Karolina Gullsby, Fynd av Bordetella holmesii

Transcription

Karolina Gullsby, Fynd av Bordetella holmesii
Detektion av Bordetella holmesii –
den som söker den finner!
Equalis användarmöte för Medicinsk mikrobiologi 12 mars 2015
Karolina Gullsby, molekylärbiolog, Klinisk mikrobiologi, Gävle sjukhus
regiongavleborg.se
Bordetella species
Species
Upptäcktsår
B. pertussis
1906
Luftvägspatogen
Endast människa
B. bronchiseptica
1912
Luftvägspatogen
Däggdjur, bla. hund, sällsynt hos
människa
B. parapertussis
1938
Luftvägspatogen
Människa och får
B. avium
1984
Luftvägspatogen
Höns
B. hinzii
1994
Luftvägspatogen
Höns
B. holmesii
1995
Invasiva infektioner,
luftvägsinfektion
Endast människa
B. trematum
1996
Sår- och öron-infektioner
Människa
B. petrii
2000
Miljöbakterie?
Hittad i bioreaktor, fall hos CFpatient, septisk artrit
2005
?
Isolerad hos människa
B. ansorpii
regiongavleborg.se
Diagnostik av B. pertussis/B. parapertussis
• Gick över från odling till PCR år 2006 - högre känslighet!
• Analyserar dagligen må-fre (prover från Uppsala, Dalarna,
Gävleborgs län)
• 2014 kraftig ökning av B. pertussis
• PCR-metod baserad på IS-sekvenser (IS481, IS1001)
regiongavleborg.se
Differentiering Bordetella sp. IS-sekvenser
IS481
IS1001
IS1001-likn.
B. pertussis
+
-
-
B. parapertussis
-
+
-
B. holmesii
+
-
+
((+))
((+))
-
B. bronchiseptica
regiongavleborg.se
PCR-diagnostik mikrobiologen Gävle
ref. Templeton et al. J Clin Microbiol 2003, modifierad!
IS481
IS1001+IS1001-likn.
B. pertussis
+
-
B. parapertussis
-
+
B. holmesii
+
+
regiongavleborg.se
PCR-diagnostik mikrobiologen Gävle
IS481
IS1001+IS1001-likn.
B. pertussis
+
-
B. parapertussis
-
+
B. holmesii
+
+
((+))
((+))
B. pertussis + B. parapertussis
+
+
B. pertussis + B. holmesii
+
+
B. bronchiseptica
regiongavleborg.se
Fall 1 B. holmesii-fynd i nph
•
•
•
•
•
•
44-årig kvinna, tidigare elitidrottare, inga bakomliggande sjukdomar
Kvinnan haft övre luftvägsinfektion 4 veckor sedan 2 veckor med
kikhostesymptom – besökte hälsocentralen
Ingen feber, CRP < 5
Dottern hostat flera veckor men nu bra
Prov för B. pertussis-PCR togs 141114
PCR mot B. pertussis/B. parapertussis kördes 141119
regiongavleborg.se
Ct 15,9 (IS481)
Ct 16,2 (”IS1001”)
regiongavleborg.se
Fall 1 B. holmesii-fynd i nph forts.
• Telefonkontakt med kliniker ”Misstänkt B. holmesii utredning
pågår”
• Odling Charcoal agar-platta + buljong (totalt 7 dagar)
• Pertussis-liknande växt
• MALDI-ToF: B. holmesii!
• Patienten frisk – ingen behandling
regiongavleborg.se
regiongavleborg.se
PCR-verifiering av patientfynd 1
IS481*
B. pertussis
kontroll
B. parapertussis
kontroll
Patientprov
26,1
IS1001* IS1001likn.*
-
ptxA*
porA**
35,9
30,4
-
24,05
-
31,6
-
17,9
-
14,4
-
-
*) Ref. Pittet et al. PLoS One 2014
**)
Ref. Hasan et al. Can J Infect Dis Med Microbiol 2014
regiongavleborg.se
Fall 2 B. holmesii-fynd i knäpunktat – 141130
• 78-årig man, rökare, RA
• Fått knäprotes januari 2014 – problem med svullnader hela
tiden
• November 2014 svullnad och ont, får gå med kryckor
• 141130 knäpunktat odlat på flaska
regiongavleborg.se
Fall 2 B. holmesii-fynd i knäpunktat – forts.
•
•
•
•
Flaska larmar efter 2 dygn
Växt ”pytte grön” dag 1 (dp = g-stav)
MALDI-ToF: B. holmesii
PCR-positiv i vår metod för IS481 och ”IS1001”
regiongavleborg.se
Tack!
Frågor?
regiongavleborg.se