Antikunu inzinerija - MolBio - Vytauto Didžiojo universitetas
Transcription
Antikunu inzinerija - MolBio - Vytauto Didžiojo universitetas
VYTAUTO DIDŽIOJO UNIVERSITETAS GAMTOS MOKSLŲ FAKULTETAS Jolita Čiapaitė ir Gintautas Saulis Naujausių mokslinių pasiekimų ir tyrimo metodų biotechnologijos srityje taikymo medicinoje mokslinė studija “Biotechnologija medicinoje” KAUNAS, 2007 ii TURINYS I. Antikūnų inžinerija . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1 II. Priešprasminiai (antisensiniai) oligonukleotidai ir ju taikymas medicinoje . . . . . . . . 6 III. Genetinė imunizacija . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 13 IV. Kamieninės ląstelės ir jų taikymas medicinoje . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 16 V. Organų regeneravimas . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 22 VI. Vakcinų biotechnologija . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 27 VII. Genų terapija . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 31 VII.1. Genetinės kilmės ligos . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 32 VII.2. Genų terapijos pradžia . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 32 VII.3. Genų terapijos būdai . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 33 VII.4. Genų įterpimo į pacientų organizmą metodai . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 36 VII.5. Ligos, galinčios būti genų terapijos taikiniais . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 43 VIII. Elektroporacijos panaudojimas navikų terapijoje . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 46 IX. Genetiškai modifikuotų organizmų ir augalų biotechnologijos panaudojimas medicinoje . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 47 X. PRAKTINIAI DARBAI Epiteliniu kamieniniu lasteliu identifikavimas . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 48 Elektrogenoterapija . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 56 XI. LITERATŪRA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 59 ANTIKŪNŲ INŽINERIJA Pagrindinių sąvokų apibrėžimai Bakteriofagas – bakterijas infekuojantis virusas. Bakteriofagas λ yra nuosaikusis fagas, kuris patekęs į bakteriją-šeimininką gali pasirinkti lizuojantį arba lizogeninį vystymosi kelią. Bakteriofagui λ lizavus bakterijas, lėkštelėje, padengtoje augančiomis bakterijomis, toje vietoje formuojasi skaidri dėmė. Infekcija filamentiniu fagu (pvz. M13) nėra letali, bakterijos nėra lizuojamos. Tačiau infekuotų bakterijų augimo greitis sulėtėja, ir lėkštelėje, padengtoje augančiomis bakterijomis formuojasi neskaidrios (drumstos) dėmės. Domenas – baltymo struktūrinis vienetas. Fab – monovalentinis antigeną prijungiantis antikūno fragmentas, kuris yra sudarytas iš vienos lengvosios ir dalies sunkiosios grandinės (kintamos srities ir pirmo nekintamos srities domeno). Tokie fragmentai susidaro antikūno molekulę paveikus proteolitiniu fermentu papainu arba genetinių modifikacijų pagalba. Fc – sąveikoje su antigenu nedalyvaujantis antikūno molekulės fragmentas, sudarytas iš abiejų sunkiųjų grandinių karboksi galinių sekų. Tokie fragmentai susidaro antikūno molekules paveikus papainu. Visa IgG antikūno molekulė yra sudaryta iš dviejų Fab ir vieno Fc fragmento. Fv – monovalentinis antigeną prijungiantis antikūno fragmentas, sudarytas iš lengvosios ir sunkiosios grandinių kintamų sričių. Monokloniniai antikūnai – homogeniškų antikūnų populiacija, turinčių tą patį antigeninį specifiškumą, ir kilusių iš vieno antikūnus gaminančių ląstelių klono. Įvadas Antikūno molekulė yra esminis imuninio atsako komponetas, nes jos geba: (i) atpažinti platų ratą skirtingų šeimininko organizmui svetimų medžiagų bei (ii) sąveikauti bei aktyvinti šeimininko organizmo efektorines sistemas. Antikūnų molekulinės struktūros ir jų vaidmens imuninio atsako mechanizmuose išaiškinimas davė pradžią plačiam šių molekulių panaudojimui medicinos ir mokslo problemoms spręsti. Medicinoje specifiniai antikūnai naudojimi: (i) ligų diagnostikai (pvz. Laimo ligos, autoimuninių ir virusinių ligų diagnostikai); (ii) ligų gydymui (pvz. reumatoidinio artrito, išsėtinės sklerozės, psoriazės (žvynelinės ligos), įvairių vėžio formų: ne Hodžkino limfomos, storosios žarnos, galvos ir kaklo, krūties vėžio); (iii) vaisiaus (prenatalinei) terapijai (pvz. siekiant išvengti motinos imuninės sistemos sensitizacijos, kai nesutampa motinos ir vaisiaus rezus faktorius). Išgryninti specifiniai antikūnai taip pat plačiai taikomi mokslo tikslams: (i) viduląstelinių ir ekstraląstelinių baltymų identifikavimui, lokalizavimui ir ekspresijos lygio įvertinimui (imunohistochemija arba imunofluorescencija); (ii) ląstelių rūšiavimui pagal tai, kokius baltymus jos ekspresuoja (tėkmės citometrija); (iii) baltymų atskyrimui (imunoprecipitacija) ir identifikavimui po elektroforetinio išskyrstymo (Western’o blotas). Antikūnų struktūra ir antikūnų inžinerija Antikūnai yra sudaryti iš dviejų lengvūjų ir dviejų sunkiūjų polipeptidinių grandinių sujungtų disulfidiniais tilteliais (Pav. 1). Sunkioji grandinė nulemia antikūno biologines savybes. Žinduoliuose aptinkamos kelios antikūnų klasės (izotipai) su skirtingomis sunkiosiomis grandinėmis. Sunkiosios ir lengvosios grandinės susilanksto į funkcinius domenus: lengvosios grandinės į du, sunkiosios – į tris arba keturis (priklausomai nuo izotipo). Kiekvienos grandinės Ngalinis domenas suformuoja kintamas sritis, prie kurių jungiasi antigenas. Kiti domenai dalyvauja šeimininko efektorinių mechanizmų aktyvacijoje. Domeninė antikūnų struktūra yra palanki baltymų inžinerijai, nes tai supaprastina funkcinių domenų, atsakingų už antigeno prijungimą (Fab arba Fv domenai) arba efektorinių domenų (Fc), mainus tarp skirtingų antikūnų molekulių. Domeninė struktūra taip pat įgalina pagaminti antikūnus gebančius atpažinti specifinius antigenus bei antikūnus sujungtus su įvairiom molekulėm, pvz. toksinais, limfokinais, augimo faktoriais. Tyrimai parodė, kad antikūnų molekulės nepaprastai lengvai pasiduoda tokio pobūdžio modifikacijoms. 1 scFv VL Lengvoji (L) grandinė Sunkioji (H) grandinė CL VH s s A CH1 CH2 CH3 CH2 CH3 s-s s-s Fv CH1 VH s A Fc s CL VL Fab s s Fab Pav. 1 Antikūno molekulės schema. Atskiri molekulės domenai pavaizduoti elipsėmis. Sunkiosios grandinės nekintamos srities domenai, kurie lemia antikūno izotipą, yra pažymėti CH1, CH2, CH3, o lengvosios grandinės nekintamos srities domenai yra pažymėti CL. Angliavandeniai (A) ant sunkiosios grandinės CH2 domeno yra pavaizduoti juodu apskritimu. Kintamos antikūno srities domenai, kurie dalyvauja antikūno atpažinime ir prijungime, yra pažymėti VH ir VL. funkciniai antikūno fragmentai yra pavaizduoti ir intaktinėje antikūno molekulėje ir kaip atskiri fragmentai, kokie jie būtų susintetinami bakterijose. Paveiksle taip pat pavaizduotos disulfidinės jungtys (s-s), svarbios antikūno molekulės erdvinei struktūrai palaikyti. Ekspresijos sistemos antikūnų gamybai Šiuo metu antikūnų gamybai yra naudojamos kelios ekspresijos sistemos, kurios turi savų privalumų it trūkumų: bakterijos, mielės, augalai, bakulovirusai ir žinduolių ląstelės. Žinduolių ląstelių kultūros yra puiki sistema pilnai užbaigtų antikūnų molekulių gamybai, kadangi jose vyksta: (i) teisingas molekulių brendimas, (ii) reikiamos po-transliacinės modifikacijos; (iii) antikūnų sekrecija iš ląstelės. Bakterijos yra daugiausiai naudojamos gaminant antikūnų molekulių fragmentus, kadangi pilnai užbaigtų antikūnų molekulių sintezė jose neįmanoma dėl to, kad molekulės nėra glikozilinamos, nesusiformuoja disulfidiniai tilteliai ir todėl nevyksta pilnas antikūno molekulės surinkimas. Ekspresuojant antikūnus E. coli citoplazmoje, susidaro netirpūs ir neaktyvūs baltymų agregatai (intarpiniai kūneliai, angl., inclusion bodies), kuriuos norint paversti funkciškai aktyviais antikūnais reikia atlikti papildomas baltymų perlankstymo ir renatūracijos procedūras. Tuo tarpu daug sėkmingiau E. coli galima ekspresuoti antikūnų molekulių fragmentus su ekstraląstelio transporto signalinėm sekomis, ko pasėkoje molekulių fragmentai yra sekretuojami į terpę. Nesenai tapo įmanoma užauginti peles, kurių organizme gaminasi tam tikram antigenui specifiniai žmogaus antikūnai. Tai buvo pasiekta įjungiant lengvos ir sunkios žmogaus antikūno grandinės lokuso sekas į pelės, kurios nuosavos lengvos ir sunkios grandinių sintezė yra sustabdyta, genomą. Tokios pelės organizme gali gamintis antikūnai specifiški plačiam ratui antigenų, įskaitant žmogaus antigenus. Taip pat tokios pelės gali būti panaudotos hibridomų, sintetinačių žmogaus antikūnus, gamybai. Šiuo metu tokios pelės gali gaminti tik kai kuriuos žmogaus antikūnų izotipus, tačiau tolesnių genetinių modifikacijų vykdymas be abejo padidins tokių pelių panaudojimo potencialą. In vitro bibliotekos antikūnų idedentifikavimui Antikūnų su norimu antigeniniu specifiškumu gamybai taip pat buvo išvystyti metodai pagrįsti imunoglobulinų genų ekspresija bakteriofaguose. Tam kaip ekspresijos sistemos paprastai 2 naudojamas bakteriofagas λ ir filamentiniai fagai. Bakteriofaginės ekspresijos sistemos gali būti sukonstruotos taip, kad galėtų susidaryti atsitiktinės sunkiosios ir lengvosios grandinių sekų kombinacijos. Toliau yra nustatoma susidariusių kombinacijų gebėjimas juntis prie reikiamo antigeno. Bakteriofagas λ yra patogi ekspresijos sistema, nes: (i) galima pakeisti gana didelę jo genomo dalį sveitima DNR, (ii) yra paprasta nustatyti baltymo ekspresiją vieno bakteriofago formuojamos kolonijos lygmenyje. Bibliotekos sudarytos iš ~106 klonų gali būti efektyviai patikrintos ir yra tinkamos specifinių antikūnų išskyrimui iš imunizuoto šeimininko. Tačiau tikrinimo procedūros metu yra identifikuojami antikūnai tik turintys aukštą specifiškumą antigenui, todėl yra sunku išskirti specifinius antikūnus iš imunizuotų donorų, jeigu didžioji dalis susidarančių antikūnų yra mažo specifiškumo. Norint gauti didesnes bibliotekas nesenai buvo sukurti metodai leidžiantys ekspresuoti Fv ir Fab fragmentus filamentinių bakteriofagų (f1, M13 ir fd) paviršiuje. Priklausomai nuo to, koks fago baltymas yra naudojamas suliejimui su antikūno fragmentu, yra įmanoma ekspresuoti vieną arba keletą dominančio antikūno melekulių kopijų. Galimybė ekspresuoti keletą kopijų palengvina mažo giminingumo antikūnų identifikavimą ir išskyrimą. Toks sukonstruotas fagas specifiškai jungiasi su antigenu ir gali būti išskirtas iš fagų, ekspresuojančių skirtingo specifiškumo antikūnų molekules, mišinio naudojant afininę chromatografiją. Yra įmanoma išskirti specifinį fagą, net jei toks fagas pradinėje fagų bibliotekoje buvo tik 1 iš 106. Tam yra atliekama keletas ‘koncentravimo’ ciklų, sudarytų iš prijungimo prie imobilizuoto antigeno ir prisijungusių fagų dauginimo. Taigi, filamentiniai fagai yra ypač tinkama ekspresijos sistema jeigu norima patikrinti didelį kiekį klonų arba norint išskirti fagus ekspresuojančius reto specifiškumo antikūnų molekules. Sekos, lemiančios antigeninį specifiškumą, gali būti ekslpresuojamos Fab fragmentų arba vienos grandinės sulietų fragmentų (scFv) forma. Fab fragmentų ekspresija yra pranšesnė, nes galima nepriklausomai sukonstruoti lengvųjų ir sunkiųjų grandinių bibliotekas ir jas perrūšiuoti, kas savo ruožtu leidžia sukonstruoti kombinatorines bibliotekas. Įvedus beprasmę (angl. amber) mutaciją tarp antikūno grandinės ir viruso dengiamojo (angl. coating) baltymo sekos, panaudojus supresinių bakterijų štamą yra įmanoma ekspresuoti antikūno molekulę fago paviršiuje, arba, panaudojus nesupresinių bakterijų štamus gaminti tirpius antikūnų molekulių fragmentus. Taip pat fagus galima panaudoti antikūnų mutavimui ir atrinkimui in vitro, tokiu būdu gaunant antikūnus su geresnėmis antigeno prijungimo savybėmis. Antikūnų gamyba in vitro Kaip minėta, vienas iš metodų gaminant specifinius antikūnus yra panadojant imunizuotus donorus. Nesenai tapo įmanoma gaminti specifinius antikūnus in vitro naudojant imunizuotų donorų periferinio kraujo limfocitų kultūras. Tam donoras yra imunizuojamas norimu antigenu, surenkama donoro periferinio kraujo, iš kurio išskiriami limfocitai, kurie yra palaikomi grynoje kultūroje in vitro, kur jie sintetina ir sekretuoja į kultivavimo terpę reikiamus antikūnus. Didelių kiekių reikiamo specifiškumo monokloninių antikūnų gamybai buvo sukurta tokių antikūnų gamybos hibridomų ląstelių linijose tecnologija. Norint pagaminti monokloninius antikūnus, specifinius tam tikram antigenui, donoras yra imunizuojamas tuo antigenu, ir iš donoro blužnies yra izoliuojamos B ląstelės. Tada B ląstelės yra suliejamos su mielomos ląstelėm (t.y. vėžinėm B ląstelės), kurios gali augti kultūroje neribotą laiką (t.y. yra nemirtingos). Dviejų ląstelių tipų suliejimas yra atliekamas paveikus ląstelių membranas jų laidumą didinančia medžiaga (pvz. polietilenglikoliu). Sulietos hibridinės ląstelės (hibridomos) yra vėžinės ląstelės, todėl dauginasi greitai ir neribotą laiką, ir tuo pačiu dideliais kiekiais gamina reikiamus antikūnus. Naujai susidariusios hibridomos ląstelės yra atrenkamos jas auginant selekcinėje terpėje ir po identifikavimo yra klonuojamos naudojant ribinio atskiedimo metodą (t.y. ląstelių suspensija yra atkiedžiama tiek, kad tam tikrame tūrio vienete yra 1 ląstelė). Išaugus naujiems hibridomos klonams (t.y. ląstelių grupėms susidariusioms dalinantis vienai motininei ląstelei), naudojant imunofermentinį ELISA metodą (angl. Enzyme-Linked ImmunoSorbent Assay) yra patikrinama, ar šie klonai tikrai gamina reikiamą antikūną. 3 Chimeriniai antikūnai Nors klinikiai tyrimai su pelės monokloniniais antikūnais teikia vilčių, tačiau jų panaudojimas turi keletą trūkumų: (i) pelės antikūnai yra greitai pašalinami iš žmogaus cirkuliacijos, (ii) jie nesąveikauja su žmogaus imuninės sistemos efektoriais, (iii) daugeliu atvejų jie sukelia imuninį atsaką į pelės baltymus (angl. human antimouse response, HAMA). Norint išspręsti šias problemas buvo sukurti chimeriniai antikūnai sudaryti iš pelės antikūno kintamos srities domenų (Fv) ir žmogaus antikūno nekintamos efektorinės srities domenų (Fc). Tokie sukonstruoti antikūnai išlaiko specifiškumą reikiamam antigenui ir sukelia mažesnį HAMA atasaką. Priklausomai nuo panaudojimo tikslo, antikūnai turi skirtingas biologines savybes. Pavyzdžiui, pageidautinos savybės idealiam antikūnui, skirtam ligos diagnostikai, yra specifiškumas tam tikram antigenui, greitas pašalinimas iš cirkuliacijos, radioaktyvios žymės buvimas. Tuo tarpu antikūnas, skirtas ligos gydymui, gali būti sukonstruotas taip, kad dalyvautų imuniniame atsake tik tam tikroje organizmo vietoje. Chimerinių antikūnų technologija leidžia pagaminti ir palyginti skirtingos struktūros bei specifinės problemos sprendimui tinkamus antikūnus. Genų inžinerija labai pravertė išskiriant ir apibūdinant imunoglobulinus iš gyvūnų rūšių, kurioms dar nesukurtos mielomos ląstelių linijos. Pvz., buvo sukonstruoti antikūnai sudaryti iš pelės kintamų sričių (Fv) ir triušio nekintamų efektorinių sričių (Fc). Genų inžinerija taip pat gali būti panaudota, kai reikia pagaminti retų imunoglobulinų izotipus (pvz. IgD). Žmogaus antikūnai su įterptomis pelės antikūnų sekomis Chimeriniuose antikūnuose paprastai panaudojama visa pelės antikūno kintama sritis (Fv). Domeninė antikūno struktūra leidžia pagaminti palyginamo su pelės specifiškumo Fv sritis sudarytas iš žmogaus antikūno molekulių sekų. Antikūno dalis, kuri sąveikauja su antigenu yra sudaryta iš 6 komplementarumą nulemiančių sričių (angl. complementarity-determining regions, CDRs) esančių sunkiosios ir lengvosios grandinės kintamose srityse (VL ir VH). Kiekvienas antikūno domenas yra sudarytas iš 7 antiparalelių β klosčių, sujungtų kilpomis, ir suformuojančių β cilindrą. Tarp β klostes jungiančių kilpų ir yra CDR sritys. Techniškai yra įmanoma CDR sritis (taigi ir jų nulemtą specifiškumą antigenui) perkelti iš vieno β cilindro į kitą. Tačiau paprastai nepakanka tiesiog įjungti pelės CDR sritis į žmogaus antikūno molekulių karkasą. Paprastai pelės antikūno molekulėje yra amino rūgštys, kurių sąveika su CDR sritimis yra labai svarbi normaliai antikūno funcijai užtikrinti. Tokios amino rūgštys kartu su CDR sritimis turi būti perkeliamos į žmogaus antikūno molekulių karkasą. Jei patikrinus yra nustatoma, kad tokio sukonstruoto antikūno biologinis aktyvumas yra sumažėjęs arba visai išnykęs, perkeliama dagiau su CDR sritimis sąveikaujančių amino rūgščių, kol atstatomas maksimalus antikūno aktyvumas. Pagrindinis akstinas tokių hibridinių antikūnų gamybai yra antikūnų, pasižyminčių minimaliom imunogeninėm savybėm, ir todėl galinčių efektyviau atlikti terapinę funkciją, poreikis. Tačiau kadangi CDR sritys yra susijusios su antikūno molekulės idiotipu (t.y. konkrečios imunoglobulino molekulės kintamai daliai būdingų epitopų (idiotopų) visuma), tokie ‘sužmoginti’ pelės antikūnai gali sukelti anti-idiotipinį atsaką. Sulieti baltymai Taip pat yra gaminamos sulietos tam tikro baltymo ir antikūno molekulės. Tai gali būti atliekama keliais būdais. Antikūno kintamos sritys gali būti suliejamos su ne-antikūno baltymais ir tokia molekulė turės antikūnui būdingą prisijungimo specifiškumą. Priklausomai nuo to, kuri antikūno molekulės dalis bus pakeista, nauja molekulė išsaugos skirtingas antikūnui būdingas biologines funkcijas. Pvz., trombolitinis baltymas, kuris susidaro suliejus audinio tipo plazminogeno aktyvatoriaus katalitinę β grandinę (t-PA) su anti-fibrino antikūnu, pasižymi didesniu specifiškumu ir stipresniu poveikiu, nei vienas t-PA. Taip pat molekulių, kurios pačios nėra imunoglobulinai (pvz. CD4, interleukinas 2, auglio nekrozės faktoriaus receptorius), dalys gali būti pakeistos kintamom antikūno molekulės sritim. Tokios molekulės buvo pavadintos ‘imunoadhezinais’, kadangi jos yra sudarytos iš adhezinės molekulės prijungtos prie imunoglobulino efektorinės Fc 4 srities. Sulieta molekulė įgauna antikūnui būdingų savybių (pvz. gebėjimą aktyvinti šeimininko efektorines sistemas) bei pasižymi geresnėm farmakokinetinėm savybėm. Antikūnų fragmentai Fab, Fv, ir vienos grandinės Fv (scFv) fragmentai su VH ir VL sritimis, prijungtomis polipeptidine jungtimi, pasižymi intaktiniam monokloniniam antikūnui būdingu specifiškumu ir afiniškumu (giminingumu) antigenui. scFv sulieti baltymai gali būti pagaminti prijungus prie amino arba karboksi galo ne-antikūno molekulę. Tokiose molekulėse Fv sritis yra tam, kad užtikrintų prijungtos molekulės pristatymą iki ląstelės, ekspresuojančios tam tikrą antigeną. Taip pat gali būti sukonstruoti bifunkciniai antikūnai, kuriuose vienoje antikūno molekulėje yra įterptos sekos nulemiančios specifiškumą dviem antigenams. Kataliziniai antikūnai Katalitinių antikūnų sukūrimas išplėtė klasikinį baltymų struktūros ir funkcijos supratimą. Ir fermentai ir antikūnai pasižymi prijungimo specifiškumu (substratui arba antigenui, atitinkamai). Nepaisant to, jų veikimo mechanizmas iš esmės skiriasi: fermentai destabilizuoja substratą, sukeldami jo perėjimą į pereinamą būseną, tuo tarpu antikūnai suriša medžiagą ramybės būsenoje. Teoriškai, antikūnas specifiškas pereinamąjai būsenai, turėtų greitinti reikciją. Tokie kataliziniai antikūnai vadinami abzimais arba haptenais. Kai kuriais atvejais abzimų katalizuojami reakcijos greičiai net 107 kartų didesni už nekatalizuojamos reakcijos greitį. Šiuo metu pasisekė gauti abzimus, katalizuojančius keletą reakcijų tipų – β-eliminaciją, oksidacijos-redukcijos reakcijas, Diels-Alder ciklų suliejimą, tritilą apsaugančių grupių skilimą, stereoselektyvią alkilo esterių hidrolizę. Pagrindinis metodinis sunkumas, kuriant savitus tam tikriems junginiams abzimus buvo tai, jog jų atrankai reikia naudoti tam tikrų gyvūnų imuninę sistemą. Pastaruoju metu klonuoti atsitiktiniu būdu persitvarkę Fab fragmentai, ir tai leido sukurti atrankos in vitro mišinius net tokiems junginiams, kurie in vivo pasižymi stipriu toksiniu poveikiu. Kataliziniai antikūnai parankūs organinei sintezei, nes jie stereosaviti. Dauguma iki šiol aprašytų katalizinių antikūnų buvo pagaminti naudojant standartinę hibridumų technologiją. Norint išplėsti katalizinių antikūnų ratą yra bandoma juos gaminti naudojant bakteriofagą λ kaip ekspresijos sistemą. Pastarojo privalumas yra tas, kad katalizinių antikūnų gamyba ir tikrinimas atliekama daug greičiau ir su daugiau kandidatų, negu įmanoma naudojant hibridomas. Kaip anksčiau minėta, bakteriofago λ bibliotekų trūkumas yra tai, kad tikrinimo sistemos gali identifikuoti tik tuos antikūnus, kurie stipriai riša antigeną. Tokie antikūnai nebūtų geri katalizei atlikti, šiuo atveju silpnas surišimas yra privalumas. Galbūt filamentiniai fagai pasirodys esantys geresnė ekspresijos sistema katalizinių antikūnų gamybai, bet tai paaiškės tik po nuodugnių tyrimų. Literatūra 1. Molecular Biology and Biotechnology: A Comprehensive Desk Reference. (1995) Robert A. Meyers (Editor), Wiley-VCH, ISBN: 978-0-471-18571-0 2. Graumann K, Premstaller A. (2006) Manufacturing of recombinant therapeutic proteins in microbial systems. Biotechnol J. 1:164-186. 