleinsyra-amplifieringsteknik), NT = Neutralisationstest, ODL = Odling, ODL AE+AN = Odling aerob och anaerob, PCR = Polymerase Chain Reaction, PCR HYBR = Polymerase Chain Reaction Hybridisering, PCR; kvant = Realtids-PCR; kvantitativ, RES; DISK = Resistensbestämning, diskdiffusion, RIBA = Recombinant Immunoblot Assay, SEKV = Sekvensering Nivå/Mätosäkerhet: S= sensitiv, R= resistent Ort: H = Huddinge, S = Solna