3. Presta LG. (2006) Engineering of therapeutic antibodies to minimize immunogenicity and optimize function. Adv Drug Deliv Rev. 58:640-656. 4. Woycechowsky KJ, Vamvaca K, Hilvert D. (2007) Novel enzymes through design and evolution. Adv Enzymol Relat Areas Mol Biol. 75:241-294. 5 PRIEŠPRASMINIAI (ANTISENSINIAI) OLIGONUKLEOTIDAI IR JŲ TAIKYMAS MEDICINOJE Pagrindinių sąvokų apibrėžimai Priešprasminis (antisensinis) oligonukleotidas – sintetinė vienvijė nukleino rūgštis, sudaryta iš 1225 mononukleotidų, kuri komplementariai jungiasi su tam tikromis komplementariomis (‘prasminėmis’) informacinės RNR sritimis ir slopina baltymo, koduojamo tos iRNR, sintezę. Priešprasminis (antisensinis) oligonukleotido analogas – junginys, kurio cheminė sudėtis, lyginant su gamtoje aptinkamais oligodeoksiribonukleotidais, buvo modifikuota taip, kad pagerėtų biofizinės ir biologinės savybės. Prisijungimo giminingumas – stiprumo, kuriuo oligonukleotidas prisijungia prie nukleino rūgštiestaikinio, matas. Paprastai jis nurodomas kaip eksperimentiškai nustatyta lydymosi temperatūra Tm, t.y. temperatūra, esant kuriai 50 % dvivijų grandinių disocijuoja į vienvijas grandines. Oligonukleotidų transportas į ląstelę – nuo laiko priklausomas procesas, kurio metu oligonukleotidai patenka į ląsteles, auginamas ląstelių arba audinių kultūroje. Nukleazinis stabilumas – oligonukleotido atsparumas įvairiems nukleino rūgštis ardantiems fermentams, esantiems serume ir ląstelių viduje. RNazė H – ląstelėje dažnai sutinkamas fermentas, kuris atpažįsta hetero dupleksą tarp DNR ir RNR, ir perkerpa duplekso RNR grandinę. Įvadas Pastaraisiais metais buvo sukurta nauja klasė junginių, kurie pasižymi gebėjimu jungtis prie tam tikrų nukleino rūgščių sekų. Šie junginiai yra vadinami priešprasminiais (antisensiniais) oligonukleotidais. Jie yra nepaprastai įdomūs dėl to, kad prisijungdami prie savo taikinio, jie slopina tos nukleino rūgšties sekos koduojamo geno raišką, todėl yra potencialiai naudingi genetinių ligų gydymui. Lyginant su ląstelėje aptinkamais oligonukleotidais, sintetinių priešprasminių oligonukleotidų cheminė struktūra yra pakeičiama taip, kad jie išliktų stabilūs in vivo sąlygomis, bei gebėtų patekti į ląstelės vidų, kur jie atlieka savo vaidmenį. Šioje paskaitoje jūs suspiažinsite su priešprasminių oligonukleotidų funkcijosmis, priešprasminių (antisensinių) oligonukleotidų analogų struktūra, veikimo mechanizmu, įvairiomis strategijomis kaip sustiprinti jų biologinį poveikį, bei sėkmingų priešprasminių oligonukleotidų pritaikymų in vitro ir in vivo pavyzdžiais. Priešprasminių oligonukleotidų kūrimo principai Racionalus vaistų kūrimas yra pirminis farmacijos pramonės tikslas. Nors dauguma šiuo metu vartojamų vaistų veikia tiesiogiai slopindami fermentų ar kitų baltymų veikimą, tačiau tik keliems yra žinomas tikslus veikimo mechanizmas. Lyginant su terapine intervencija baltymų lygyje, intervencija DNR ar informacinės RNR (iRNR) lygyje būtų daug efektyvesnė, nes aktyvios transkripcijos metu kiekvienas genas yra transkribuojamas į 102-104 kopijų iRNR molekulių, kurios savo ruožtu transliuojamos į 104-106 kopijų baltymų molekulių. Molekulės, inhibuojančios transkripciją arba transliaciją, gali būti sukurtos naudojantis labai racionaliais principais. 1978m. P.C. Zamecnik ir M.L. Stephenson pirmieji pasiūlė panaudoti oligonukleotidus, nukreiptus prieš komplementarias virusinių nukleino rūgščių sekas, viruso replikacijos slopinimui. Nuo to laiko buvo atlikta nemažai tyrimų tobulinant šią terapijos priemonę. Priešprasminiai oligunukleotidai yra sintetiniai oligonukleotidai, kurie pagal Watson-Crick bazių poravimo principą jungiasi prie tam tikrų komplementarių iRNR sekų, ir tuo būdu inhibuoja baltymo biosintezę. Tuo tarpu DNR transkripciją slopina trigubą grandinę formuojantys oligonukleotidai, kurie pagal Hoogsteen bazių poravimo principą jungiasi su didžiojo griovelio dvigrande DNR (Pav. 1). Dėl bendrų bazių poravimo taisyklių oligonukleotidiniai antagonistai gali būti universalia priemone daugelio ligų, sukeltų virusų, onkogenų, imunomoduliatorių, receptorių ar jonų kanalų, gydymui. Tam, remiantis žinoma nukleino rūgšties-taikinio seka, yra susintetinamas tam tikrai jos daliai komplementarus oligonukleotidas. Oligonukleotido specifiškumą nulemia taikinio sekos paplitimas 1 visoje nukleino rūgšties molekulės sekoje. Buvo paskaičiuota, kad oligonukleotidinė seka, sudaryta iš 17 monomerų, pasitaiko tik 1 kartą visame žmogaus genome (4 × 109 bazių porų). Šis pastebėjimas, kuris taip pat buvo patvirtintas naudojant in vitro hibridizacijos tyrimus, rodo, kad oligonukleotidinių antagonistų poveikis turėtų būti labai specifinis. Taip pat reikia paminėti, kad priešparsminis (antisensinis) principas veikia ir gamtoje (priešprasminės RNR reguliuoja genų raišką). T R C+ CH3 H H R CH3 N O H H O N H O N N O N H N R R R Hogsteen N R Watson-Crick O H N N A N O N O Hogsteen C H H N H N + N T N N N N H N N G H Watson-Crick Pav. 1 Bazių tripletai TAT ir C+GC. Dvivijės grandinės formuojasi remiantis bendru Watson-Crick bazių poravimo principu. Trivijės grandinės susidaro, kai pagal Hogsteen bazių poravimo principą trečios grandinės bazės sudaro vandenilines jungtis su dvivijės grandinės didžiąjame griovelyje esančiomis purino bazėmis. Dėl šios priežasties trivijės DNR grandinės formuojasi tik tose DNR srityse, kuriose yra daug purino bazių. Priešprasminių oligonukleotidų struktūra ir savybės Priešprasminiai ir trigubą grandinę formuojantys oligonukleotidai gali būti panaudojami mechanistiniams molekulinės biologijos tyrimams arba kaip genų raišką slopinantys medicininiai preparatai. Tačiau šių junginių taikymas gydymo tikslams vis dar yra ankstyvoje stadijoje. Norint paspartinti oligonukleotidų analogų praktinį taikymą turi būti sukurti oligonukleotidai turintys tokias savybes: 1. Tam, kad pasireikštų genų raišką slopinantis poveikis, jie turi būti pakankamai stabilūs serume ir ląstelės viduje. 2. Tam, kad pasiektų savo veikimo vietą, jie turi pereiti per ląstelės membranas, bei patekti į įvairius kūno organus. 3. Būtina, kad fiziologinėm sąlygom jie suformuotų stabilius Watson-Crick ir Hoogsteen junginius su komplementariomis taikinių sekomis. 4. Būtina, kad sintetinio oligonukleotido sąveika su taikinio seka būtų labai specifinė. Oligonukleotidų ir jų analogų struktūra. Tam, kad būtų patenkintos keturios aukščiau paminėtos sąlygos buvo atlikta daugybė ‘natūralių’ (gamtoje aptinkamų) oligonukleotidų cheminių modifikacijų: (i) fosfodiesterio karkaso modifikacijos ir pakeitimas, (ii) bazių modifikacijos, (iii) angliavandenių modifikacijos, (iv) konjugatų formavimas įvairiose oligonukleotido vietose. Daugiausiai naudojamos ir geriausiai ištirtos yra fosfato karkaso modifikacijos, ypač panaudojant fosforotioatus, fosforoamidatus, metilfosfonatus, bei 3’ galo modifikacijos pašalinant arba blokuojant hidroksilo grupę (Pav. 2). Nesenai buvo aprašyti ‘defosfo’ oligonukleotidai, kuriouse fosfodiesterio grupė yra pilnai pakeista, pvz. formacetaliai, tioformacetaliai, metilhidroksilaminai ir kiti (Pav. 2-3). Dar drastiškesnių modifikacijų pavyzdžiai yra ‘peptidinių nukleino rūgščių’ arba ‘morfolino nukleozidų’ oligomerai (Pav. 3), kuriuose nukleino rūgšties karkasas, sudarytas iš fosfato ir angliavandenio liekanų, yra pakeistas atitinkamai peptidine grandine arba karbamatu sujungtų morfolinų grandine. Tačiau nors kai kurie iš šių ‘defosfo’ oligonukleotidų pasižymi labai geromis hibridizacinėmis savybėmis ir nukleaziniu stabilumu, vis dar labai mažai yra žinoma apie jų gebėjimą patekti į ląstelę ir biologinį aktyvumą. 2 cholesterolis vitaminas E psoralenas 5'-konjugatas B O O 2,6-diamino purinas 5-metilcitozinas O - B O P O O O O - S O P O H3C O P O O - O metilfosfonatas fosforo tioatas O R N P O R O B O P O O O α -D-deoksiribozë β -L-deoksiribozë 2'-O-metilribozë O H C O O 3'-konjugatas H poli-L-lizinas akridinas formacetalis fosforamidatas Pav. 2 Oligonukleotidų modifikacijos O X B O O CH2 CH CH2 CH2 O X Y z O B Y CH2 CH2 N CH3 N N CH3 SO2 Si(CH3)2 Z Junginys O S O O N CH2 O Formacetalis Tioformacetalis Metilhidroksilaminas Oksimas Metilenedimetilhidrazas Dimetilenesulfonas CH3 Sililas O B O O B N O O N NH B O N O O B O NH N Peptidinės nukleino rūgštys Morfolino nukleozidų oligomerai Pav. 3 “Defosfo” oligonukleotidų pavyzdžiai. 3 Oligonukleotidų atsparumas nukleazių poveikiui. Dėl 3’-ekzonukleazių poveikio nemodifikuoti oligonukleotidai su įprastu fosfodiesterio karkasu serume yra suskaidomi per kelias valandas. Oligonukleotido 3’ galo modifikacijos, kurių metu yra pašalinama arba blokuojama hidroksilo grupė arba kelių 3’ galinių internukleozidinių fosfatinių jungčių modifikacija paprastai labai padiddina oligonukleotido atsparumą 3’-ekzonukleazių poveikiui. Be to, kai kuriuose audiniuose stebimas gana aukštas 5’ ekzonukleolitinis aktyvumas. Dėl šios priežasties gana dažnai pasitaikanti modifikacija yra 2-5 fosfato liekanų, esančių 3’ ir 5’ oligonukleotido galuose, pakeitimas fosforotioato arba metilfosfonato liekanomis. Tokie pakeitimai paprastai bent 10 kartų padidina oligonukleotido nukleazinį satbilumą ir tuo pačiu yra išlaikomas oligonukleotido sekos specifiškumas. Tačiau in vivo sąlygom tokie modifikuoti oligonukleotidai nėra visiškai stabilūs, nes jie vis dar gali būti skaidomi endonukleozėmis. Tačiau viso oligonukleotido karkaso modifikacija gali stipriai pakeisti ir kitas oligonukleotido savybes, pvz. lipofiliškumą, tirpumą arba prisijungimo prie komplementarių sekų giminingumą. Oligonukleotidų skaidymas biologinėse sistemose gali būti sulėtintas įvedant daugelį kitų pakeitimų, pvz. angliavandenių modifikacijas (α-deoksiribozė, 2’modifikuota ribozė) arba kai kurių bazių modifikacijas. Be to, oligonukleotidus galima apsaugoti nuo nukleazių poveikio supakuojant juos į liposomas arba nano daleles, kurios taip pat yra patogūs nešikliai in vivo. Oligonukleotidų transportas į ląstelę. Panašiai kaip ir su nukleaziniu stabilumu, oligonukleotidų transportas ir pasiskirstymas ląstelėje didžiąja dalimi priklauso nuo cheminių modifikacijų. Nemodifikuoti oligonukleotidai paprastai būna sudaryti iš 12-25 nukleotidų ir yra labai hidrofiliški anijoniniai junginiai. Nepaisant to, jie lengvai patenka į gyvą ląstelę endocitozės būdu, kuri greičiausiai vyksta tarpininkaujant receptoriams. Tačiau laisvų oligonukleotidų koncentracija citoplazmoje yra labai nedidelė, nes jie sukaupiami lizosomose ir endosomose. Įdomu tai, kad išlaisvinus oligonukleotidus iš šių talpyklų arba mikrošvirkštu injekavus oligonukleotidus į citoplazmą jie labai greitai prasiskverbia į ląstelės branduolį. Oligonukleotidų patekimas į ląstelę gali būti pagerintas naudojant lipofilinę derivatizaciją (pvz. susintetinant lipofilinius konjugatus oligonukleotido 5’ gale), konjuguojant oligonukleotidą su poli-L-lizinu, arba supakuojant oligonukleotidus į liposomas, kurios nukreipiamos į reikiamą vietą naudojant specifinius antikūnus. Vis dar neaišku, ar neturintys krūvio lipofiliniai metilfosfonatai patenka į ląstelę pasyvios difuzijos ar aktyvaus transporto būdu. Fosforotioatai, esant aukštai jų koncentracijai, konkuruoja su įprastais fosfodiesterio oligonukleotidais, bet jiems reikia daugiau laiko pasiekti viduląstelinę pusiausvyrą. Peptidinės nukleino rūgštys į ląstelę beveik visai nepatenka. Apskritai, oligonukleotidų patekimas į ląstelę priklauso nuo laiko, energijos, ir ląstelės tipo. Be to, oligonukleotidai yra pernešami ne tik į ląstelę, bet ir iš jos. Norint įvertinti sintetinio oligonukleotido biologinį veiksmingumą yra būtina įvertinti įvairių galimų jo modifikacijų poveikį transportui į ląstelę. Taip pat gali atsitikti taip, kad oligonukleotidų transportas į ląstelę audinių kultūroje nekoreliuoja su jų farmakologiniu veiksmingumu gyvame organizme. Oligonukleotidų analogų prisijungimo giminingumas. Oligonukleotidų modifikavimas paprastai yra susijęs su prisijungimo prie komplementarios sekos giminingumo pokyčiais. Krūvis, steriniai faktoriai ir stereochemija yra pagrindiniai veiksniai nulemiantys modifikuoto oligonukleotido giminingumą. Stereochemija yra ypač svarbi daugumai modifikacijų (pvz. fosfato liekanoje pakeitus deguonies atomą siera, metilo arba alkilamino grupe ties fosforu susidaro chiralinis centras). Taigi, jeigu oligonukleotide su n tarpnukleotidinių fosfato grupių jos visos yra pakeičiamos metilfosfonato liekanomis, standartinės sisntezės metu susidarys 2n diastereomerų mišinys. Dėl sumažėjusios krūvių stūmos sintetinių oligonukleotidų, kuriuose metilfosfonato liekanos yra įjungtos atsitiktiniu principu, prisijungimo giminingumas yra panašus ar netgi šiek tiek mažesnis nei nemodifikuotų oligonukleotidų. Tuo tarpu taisyklingos stereochemijos metilfosfonatai (R konfigūracija ties fosforu) paprastai daug aukštesniu prisijungimo giminingumu. Fosforotioato grupių (R, S mišinys) įvedimas į oligonukleotidą paprastai sumažina lydymosi temperatūrą ~0.41.0°C vienai pakeistai grupei. Lydymosi temperatūra Tm yra temeratūra esant kuriai 50% dvigubų grandinių disocijuoja į viengubas grandines. Tm reikšmės dažnai labai skiriasi priklausomai nuo komplementarios grandinės kilmės (RNR ar DNR). Deja, iki šiol dar nesukurtas streospecifinis 4 metilfosfonatų ir fosforotioatų sintezės metodas, nors fosforotioatams tai yra mažiau aktualu, kadangi jų stereochemija turi mažesnę įtaką prisijungimo giminingumui. α-nukleotidų arba 2’-Oalkilribonukleotidų įvedimas į oligonukleotidą stipriai padidina jo prisijungimo prie RNR giminingumą. Kitas būdas padidinti prisijungimo giminingumą yra konjuguoti oligonukleotidą su interkaliujančiais arba susiuvančiais junginiais, pvz. akridinu arba psoralenu. Trigubą grandinę sudarančių oligonukleotidų prisijungimo giminingumo padidinimui naudojami modifikuotos bazės, pvz. 5’-metilcitozinas. Taip pat buvo sukurti trigubą grandinę formuojantys cikliniai oligonukleotidai, kurie pasižymi dideliu nukleaziniu stabilumu bei dideliu prisijungimo giminingumu. Tokiuose cikliniuose oligonukleotiduose priešprasminė oligonukleotido dalis sudaro dvigubą grandinę pagal Watson-Crick bazių poravimo principą, o trigubą grandinę formuojanti oligonukleotido dalis jungiasi pagal Hoogsteen bazių poravimo principą. Oligonukleotidų sintezė Mažos apimties oligonukleotidų sintezė paprastai atliekama pasitelkiant kietos fazės chemijos ir fosforoamidito metodus. Šiuo metu prekyboje esančių įrenginių DNR sintezei išeiga yra 0.2 µM – 2 mM oligonukleotidų, taigi galima susintetinti keletą gramų oligonukleotidų. Toks kiekis yra pakankamas tiriant jų poveikį gyvūnų organizme. Tačiau norint išplėsti oligonukleotidų taikymą medicinoje yra būtina išplėsti jų sintezės mastus. Vis dar tęsiasi mokslinė diskusija, kokie chemijos metodai (skystos ar kietos fazės sintezė, fosforoamidito, H-fosfonato ar fosfotriesterių chemija) yra tinkamiausi šiam tikslui pasiekti. Naujausiuose metoduose dsidelių kiekių oligonukleotidų sintezei naudojami skysti polimeriniai pagrindai (t.y. derinami kietos ir skystos chemijos pranašumai), arba neapsaugoti monomeriniai oligonukleotidų komponentai, todėl sintezės procesas supaprastėja ir atpinga. Gaminant oligonukleotidus farmacijos pramonei taip pat pradėti naudoti tokie metodai kaip masių spektrometrija ir kapiliarinė elektroforezė. Oligonukleotidų veikimo mechanizmas Kaip minėta, trigubą grandinę sudarantys oligonukleotidai naudojami transkripcijos slopinimui, tuo tarpu priešprasminiai oligonukleotidai – transliacijos slopinimui. Pastarųjų veikimo mechanizmas daugiausiai priklauso nuo pasirinktos taikinio sekos. Priešprasminiai oligonukleotidai gali slopinti: persiuvimą (splaisingą), poliadenilinimą, taisyklingą RNR susilankstymą, translokaciją, iRNR transliacijos iniciaciją arba ribosomų judėjimą išilgai iRNR molekulės. Tačiau yra sunku nustatyti priešprasminių oligonukleotidų poveikio mechanizmą organizme, kadangi jų poveikis gali būti nulemtas iš esmės skirtingų mechanizmų, t.y. poveikis gali būti dėl ląstelės receptorių blokavimo arba tiesioginio viruso fermentų (pvz. DNR polimerazės arba atvirkštinės transkriptazės) slopinimo. Naudojant oligonukleotidus viruso sukeltos ligos gydymui yra sunku įvertinti kokia stebimo biologinio poveikio dalis yra nulemta to, kad užblokuojam viruso adsorbcija ląstelės paviršiuje, o kokia – interferoninės sistemos aktyvacijos. Taip pat vis dar nėra nustatyta, kiek iRNR karpymas ląstelėje esančia RNaze H prisideda prie priešprasminių oligonukleotidų poveikio. RNazė H atpažįsta hibridines DNR-RNR molekules ir perkerpa RNR grandinę. Manoma, kad RNazės H substratas yra DNR-RNR molekulių hibridai, kurių ilgis yra tik kelios bazių poros, todėl RNazės H poveikio pasekmė yra nespecifinis iRNR karpymas. Dėl šios priežasties, jeigu yra naudojami natūralūs fosfodiesteriai arba fosforotioatai, RNazės H poveikis gali susilpninti priešprasminių oligonukleotidų poveikį. Tačiau RNazė H nekerpa daugelio sintetinių oligonukleotidų darinių (metilfosfonatų, α-anomerinių oligonukleotidų, junginių su 2’-O-alkilriboze, defosfooligonukleotidų analogų). Todėl hibridinės molekulės 3’ ir 5’ galuose turinčios RNazės H poveikiui atsparias modifikacijas bei turinčios tik trumpas RNazę H indukuojančias sekas yra intensyviai tiriamos kaip potencialūs padidinto specifiškumo inhibitoriai. Oligonukleotidų taikymas Oligonukleotidų aktyvumas in vitro. Pastaraisiais metais pasirodė nemažai publikacijų, kuriose aprašomas įvairių priešprasminių oligonukleotidų veiksmingumas ląstelių kultūrose. 1 lentelėje yra pateikti keli priešprasminių ir trigubą grandinę sudarančių oligonukleotidų, nukreiptų prieš įvairius 5 virusus, onkobaltymus, receptorius, citokinus, augimo veiksnius, aktyvumų in vitro pavyzdžiai. Daugumoje atvejų efektyvi oligonukleotidų dozė, inhibuojanti ekspresiją, yra 0.1-50 µM. Nemodifikuoti oligonukleotidai yra aktyvūs tik tada, jei ląstelių augimo terpėje nėra serumo. Tuo tarpu fosforotioato oligonukleotidai turi stipresni poveikį nei metilfosfonato oligonukleotidai. Pastarųjų konjugatai su psoralenu stipriai padidina oligonukleotido poveikį, jei jis derinamas su radiacija. Apibendrinant, oligonukleotidų antagonistai pasižymi plačiu spektru specifinių aktyvumų nukreiptų prieš įvairius taikinius: virusus, receptorius, fermentus, onkogenus, augimo veiksnius ir kitus šeimininko genų produktus. Oligonukleotidų aktyvumas in vivo, toksiškumas ir pasiskirstymas organuose. Nesenai buvo įvertintas priešprasminių oligonukleotidų veiksmingumas in vivo. Buvo parodyta, kad ant pelės odos užnešti metilfosfonato oligonukleotidai yra veiksmingi prieš herpes simlex virusą 1 (HSV-1). Taip pat buvo pademonstruota, kad fosforotioato priešprasminiai nukleotidai užnešti ant HSV-1 užkrėstos pelės ragenos slopino virusų dauginimąsi ir visiškai išgydė nuo infekcijos. Šiame eksperimentiniame modelyje priešprasminių oligonukleotidų antivirusinis aktyvumas buvo panašus į trifluorotimidino, bei nebuvo vietinio ar sisteminio toksiško poveikio. Oligonukleotidai su alkilinančiomis grupėmis buvo veiksmingi prieš erkinio encefalito virusą pelėje. Gydant sistemingai, fosforotioato priešprasminiai oligonukleotidai sėkmingai slopino anties hepatito B viruso replikaciją. Taip pat buvo parodyta, kad galima moduliuoti nerimo jausmą priešprasminiais oligonukleotidais specifiškai slopinant neurotransmiterio receptoriaus raišką gyvose smegenyse. Nesenai buvo parodyta, kad c-myb priešprasminiai nukleotidai suleisti į laboratorinės žiurkės organizmą pluroniniame (t.y. nejoniniame detergente, pagamintame iš polioksipropileno glikolio, etileno oksido ir etileno glikolio) tirpale slopina arterijų lygiojo raumens ląstelių kaupimąsi pažeistose kaklo arterijose. Kitas tyrimas atliktas su laboratoriniais gyvūnais parodė, kad specifinio geno raiškos slopinimas priešprasminių oligonukleotidų taikant vietinę nuolatinę perfuziją slopina naviko augimą. Sėkmingas fosforotioato oligonukleotidų, nukreiptų prieš c-myb, taikymas pelių, sergančių pirminiu imunodeficitu gydymui teikia vilčių, kad tokiu pat būdu bus galima gydyti leukemija sergančius žmones. Be to, buvo parodyta, kad priešprasminis branduolio faktoriaus κB slopininimas 3’galo fosforotioatų konjugatais (suleistasi į pelių pilvo ertmę) visiškai sunaikino persodintus žmogaus T-ląstelių limfotropinio viruso 1 (HTVL-1) tax baltymu transformuotus navikus. Pirmas klinikinis tyrimas su žmonėmis buvo nesėkmingas, kadangi po 10 dienų infuzijos fosforotioato priešprasminiu oligonukleotidu (0.05 mg.kg-1.val-1) nukreiptu prieš p53, ligonio, sergančio leukemija, organizme nebuvo jokio atsako. Tačiau šis bandymas taip pat parodė, kad ilgalaikis sistemingas priešprasminių oligonukleotidų vartojimas galimas be didesnių žalingų pasekmių žmogaus organizmui. Tai patvirtina ir tyrimai laboratoriniuose gyvūnuose. Pvz. suaugusių vyriškos lytie žiurkių kūno ir organų masė nepakito po ilgalaikės nuolatinės infuzijos naudojant osmotinę pompą su 50-150 mg fosforotioato oligonukleotidu sudarytu iš 27 monomerų. Kitas tyrimas parodė, kad suleidus (į veną arba pilvo ertmę) fosforotioato oligonukleotidų, oligomeras išlieka organizme iki 48 val., ir yra aptinkamas daugumoje audinių. Taip pat nebuvo pastebėta jokio toksiško poveikio pelei, kuri 14 dienų kas dieną gaudavo 100 mg oligonukleotidų dozę. Tiriant 3’ gale modifikuotų oligonukleotidų pasiskirstymą pelės organuose po vienkartinės intraperitoninės injekcijos buvo parodyta, kad po 4 val. oligonukleotidai aptinkami tirtuose organuose tokia tvarka: inkstai > kepenys > blužnis > širdis, plaučiai > raumenys, ausys >> smegenys. Taigi priešprasminiai ir triviją grandinę formuojantys oligonukleotidai gali būti nepaprastai naudingi įvairių ligų gydymui. Jau dabar yra pasiekta, kad sintetiniai oligonukleotidai išliktų nesuskaidyti serume pakankamai ilgą laiką, kad spėtų pasireikšti jų farmakologinis poveikis. Kuriami nauji modifikuoti oligonukleotidai, pasižymintys geresnėmis savybėmis. Eksperimentai ląstelių kultūrose rodo, kad pakanka mikromolinių priešprasminių oligonukleotidų koncentracijų norin pasiekti reikiamą poveikį. Ir galiausiai, eksperimentai su gyvūnais ir klinikiniai tyrimai su žmonėmis parodė, kad net ilgalaikis oligonukleotidų vartojimas nėra toksiškas organizmui. 6 1 lentelė. Priešprasminių ir trigubą grandinę sudarančių oligonukleotidų aktyvumo in vitro pavyzdžiai. ŽIV – žmogaus imunodeficito virusas, HSV – herpes simplex virusas, VSV – vezikulinio stomatito virusas, SV – beždžionių virusas (angl. simian), P-O – fosfodiesteris, P-S – fosforotioatas, P-Me – metilfosfonatas, (psoralenas) – konjugatas su psoralenu, -(poli-L-Lys) – konjugatas su poli-L-lizinu, -(TF-poli-Lys) – konjugatas su transferinu-poli-L-lizinu, -(akridinas) – konjugatas su akridinu, -(amino) – amonopropandiolfosfatas, tfo – triviją grandinę formuojantis oligonukleotidas. Taikiniai Ląstelės tipas Oligomero tipas Virusai Rauso sarkoma Fibroblastai P-O, P-S ŽIV H T ląstelės P-S HSV Vero P-Me HSV Vero P-Me-(psoralenas) VSV L 929 P-O-(poli-L-Lys) Gripo MDK P-S Hepatito B PLC/PRF/5 P-O, P-S SV 40 CV-1 P-O-(akridinas) [tfo] Branduolio onkobaltymai c-myb HL-60 P-O-(TF-poli-Lys) c-myb BC3H1 P-S c-myc HL-60 P-O, P-S c-myc Burkitt’o P-O ląstelės c-myc T limfocitai P-O Citoplazminiai ir membranos onkobaltymai Ha-ras T24 P-O-Acr Bcl-2 Pre-B ALL P-O, P-S Ląstelės receptoriai ICAM-1 A 549 P-S IGF-1R BALB/c3T3 P-O PB limfocitai P-O-(amino) [tfo] IL2Rα Citokinai ir augimo veiksniai IL-2 T ląstelės P-O Monocitai P-S IL-1β Endotelinės P-O IL-1α CSF-1 Monocitai P-O Efektyvi dozė (µM) Literatūros šaltinis 10 0.5 50-100 5 0.1 1.25 0.3-17 15-30 Zamecnik PC et al. (1978) Proc Natl Acad Sci U S A. Matsukura M et al. (1987) Proc Natl Acad Sci U S A. Smith CC et al. (1986) Proc Natl Acad Sci U S A. Smith CC et al. (1986) Proc Natl Acad Sci U S A. Lemaitre L et al. (1987) Proc Natl Acad Sci U S A. Leiter L et al. (1990) Proc Natl Acad Sci U S A. Goodarzi G et al. (1990) J Gen Vir. Birg F. Et al. (1990) Nucleic Acids Res. 50 10-25 10 100 Citro G et al. (1992) Proc Natl Acad Sci U S A. Simons M et al. (1992) Circ Res. Wickstrom EL et al. (1989) Cell Dev. Biol. McManaway ME et al. (1990) Lancet 30 Heikkila R et al. (1987) Nature 1-10 25-150 Wickstrom EL et al. (1989) Cell Dev. Biol. Reed JC et al. (1990) Cancer Res. 0.5-1 15 10 Chiang M.-Y et al (1991) J. Biol. Chem. Surmacz E et al. (1992) Exp. Cell. Res. Orson FM et al. (1991) Nucleic Acids Res. 5 0.5-2.5 10 5-10 Harel-Bellan A et al. (1988) J. Exp. Med. Manson J et al. (1990) Lymphokine Res. Maier JA et al. (1990) Science Birchenall RM et al. (1990) J. Immunol. Literatūra 1. Molecular Biology and Biotechnology: A Comprehensive Desk Reference. (1995) Robert A. Meyers (Editor), Wiley-VCH, ISBN: 978-0-471-18571-0 2. Chan JH, Lim S, Wong WS. (2006) Antisense oligonucleotides: from design to therapeutic application. Clin Exp Pharmacol Physiol. 33:533-40. 7 GENETINĖ IMUNIZACIJA Pagrindinių sąvokų apibrėžimai Biolistinis prietaisas – prietaisas, naudojamas tiesioginiam genetinės medžiagos įvedimui į gyvą ląstelę ląstelių kultūroje arba gyvo organizmo ląstelę. Ląstelinis imunitetas – citotoksinių T limfocitų ir/arba makrofagų aktyvacija prieš specifinius antigenus. Humoralinis imunitetas – antikūnų gamyba antigenais aktyvuotuose B limfocituose. Imunizacija – humoralinio ir ląstelinio imuniteto prieš specifinį antigeną susidarymas, kai imuninė sistema vienokiu ar kitokiu būdu susiduria su tuo antigenu. Virusų ar bakterijų vektoriai – modifikuoti virusų ar bakterijų genomai, į kuriuos įvesiti virusui ar bakterijai svetimi genai, kurie užtikrina svetimo geno produkto patekimą į ląstelę taikinį. Įvadas Genetinė imunizacija (GI) yra priemonė sukelti imuninį atsaką prieš specifinius baltymus, gyvūno ląstelėje ekspresuojant genus, koduojančius tuos baltymus. Ilgalaikis antigeno buvimas in vivo sąlygom sukelia žymią antigeno amplifikaciją ir imuninės sitemos stimuliaciją, ir galiausiai sukelia imuninį atsaką prieš tą antigeną. Buvo sukurti įvairūs biologiniai ir fiziniai metodai, kurių pagalba aktyvūs genai yra pernešami į gyvūnų ląsteles. Genetinė imunizacija reikalauja mažiau laiko, pinigų ir darbo sąnaudų lyginant su baltyminių vakcinų paruošimu, kadangi DNR manipuliacijos yra paprastos ir įvairios, ir DNR gali būti išgryninta iki homogeniškumo be jokių sunkumų. Genetinė imunizacija imituoja natūralių interferonų poveikį, nes jos dėka vyksta ilgalaikė geno raiška tik tam tikroje to paties tipo ląstelių populiacijoje. Dėl to gali gamintis didesni kiekiai antikūnų ir pailgėti jų gamybos trukmė lyginant su antikūnų gamybos stimuliacija įprastomis priemonėmis. Be to, genetinė imunizacija gali sukelti specifinį T ląstelių atsaką, kurio nesukelia baltyminių imunogenų inokuliacija. Vakcinacija yra svarbiausia medicininė priemonė ligų prevencijai. Be to, tai nepakeičiamas įrankis šiuolaikiniuse biologiniuse tyrimuose. Nors kiekvienais metais didelis skaičius žmonių ir gyvūnų gyvybių yra apsaugomos imunizacijos dėka, tačiau dabartinių imunizacijos metodų taikymas yra apribotas dėl tam tikrų sunkumų (pvz. didelės išlaidos ir būtinybė vakcinas laikyti šaltai). Todėl vis dar neįmanoma kovoti su daugelių ligų, kadangi vakcinos arba nepakankamai veiksmingos, arba jų iš viso nėra. Pastaraisiais metais iš esmės pasikeitė požiūris į vakcinų kūrimą. Tradicinis būdas sukelti imuninį atsaką yra inokuliuoti žmogų arba gyvūną negyvais arba gyvais susilpnintais patogenais, arba išgrynintais baltyminiais antigenais. Negyvų ar gyvų susilpnintų patogenų nadojimas yra rizikingas, kadangi visda išlieka galimybė, kad dalis patogenų gali būti nenužudyta ar nepakankamai susilpninta. Baltymų gryninimas reikalauja didelių laiko sąnaudų, yra brangus, o kartais sunkus ar neįmanomas. Biotechnologijų pažanga leido klonuoti genus, koduojančius specifinius baltymus, bei įvesti tuos genus į gyvūnų organizmą, kad baltymas būtų sintetinamas organizmo ląstelėse. DNR manipuliacijos yra paprastesnės, įvairesnės ir pigesnės nei baltymų manipuliacijos. Specifinių genų įvedimas į gyvūno organizmą, kad vyktų imunogenų sintezė in vivo bovo pavadintas “genetine imunizacija”. Pirmoji aprašyta vakcina prieš raupus pagaminta naudojant vaccinia virusą iš esmės yra gnetinės imunizacijos pirmtakė. Skirtumas yra tas, kad genetinėje imunizacijoje specifiniai genai atsakingi už imunizaciją yra gerai ištirti ir gali būti įjungti į įvairius ekspresijos vektorius. Ideali imunizacijos procedūra: (i) turi turėti kuo mažiau šalutinių poveikių, įskaitant individus su imuninės sitemos sutrikimais, (ii) negali būti toksiška ar stimuliuoti navikų formafimąsi, (iii) negali sklisti nuo vakcinuoto individo nevakcinuotam bei teršti aplinkos. Taip pat svarbu, kad imunizacijos pasekmė būtų veiksmingas ir ilgalaikis humoralinis ir ląstelinis imunitetas. Vakcinos gamybos kaina turėtų būti žema, o vakcinacijos procedūra – paprasta. Kol tokia ‘ideali’ vakcina dar nesukurta, kaip minėta anksčiau, genetinė imunizacija turi privalumų lyginant su įprastom vakcinom. 1 Sėkmingai genetinei imunizacijai yra nepaprastai svarbu, kad genetinė medžiaga būtų saugiai pernešta į ląstelę taikinį, ir, kad pernešto geno raiška užtikrintų pakankamo kiekio baltymo-antigeno sintezę, kuris sukeltų imunininį atsaką. Yra keletas būdų atlikti genetinę imunizaciją: (i) įvedus antigeną koduojantį geną į infekcinį, bet nepatogeninį nešiklį, arba (ii) DNR gali būti įterpta į šeimininko ląstelę fiziškai. Bet kuriuo atveju, tam, kad vyktų imunogeninio geno raiška, įvedama DNR turi pereiti viduląstelines membranas ir atsidurti reikiamo vietoje. Metodai, naudojami šiam tikslui pasiekti yra aprašyti sekančiuose skyreliuose. DNR įvedimo į ląstelę metodai Aktyvių genų įvedimas į ląsteles naudojant virusų ir bakterijų vektorius. Pastaraisiais metais buvo sukurta keletas virusinių ir bakterinių gyvų rekombinantinių vakcinų nešiklių. Evoliucijos eigoje šie mikroorganizmai įgijo mechanizmus, kurių pagalba gali pernešti savo genetinę medžiagą į šeimininko ląstelę. Šiuolaikiniai biotechnologijos metodai leidžia mus dominančius genus įvesti į viruso ar bakterijos genomą, o infekcijos pasėkoje mus dominantis genas yra sėkmingai ekspresuojamas šeimininko ląstelėje. Tinkamiausi vektoriai rekombinantinių vakcinų gamybai yra: vaccinia virusas, adenovirusai, retrovirusai, BCG (bacillus Calmette-Guerin), Escherichia coli, Salmonella typhimurium, kiti pox virusai, herpesvirusai ir poliovirusai. Tačiau padėtis gali komplikuotis dėl imuninio atsako į vektorių suaugusiuose individuose, kurie anksčiau buvo imunizuoti prieš virusą/bakteriją vektorių, arba buvo infekuoti tuo virusu ar bakterija. Neaišku kaip jau esantis imunitetas bet kuriam adenovirusų serotipui paveiktų pirminę ar antrinę imunizaciją adenoviruso rekombinantiniu vektoriumi. Vaccinia viruso rekombinantų veiksmingumas taip pat yra abejotinas individuose, kurie buvo anksčiau imunizuoti vaccinia virusu. Kadangi oraganizme jau yra imunitetas šiems virusasms, imuninis atsakas į šių virusų rekombinantinius baltymus gali būti labai mažas. Kai kurie retrovirusai yra šiek tiek imunogeniški, tačiau dauguma yra imunosupresoriai. Antigeną ekspresuojančių autologinių ląstelių reinplantacija. Vienas iš galimų būdų sukelti imuninį atsaką yra ex vivo modifikuotų autologinių (t.y. paimtų iš to paties individo) ląstelių reinplantacija į organizmą. Tokios procedūros metu ląstelės yra pirmiausiai paimamos iš organizmo. Tada in vitro į ląstelę įvedamas antigeną koduojantis genas ir ląstelė grąžinama į organizmą (gali būti infuzuojama, implantuojama arba įvedama pirmiausiai ląstelę patalpinus į porėtos membranos kapsulę). Nors metodas yra daug sudėtingesnis, nei tiesioginis genų įvedimas in vivo, tačiau įvedant genus ex vivo išvengiama kai kurių su saugumu susijusių problemų. DNR injekcijos į raumens audinį. Aukštą heterologinių genų raiškos lygį raumens ląstelėse galima pasiekti tiesiogiai į skeleto raumens audinį injekuojant gryną RNR ar DNR. Tikslus mechanizmas, kaip polinukleotidai patenka į raumens ląstelę yra nežinomas, tačiau įmanoma, kad ląstelės išorėje esanti DNR ar RNR gali patekti į vidų, kai fizinio aktyvumo metu raumens ląstelės išsitempia ir jų plazminėje membranoje atsiranda plyšiai. Buvo parodyta, kad naudojant šį metodą taip pat galima sukelti imuninį atsaką. Biolistinis DNR įvedimas į odos ląsteles. Biolistika (biologinė balistika) yra ląstelių transfekcijos metodas, kuriame DNR įvedimas į ląstelę atliekamas apšaudant ląstelę DNR padengtomis mikrodalelėmis. Buvo parodyta, kad inokuliavus aukso mikrodaleles, padengtas plazmidėmis ekspresuojančiomis žmogaus baltymus, į pelės odą galima sukelti humoralinį imuninį atsaką į keletą antigenų. Naudojant šį metodą pirminė imunizacija gali būti stimuliuojama pakartotinai įvedant DNR. Naudojant tradicinius imunizacijos baltymais metodus imuninis atsakas pasireiškia po kelių savaičių ir tada nuslopsta, tuo tarpu po DNR injekcijos didelis antikūnų kiekis išlieka praėjus keliems menesiams po inokuliacijos. Nors ląstelinis imunitetas po tokios procedūros nebuvo kruoščiai tiriamas, tačiau tikimybė, kad jis neišsivystė yra maža, kadangi procedūra buvo labai panaši į natūralią infekciją in vivo sąlygomis. Priešingai nei biologiniai vektoriai išgryninta DNR nepasižymi infekcinėmis savybėmis, taigi yra daud saugesnė. Be to, padidinti procedūros saugumą galima inokuliuojant ląsteles tik į viršutinį odos ląstelių sluoksnį, kurios po kelių dienų apmišta ir yra pašalinamos. Tokiu būdu galima išvengti ilgalaikio modifikuotų ląstelių poveikio. Plazmidinės DNR panaudojimas imunizacijai turi ir kitų privalumų: (i) jos yra mažesnės nei virusų/bakterijų 2 vektoriai, (ii) jas lengva modifikuoti pridedant signalines sekas, ko pasėkoje baltymas bus nukreiptas į pageidaujamą ląstelės vietą (į membraną, arba, kad baltymas būtų sekretuojamas iš ląstelės), ir (iii) plazmidinė DNR yra termostabilesnė. Genetinės imunizacijos taikymo perspektyvos Pagrindinis tikslas kuriant vakcinas yra naudojant minimalų inokuliacijų skaičių gauti didžiausią serumą neutralizuojančių antikūnų titrą ir ilgai trunkantį imunitetą prieš tam tikrą ligą sukelentį patogeną. Genetinės imunizacijos pranašumas yra tai, kad in vivo antigeną gaminančios ląstelės išlieka ilgai, todėl gali užtikrinti ilgai trunkančią imunizaciją. Kaip minėta, genetinės imunizacijos privalumas yra it tas, kad nereikia atlikti techniškai sudėtingo baltymų gryninimo ir adjuvanto parinkimo, kas yra būtina kuriant tradicines vakcinas. Be to, išskyrimo gryninimo procedūros metu gali įvykti konformaciniai baltymų pokyčiai, kas gali neigiamai paveikti jų antigenines savybes. Šios problemos galima išvengti naudojant genetinę imunizaciją. Genetinė imunizacija jau yra sėkmingai pritaikyta laboratorinių ir kai kurių naminių gyvūnų imunizacijai, bei perspektyvoje gali būti taikoma ir žmonių imunizacijai. Genetinė imunizacija yra nauja vakcinų technologijų kryptis. Dabar jau yra įmanoma ekspresuoti dominantį antigeną autentiškoje audinio aplinkoje gyvame organizme, ko pasėkoje audinyje yra sintetinamas natyvios kofigūracijos antigenas, kuris sukelia humoralinį ir ląstelinį imuninį atsaką. Genetinės imunizacijos saugumas yra didžiausia problema, kurią reikia išspręsti prieš pradedant šį metodą naudoti žmonių imunizacijai. Šiuo metu surinktas didelis kiekis informacijos apie vakcinoms naudojamus virusų ir bakterijų vektorius. Biotechnoligijų pažanga leidžia sumažintį jų patogeniškumą modifikuojant jų genomus. Patogeniškumas gali būti susilpnintas į genomą įvedant limfokinų genus. Tačiau potencialus jų onkogeniškumas ir patogeniškumas (ypač kūdikiams ir individams su imuninės sistemos sutrikimais) nusveria jų takymo visai žmonių populiacijai poreikį. Perspektyvoje genetinė imunizacija galėtų būti taikoma vėžio gydymui. Vienas iš dabartinių navikų imunobiologijos tikslų yra surasti būdus sukelti antinavikinį imunitetą ekspresuojant įvairių citokinų genų derinius navikinėse ląstelėse. Nuolatinė citokinų gamyba navikinėse ląstelėse galėtų veikti kaip adjuvantai, pritraukiantys limfocitus prie navikinių ląstelių sankaupų ir stimuliuojantys šių ląstelių sunaikinimą. Yra tikrinama, kuris iš aukčiau aprašytų DNR įvedimo į ląstelę metodų yra veiksmingiausias norint pasiekti specifinę genų ekspresiją išimtinai navikinėse ląstelėse. 3 KAMIENINĖS LĄSTELĖS IR JŲ TAIKYMAS MEDICINOJE Pagrindinių sąvokų apibrėžimai Kamieninė ląstelė – nediferencijuota ląstelė, kuri turi neribotą gebėjimą atsinaujinti dalindamasi, bei gali diferencijuotis į specializuotą audinio ar organo ląstelę. Gemalo (embrioninės) kamieninė ląstelė – nediferencijuotos trijų gemalinių sluoksnių (endodermos, ektodermos ir mezodermos) ląstelės, kurių pagrindinė savybė yra pluripotencija, t.y. gebėjimas diferencijuotis į daugiau nei vieną specializuotų ląstelių tipą. Suaugusio organizmo kamieninės ląstelės (arba somatinės kamieninės ląstelės) – nediferencijuotos ląstelės aptinkamos tarp diferencijuotų audinių ar organų ląstelių suagusių ir vaikų organizme, ir galinčios diferencijuotis į pagrindinius tą audinį ar organą sudarančių ląstelių tipus. Pagrindinė šių ląstelių funkcija yra žuvusių to audinio ar organo ląstelių pakeitimas. Įvadas Kamieninės ląstelės yra svarbios gyvo organizmo funkcionavimui dėl daugelio priežasčių. Ankstyvoje embriono vystymosi stadijoje (3-5 dienos po apvaisinimo), vadinamoje blastocista, kamieninės ląstelės intensyviai dalinasi suformuodamos daugybę specializuotų ląstelių tipų, kurios savo ruožtu suformuoja organizmo audinius ir organus. Kai kuriuose suaugusio organizmo audiniuose (kaulų čiulpuose, raumenyse, smegenyse) aptinkamos suaugusio organizmo kamieninių ląstelių populiacijos, kurių dėka pasenusios, pažeistos ar ligotos ląstelės yra pakeičiamos naujomis. Abiejų tipų kamieninės ląstelės pasižymi ypatingu gebėjimu atsinaujinti bei diferencijuotis praktiškai į bet kurią suaugusio organizmo ląstelę (Pav. 1). Kamieninių ląstelių atsinaujinimas vyksta dėl šių ląstelių gebejimo dalintis dviem skirtingais būdais: simetriškai ir asimetriškai. Ląstelei dalinantis simetriškai susidaro dvi identiškos dukterinės ląstelės pasižyminčios kamieninių ląstelių savybėmis. Ląstelei dalinantis asimetriškai susidaro viena kamieninė ląstelė ir ląstelė, turinti ribotą atsinaujinimo potencialą. Tokia ląstelė pasidalina keletą kartų prieš galutinai diferencijuodamasi į specifinio tipo ląstelę. Manoma, nors ir eksperimentiškai neįrodyta, kad galbūt molekuliniai skirtumai tarp simetriško ir asimetriško dalinimosi gali būti nulemti skirtingos membraninių baltymų (pvz. membranos receptorių) segregacijos dukterinėse ląstelėse. Kamieninė ląstelė Atsinaujinimas Proliferacija Diferenciacija Diferencijuotos ląstelės Pav 1. Kamieninių ląstelių proliferacija. Dalinantis kamieninei ląstelei susidaro dukterinė ląstelė, kuri išlaiko kamieninės ląstelės savybes, ir antra ląstelė, kuri toliau proliferuoja (dalinasi) ir diferencijuojasi į specializuotas ląsteles. Taip pat yra tiriamos signalinės molekulės, kurios perprogramuotų diferencijuotą ląstelę į ląstelę, panašią į kamieninę. Tokios molekulės paprastai yra transkripcijos faktoriai, taip pat onkogenas cmyc. Pradiniai tyrimai parodė, kad paveikus pelės ląsteles tokių anti-diferenciacijos signalinių molekulių mišiniu diferencijuotos ląstelės tampa pluripotentinėmis. Tačiau tokio metodo taikymas ligų terapijai yra nepriimtinas, kadangi procedūros metu ląstelės yra transformuojamos onkogenais. 1 Kamieninių ląstelių tyrimai suteikia naujų žinių apie tai, kaip organizmas vystosi iš vienos ląstelės ir padeda išaiškinti mechanizmus, kaip suaugusiame organizme pažeistos ląstelės yra pakeičiamos naujomis sveikomis ląstelėmis. Taip pat yra intesyviai tiriamos galimybės panaudoti kamienines ląsteles ligų gydymui. Pastaroji tyrimų sritis vadinama regeneracine medicina. Šioje paskaitoje bus aptarti kamieninių ląstelių tipai ir jų funkcijos, bei jų taikymo medicinoje perspektyvos. Suaugusio organizmo kamieninės ląstelės Ankstyvojoje gemalo vystymosi stadijoje gemalinės ląstelės dalinasi labai gretai. Pasidalinusios ląstelės diferencijuojasi į specializuotas audinių ir organų ląsteles. Ląstelėms diferencijuojantis jų dalinimosi greitis ilgainiui sulėtėja ir dauguma suaugusių gyvūnų ląstelių nustoja dalintis ir išlieka G0 ląstelės ciklo stadijoje visą jų gyvavimo trukmę. Tačiau daugelio ląstelių gyvavimo trukmė yra ribota dėl programuotos ląstelės mirties (apoptozės) arba dėl įvairių pažaidų. Todėl, norint palaikyti pastovų ląstelių skaičių suaugusiuose audiniuose ir organuose, mirusios ląstelės turi būti pakeistos naujomis. Balanso palaikymui kai kuriuose audiniuose yra diferencijuotų ląstelių subpopuliacijos, kurios gali dalintis visą gyvūno gyvenimą, taip pakeisdamos mirusias ląsteles (pvz. jungiamąjame audinyje esantys fibroblastai, vidinį kraujagyslių paviršių išklojančios epitelinės ląstelės, kai kurių vidaus organų (kepenų, kasos) epitelinės ląstelės). Tačiau dauguma diferencijuotų ląstelių suaugusių gyvūnų audiniuose nebegali dalintis. Jei tokios ląstelės žūsta, jos yra pakeičiamos dalinantis mažiau diferencijuotoms, gebančioms atsinaujinti ląstelėmis, vadinamos kamieninėmis ląstelėmis, kurios aptinkamos daugumoje suaugusių audinių. Esminė kamieninių ląstelių savybė yra ta, kad joms dalinantis susidaro viena dukterinė ląstelė, kuri išsaugo kamieninės ląstelės savybes ir antra, kuri toliau dalindamasi geba diferencijuotis (Pav. 1). Kamieninės ląstelės yra nepaprastai svarbios audinių ir organų struktūros palaikymui, nes visą gyvūno gyvenimą jos išsaugo gebėjimą dalintis ir pakeisti mirusias diferencijuotas ląsteles. Jos yra ypač svarbios audinių, kurių ląstelės turi trumpą gyvavimo trukmę, atsinaujinimui (pvz. kraujo, epitelinės odos, epitelinės virškinamojo trakto ląstelės). Kamieninės ląstelės taip pat buvo identifikuotos kituose suagusio organizmo audiniuose, įskaitant skeleto raumens ir nervų sistemos audinius, kur jų funkcija yra pažeistų audinio ląstelių pakeitimas. 1961m. E. McCulloch ir J. Till eksperimentiškai pademonstravo, kad viena pelės kaulų čiulpų ląstelė gali dalintis ir diferencijuotis į bet kurią kraujo ląstelę. Taip buvo identifikuota pirmoji kamieninių ląstelių grupė, dalyvaujanti kraujo ląstelių susidaryme (hemopoezėje). Šiuo metu hemopoetinės kamieninės ląstelės yra gerai ištirtos ir puikiai iliustruoja kamieninių ląstelių vaidmenį palaikant diferencijuotų ląstelių populiaciją. Yra keli kraujo ląstelių tipai, kurie turi specializuotas funkcijas: eritrocitai (raudonosios kraujo ląstelės), kurios transportuoja O2 ir CO2, granuliocitai ir makrofagai (fagocitinės ląstelės), kraujo plokštelės (trombocitai), kurios susidaro iš megakariotų dalyvauja kraujo krešėjime, ir limfocitai, kurie dalyvauja imuniniame atsake. Visų šių ląstelių gyvavimo trukmė yra ribota (diapazonas nuo mažiau nei vienos dienos iki kelių mėnesių) ir jos visos yra kilusios iš tos pačios hemopoetinių kamieninių ląstelių populiacijos. Kiekvieną dieną žmogaus organizme žūsta daugiau nei 100 milijonų kraujo ląstelių, ir toks pats kiekis naujų ląstelių susidaro iš hemopoetinių ląstelių kaulų čiulpuose. Hemopoetinių ląstelių palikuonys paprastai kelis kartus pasidalina prieš pasirinkdamos specifinį diferenciacijos kelią, kurį savo ruožtu nulemia specifiniai augimo faktoriai. Pilnai diferencijavusios kraujo ląstelės nustoja dalintis. Taigi hemopoetinių kamieninių ląstelių proliferacija užtikrina pastovaus diferencijuotų ląstelių skaičiaus palaikymą. Žarnyno epitelinių ląstelių atsinaujinimo procesas iliustruoja, kaip atsinaujina epitelinis audinys. Žarnyno vidus yra išklotas vienu sluoksniu epitelinių ląstelių, kurių funkcija yra maisto virškinimas ir maisto medžiagų sugėrimas. Kadangi epitelinės ląstelės nuolat yra nepalankioje aplinkoje, jų gyvavimo trukmė yra tik kelios dienos. Taigi epitelio atsinaujinimas vyksta visą organizmo gyvenimą. Naujos ląstelės susidaro žarnų kriptų dugne nuolat dalinantis kamieninėms ląstelėms. Dalinantis kamienėms ląstelėms susidaro pereinamų-amplifikuojančių ląstelių (angl. transitamplifying cells) populiacija, kurios savo ruožtu greitai dalinasi ir užima apie du trečdalius kriptos. Pereinamos-amplifikuojančios ląstelės dalinasi 3-4 kartus ir tada diferencijuojasi į tris epitelinių 2 ląstelių tipus: absorbcines epitelines ląsteles ir du tipus sekretuojančių ląstelių vadinamas gobleto ląsteles ir enteroendokrinines ląsteles. Plonosiose žarnose taip pat susidaro ketvirtas ląstelių tipas, vadinamos Peneth’o ląstelės, kurios sekretuoja antibakterines medžiagas. Taip pat yra aprašytos kamieninės ląstelės dalyvaujančios odos ir plaukų atsinaujinimo procese. Odos ir plaukų ląstelės nuolat susidaria su nepalankiom aplinkos sąlygom (pvz. saulės ultravioletinė spinduliuotė) ir lygiai kaip ir žarnyno epitelinės ląstelės atsinaujina visą organizmo gyvenimą. Žmogaus epidermis pasikeičia kas dvi savaites, nusineriant paviršiuje esančioms ląstelėms. Epidermis yra daugiasluoksnis epitelis. Pamatinemia epidermio sluoksnyje yra vienos ląstelės storio kamieninių ląstelių sluoksnis. Dalinantis epidermio kamieninėms ląstelėms susidaro pereinamosamplifikuojančios ląstelės, kurios pasidalina 3-6 kartus ir juda link išorinio epidermio sluoksnio. Plaukas yra odos darinys sudarytas iš sukietėjusių epidermio ląstelių. Plauko folikulo sienelėje yra kamieninių ląstelių sankaupa, kurių dalinimasis lemia plauko augimą. Dalinantis kamieninėms ląstelėms susidaro pereinamos-amplifikuojančios matrikso ląstelės, kurios proliferuoja ir diferencijuojasi suformuodamos plauko stiebą. Pažeidus galvos odą plauko kamieninės ląstelės gali diferencijuotis į epidermį. Tai rodo, kad tai multipotentinės kamieninės ląstelės iš kurių gali susidaryti ir oda ir plaukas. Skirtingai nei hematopoetinių, žarnyno epitelio ir odos epidermio kamieninių ląstelių, skeleto raumens kamieninių ląstelių funkcija yra ne nuolatinis atsinaujinimas, o pažaidų taisymas. Skeleto raumuo yra sudarytas iš didelių daugiabranduolinių ląstelių (raumens skaidulų), kurios susidaro susiliejant ląstelėms organizmo vystymosi metu. Paprastai skeleto raumuo yra stabilus audinys, kuriame ląstelių kaita yra labai maža. Tačiau sužeidus arba po fizinio aktyvumo raumuo gali greitai regeneruoti dėl raumens kamieninių ląstelių, kurios vadinamos satelitinėmis, proliferacijos. Satelitinės ląstelės yra išsidėstę tarp raumens skaidulos plazminės membranos ir sarkolemos (angl. basal lamina). Paprastai jos būna neaktyvios, sustoję G0 ląstelės ciklo fazėje. Sužeidimas arba fizinis aktyvumas gali aktyvuoti šias ląsteles, jos pradeda dalintis, naujos ląstelės susilieja ir suformuoja naują raumens skaidulą. Kamieninės ląstelės taip pat buvo identifikuotos ir kituose suagusiuose audiniuose: smegenyse, akies tinklainėje, širdyje, plaučiuose, inkstuose, kepenyse, kasoje. Manoma, kad daugumoje, o galbūt netgi visuose audiniuose yra kamieninių ląstelių. Taip pat tikėtina, kad kamieninės iš vieno tipo audinio gali diferencijuotis į kito tipo audinį. Toks reiškinys buvo pavadintas “vystymosi plastiškumu”. Pavyzdžiui buvo atlikti eksperimentai, kuriuose iš kaulų čiulpų izoliuotos hematoetinės kamieninės ląstelės buvo paveiktos taip, kad diferencijavosi į plaučių ląsteles. Tačiau suaugusių kamieninių ląstelių vystymosi plastiškomo ribos išlieka kontraversišku klausimu. Suaugusių kamieninių ląstelių taikymas medicinoje Suaugusių kamieninių ląstelių gebėjimas regeneruoti pažeistą audinį neabejotinai gali būti naudingas klinikinėje medicinoje. Jei būtų įmanoma tokias ląsteles izoliuoti ir dauginti auginant ląstelių kultūroje, jos galėtų būti panaudotos pažeisto audinio pakeitimui ir įvairių ligų gydymui, pvz. diabeto arba tokių neurodegeneracinių ligų kaip Parkinsono arba Alchaimerio liga. Kaulų čiulpų transplantacija kai kurių vėžinių susirgimų gydymui yra vienas iš šiuo metu plačiai taikomų suaugusių kamieninių ląstelių panaudojimo pavyzdžių. Tradiciškai vėžiniai susirgimai yra gydomi chemoterapija, t.y. panaudojant vaistus, kurie nužudo greitai besidalinančias vėžines ląsteles pažeisdami DNR ir inhibuodami DNR replikaciją. Tokio gydymo trūkumas yra tas, kad šie vaistai yra nespecifiniai ir pažeidžia ne tik vėžines, bet ir normalių audinių ląsteles (pvz. kraujo, odos, plaukų, virškinamojo epitelio), kurių atsinaujinimas priklauso nuo pastovaus kamieninių ląstelių atsinaujinimo. Hemopoetinės kamieninės ląstelės yra vienos iš greičiausiai besidalinančių kūno ląstelių, todėl toksiškas antivėžinių vaistų poveikis šioms ląstelėms dažnai apriboja chemoterapijos efektyvumą. Kaulų čiulpų transplantacija suteikia galimybę ištaisyti vėžinių vaistų toksiškumo padarinius ir leidžia gydymui naudoti didesnes vaistų dozes, ko pasėkoje gydymas tampa efektyvesnis. Pirmąjame tokio gydymo etape pacientui yra paskiriama intensyvesnė chemoterapija, nei įprastom sąlygom ligonis galėtų ištverti dėl toksiško vaistų poveikio kraujodaros sistemai. Antrąjame etape, pabaigus chemoterapiją, ligoniui yra transplantuojamos naujos 3 hemopoetinės kamieninės ląstelės (izoliuotos iš kaulų čiulpų arba periferinio kraujo) ir taip yra išvengiama potencialiai mirtinų vaistų sukeltų pažeidimų ir atstatoma normali kraujodaros sistemos funkcija. Kai kuriais atvejais kamieninės ląstelės yra izoliuojamos iš paciento audinių prieš chemoterapiją, saugomos iki chemoterapijos pabaigos, o tada transplantuojamos atgal ligoniui. Tačiau tokiu atveju yra ypač svarbu, kad izoliuotų ląstelių populiacijoje nebūtį vėžinių ląstelių. Kita galimybė yra ląsteles transplantacijai gauti iš sveiko donoro (paprastai artimo giminaičio), turintčio su ligonio suderinamo tipo audinius. Taip pat hemopoetinės kamieninės ląstelės gali būti izoliuojamos iš su ligoniu giminystės ryšiais nesusijusio donoro virkštelės kraujo. Be vėžio gydymo hemopoetinės kamieninės ląstelės taip pat yra naudojamos ligonių, sergančių kraujodaros sistemos ligomis, pvz. aplastinei anemijai, su hemoglobino defektais ar imunodeficitu susijusioms ligoms. Klinikinį pritaikymą taip pat turi ir epitelinės kamieninės ląstelės: jos gali būti naudojamos odos persodinimui ligoniams su nudegimais, žaizdom ir opom. Tam epiderminės odos ląstelės yra auginamos in vitro, kol sudaro reikiamo ploto epitelio lakštą, kuris yra persodinamas ligoniui. Kadangi paties ligonio oda gali būti panaudota tokiai procedūrai, yra išvengiama komplikacijų susijusių su audinio atmetimu dėl imuninės sistemos poveikio. Šiuo metu intensyviai vykdomi suaugusių kamieninių ląstelių eksperimentiniai ir klinikiniai tyrimai, siekiant jas pritaikyti kuo plastesnio ligų rato gydymui. Suaugusio organizmo kamieninių ląstelių klinikinis taikymas yra ribotas dėl sunkumų, susijusių su reikiamų kamieninių ląstelių populiacijų izoliavimu ir kultivavimu. Be to, daugelyje suaugusių audinių kamieninės ląstelės iki šiol dar nėra identifikuotos. Nepaisant to, suaugusio organizmo kamieminės ląstelės jau sėkmingai naudojamos kai kurių ligų gydymui (Parkinsono ligos, pirmo tipo diabeto ir nugaros smegenų sužeimų), kai tuo tarpu gemalo kamieninių ląstelių panaudojimas medicinoje išlieka teorinis. Kadangi suagusio organizmo kamieninių ląstelių naudojimas medicinos tikslams yra etiškai priimtinesnis nei gemalo kamieninių ląstelių (t.y. nereikia sunaikinti gemalo norint jas izoliuoti) ir jos sukelia mažiau pavojų paciento sveikatai, jų taikymo galimybių plėtojimas yra labiau skatinamas. Gemalo kamieninės ląstelės Kaip minėta, suaugusio organizmo (somatines) kamienines ląsteles yra sunku izoliuoti ir auginti kultūroje. Tuo tarpu palyginti paprasta yra izoliuoti ir dauginti kamienines ląsteles iš ankstyvos stadijos gemalo. Šios ląstelės vadinamos gemalo kamieninėmis ląstelėmis (GKL). GKL gali būti neribotai auginamos grynose kamieninių ląstelių populiacijose, kur jos išsaugo gebėjimą dalintis ir diferencijuotis į bet kurio tipo specializuotą suaugusio organizmo ląstelę, t.y. yra pluripotentinės. Dėl šios priežasties susidomėjimas embrioninių kamieninių ląstelių taikymo galimybe fundamentaliojo mokslo ir klinikiniuose tyrimuose yra nepaprastai didelis. GKL iš pelės blastocistų vidinių ląstelių masės buvo izoliuotos ir pradėtos kultivuoti 1981m. (Evans & Kaufman, 1981). Šios ląstlės gebėjo neribotai daugintis in vitro, o įvestos atgal į ankstyvos stadijos embrioną jos diferencijavosi į visų pelės audinių ląsteles. Žmogaus GKL buvo izoliuotos iš žmogaus balstocistos (3-5 dienų amžiaus gemalų) vidinių ląstelių masės (sudaryta iš 50-150 ląstelių) ir pradėtos kultivuoti 1998m. (Thomson et al., 1998). Dėl jau minėto neriboto GKL gebėjimo atsinaujinti ir pluripotencijos, šios ląstelės yra potencialiai naudingos regeneracinėje medicinoje (kaip ląstelių šaltinis pakeičiant pažeistą audinį). Šiuo metu daug pastangų yra dedadama atrenkant optimalias kultivavimo sąlygas, kuriant naujas GKL linijas tinkamas klinikiniam taikymui, bei ieškant efektyvių metodų įgalinančių kryptingą diferenciacijos stimuliaciją. Tačiau norint panaudoti terapinį GKL potencialą pirmiausiai yra būtina suprasti molekulinius mechanizmus nulemiančius specifines šių ląstelių savybes. Iki šiol mechanizmai nulemiantys GKL atsinaujinimą ir pluripotenciją yra nepilnai išaiškinti. Nors žmogaus GKL turi kanoninį ląstelės ciklą sudarytą iš G1, S, G2 ir M fazių, tačiau dėl gerokai trumpesnės G1 fazės bendra ciklo trukmė yra gerokai trumpesnė, nei somatinių ląstelių (trunka 1516 val.), ir tai bent jau iš dalies nulemia greitą GKL dalinimąsi. Buvo nustatyta, kad GKL transkriptoma (t.y. tam tikrame audinyje ir tam tikrom sąlygom esantis aktyvuotų genų, mRNR, ar 4 transkriptų rinkinys) yra daug paprastesnė nei specializuotų ląstelių. Todėl tikėtina, kad reguliaciniai veiksniai susiję su specifiniais audinių fenotipais neturi įtakos GKL proliferacijai. In vivo pluripotencija ir greitas GKL dauginimasis yra laikinas reiškinys. Gemalui vystantis, ląstelių dauginimasis lėtėja, ir tuo pačiu yra aktyvinama ląstelių diferenciacija į specifinius ląstelių tipus. Pastarieji reiškiniai yra susiję su mechanizmų, reguliuojančių tam tikrą fenotipą nulemiančių genų raišką, įjungimu. Šiuo metu jau nustatyti keli GKL dalinimąsi ir pluripotenciją reguliuojantys veiksniai: transkripcijos faktoriai, ląstelės ciklo reguliatoriai, mikro RNR, genai, susiję su chromosomų stabilumu ir DNR metilinimu. Tikslūs GKL atsinaujinimą ir pluripotenciją nulemiantys molekuliniai mechanizmai yra intensyviai tiriami, kadangi šios žinios padėtų tobulinti GKL auginimo ląstelių kultūroje metodus ir leistų sukurti ląstelių diferenciacijos valdymo strategijas, kas savo ruožtu labai svarbu, norint panaudoti šias ląsteles ligų terapijai. In vitro sąlygom pelės gemalo kamieninės ląstelės yra auginamos terpėje su LIF (angl. Leukemia Inhibitory Factor, leukemiją slopinantis veiksnys), kuris yra būtinas, norint išlaikyti ląsteles nediferencijuotoje būsenoje. LIF signalas yra perduodamas JAK-STAT signalo perdavimo keliu. LIF sąveika su ląstelės plazminėje membranoje esančiu citokinų receptoriumi aktyvuoja Janus kinazę (JAK), kuri fosforilina citokinų receptorių. Receptoriaus fosforilinimas skatina STAT (angl. Signal Transducers and Activators of Transcription, signalo perdavėjai ir transkripcijos aktyvatoriai) prisijungimą prie receptoriaus. JAK fosforilina prisijungusį STAT, kas stimuliuoja STAT hetero ir homodimerų susidarymą. STAT dimerai kaupiasi ląstelės branduolyje ir aktyvina tam tikrų genų raišką. Jeigu LIF yra pašalinamas iš terpės ląstelės susikaupia į struktūras, panašias į gemalą (embrioidinius kūnus) ir diferrencijuojasi į įvairius ląstelių tipus: neuronus, adipocitus, kraujo ląsteles, epitelines ląsteles, lygiojo raumens ląsteles, ir netgi gali suformuoti plakančią širdį. Žmogaus GKL kultivavimui nereikia LIF, tačiau norint jas išlaikyti nediferencijuotas naudojami kiti augimo faktoriai, kurių prigimtis dar nevisai išaiškinta. Svarbu yra tai, kad į kultivavimo terpę pridėjus reikiamų augimo faktorių galima stimuliuoti GKM diferenciaciją į norimo tipo ląsteles. Tokiu būdu galima pagaminti nemažą kiekį vieno tipo ląstelių (pvz. širdies arba nervinių ląstelių), kurios gali būti panaudotos transplantacijai. Pvz. jau yra sukurti pelės GKL diferecijavimo į neuronus metodai. Tokie neuronai buvo panaudoti transplantacijai į mielino ir Parkinsono liga sergančius graužikus. Šiuo metu daug tyrimimų yra atliekama siekiant atrinkti GKL kultivavimo sąlygas, kurios skatintų GKL diferenciaciją į tam tikro tipo ląsteles. Gemalo kamieninių ląstelių panaudojimo medicinoje perspektyvos Nepaisant to, kad GKL buvo pradėtos kultivuoti 1981m., vis dar nėra patvirtintų žmogaus gydymo metodų naudojant GKL. GKL yra linkę suformuoti auglius ir piktybines karcinoma, dėl to GKL transplantai dažnai atmetami organizmo. Daugelyje šalių paskelbti moratoriumai moksliniams GKL tyrimams arba naujų GKL ląstelių linijų kūrimui. Teoriškai išlieka galimybė, kad GKL ateityje bus panaudotos regeneracinėje medicinoje (kaip minėta, suaugusio organizmo kamieninės ląstelės jau naudojamos) kaip ląstelių šaltinis fiziškai ar ligos pažeistų audinių regeneracijai. 1997 metais I. Wilmut su kolegomis pirmą kartą klonavo avį, taip pradėdami naują regeneracinės medicinos erą. Avis Dolly išsivystė iš neapvaisinto kiaušinėlio, į kurį vietoj normalaus kiaušinėlio baranduolio buvo įvestas pieno liaukos epitelinės ląstelės branduolys. Tokia procedūra vadinama somatinės ląstelės branduolio pernešimu. Somatinių ląstelių branduolio pernešimas iš somatinės ląstelės į kiaušialąstę su pašalintu branduoliu buvo panaudotas kuriant įvairių žinduolių rūšių klonus: avies, pelės, kiaulių, galvijų, ožkų, triušių ir kačių. Tačiau klonavimas naudojant somatinių ląstelių branduolio pernešimo procedūrą yra labai neefektyvus: gyvibingas palikuonis išsivysto tik iš 1-2% embrionų. Apjungus gyvūnų klonavimą naudojant somatinių ląstelių branduolio pernešimo procedūrą su GKL savybėmis atsiranada terapinio klonavimo galimybė. Terapinio klonavimo proceso metu branduolys iš suagusio organizmo ląstelės pernešimas į kiaušialąstę su pašalintu branduolio. Iš gautos ląstelės in vitro sąlygom užauginamas ankstyvos stadijos gemalas. Iš gemalo izoliuojamos GKL ir auginamos kultūroje, kur gali būti dirbtinai stimuliuojama jų diferenciacija į reikiamo tipo specializuotas ląsteles, kurios savo ruožtu gali būti panaudotos transplantacijai tam pačiam 5 somatinio branduolio donorui. Pagrindinis terapinio klonavimo privalumas yra tas, kad susidariusio gemalo ląstelės yra genetiškai identiškos ląstelėms individo, kuriam GKL bus transplantuojamos, tokiu būdu išvengiant problemų susijusių su transplantuoto audinio atmetimu dėl imuninės reakcijos. Terapinio klonavimo derinimo su genų pernešimu efektyvumas buvo pademonstruotas gydant įgimtu imunodeficitu sergančią pelę. Šia imunodeficito forma pelės serga dėl geno, koduojančio RAG2 baltymą, mutacijos. RAG2 reguliuoja genų, susijusių su funkciškai aktyvių antikūnų ir T ląstelių receptorių susidarymu, rašką limfocituose. Sergančių pelių fibroblastų branduoliai buvo įvesti į pelės kiaušialąstę, iš kurios buvo pašalintas branduolys. Iš gauto gemalo buvo izoliuotos GKL, kurios buvo auginamos kultūroje. RAG2 geno defektas buvo ištaisytas į GKL įvedant plazmidinį vektorių su funkciškai aktyviu RAG2 genu. Toliau buvo stimuliuojama gautų GKL diferenciacija į hematopoetines kamienines ląsteles, o pastarosios buvo transplantuotos sergančiai pelei. Buvo parodyta, kad toks gydymas bent iš dalies pagydo pelių imunodeficitą. Iš esmės terapinis klonavimas galėtų būti vienu iš geriausiu būdų gydyti tokioms sunkioms ligoms kaip Parkinsono liga, Alchaimerio liga, diabetas ir nugaros smegenų pažaidos. Nors tyrimai, atlikti su gyvūnais, teikia vilčių, dar nemažai problemų turi būti išspręsta prieš pradedant taikyti terapinį klonavimą žmonių gydymui. Pagrindinės problemos: (i) etinės (ypač dėl gemalo sunaikinimo ir reprodukcinio klonavimo galimybės), (ii) poreikis tobulinti gemalų kūrimo metodus, (iii) poreikis tobulinti kryptingos GKL direfenciacijos stimuliacijos metodus. Literatūra 1. Cooper GM, Hausman RE. The Cell: A Molecular Approach (4th edition). (2007) ASM press, Washington, D.C ir Sinauer Associates Inc., Sunderland, Massachucettes, ISBN-13 978-087893-220-7. 2. Animal cell culture: a practical approach (3rd edition). (2000) Masters JR, ed, Oxford University Press, New York, ISBN 0-19-963797-0. 3. Becker KA, Ghule PN, Therrien JA, Lian JB, Stein JL, van Wijnen AJ, Stein GS. (2006) Selfrenewal of human embryonic stem cells is supported by a shortened G1 cell cycle phase. J Cell Physiol. 209:883-893. 4. Liu N, Lu M, Tian X, Han Z. (2007) Molecular mechanisms involved in self-renewal and pluripotency of embryonic stem cells. J Cell Physiol. 211:279-286. 5. Serakinci N, Keith WN. (2006) Therapeutic potential of adult stem cells. Eur J Cancer. 42:1243-1246. 6. Perin EC, Geng YJ, Willerson JT. (2003) Adult stem cell therapy in perspective. Circulation. 107:935-938. 7. Alison MR, Lovell MJ, Direkze NC, Wright NA, Poulsom R. (2006) Stem cell plasticity and tumour formation. Eur J Cancer. 42:1247-1256. 6 ORGANŲ REGENERAVIMAS Pagrindinių sąvokų apibrėžimai Alogeninis – iš tos pačios rūšies organizmo, bet genetiškai skiriasi. Angiogenezė – naujų kraujagyslių susidarymas, vaskuliarizacija. Autogeninis – iš to paties organizmo. Makrokapsuliacija – didelės ląstelių masės ar audinio patalpinimas į biopolimerinę membraną, norint išvengti imuninės sistemos atsako. Mikrokapsuliacija – vienos ar kelių ląstelių patalpinimas į biopolimerinę membraną, norint išvengti imuninės sistemos atsako. Ksenogeninis – iš skirtingų rūšių organizmų. Įvadas Dirbtinių organų panaudojimas gali turėti labai didelį poveikį medicinos praktikai gydant įvairias įgytas ir paveldėtas ligas. Tikimasi, kad ateityje ląstelių persodinimas gali tapti alternatyviu metodu donorų organų persodinimui. Kadangi daugelis ląstelių populiacijų gali būti padaugintos auginant jas ląstelių kultūroje, tereikia nedidelio kiekio donoro ląstelių implantui paruošti. Dėl to nebereikėtų viso donoro organo, ko pasėkoje padidėtų potencialių donorų skaičius. Kuriamos naujos, organizme lengvai suįrančios polimerinės medžiagos, kurios galėtų būti panaudojamos kaip laikina, persodintas ląsteles palaikanti, platforma. Į tokių biopolimerų sudėtį įjungiami ląstelių adheziją ir augimą skatinantys specifiniai peptidai, augimo ir angiogeniniai veiksniai, ir kitos bioaktyvios molekulės, kurių bendras poveikis yra ekstraląstelinio matrikso sekrecijos ir natūralaus audinio regeneracijos stimuliacija. Didžiausia su tokių medžiagų panaudojimu susijusi problema yra neigiamos organizmo reakcijos į jų buvimą, pvz. kraujo, kontaktuojančio su implantu, krešėjimas, fibrilinė implantų kapsuliacija. Dėl šios priežasties, norint sumažinti organizmo reakcijas, didelė dalis tyrimų šioje srityje yra skirta sąveikų tarp polimerų ir biologinių audinių išaiškinimui. Bendri dirbtinių organų gamybos principai Žmogaus kūnas yra sudėtinga biologinė mašina sudaryta iš hierarchiškai išsidėsčiusių komponetų (ląstelės sudaro audinius, audiniai sudaro organus, o organai – organizmą). Normalus organizmo funkcionavimas yra nulemtas koordinuotos jo dalių veiklos. Tačiau jei kažkuris organizmo komponentas nustoja normaliai funkcionuoti (dėl ligos ar fizinio pažeidimo), sutrinka viso organizmo veikla. Dažnai vienintelis būdas norint atstatyti normalią organizmo veiklą yra viso organo transplantacija. Daugelis gyvybių buvo išgelbėtos tokiu būdu, tačiau dar daugiau buvo prarasta dėl nepaprastai mažo donorų skaičiaus. Persodinamų organų trūkumas ir kitos problemos susijusios su organų persodinimu (pvz. organų atmetimas dėl imuninės sistemos atsako, būtinumas nuolat vartoti imunosupresinius vaistus, donorų organų išsaugojimas ir transportavimas, techniškai sudėtingos persodinimo operacijos) paskatino mokslininkus ieškoti alternatyvių metodų nefunkcionuojančių organų pakeitimui. Paaiškėjo, kad kai kurios medžiagos gali būti panaudotos audinio funkcijos atstatymui ar pakeitimui. Šiam tikslui gali būti panaudotos nesuardomos ir biologinėse sistemose suardomos sintetinės medžiagos, o taip pat ir organizmo audiniai. Medžiagos, naudojamos dirbtinių organų gamybai (pvz. plastmasė gaminat širdį, įvairūs metalai gaminat vinis, naudojamas sulūžusių kaulų sujungimui), yra pasirenkamos taip, kad ilgai galėtų būti organizme. Kadangi šios medžiagos yra svetimos organizmui, dažnai atsiranda problemų su biosuderinamumu, pvz. vyksta atmetimas arba medžiaga suįra, ir galiausiai seną implantą reikia pakeisti nauju. Vienas iš pavyzdžių yra kartais plyštantys silikoniniai krūtų implantai. Kadangi daugumos organų funkcija yra atliekama parenchiminių ląstelių, kai kurie organų funkcijos regeneravimo metodai yra pagrįsti šių ląstelių panaudojimu. Lyginant su viso organo ar jo dalies persodinimu, šis metodas sumažina atmetimo riziką. Kadangi naudojamos tik parenchiminės ląstlės, eliminuojant kitas organo ląsteles, kurios prisideda prie imuninio atsako sukėlimo, po persodinimo stebimas mažesnis imuninis atsakas. Paėmus nedidelę organo audionio biopsiją, in vitro galima 1 užauginti gana didelius ląstelių kiekius, kurie gali būti panaudoti persodinimui. Audinio biopsija gali būti paimta iš ligonio arba iš artimo giminaičio. Tokio metodo taikymas labai padidintų donorų skaičių, sumažintų poreikį laukti organų iš mirusių donorų, pacientas būtų mažiau traumuojamas operacijos metu, bei sumažėtų gydymo išlaidos. Viliantis, kad atskiros parenchiminės ląstelės organizme galėtų suformuoti funkcionalų organą, parenchiminės ląstelės buvo injekuotos į organizmo ertmes. Toks bandymas buvo atliktas su įvairių tipų ląstelėmis, tačiau be rezultatų, nesusiformavo jokios organą primenančios struktūros. Tam, kad išgyventų, proliferuotų ir normaliai funkcionuotų dauguma ląstelių turi būti prisitvirtinę prie kokio nors pagrindo. Todėl buvo sukurtas metodas, kuriame ląstelės yra pritvirtinamos prie tam tikros polimerinės matricos ir tik tada implantuojamos į norimą organizmo vietą. Buvo nustatyta, kad norint, kad ląstelės sąveikautų ir funkcionuotų kaip audinys, jos turi būti arti viena kitos. Taip pat normaliam ląstelių funkcionavimui yra svarbu, kad jos gautų maisto medžiagų ir iš jų būtų pašalinamos susidarančios kenksmingos medžiagos, o tam ląstelės turi būti arti kraujagyslės. Atsižvelgiant į šiuos veiksnius buvo pagamintos matricos iš organizmo ekstraląstelinės matricos baltymų (pvz. kolageno ir glikozamonoglikanų). Tokios matricos buvo įvestos į organizmą tikintis, kad jos pritrauks ląsteles iš svekų audinių ir taip skatins pazeisto audinio regeneraciją. Taip pat šios matricos yra naudojamos kaip šablonas, pagal kurį persodintos ląstelės regeneruoja nervus, odą, kraujagysles, dantenų audinį, kremzlę ir kaulus. Tačiau vis dar yra techniškai sunku pagaminti baltymines matricas, kurios yra reikiamų formų ir pasižymi pageidaujamomis mechaninėmis savybėmis. Be to, buvo pastebėta, kad jų įvedimas į organizmą gali skatinti visai kitų nei pageidaujama ląstelių tipų proliferaciją. Organų regeneracijai taip pat pradėti naudoti sintetiniai polimerai kurie organizme yra suardomi. Šios medžiagos naudojamos kaip platforma persodintoms ląstelėms, kuri joms dalinantis skatina tam tikrą ląstelių išsidėstymą. Parenchiminės ląstelės yra izoliuojamos iš audinio, pasėjamos polimerinėje matricoje ir persodinamos į organizmą. Ląstelėms dalinantis organizme jos sekretuoja ektraląstelinės matricos baltymus, kas skatina polimerinės matricos irimą. Augančios ląstelės, ekstraląstelinė matrica ir besiformuojančios kraujagyslės palaipsniui užpildo dėl matricos irimo atsirandančias ertmes. Biodegraduojami sintetiniai polimerai turi būti pagaminti taip, kad ląstelės galėtų prie jų prisitvirtinti, ląstelės neprarastų savo funkcijų ir stimuliuotų ląstelių augimą. Dauguma polimerų naudojamų ląstelių persodinimui yra poliesteriai ir polianhidridai. Jie gaminami lakštų, porėtų struktūrų ir fibrilinių grandinių, kurios savo ruožtu gali būti sumegztos į tinklą, forma. Šių medžiagų irimas organizme gali vykti dėl visos matricos degradacijos, visos matricos erozijos arba matricos paviršiaus erozijos. Visos matricos degradacijos metu, polimero grandinės yra tolygiai sukarpomos visame matricos tūryje. Polimero molekulinė masė nuolat mažėja, kol polimero grandinių fragmentai tiek sumažėja, kad ištirpsta. Visos matricos erozijos metu matrica yra netolygiai suskaidoma, o susidarę fragmentai palaipsniui ištirpsta. Vykstant matricos paviršiaus erozijai polimero grandinės yra nukerpamos tik ties paviršiumi, todėl matriza mažėja pamažu. Svarbi organizme suįrančių biopolimerų grupė, kuri yra patvirtintinta naudojimui žmogaus organizme, yra poli pieno rūgštis (poli laktatas), poli glikolinė rūgštis (poli hidroksiacetinė rūgštis) ir jų kopolimerai. Šių polimerų degradacijos organizme metu susidaro mažos molekulinės masės junginiai, pieno rūgštis ir glikolinė rūgštis, kurios yra įprasti ląstelės metabolitai. Sintetiniai polimerai gali būti pagaminti specifinės formos (kokios reikia implantui paruošti), jų porų dydis ir paviršiaus plotas gali būti pritaikytas maksimaliai ląstelių adhezijai, o polimero degradacijos greitis gali kisti nuo kelių dienų iki kelių metų. Polimerinės matricos iš poli pieno ir poli glikolinės rūgšties degraduoja organizme vykstant jų irimui visame matricos tūryje. Irimo greitis priklauso nuo kopolimerų santykio, pH ir tempertūros, ir vyksta dėl esterinės jungties hidrolizės (Pav 1). homopolimero (pieno rūgšties ar glikolio rūgšties) hidrolizės greitis yra minimalus, tuo tarpu poli(pieno-ko-glikolio rūgšties) polimerų, sudarytuose iš skirtingų monomerų santykiu 50:50 hidrolizės greitis yra maksimalus. Hidrolizės greitis didėja didėjant temperatūrai ir šarmėjant arba rūgštėjant terpės pH. 2 H O H O O H O H O O O H3C H O H3C H Poli(pieno-ko-glikolio rugstis) +H2O H O H O H OH O H O HO O H3C H O H3C H +H2O O HO O OH H3C H Pieno rugstis + HO OH H H Glikolio rugstis Pav. 1 Poli(pieno-ko-glikolio rūgšties) kopolimerų hidrolizės schema. Biodegraduojami polimerai gali būti prieš persodinimą vaskuliarizuoti. Tai ypač svarbu, kai persodinto tipo ląstelių išlikimas ir normalus funkcionavimas priklauso nuo optimalaus maisto medžiagų tiekimo. Į polimerų matricas gali būti įterptos įvairios biologiškai aktyvios molekulės, inhibuojančios imuninį atsaką ar skatinančios ląstelių adheziją, pvz. augimo faktoriai, augimo slopikliai, angiogeniniai, imunosupresiniai ir diferenciaciją skatinantys veiksniai. Matricai palaipsnui degraduojan, šie veiksniai yra lėtai atpalaiduojami į implanto aplinką, kur jie skatina audinio regeneraciją. Biomolekulės gali būti prijungiamos kovalentiškai arba fiziškai įterpiamos į polimero matricą. Kai kurių organų atveju neįmanoma in vivo užauginti persodinimui reikiamo kiekio ląstelių. Tada audinys gali būti pesodintas iš kitos rūšies organizmo. Kai pagrindinė persodintų ląstelių populiacijos funkcija yra metabolinė reguliacija ir aktyvumas, gali būti persodinami į membraninę kapsulę patalpintos ksenogeninės (iš kitos rūšies organizmo) ląstelės arba audiniai. Membranos yra sukonstruojamos taip, kad kapsulės viduje esančios ląstelės ar audiniai yra apsaugoti nuo kontakto su organizmo, taip išvengiant imuninio atsako. Tačiau per membranas gali vykti medžiagų apykaita: ląstelių gaminami metabolitai tampa prienami visam organizmui (pvz. insulinas), o maisto medžiagos iš aplinkos patenka į kapsuliuotas ląsteles (pvz. gliukozė). Kiekvieną organą sudarančios ląstelės turi unikalias funkcijas. Todėl skirtingų organų regeneracijai dažnai reikia skirtingų polimerinių matricų. Sekančiuose skyreliuose bus aptartos kasos ir kepenų regeneravimo strategijos. Kasa. Vis daugiau žmonių pasaulyje serga diabetu. Daugelyje valstybių sergančių diabetu skaičius sudaro 5-10% visos populiacijos. Prognozuojama, kad suaugusių žmonių, sergančių diabetu skaičius pasaulyje padidės nuo 171 milijono 2000 metais iki 300 milijon 2030. Diabetas (pirmo ir antro tipo) yra liga, kuria susergama dėl gliukozės homeostazės sutrikimų. Pirmo tipo diabetu susergama dėl to, kad dėl įvairių priežasčių (imuninių, infekcijos) organizme yra sunaikinamos insuliną sistetinančios kasos β ląstelės. Antro tipo diabetu susergama dėl to, kad raumens ir riebalinis audinys tampa atsparus insulino poveikiui ir sutrinka insuliną sistetinančių kasos β ląstelių funkcija. Ligoniai, sergantys pirmo tipo diabetu ir vėlesnėse antro tipo diabeto stadijose, paprastai yra gydomi insulino injekcijomis. Alternatyvus metodas diabetui gydyti yra kasos persodinimas, tačiau donorų yra daug mažiau, nei ligonių. 2000 metais buvo sukurtas modifikuotas žmogaus kasos (Langerhanso) salelių izoliavimo ir imunosupresijos protokolas, kuris stipriai pagerino persodintų salelių prigijimą ir paspartino salelių izoliavimo ir persodinimo tyrimus. 1999-2005 metais daugiau nei 350 ligonių buvo atliktos salelių persodinimo operacijos. Apie 70–80% ligonių praėjus metams nuo transplantacijos tapo nepriklausomi nuo insulino injekcijų, tačiau tik 10% išliko visiškai nepriklausomi praėjus penkiems metams po persodinimo operacijos. Paprastai persodinimui reikia 6000–9000 salelių vienam ligonio 3 kūno masės kilogramui, t.y. reikia apie 0.5-1 milijono salelių vienam persodinimui. Normalaus žmogaus kasoje yra apie apie milijonas salelių, tačiau izoliavimo procedūros metu geriausiu atveju galima gauti 400000 ar netgi daug mažiau. Tai reiškia, kad transplantacijai reikia 2–4 donorų, kas dažnai yra sunkiai pasiekiama. Taigi šioje srityje didžiausias dėmesys yra skiriamas salelių izoliavimo ir konservavimo metodų tobulinimui. Ksenogeninių kasos ląstelių persodinimas gali stipriai padidinti prieinamų donorų skaičių. Tačiau tai taip pat reiškia, kad norint išvengti implanto atmetimo, reikės panaudoti medžiagas persodintų salelių izoliavimui nuo ligonio imuninės sistemos. Kasos salelės gali būti patalpinamos į polimerinių membranų kapsules, per kurias gali vykti mažų molekulių apykaita, būtina normaliam salelių funkcionacimui (t.y. insulino, gliukozės, deguonies), tačiau per membranas negalėtų pereiti didesnės imuninės sistemos molekulės (imunoglobulinai). Vienas iš plačiai ištirtų metodų yra žiurkės kasos salelių mikrokapsuliacija hidrofiliniame alginato gelyje su papildomu polimeriniu apvalkalu, kuris praleidžia tik tam tikro dydžio molekules. Buvo parodyta, kad persodinus tokias kapsuliuotas saleles diabetikių žiurkių kraujyje atstatomas normalus gliukozės lygis, kuris išlieka normalus ilgus laiko tarpus (mėnesiais). Mikrokapsuliacijai taip pat gali būti naudojami polielektrilitų kompleksai, kurie yra ypač patrauklūs dėl to, kad salelių kapsuliacijos procesas yra paprastas. Mikrokapsuliuotų salelių persodinimo privalumas yra tas, kad labai padidėja implantų sąlyčio su ligonio organizmu paviršiaus plotas. Pagrindinė problema susijusi su mikrokapsuliuotų sąlelių panaudojimu yra neoptimali svarbiausių metabolitų (gliukozės ir insulino) difuzija per membranas. Normalioj kasoj yra kapiliarų tinklas, kuris išraizgo visą organą ir netgi į kasos saleles, ir aprūpina kiekvieną kasos ląstelę deguonimi. Tai reiškia, kad difuzijos atstumas tarp ląstelės ir kraujagyslės yra labai mažas. Mikrokapsuliuotų salelių atveju netgi optimaliom vaskuliarizacijos sąlygom medžiagų difuzija bus apsunkita dėl alginato gelio ir išorinės kapsulės membranos. Tai reiškia, kad stimuliuojant kapsuliuotas ląsteles gliukoze, insulino sekrecija bus uždelsta. Taip pat, dėl salelėje vykstančių oksidacinių procesų, gali susidaryti deguonies koncentracijos gradientas, kadangi dėl lėtesnės difuzijos deguonis iš kraujotakos lėčiau pateks į ląsteles, esančias saleles centre. Šiuo metu intensyviai ieškoma būdų išspręsti su difuzija susijusias problemas. Didelio skaičiaus kasos salelių kapsuliacijai naudojamas metodas vadinamas makrokapsuliacija. Makrokapsulės gali būti intravaskuliarinės ir ekstravakuliarinės ir yra gaminamos iš tokių pačių pusiau pralaidžių membranų kaip ir mikrokapsulės. Intravaskuliarinė kapsulė yra sudaryta iš vamzdelio su dviguba sienele, kuris yra tiesiogiai prijungtas prie ligonio kraujotakos sistemos. Kraujas teka vamzdelio viduriu, o mažos molekulės difunduoja per membraną į kapsulės skyrių, kuriame supakuotos kasos salelės (t.y. tarp vamzdelio membranų). Didžiausiasi tokio aparato trūkumai yra: (i) daug mažesnis paviršiaus plotas lyginant su mikrokapsulėm, (ii) storesnės makrokapsulės membranos dar labiau apriboja medžiagų difuziją. Paviršiaus plotas gali būti padidintas naudojant mažo diametro vamzdelių pluoštus, tačiau tokių darinių panaudojimas skatina kraujo krešėjimą. Ekstravaskuliarinių kapsulių konstrukcija yra tokia pati, kaip ir mikrokapsulių, bet jos yra didesnės. Naudojant ekstravaskuliarines kapsules susiduriama su tom pačiom difuzijos problemom, kaip ir su intravaskuliarinėm kapsulėm. Atskirų kasos ląstelių makrokapsuliacija gali padėti išspręsti problemą, susijusią su mažu paviršiaus plotu ir medžiagų difuzija tarp atskirų ląstelių. Kepenys. Hepatocitai yra lengvai auginami in vitro ląstelių kultūroje. Todėl persodinimui gali būti naudojamos ir autogeninės ir alogeninės ląstelės. Pirmasis polimeras panaudotas kepenų regeneracijai buvo notūralus organizmo ekstraląstelinės matricos baltymas lamininas. Šių baltymų pagalba persodintoms ląstelėms sukuriama aplinka, kuri imituoja sąlygas kepenyse. Paaiškėjo, kad jie nepaprastai svarbūs ilgalaikiam persodintų ląstelių funkcionalumui. Pagrindinis ekstraląstelės matricos baltymų trūkumas yra tas, kad jie yra nepakankamai kietos struktūros, kad iš jų būtų galima pagaminti matricą implantavimui. Dėl to buvo susintetintos medžiagos savo erdvine struktūra panašios į ekstraląstelinės matricos baltymų, tačiau tvirtesnės. Kepenys yra labai vaskuliarizuotas organas, kurio ląstelės yra išsidėstę tam tikra tvarka. Todėl dirbtinės matricos 4 panaudojimas galėtų palengvinti struktūrizuotą persodintų ląstelių išsidėstimą ir organo regeneraciją. Kolagenu padengti dekstrano mikro nešikliai buvo sėkmingai panaudoti kaip substratai hepatocitų prisitvirtinimui. Kolagenas palengvina ląstelių prisitvirtinimą, o dekstranas suteikia tvirtą pagrindą ir užtikrina didelį paviršiaus sąlyčio su aplinka plotą. Buvo parodyta, kad žiurkėms persodinti mikronešikliai sudaro agregatus, kurie yra kaip šablonas formuojantis naujam audiniui ir susidarant naujoms kraujagyslėms. Šis metodas buvo sėkmingai panaudotas žiurkės kepenų funkcijų palaikymui, kai dalis organo buvo pašalinta. Biodegraduojami polimerai, pvz. poligalaktinas, poliortoesteriai, polianhidridai ir poli(α-hidroksi esteriai), bei nedegraduojami polimerai (pvz. polivinilo alkoholis) buvo panaudoti kaip matricos persodintiems hepatocitams. Šių medžiagų panaudojimo privalumas yra tas, kad jų savybės gali būti lengvai modifikuojamos. Pvz. prieš ląstelių implantaciją į matricą, ji gali būti apdorota tai, kad susidarančių porų dydis skatintų maksimalią vaskuliarizaciją. Apibendrinant, sėkmingam kepenų ląstelių persodinimui yra būtina paruošti jau vaskuliarizuotą polimerinę matricą, parinkti matricos komponentus, kurie skatina ląstelių adheziją, diferencijuotų ląstelių funkciją, bei erdvinę matricos struktūrą, kuri skatina ir tvarkingą ląstelių ir susidarančių kapiliarų išsidėstymą besiformuojančiame audinyje. Literatūra 1. Molecular Biology and Biotechnology: A Comprehensive Desk Reference. (1995) Robert A. Meyers (Editor), Wiley-VCH, ISBN: 978-0-471-18571-0 2. Animal cell culture: a practical approach (3rd edition). (2000) Masters JR, ed, Oxford University Press, New York, ISBN 0-19-963797-0. 3. Paget M, Murray H, Bailey CJ, Downing R. (2007) Human islet isolation: semi-automated and manual methods. Diab Vasc Dis Res. 4:7-12. 5 VAKCINŲ BIOTECHNOLOGIJA Pagrindinių sąvokų apibrėžimai Adjuvantiniai (papildomi, pagalbiniai) genai – tai genai (paprastai limfokinų), kurie yra dažnai naudojami rekombinatinių vakcinų veiksmingumui padidinti. Bakulovirusas – tai DNR virusas infekuojantis vabzdžius, kuris yra plačiai naudojamas pigiai ir didelės išeigos rekombinatinių baltymų gamybai vabzdžių ląstelėse arba lervose. Chimerinis – terminas taikomas apibūdinti dviejų ar daugiau nukleino rūgščių ar baltymų suliejimo produktą. Rekombinantinis – organizmas, nukleino rūgštis arba baltymas pagamintas naudojant genų inžineriją. Vaccinia virusas – virusas priklausantis Orthopoxvirus genčiai, kuris suteikia imunitetą prieš keletą orthopox virusų (pvz. raupus). Vektorius – bakterija, virusas arba plazmidė, kuri yra panaudojama DNR molekulės įvedimui kuriant rekombinantus. Įvadas Problemų, susijusių su įprastomis vakcinomis, sprendimui šiuo metu pasitelkiami inovatyvūs molekulinės biologijos metodai. Biotecnologijų pažanga leido sukurti naują kartą vakcinų, kurių gamybai panaudojami netradiciniai metodai. Tai vakcinos, pagamintos iš patogenų subvienetų arba sintetinių peptidų bei gyvos rekombinantinės vakcinos. Daugiausiai vilčių teikia gyvos rekombinantinės vakcinos, pagamintos izoliavus imunizuojantį geną iš sergančio organizmo ir įvedant jį į vektorių. Tokios vakcinos gali suteikti imunitetą prieš patogeninus, kurių patogeniškumo neįmanoma susilpninti ar inaktyvuoti tuo pačiu nesunaikinant ir imunogeniškumo. Rekombinantinės vakcinos Gyvų rekombinatinių vakcinų naudojimo privalumas, lyginant su tradicinėmis gyvomis vakcinomis, yra tai, kad sumažėja rizika saugumui ir transportavimo nepatogumai. Rekombinatinių vakcinų kūrimui jau panaudoti genai iš keleto virusų, pvz. beždžionių viruso 40, jaučio papilomos viruso, adenovirusų, herpes virusų ir retrovirusų. Ypač parankus vektorius rekombinantinių vakcinų prieš gyvūnų ir žmogaus patogenus kūrimui yra Vaccinia virusas (VV). VV yra didelis, sudėtingą apvalkalą turintis, dvivijės DNR virusas, priklausantis Poxviridae šeimai, Orthopoxvirus genčiai. VV genomas yra apie 190 kbp ilgio, koduoja ~250 genų, o viriono išmatavimai yra apie 360 × 270 × 250 nm. VV pagrindu buvo sukurta vakcina padėjusi išnaikinti raupus. Kai VV pagrindu sukurtos vakcinos sudėtyje yra rekombinantinis komponentas, po vakcinacijos vyksta ir VV, ir į VV genomą įjungto svetimo geno replikacija ir raiška, ko pasėkoje vakcinuotas individas įgyja imunitetą prieš abu patogenus. VV genome yra 19 galimų svetimų genų įjungimo vietų. Be to, rekombinantų identifikavimą palengvina galimybė panaudoti visą eilę genų-žymenų (t.y. genas, nulemiantis atsparumą antibiotikui) ir reporterinių genų (t.y. genas, kurio produktas (baltymas) yra lengvai nustatomas). Kadangi VV rekombinatų gamyba yra nesudėtinga, atsirado galimybė pagaminti vakcinas, kurios imunizuotų prieš keletą patogenų iš karto. Vaccinia viruso rekombinantai Pirmas žingsnis kuriant vakciną Vaccinia viruso pagrindu yra plazmidės, su jos sekoje įterptu chimeriniu genu, sukonstravimas. Tam VV promotoriaus seka yra suliejama su svetimą baltymą koduojančia seka, kurios galuose yra prijungtos DNR sekos iš ne esminių VV genomo sričių. Toks chimerinis genas yra įjungiamas į VV genomą naudojant homologinę rekombinaciją audinių kultūros ląstelėse, kurios buvo užkrėstos laukinio tipo VV ir tada transfekuotos plazmide. Iš esmės chimerinis genas gali būti įjungtas bet kurioje ne esminėje VV genomo srityje, tačiau geno įjungimas timidino kinazės (TK) geno lokuse turi privalumų, nes susidarantys rekombinantai yra TK−. TK− fenotipo rekombinantiniai virusai yra mažiau patogeniški, o be to juos lengva atskirti nuo laukinio tipo TK+ virusų auginant su 5-bromodeoksiuridinu (timidino analogas). Naujų 1 rekombinantų patikrinimo procesas gali būti pagreitintas jei į VV genomą yra įvedami ne tik imunizuojantys, bet ir reporteriniai genai, pvz. E.coli β-galaktozidazės (LacZ) genas. Jei vyksta LacZ geno raiška, terpėje su 5-bromo-4-chloro-3-indolil-β-D-galaktozidaze (Xgal) susidaro mėlynos viruso kolonijos. Čia mes aptarsime tris vaccinia viruso rekombinantus, kurie buvo panaudoti kaip vakcinos prieš: (i) galvijų marą (angl. rinderpest) (GM), (ii) vezikulinį stomatitą (VS), (iii) beždžionių imunodeficito virusą (BIV), ir (iv) žmogaus imunodeficito virusą (ŽIV). Vaccinia viruso rekombinantinė vakcina prieš galvijų marą. Galvijų maras yra staigi, karščiavimą sukelianti ir labai užkrečiama liga, kuria serga Atrajotojų (Ruminantia) pošeimio atstovai (ypač naminiai raguočiai ir buivolai Afrikoje ir Azijoje). Sergant šia liga mirtingumas yra 90%. Šiuo metu yra naudojamos trijų tipų vakcinos prieš GM: (i) kaprinizuotos (pagaminamos po serijinių laukinio tipo viruso pasažų per ožkos organizmą), (ii) lapinizuotos (pagaminamos po serijinių laukinio tipo viruso pasažų per triušio organizmą), (iii) Plowright’o audinių kultūrų. Tai gyvos vakcinos, kuriose viruso patogeniškumas yra susilpnintas. Visoms gyvoms vakcinoms būdingi trūkumai yra: nestabilumas kaitinant, specializuotų audinių kultivavimo laboratorijų ir šalto transportavimo infrastruktūros (angl. cold chain) būtinumas (pastaroji sąlyga ypač svarbi šilto klimato šalyse), bei nevienodas vakcinų patogeniškumo laipsnis. Tuo tarpu liofilizuotas VV yra atsparus karščiui, lengvai pagaminamas, sandėliuojamas ir transportuojamas. Be to, vakcinaciją gali atlikti minimaliai apmokytas personalas. Galvijų marą sukelia apvalkalą turintis vienvijės RNR virusas, kuris priklauso Morbillivirus genčiai, Paramyxoviridae šeimai (šiai šeimai taip pat priklauso žmogaus tymus, šunų marą, bei smulkių atrajotojų (ožkų, avių) marą (peste des petits ruminants, PPR) sukeliantys virusai). Tyrimai parodė, kad Paramyxoviridae šeimos virusų paviršiaus baltymai hemagliutininas (H) ir susiliejimo baltymas (F) suteikia imunitetą prieš šiuos virusus. Naudojant labai virulentišką galvijų maro viruso Kebete ‘O’ štamą buvo ištirti 8 viruso baltymai. Genams, koduojantiems 5 baltymus (fosfobaltymą (P), H, F, nukleobaltymą (N), matriksą (M)) buvo susintetintos DNR kopijos (cDNR) ir nustatyta nukleotidų seka. Naudojant standartines procedūras buvo sukonstruoti viengubi VV rekombinantai ekspresuojantys H geną (vRVH) ir F geną (vRVF), ir dvigubas rekombinantas ekspresuojantis abu genus (vRVFH). VV genai koduojantys timidino kinazę ir hemagliutininą buvo tikslingai inaktyvuoti į jų seką įterpiant H ir F genus, ko pasėkoje VV virulentiškumas buvo dar labiau susilpnintas. vRVH, vRVF ir vRVFH gebėjimas sukelti imuninį atsaką buvo tirtas su naminiais raguočiais. Visuose viengubais rekombinantais vakcinuotuose gyvūnuose inokuliacijos vietoje jau po 4 dienų atsirado raupų žaizdos, kurios visiškai užgijo po 2 savaičių. Galvijuose, vakcinuotuose dvigubu rekombinantu, raupų inokuliacijos vietoje neatsirado, o tai rodo, kad šios vakcinos virulentiškumas yra labai sumažėjęs. Visų rekombinantais vakcinuotų galvijų organizme gaminosi serumą neutralizuojančius antikūnus prieš galvijų maro virusą. Kartu su vakcinuotais galvijais laikant nevakcinuotus buvo nustatyta, kad VV rekombinatų perdavimas nevyksta galvijams kontaktuojant. Norint įvertinti vakcinos suteiktą imunitetą, visiems tirtiems gyvūnams praėjus 35 dienoms nuo imunizacijos į kaklo limfmazgį buvo suleista didelė dozė galvijų maro virusų, kuri audinių kultūroje infekuotų 50% populiacijos, o gyvame organizme sukelia gyvulių marą ir 100% mirtingumą. Vakcinuoti galvijai buvo pilnai apsaugoti nuo ligos, nors kai kurių galvijų, vakcinuotų vRVF, organizme pasireiškė anamnezinis atsakas, kas rodo, kad vyksta galvijų maro viruso replikacija. Taip pat tyrimai parodė, kad vRVFH yra nepatogeniškas ir kitiems gyvūnams, pvz. pelėms, sveikoms ir beždžionių imunodeficito virusu infekuotoms rezus makakoms. Taigi apibendrinant, tyrimų rezultatai rodo, kad VV rekombinatinės vakcinos gali būti veiksminga priemonė prieš galvijų ir smulkių atrajotojų marą. Vaccinia viruso rekombinantinė vakcina prieš vezikulinį stomatitą. Viena iš pirmųjų VV rekombinatinių vakcinų buvo prieš vezikulinį stomatitą (VS) (ligą sukelia VS virusas priklausantis Rhabdoviridae šeimai, Vesiculovirus genčiai). VS yra užkrečiama liga paplitusi išimtinai Šiaurės ir Pietų Amerikoje, kuria serga arkliai, raguočiai ir kiaulės, ir kurios charakteringi simptomai yra vezikuliniai pažeidimai ant liežuvio ir burnos gleivinės. Kaip modelinis organizmas VS tyrimams 2 naudojama pelė, kurioje ši liga sukelia neuropatiją ir 100% mirtingumą. VS yra ypatinga tuo, kad diagnozuojant ligą, dėl identiškų simptomų, ji dažnai sumaišomas su snukio ir nagų liga. Vakcinacija prieš VS yra uždrausta JAV, kadangi yra neįmanoma atskirti vakcinuotų nuo natųraliai infekuotų gyvūnų. Nepaisant to, naudojant serologinius metodus yra įmanoma atskirti gyvūnus, vakcinuotus preparatais, pagamintais iš imunogeninių baltymų subvienetų. Realiai, vakcinų, pagamintų iš subvienetų ir gyvų vakcinų privalumai gali būti apjungti sukūrus VV rekombinatinę vakciną ekspresuojančią specifinius VS viruso (VSV) baltymus. VSV rekombinantai buvo sukonstruoti remiantis tais pačiais principais kaip ir galvijų maro virusui. Vakcinos kūrimui buvo pasirinktas VSV paviršiaus glikobaltymas G, kadangi eksperimentai su pelėmis parodė, kad šis imunogenas sukelia apsauginį imuninį atsaką. Naudojant glikobaltymo G mRNR buvo sussintetinta cDNR, kuri buvo sulieta su VV promotorium ir įjungta į VV genomą. Gauti rekombinantai išsaugojo gebėjimą infekuoti šeimininko ląsteles ir sintetino panašaus ar identiško, kaip ir natūralūs VSV baltymai, dydžio ir antigeniškumo polipeptidus. Vakcinuotų pelių organizme VSV serumą neutralizuojantys antikūnai pradėjo gamintis po 14 dienų ir jų sintezė nuolat didėjo iki 42 dienos po vakcinacijos. Papildoma vakcinacija po 28 dienų 7-8 kartus padidino serumą neutralizuojančių antikūnų titrą. Infekavus VS virusu vakcinuotas peles, visos buvo apsaugotos nuo viruso poveikio, tuo tarpu kontrolinių pelių mirtingumas buvo 100%. Panaudojus šią rekombinantinę VV vakciną prieš VSV galvijų vakcinacijai du trečdaliai paskiepytų galvijų buvo apsaugoti nuo VSV infekcijos. Tai, kad ne visi galvijai įgijo imunitetą prieš VSV po vakcinacijos rodo, kad pilnai apsaugai nuo viruso taip pat būtinas gyvūno organizmo imuninės sistemos ląstelių atsakas, kurio ši vakcina nestimuliuoja. Viena iš galimybių padidinti apsauginį vakcinos poveikį yra sukonstruoti rekombinantus, kurie sintetintų daug didesnius glikobaltymo G kiekius. Bakoloviruso ekspresijos vektoriai Bakuloviruso rekombinantinės sistemos pasižymi gebėjimu sintetinti didelius kiekius baltymų, kurie savo ruožtu gali būti panaudojami vakcinų, pagamintų iš antigenų subvienetų, gamybai. Iki 68% baltymų, sintetinamų rekombinantiniu bakulovirusu infekuotų Spodoptera exigua lervų, yra rekombinantinis baltymas. Naudojant imunofermentinį ELISA metodą (angl. Enzyme-Linked ImmunoSorbent Assay) buvo parodyta, kad kai sintetinamas toks kiekis rekombinantinio baltymo, jį galima naudoti diagnostiniuose tyrimuose neišgrynintą, nes jautrumas nuo to nė kiek nesumažėja bei nepastimas kitų baltymų poveikis. Bakulovirusų ekspresijos vektorių panaudojimas buvo įdiegtas gaminant monokloninius antikūnus prieš vieną specifinį viruso baltymą ar potogeną, sudarytą iš kelių baltymų, kai imunizacijos ar tikrinimo (skriningo) procedūrai nebūtinas išgrynintas antigenas. Š sistema buvo efektyvi gaminant monokloninius antikūnus neįprastiems antigenams (pvz. Alcheimerio baltymas) ar antigenams, kurių biologinį aktyvumą ( hemagliutinaciją ar neutralizaciją) yra sudėtinga patikrinti (pvz. VSV N baltymas). Rekombinantinės VV ir bakuloviruso vakcinos prieš bežbdionių imunodeficito virusą (BIV). Makakos, užkrėstos BIV, yra veritngas eksperimentinis modelis, bandant sukurti vakciną prieš žmogaus imunodeficito virusą (ŽIV). Nors vis dar abejotina, ar kada nors bus pagamintos gyvos retrovirusinės vakcinos, kurios patenkins saugumo reikalavimus, keliamus žmogaus vakcinoms, tačiau neseni eksperimentiniai rezultatai teikia vilčių. Rezus makakose buvo atliekti tyrimai su gyva rekombinantine VV vakcina ekspresuojančia BIV glikobaltymus. Vakcinos poveikui sustiprinti gyvūnai yra papildomai vakcinuojami tuo pačiu rekombinatiniu subvienetiniu antigenu ekspresuojamu žinduolių ląstelėse, Kinijos žiurkėno kiašialąstėse, ar bakuloviruso ekspresijos vektoriuje. Gauti rezultatai rodo, kad šiek tiek didesnė apsauga nuo BIV yra pasiekiama atlikus dvigubą vakcinaciją su VV ir bakuloviruso rekombinantinėm vakcinom, negu tik su VV. Rekombinantinių VV ir bakulovirusų vakcinų panaudojimo perspektyvos. Nors nei VV, nei bakulovirusų rekombinantinės vakcinos neapsaugo nuo BIV ifekcijos, tačiau in vitro tyrimai parodė, kad po 2 savaičių po vakcinacijos viruso replikacija yra slopinama, o virusų kiekis plazmoje (viremija) yra daug mažesnis makakose, vakcinuotose naudojant rekombinantinę vakciną prieš vieną iš BIV paviršiaus glikobaltymų. Šie tyrimai rodo, kad imunizacija BIV paviršiaus 3 glikobaltymu yra toli gražu nepakankama apsaugai nuo viruso, nors ji gali šiek tiek pristabdyti virusų dauginimąsi ir nutolinti ligos pradžią. Rekombinantinės vakcinos prieš ŽIV Keletoje laboratorijų yra tiriama galimybė panaudoti VV rekombinantus kaip vakcinas prieš ŽIV infekciją. Tyrimai parodė, kad kai kuriuose VV rekombinantuose ekspresuojančiuose ŽIV antigenus pastarieji yra teisingai apdorojami ir transportuojami, o eksperimentinių gyvūnų ir savanorių žmonių organizme šios vakcinos sukėlė organizmo imuninės sistemos ląstelių atsaką į ekspresuojamus ŽIV baltymus. Tačiau tokių vakcinų panaudojimas žmonių vakcinacijai yra potecialiai pavojingas, todėl intensyviai ieškoma būdų VV rekombinantines vakcinas padaryti saugesnes. Kaip minėta, svetimų DNR sekų įterpimas į timidino kinazės geną susilpnina VV virulentiškumą. Be to, eksperimentai parodė, kad interleukiną 2 (IL-2) ir pelės interferoną γ (INF-γ) koduojančių genų įvedimas į VV genomą ir šių genų raiška apsaugojo pliką pelę nuo VV infekcijos. Buvo sukonstruoti VV rekombinantai ekspresuojantys INF-γ koduojančius chimerinius genus ir ŽIV-1 struktūrinius baltymus koduojančius genus. Šie sulieti baltymai išlaiko antigenines INF-γ ir ŽIV savybes. Tačiau buvo pastebėta, kad įvairūs sulietų INF-γ baltymų variantai pasižymi nevienodu biologiniu antivirusiniu aktyvumu, nors visais atvejais bent šiek tiek sumažina patogeniškumą eksperimentinėse plikose pelėse. Gyvų rekombinantinių vakcinų veiksmingumas ir naudojimo saugumas Vaccinia viruso (VV) rekombinantinių vakcinų naudojimo saugumas buvo patvirtintas eksperimentais, rodančiais, kad nevyksta VV perdavimas iš vakcinuotų gyvūnų kontaktiniams (t.y. gyvūnams, kurie nebuvo vakcinuoti, bet buvo laikomi kartu su vakcinuotais). Tiriama galimybė dar labiau susilpninti VV rekombinantinių vakcinų virulentiškumą į VV genomą įvedant limfrokinų genus (pvz. interleukiną 2 (IL-2) ir interferoną γ (INF-γ)). Buvo sukonstruoti sulieti baltymai, kuriuose INF-γ (iš žmogaus arba pelės) yra sujungtas su įvairiais imunogenais. VV rekombinantai, ekspresuojantys tokius sulietus baltymus, pasirodė besą mažiau patogeniški imudeficitu sergančiai (plikai) pelei. Tolesniam bendram rekombinantinių VV vakcinų veiksmingumo didinimui labai svabus yra adjuvantinių sistemų kūrimas. Imunologijoje adjuvantas yra veiksnys, kuris pats neturi jokio specifinio antigeninio poveikio, tačiau gali stimuliuoti imuninę sistemą sustiprindamas atsaką į vakciną. Vakcinose adjuvantai paprastai yra aliuminio hidrochlorido arba kalcio fosfato gelis. Freundo pilnasis adjuvantas yra aliejų, emulsiklių, negyvų bakterijų (paprastai mikobakterijų Mycobacterium tuberculosis) mišinys. Buvo parodyta, kad INF-γ ir VSV glikobaltymo G mišinys padvigubina Freundo pilno adjuvanto poveikį ir sustiprina imuninį atsaką po pakartotinos vakcinacijos. Taip pat buvo parodyta, kad IL-2 pasižymi adjuvantinėmis savybėmis. Tačiau imunoreguliacinių IL-2 ir INF-γ genų panaudojimas polivalentinėse rekombinantinėse VV vakcinose vis dar turi būti galutinai įveritntas. Jei paiaiškės, kad šie limfokinai veikia kaip adjuvantai padidindami imuninį atsaką, šis atradimas visiškai pakeis vakcinacijos sąvoką. Žmogaus INF-γ genas galėtų būti įvestas į Vaccinia viruso vektorius prieš žmogaus patogenus, o taip pat panašūs vektoriai gali būti sukonstruojami naminių gyvūnų rūšims, kas savo ruožtu padidintų tokių vakcinų veiksmingumą. 4 VII. GENŲ TERAPIJA Kiekvienas mūsų, dažniausiai to net neįtardami, turime apie 5-6 defektyvius genus. Tai paaiškėja jei mes, ar vienas iš mūsų artimų giminaičių kenčia nuo genetinių ligų. Tokių žmonių pasaulyje yra milijonai. Maždaug 10% žmonių turi, ar jam išsivystys vėliau paveldėtas genetinis sutrikimas. Žinoma apie 4000 ligų, kurios kyla dėl vieno geno sutrikimo, ir dauguma kol kas nepagydomos. Kai kurie pavienių genų sutrikimai yra gana dažni – cistinė fibrozė randama viename iš 2500 kūdikių gimusių Vakarų pasaulyje. Tačiau monogeninės ligos yra palyginti retos, todėl šiuo metu daugiausia dėmesio ir lėšų skiriama plačiai paplitusių ligų, tokių kaip vėžys, širdies ir kraujagyslių, AIDS genų terapijos tyrimams. Žinios apie žmogaus genomą, genetinį ligų pagrindą, bei molekulinės biologijos pasiekimai atveria naujas galimybes gydyti įvairiausias ligas. Vienas labiausiai viliojančių ateities gydymo būdų yra genų terapija – gydymo būdas, pagrįstas individo ląstelėse esančios genetinės informacijos ar genų veiklos pakeitimu. Taigi, genų terapija yra vienas iš būdų gydyti genetinius sutrikimus. Šis metodas ypatingas tuo, kad ligos gydomos ten, kur jos prasideda, t.y. taisomi “negeri”, defektyvūs genai. Sutrikęs genas pakeičiamas veikiančiu genu taip, kad organizmas galėtų gamintis gerą fermentą ar baltymą. Daug dėmesio taip pat skiriama vadinamosioms genetinėms metabolinėms ligoms, kurias sukelia sutrikęs genas, negaminantis konkrečią metabolinę reakciją katalizuojančio fermento arba gaminantis neefektyvų ar nepakankamai efektyvų. Genų terapija gali būti pritaikyta genetinėms, infekcinėms bei kitoms ligoms gydyti. Dauguma genetinių ligų yra poligeninės (aterosklerozė, vėžys, artritas ir kt.), todėl tikslinga ne tik taisyti genetinius defektus, bet įterpti genus, sumažinančius genetinių defektų pasireiškimą. Pirmi genų terapijos tyrimai buvo skirti paveldimoms ligoms, susijusioms su vieno geno sutrikimais, tokioms kaip SCID, cistinė fibrozė, gydyti. Tokios ligos yra idealus genų terapijos objektas, nes pakeitus defektyvųjį geną sveiku gali būti pasiektas pageidaujamas efektas. Tačiau monogeninės ligos yra palyginti retos, todėl šiuo metu daugiausia dėmesio ir lėšų skiriama plačiai paplitusių ligų, tokių kaip vėžys, širdies ir kraujagyslių, AIDS genų terapijos tyrimams. Apie du trečdaliai dabartiniu metu atliekamų genų terapijos tyrimų skirti vėžiui gydyti ir tik aštuntoji visų tyrimų dalis skirta paveldimoms genetinėms ligoms. Klinikiniai genų terapijos tyrimai skirstomi į tris stadijas. Amerikos Nacionaliniame Sveikatos institute, koordinuojančiame genų terapijos tyrimus, 89% užregistruotų genų terapijos tyrimų yra pradinės I stadijos, 10% - II ir tik 1% - III, t.y. galutinės stadijos. Genų terapijos sėkmę įrodo tik III stadijos klinikiniai tyrimai. Šiuo metu daugiausiai vilčių teikia odos ir inkstų vėžio, SCID bei hemofilijos gydymas genų terapijos būdu. VII.1. Genetinės kilmės ligos Dauguma mūsų nepatiriame sunkių pasekmių dėl defektyvių genų, nes mes turime po dvi kopijas beveik visų genų, vieną gautą iš motinos, kitą iš tėvo. Vienintelė išimtis yra genai, kurie yra vyrų lytinėse chromosomose. Daugumoje atvejų vieno normalaus geno užtenka išvengti ligos simptomų. Jei defektyvus genas yra recesyvinis, tai normalus genas atliks užprogramuotas funkcijas už juos abu. Tik turint dvi to pačio recesyvinio geno kopijas pasireikš liga. Kita vertus, jei defektyvus genas dominantinis, jis vienas gali sukelti ligą, net jei yra kartu su normaliu. Žinoma, pastaruoju atveju tik sergančio tėvo vaikai sirgs šio dominantinio defektyvaus geno sąlygojama liga, ir tikimybė, kad vaikai paveldės šią ligą yra 50%. Hantingtono chorėja, sunki nervų sistemos liga, kuri pasireiškia tik suaugusiems, yra dominantinės genetinės ligos pavyzdys. Yra su X chromosoma susijusių genetinių ligų. Kadangi vyrai turi tik vieną X chromosomą, šioje chromosomoje esančio defektyvaus geno funkcijos nekompensuojamos. Tokių ligų pavyzdžiai yra Duchenne raumenų distrofija ir hemofilija. Karalienė Viktorija turėjo geną atsakingą už hemofiliją, ir per ją jis paplito tarp karališkųjų Rusijos, Ispanijos ir - 33 Prūsijos šeimų. Hemofilija sergantiems žmonėms trūksta krešėjimo faktorių. Prieš genetinei inžinerijai imant juos gaminti, hemofilikai buvo gydomi su atitinkamais baltymais išskirtais iš žmonių kraujo, kuris kartais būdavo užkrėstas AIDS. Ne visi defektyvūs genai sukelia neigiamą poveikį, nes aplinka, kurioje genas funkcionuoja taip pat yra svarbi. Klasikinis to pavyzdys yra siklemija ir maliarija. Tik homozigotoms pagal šį gena pasireiškia siklemijos liga, o heterozigotos ja neserga. Kraštuose kur paplitusi maliarija siklemijos genas yra gana paplitęs, nes heterozigotos su šiuo genu yra atsparūs maliarijai. Kai maliarijos parazitas patenka į jų eritrocitus, šie virsta pjautuviškais ir praranda kalio jonus, o tai nužudo maliarijos sukėlėją. VII.2. Genų terapijos pradžia 1990 m. ketverių metukų amerikietė mergaitė buvo pirmoji pacientė, gydyta genų terapijos būdu. Ji sirgo sunkia kombinuoto imunodeficito liga (SCID – angl. severe combined immunodeficiency disease) dėl įgimto fermento adenozino deaminazės (ADA) trūkumo. ADA svarbus purinų apykaitoje. Trūkstant šio fermento kaupiasi ADA substratas deoksiadenozinas, kurio toksiniai kiekiai užmuša kai kurias jautrias ląsteles, tarp jų ir Tlimfocitus, nulemiančius ląstelinį imunitetą. Siekdami išvengti infekcijų sergantieji SCID privalėjo gyventi steriliomis sąlygomis, o vienintelis gydymo būdas buvo kaulų čiulpų persodinimas. Genų terapijos būdu gydytai pacientei buvo perpilti jos pačios genetiškai modifikuoti limfocitai. Tuo tikslu iš periferinio kraujo buvo išskiriami limfocitai, į juos įterpiamas ADA genas ir modifikuotos ląstelės grąžinamos į kraujotaką. Gydymas buvo sėkmingas – genetiškai modifikuotos ląstelės gamino reikiamą fermentą, ir mergaitė galėjo gyventi normalų gyvenimą. Tačiau limfocitų gyvavimas nėra ilgas (tik keli mėnesiai), todėl procedūros turi būti periodiškai kartojamos. Vėliau buvo panaudotos ilgaamžės kaulų čiulpų ląstelės, iš kurių buvo atskiriamos kamieninės ląstelės, o į šias įterpiami normalūs ADA genai. VII.3. Genų terapijos būdai Žinomi du pagrindiniai – lytinių ląstelių bei somatinių ląstelių genų terapijos būdai. Lytinių ląstelių genų terapija - tai lytinių ląstelių (kiaušialąsčių, spermatozoidų, bei ląstelių iš kurių jos atsiranda) manipuliacija siekiant pakeisti jų genetinę informaciją. Jai tai pat gali būti priskiriama manipuliacijos su zigota. Lytinių ląstelių genų terapijos sukelti genetinės informacijos pakeitimai gali būti paveldimi. Tuo tarpu somatinių ląstelių genų terapijos metu keičiama genų veikla paciento ląstelėse; būsimos kartos šių genų veiklos pokyčių nepaveldi. Lytinių ląstelių genų terapija Pastaruoju metu gemalinių lytinių ląstelių genų terapija etiškai laikoma nepriimtina, nors turi realių potencinių galimybių iš esmės išgydyti daugelį įgimtų ligų taip, kad ši liga nebūtų perduodama tolesnėms generacijoms. Tuo pačiu taip būtų išvengta brangiai kainuojančių somatinių ligų gydymo. Etiškai šis gydymo būdas nepriimtinas dėl to, kad visuomet išlieka rizika pasireikšti nepageidaujamiems ir ilgalaikiams šalutiniams reiškiniams, kurie gali paveikti pacientą bei jo palikuonis. Lytinių ląstelių genų terapijos technologija yra santykinai paprasta, nes nereikalauja specifiškumo terapijos taikiniams ir genetiniai sutrikimai gali būti koreguojami tiesioginėmis manipuliacijomis. Vaisiaus genų veiklos pakeitimai jau atliekami su gyvūnais. Tokie tyrimai padeda sukurti produktyvesnes gyvūnų rūšis, leidžia geriau suprasti genų veiklos reguliavimo mechanizmus, įvertinti atskirų genų produktų paskirtį, genetiškai modifikuoti gyvūnai kuriami mokslinių tyrimų bei medicinos tikslais. - 34 Pirmasis pasaulyje transgeninis primatas, kiekvienoje savo kūno ląstelėje turintis medūzos geną (fluorescuojančio žaliojo baltymo geną) buvo bezdžionėlė, kurios vardas ANDi atspindi jos atsiradimo priežastį – tai atvirkščiai skaitoma deoksiribonukleorūgšties (angl. deoxyribonucleic acid – DNA) santrumpa. Per kelias 2001 metų sausio dienas jauna rhesus beždžionėlė ANDi tapo vienu iš žymiausių gyvūnėlių planetoje. Šis eksperimentas parodė ne tik artimą, bet ir tolimą “transgeninių” žmonių ateitį – pasaulį išvydusios beždžionėlės genas buvo neveiklus (tylus), tuo tarpu kiti du embrionai, kuriuose vyko geno ekspresija, žuvo. Atliekant panašius tyrimus su transgeninėmis pelėmis nustatyta, kad iš šimto išgyvenusių embrionų tik viename vyko perkelto geno ekspresija. Embrioninės genų terapijos metu susiduriama ir su kitais sunkumais, nes įterpiamas genas gali atsirasti bet kurioje genomo vietoje: šalia reguliacinių sekų, kurios aktyvina ar slopina normaliai veikiančių genų veiklą; naujasis genas gali įsiterpti į funkcionuojančius genus ir nutraukti jų veiklą. Vis tik žvelgiant keletą dešimtmečių į ateitį, daugelis tyrėjų mano, kad embrioninė genų terapija gali būti viena iš pagrindinių medicinos šakų. Tuo tarpu kiti mokslininkai baiminasi, kad noras įveikti paveldimas ligas gali pavirsti “žmonių tobulinimo programa”, o patys “pagerintieji” vaikai galbūt jausis lyg specifiniams tikslams sukurtos mašinos. Tačiau manoma, kad saugūs metodai, kruopšti priežiūra bei viešumas gali padėti šiai genų terapijos rūšiai tapti realybe. Somatinių ląstelių genų terapija Visame pasaulyje labiausiai plėtojamas somatinių ląstelių genų terapijos būdas. Kadangi genai lemia kiekvienos kūno ląstelės veiklą, ligas galima išgydyti į paciento ląsteles įterpus reikiamus genus. Būtina, kad tokie gydymo tikslams vartojami genai saugiai, specifiškai ir efektyviai pasiektų tinkamas paciento ląsteles. Genai į organizmą gali būti įterpiami ex vivo (už gyvo organizmo ribų) ir in vivo (gyvo organizmo viduje) būdu. Ex vivo genų terapija Ex vivo terapijos metu iš paciento organizmo paimtos ląstelės in vitro genetiškai modifikuojamos, kultivuojamos, atrenkamos ir po to grąžinamos į organizmą. Tačiau tokių ląstelių nėra daug: fibroblastai, limfocitai, hepatocitai, keratinocitai, endotelio ir raumenų ląstelės bei kamieninės kaulų čiulpų ląstelės. Šiuo ex vivo būdu buvo gydyti vaikai, sergantys SCID. Sėkmingai ex vivo genų terapija buvo pritaikyta ir šeiminei hipercholesterolemijai gydyti. Pernelyg didelį cholesterolio kiekį kraujyje lemia mažo tankio lipoproteinų (MTL) receptorių, būtinų iš kraujo cholesteroliui pašalinti, stoka kepenų ląstelėse. Genų terapijos tikslams biopsijos metu paimamas kepenų gabalėlis ir hepatocitai užkrečiami retrovirusais, į kuriuos įterpti MTL receptorius koduojantys genai. Genetiškai modifikuotos ląstelės kultivuojamos ir po to grąžinamos į organizmą. Pažymėtina, kad reikalingi “sveikieji” genai nebūtinai turi būti įterpiami į tas ląsteles, kuriose normaliai vyksta jų ekspresija. Genų terapijai gali būti panaudotos kitos “patogios” ląstelės, pavyzdžiui, kraujo krešėjimo veiksniai VIII ir IX yra sintetinami hepatocituose, tačiau gydymo tikslams jie yra įterpiami į fibroblastus. Genų įterpimą į organizmą ir jų ekspresiją sunkina kai kurios aplinkybės, pavyzdžiui, netgi monogeninės paveldimos ligos pasireiškia keliuose audiniuose, tuo tarpu ex vivo genų terapiją galima taikyti ne visuose audiniuose. Be to, “sveikasis” genas ne visada normalizuoja koordinuotą bendrame procese dalyvaujančių genų ekspresiją. Pavyzdžiui, bb globino geną galima sėkmingai įterpti į eritroblastus, o šie gali būti reimplantuoti į kaulų čiulpus, tačiau funkcionalus hemoglobino molekulės tetrameras nesusidaro, nes neegzistuoja bb globino ir aa globino grandinių sintezės koordinacijos. - 35 - In vivo genų terapija In vivo genų terapijos metu genus tiesiai į organizmą įterpia virusai, sintetiniai pernešėjai ar kiti vektoriai. Šiuo atveju nereikia paimti organizmo ląstelių ir jų genetiškai modifikuoti bei kultivuoti – šį darbą atlieka vektoriai ir pats organizmas. Matyt, in vivo metodas bus naudojamas ir ypatingos skubos atvejais, kai ex vivo metodams panaudoti pritrūksta laiko. Pirmą kartą in vivo genų terapija buvo taikyta gydant dažniausią baltųjų rasės monogeninę ligą - cistinę fibrozę. Šis metodas gali pats efektyviausias, tačiau kol kas yra mažiausiai išvystytas. Tai susiję su žemu genetinių vektorių specifiškumu, siekiant koreguoti tik tam tikras organizmo sritis. Be to, kepenys sąlygoja greitą vektorių (adenovirusų, DNR/lipidų kompleksų) išvalymą iš organizmo. Dar vienas in vivo genų terapijos trūkumas yra tai, kad pakartotinės vektorių injekcijos gali sukelti stiprias imunines reakcijas. In situ genų terapija Kadangi šiuo metu genų terapijos vektoriai nepasižymi dideliu specifiškumu, dažnai renkamasi genetinį vektorių injekuoti į gydomą audinį. Šis metodas taikomas cistinės fibrozės gydymui, kurio siekiama genetiškai modifikuoti kvėpavimo takų epitelio ląsteles. Cistinės fibrozės priežastis yra geno (CFTR) mutacija, dėl ko pakinta endotelio ląstelių membranos pralaidumas. In situ genų terapija taikoma ir vėžio gydymui. Pagrindinis in situ genų terapijos trūkumas yra žemas efektyvumas. Genų „nutildymas“ Kartais reikia ne pakeisti mutavusį gena normaliu, o tiesiog blokuoti geno raišką. Žinome, kad RNR sintezė prasideda, kai transkripcijos faktoriai (TF) patenka ant geno promotoriaus srities DNR sekos ir slenka išilgai geno. Taip nuo DNR į iRNR nurašoma informacija apie būsimo baltymo struktūrą. Nustatyta, kad paveikus ląstelės promotoriaus srities „melagingomis“ kopijomis, galima nukreipti transkripcijos faktorius nuo tikrojo geno ir taip sustabdyti iRNR sintezę. Šis metodas turėtų būti greitai pritaikytas klinikoje. Jei neįmanoma sustabdyti iRNR sintezės, kartais galima „pristabdyti“ jau susintetintos iRNR veiklą. Tuo tikslu iRNR veikiama mažomis RNR molekulėmis, kurių nukleotidų seka komplementari iRNR molekulės sričiai. Tokiu būdu blokuojama iRNR transliacija ir žalingas baltymas nesintetinamas. Be šių metodų galima neleisti veikti jau pagamintam baltymui. Kaip pavyzdį galima paminėti epidermio augimo faktoriaus receptorių – krūties ląstelėse esantį baltymą HER-2, prie kurio jungiasi augimo signalai. HER-2 yra receptorius, priklausantis tirozinkinazių klasei. HER-2 kartu su kitu epidermio augimo faktoriaus receptoriumi sudaro aktyvų dimerinį receptorių, o dėl to įvykstantis aminorūgšties tirozino fosforilinimas inicijuoja kompleksinę reakciją, pasibaigiančią ląstelės dalijimusi. Daugelis moterų turi dvi baltymą HER-2 koduojančio geno kopijas, bet apie trečdalis krūties vėžiu sergančių moterų 17-oje chromosomoje turi papildomą šio geno kopiją. Todėl jų ląstelėse yra apie 100 kartų daugiau šių augimo signalo receptorių. Tokia receptorių gausa ypač nepageidaujama, kai ląstelės tampa piktybinėmis. Baltymo (receptoriaus) užblokavimo būdas buvo pritaikytas gydant moteris, sergančias krūties vėžiu (I ir II klinikinių tyrimų stadija). Pacientės buvo gydomos genų inžinerijos būdu sukurtais monokloniniais antikūnais (Trastuzumab), blokuojančiais receptorius HER-2. Iš 222 moterų, dalyvaujančių I ir II genų terapijos tyrimų stadijose, 34 pacientėms (15%) pasireiškė teigiamas preparato poveikis. - 36 VII.4. Genų įterpimo į pacientų organizmą metodai Genų terapijos sėkmė labai priklauso nuo genų pernešimo technologijų pritaikymo medicinoje. Todėl labai svarbu parinkti tinkamas genų pernešimo sistemas. Genų terapijos tikslams reikiamas genas įterpiamas į daleles, galinčias patekti į organizmo ląsteles. Šios geną pernešančios dalelės vadinamos vektoriais. Vektoriai gali būti virusiniai, nevirusiniai ir fiziniai. Nesvarbu, kokia vektoriaus prigimtis, visi jie turi būti specifiški taikiniams (ląstelėms ar audiniams), genų ekspresijos trukmė turi būti pakankama, o svarbiausia, genų pernešimas ir ekspresija turi būti saugūs. Kartu su reikiamais terapiniais genais į vektorius gali būti įterpti ir indukuojami promotoriai, leidžiantys reguliuoti įterptų genų ekspresiją. Naudojant audiniams specifinius promotorius galima pasiekti, kad terapinių genų ekspresija vyktų tik specifinėse ląstelėse. Virusiniai vektoriai Šiuo metu plačiausiai naudojami virusiniai vektoriai. Iš virusų pašalinami ligas sukeliantys komponentai ir į juos įterpiami rekombinantiniai genai – taip gaunami “genetiniai vaistai”, galintys į šeimininko ląsteles pernešti reikalingus genus. Dažniausiai naudojami vektoriai yra šie: Retrovirusai Retrovirusų genomą sudaro RNR. Šie virusai gali sukurti savo RNR genomo dvigrandes DNR kopijas, kurios gali būti integruotos į ląstelių šeimininkių chromosomas (pvz. ŽIV). O integruotos į ląstelės šeimininkės genomą genetinės madžiagos ekspresija gali būti ilgalaikė. Tačiau šie svetimi genai įsiterpia nespecifiškai ir gali įsiterpti į svarbų geną ir taip sukelti jo mutaciją arba „išjungimą“. Retrovirusai negali patekti į ląstelės branduolį pro intaktinę branduolio membraną, todėl jie infekuoja tik aktyviai besidalijančias ląsteles (dalindamasi ląstelė laikinai praranda branduolį supančią membraną). Todėl jie negali būti naudojami kaip vektoriai nesidalijančiose, pavyzdžiui, nervų ar raumenų ląstelėse. Tačiau gebėjimas infekuoti tik besidalijančias ląsteles, gali būti panaudotas kovai su vėžinėmis ląstelėmis – į greitai besidalijančias vėžines ląsteles gali būti įterpti “genai savižudžiai”, kurie sukelia šių lastelių mirtį, taip pat kitokie genai, koduojantys vaistus nuo vėžio. Adenovirusai Adenovirusų genomą sudaro linijinė dvigrandė DNR. Šie virusai žmonėms sukelia kvėpavimo, žarnyno ir akių infekcijas. Peršalimo virusas yra adenovirusas. Adenovirusai patenka į ląsteles endocitozės būdu ir lieka citoplazmoje, t.y. šie virusai neįterpia savo genomo į ląstelės šeimininkės DNR (ekstrachromosominis gyvybės ciklas), todėl jie gali būti naudojami nesidalijančioms ląstelėms infekuoti. Ši adenovirusų savybė sumažina įterptinės mutagenezės pavojų, tačiau dėl tos pačios priežasties terapinių genų ekspresija ląstelėse yra trumpalaikė. Adeno-asocijuoti virusai (Adeno-associated viruses). Tai mažų, viengrandės DNR genomo virusai, galintys įterpti savo genetinę medžiagą 19-os chromosomos specifinėje vietoje, nesukeldamas jokių pastebimų šalutinių reiškinių. Adenoasocijuotų virusų (AAV) vektoriai yra veiksmingesni bei sukelia mažiau nepageidaujamų poveikių. Šie virusai stabiliai integruojami į ląstelės genomą, jie infekuoja įvairiausias – tiek nesidalijančias, tiek ir besidalijančias šeimininko ląsteles, be to, išlaikomas aukštas genų ekspresijos lygis bei mažas toksiškumas. Į AAV galima įterpti gana didelį svetimos DNR kiekį, todėl kartu su reikiamu genu gali būti įterptas ir indukuojamas promotorius, galintis reguliuoti pernešto geno ekspresiją. - 37 AAV nepasižymi jokiais žinomais patogeniniais reiškiniais. Manoma, kad apie 80% populiacijos šiems virusams turi antikūnų. AAV vektoriai pasižymi žemu imunogeniškumu. Pagrindinis jų trūkumas yra tas, kad jų gamyba yra sudėtinga (dauguma AAV sistemų turi būti naudojamos kartu su adenovirusais, kurie atlieka pagalbininko funkcijas). Integruoto geno ekspresijos lygis būna žemas. Be to, AAV talpina tik iki 4,8 kb svetimos genetinės medžiagos. Herpes simplex virusai. Tai virusų klasė su dvigrandės DNR genomu, infekuojanti tam tikro tipo ląsteles, neuronus. Pirmo tipo Herpes simplex virusas sukelia pūslelinę. HSV gali transfekuoti tiek besidalijančias, tiek ir nesidalijančias ląsteles. HSV ypač gerai transfekuoja nervų sistemos ląsteles, todėl manoma, kad ateityje gali būti sėkmingai pritaikyti nervų sistemos genų terapijai. HSV vektoriai gali talpinti didžiulį kiekį (iki 150 kb) svetimos genetinės medžiagos. Pagrindiniai HSV trūkumai yra didelis virusinių dalelių imunogeniškumas ir ilgalaikis genetinės medžiagos išlaikymas virusinėje dalelėje. Virusinių vektorių trūkumai Vienas iš pagrindinių virusinių vektorių trūkumų yra tai, kad visi virusai gali sukelti uždegimą, taigi ir imuninę reakciją, suardančią įterptą geną. Netgi modifikuoti virusai gali sukelti pavojų pacientui. Pirmoji genų terapijos auka – Pensilvanijos universiteto savanoris 18-metis Jesse Gelsinger mirė 1999 m. rugsėjo mėnesį. Naudoti adenovirusai sukėlė labai stiprią imuninės sistemos reakciją, nulėmusią daugelio organų pažeidimus ir mirtį. Imuninė organizmo reakcija gali riboti pakartotiną to pačio vektoriaus naudojimą. Tai gali būti viena iš problemų platesniam naudojimui, kadangi dalis žmonių populiacijos gali būti jau anksčiau susidūrusi su tuo virusu ir todėl turėti neutralizuojančius antikūnius. Be to, tarp genų terapijoje naudojamų virusinių dalelių ir aplinkoje ar jau pačioje ląstelėje ar organizme esančių virusų, gali įvykti genetinės medžiagos mainai ir tuomet susidaryti žalingi, pavojingi ir galintys replikuotis ląstelėje nauji virusai. Virusinių vektorių naudojimą riboja ir tai, kad į virusinę dalelę (išskyrus HSV) galima įterpti tik iki 9-10 kb dydžio svetimą geną (terapinį ar geną markerį). Daugelio genetinių ligų gydymui tai nepakankamas dydis. Kita svarbi ir kol kas neišspręsta problema yra tai, kad retrovirusiniai vektoriai į šeimininko genomą nešamus genus integruoja atsitiktinai. Kartais tai gali modifikuoti gyvybiškai svarbių genų veiklą. Nevirusiniai vektoriai Šiuo metu plačiai tiriami ne tik virusiniai, bet ir kitokio tipo vektoriai. Jie skirstomi į dvi pagrindines grupes: cheminiai ir fiziniai nevirusiniai vektoriai. Cheminiai nevirusiniai vektoriai Didžioji dauguma nevirusinių vektorių sistemų yra susijusios su polikatijoniniais dariniais, kuriems priklauso dvi pagrindinės klasės: katijoninių liposomų/micelių-DNR kompleksai, vadinami lipopleksais (angl. lypoplex), ir katijoninių polimerų-DNR kompleksai - polipleksai (angl. polyplex). Šių kompleksų pagrindinė sudedamoji dalis yra katijoniniai polimerai. Todėl jie, kartu su neigiamą krūvį turinčiomis DNR molekulėmis, sudaro pakankamai stabilius nanometrinius kompleksus. Manoma, kad jie į ląstelę patenka endocitozės būdu. Kuomet toks kompleksas patenka į ląstelės vidų, genetinė medžiaga turi išsilaisvinti iš šio komplekso bei iš ankstyvosios endosomos. Jei perkelta genetinė medžiaga yra iRNR, citoplazmoje ji gali būti transliuojama iš karto, jei tai DNR - tai ji dar turi patekti į branduolį. - 38 Pagrindinės nevirusinių cheminių vektorių problemos yra šios: fiziologinėmis sąlygomis lipopleksai ir polipleksai pasižymi nestabilumu ir dažnai agreguojasi. Be to, ir lipopleksai ir polipleksai pasižymi heterogeniškumu. Pagrindinis cheminių vektorių trukumas yra palyginti žemas jų efektyvumas, t.y. jie transfekuoja palyginti nedaug ląstelių. Fiziniai nevirusiniai vektoriai Fiziniams nevirusiniams vektoriams priskiriami tokie metodai kaip genų šautuvas (gene gun), mikroinjekcijos, nuogos DNR injekcijos ir elektroporacija bei lazerių, magnetinių laukų ar ultragarso (sonoporacija) panaudojimas. Genų šautuvas Jo panaudojimo principas pagristas tuo, kad metalų (aukso, volframo) dalelės (~1.2 µm), padengtos genetine medžiaga, specialių šautuvų pagalba yra pagreitinamos iki tiek, kad susidūrusios su ląstelėmis ar audiniais gali prasiskverbti į jų vidų. Tokiu būdu, nutaikius į atitinkamą audinį (dažniausiai išorinį) genų įvedimas gali būti atliktas lokaliai. Vienas iš pagrindinių šio metodo trūkumų yra tai, kad dėl didelio 1,2 µm dalelių greičio sužalojama daug ląstelių. DNR injekcijos Genetinės medžiagos mikroinjekcijos yra genų terapijos metodas, kuomet genetinė medžiaga suleidžiama į kiekvieną atskirą ląstelę. Tam naudojamas mikromanipuliatorius ir stiklinė mikropipetė, kurių pagalba DNR injekuojama tiesiai į branduolį. Tai yra preciziškas metodas, tačiau neefektyvus, norint transfekuoti dideles ląstelių populiacijas ir patogesnis lytinių ląstelių genų terapijai. Galima injekuoti DNR tiesiogiai į audinį. Žinoma, kad nuogos plazmidinės DNR injekcijos į audinį gali transfekuoti kai kurių audinių ląsteles (kepenų, raumenų). Kokiu būdu nuoga plazmidinė DNR patenka į audinių ląsteles tiksliai nėra žinoma. Manoma, kad tai gali būti susiję su i) audinio ir ląstelių pažeidimais injekcijos metu. Šie pažeidimai, gali palengvinti plazmidės patekimą į ląsteles; ii) padidėjusiu hidrodinaminiu slėgiu audinyje. Į audinį dideliu greičiu injekuojamas tirpalas su plazmide gali palengvinti jos patekimą per ląstelių membraną; ii) endocitoze, tarpininkaujant nespecifiniams receptoriams. Elektroporacija Ląsteles paveikus trumpais, stipraus elektrinio lauko impulsais, laikinai pakinta membranos pralaidumas įvairiems cheminiams junginiams, pradedant mažomis hidrofilinėmis molekulėmis (įvairūs jonai, žymėtos molekulės, vaistai) baigiant makromolekulėmis, tokiomis kaip RNR ir DNR (Saulis ir Satkauskas, 2004). Tinkamai parinkus elektrinio impulso parametrus, elektropermeabilizacija gali būti grįžtama. Šis reiškinys dar vadinamas elektroporacija (Saulis ir Satkauskas, 2004). Pirmą kartą genų įvedimui į ląsteles elektroporacija buvo panaudota 1976 m. (Auer ir kt., 1976) – žmogaus eritrocitai buvo įkrauti viruso SV-40 DNR bei žinduolių ląstelių RNR. Nukleino rūgšties koncentracija ląstelių viduje siekė 35% išorinio tirpalo koncentracijos. Viruso SV-40 DNR žymiai geriau prasiskverbdavo į ląsteles, jeigu ją prieš tai apdorodavo E. coli endonukleaze, pervedančia nukleininę rūgštį iš superspiralinės į tiesinę formą. 1982 m. Neumann ir kt. pirmieji transformavo ląsteles naudojant elektroporaciją (Neumann ir kt., 1982). Jie pelių L-ląsteles, turinčias defektinį timidinkinazės geną, patalpintas į tirpalą su plazmidėmis pTK2E, turinčiomis viruso timidinkinazės geną, paveikė elektriniais impulsais. Po to ląstelės buvo auginamos selektyvioje terpėje, kurioje išgyvendavo ir sudarydavo kolonijas tik tos ląstelės, į kurias pateko plazmidė su - 39 timidinkinazės genu. Tokiu būdu, iš susidariusių kolonijų skaičiaus, buvo galima spręsti apie transformacijos efektyvumą. Elektroporacija jau yra tapusi įprastu biotechnologiniu metodu ląstelių transformacijai. Naudojant elektroporaciją, įmanoma transformuoti praktiškai bet kokio tipo prokariotų ir eukariotų ląsteles. Tai jau yra atlikta su įvairiomis žinduolių (Chu ir kt., 1987), žuvų, vabzdžių (Mann ir King, 1989), augalų, mielių ląstelėmis (Meilhoc ir kt., 1990) ar bakterijomis (Satoh ir kt., 1990). Daugeliu atvejų, naudojant elektroporaciją, genų ekspresija padidėja nuo 100 iki 1000 kartų. Tiesa, DNR patekimo į ląsteles mechanizmas iki galo neišaiškintas. Pirmieji DNR įvedimo į audinius tyrimai pasirodė 1991 m., kai ši technologija buvo panaudota genų įterpimui į odą (Titomirov ir kt., 1991). Tačiau intensyvūs tyrimai prasidėjo tik nuo 1998 m. Šiuo metu elektroporacija jau yra pritaikyta in vivo efektyviam genų įvedimui į įvairius audinius (raumenis, kepenis, plaučius, odą, sąnarius, navikus, pelių sėklides, stuburo smegenis, blužnį, kraujagysles, nervinį audinį, tinklainę) (2000; Hanna ir kt., 2001; Heller ir kt., 1996). Daugiausia tyrimų atliekama su raumenimis. Pirmiausia raumenys yra lengvai prieinamas audinys, antra, raumenų ląstelės nesidalina, todėl elektroporacijos būdu įvesta DNR gali būti ekspresuojama ilgesnį laiką. Trečia, raumeninis audinys yra gausiai vaskuliarizuotas. Tai leidžia tikėtis, kad sėkmingai atlikus raumens transfekciją, terapinio geno produktas lengvai galės patekti į kraujotaką ir daryti terapinį poveikį. Šiuo atveju į raumenį būtų žiūrima, kaip į terapinių baltymų sekrecijos organą. Be to, raumenų genų terapija gali būti panaudojama ir vakcinacijai. Raumuo, kaip elektrogenoterapijos taikinys pasirinktas ir todėl, kad yra genetinių raumens ligų (pvz. Duchene distrofija), kurios gali būti genų terapijos taikiniu. Duchene distrofija pasireiškia dažniausiai berniukams 3-5 gyvenimo metais. Jos dažnis 1 atvejis iš 3500. Liga yra susijusiu su pakitusiu recesyviniu X chromosomos genu, atsakingu už distrofino baltymo gamybą. Genas yra labai didelis (apie 14 kb), todėl jo pernešimas standartiniais virusiniais vektoriais yra neįmanomas. Dėl šio pakitusio baltymo raumenų vystymasis sutrinka, jie pradeda atrofuotis ir vaikas žūva. Elektroporacija taip pat gali būti panaudota ir plazmidinės DNR įvedimui į odos ląsteles in vivo. Dviejų superspiralizuotų plazmidžių DNR mišinys buvo įšvirkštas ką tik gimusiems peliukams po oda. Po 10-60 min, jų odos klostė buvo paveikta dviem aukštos įtampos impulsais. Nuo paveiktos odos buvo pašalintos fibroblastinės ląstelės, ir po 2-3 savaičių kultūroje buvo aptikti transformuotų fibroblastų klonai (Prausnitz ir Banga, 1998). Tai parodo, kad elektroporacija galėtų būti pritaikoma ir DNR vakcinacijoje. Pagrindiniai elektrogenoterapijos privalumai: i) metodas yra paprastas ir saugus; ii) plazmidės paruošimas yra daug paprastesnis ir pigesnis lyginant su kitų vektorių paruošimu; iii) audinių transfekcija gali būti atliekama lokaliai, tiksliai norimose vietose; iv) praktiškai nėra apribojimų dėl geno ar genų dydžio. Pagrindiniai elektrogenoterapijos trūkumai: i) lyginant su virusiniais vektoriais elektrogenoterapijos efektyvumas yra palyginti mažas; ii) elektroporacijos būdu įvesta DNR nesiintegruoja į ląstelių genomą, todėl geno ekspresija nėra ilgalaikė. Kiti fiziniai metodai Kiti fiziniai metodai, tokie kaip lazeriai, magnetiniai laukai ar ultragarsas (sonoporacija) taip pat gali būti naudojami genų įterpimui, tačiau kol kas jie yra mažiau efektyvūs (Wells, 2004). Nors šiuo metu efektyviai genų terapijai pasiekti panaudojami įvairūs metodai, tačiau kol kas populiariausi yra metodai, kuriuose naudojami virusiniai vektoriai (Satkauskas ir Saulis, 2004). - 40 VII.5. Ligos, galinčios būti genų terapijos taikiniais Šiuo metu ligos, kurioms gali būti taikoma genų terapija, turi pasižymėti keliomis savybėmis. 1) Žinant, kad genų terapija gali turėti šalutinių efektų gydomos tik gyvybei pavojų keliančios ligos. 2) Genai, atsakingi už ligos atsiradimą, turi būti pilnai charakterizuoti. 3) Turi būti rasti efektyvūs vektoriai galintys specifiškai atakuoti gydomos srities ląsteles. Genetines ligas galima suskirstyti į dvi grupes: monogenines ir poligenines ligas. Monogeninės ligos Ligos, kurias lemia vieno geno sutrikimai, vadinamos monogeninėmis. Daugiau kaip 4000 ligų kyla dėl vieno geno sutrikimo. Dauguma monogeninių ligų kyla dėl mutacijų DNR grandinėje, dėl ko genas koduoja defektyvų baltymą, negalintį atlikti savo specifinės funkcijos. Kai kuriais atvejais, jei gaminamas smarkiai pakitęs baltymas, jis gali būti neatpažįstamas ir sukelti imuninį atsaką. Ištirta tik nedidelė monogeninių ligų dalis, kurioms gali būti taikoma genų terapija (šeimyninė hipercholesterolemija, policistinė inkstų liga, Huntingtono chorėja, cistinė fibrozė, hemofilija, fenilketonurija, Duchenne raumenų distrofija). Šiuo metu, naudojant esamus vektorius, šių ligų gydymui reiktų dažno genų terapijos pakartojimo. Ateityje tikimasi sukurti tokius vektorius, kad ligos eiga būtų kontroliuojama tik retais (vienas ar du kartai per metus) genų terapijos taikymais. Tai ne tik pagerintų pacientų gyvenimo kokybę, bet taip pat leistų žymiai sumažinti gydymo išlaidas. Hemofilija A yra viena iš paveldimų ligų (ja serga vienas iš 5000 vyrų), kuriai gali būti taikoma genų terapija. Geną, koduojantį VIII krešėjimo faktorių, į organizmą galima įterpti tiek in vivo (pasitelkiant virusinius vektorius), tiek ex vivo būdais. Ex vivo reikiamas genas įterpiamas į odos fibroblastus, o genetiškai modifikuotos ląstelės implantuojamos į paciento pilvo ertmę. Tokia procedūra leidžia išvengti tradicinių virusinių vektorių sukeliamų šalutinių poveikių. Pirmoje klinikinių tyrimų stadijoje buvo gydomi šeši pacientai ir po dešimties mėnesių keli sunkiai sergantieji hemofilija išvengė savaiminių kraujavimų. Poligeninės ligos Ligos, kurias lemia ne vieno geno sutrikimai, vadinamos poligeninėmis. Nors genų terapija geriausiai tinka monogenetinėms ligoms gydyti, tačiau ji gali būti taikoma siekiant palengvinti ir poligenines ligas, tokias kaip vėžys, širdies ligos, Alzhaimerio liga ar artritai. Didžiausia genų terapijos tyrimų dalis skirta onkologinėms ligoms gydyti, nes vėžys yra viena iš pagrindinių ligų, sukelianti didelį pacientų mirtingumą. Nepaisant progreso chirurginiame gydyme, radioterapijoje bei chemoterapijoje, liga dažnai yra neišgydoma. Viena iš pagrindinių problemų yra atskirti sveikas ląsteles nuo vėžinių. Daugėjant žinių apie molekulinius vėžio vystymosi mechanizmus, atsiranda daugiau galimybių vėžio gydymui panaudoti genų terapiją. Genų terapijos, kaip ir kitų vėžio gydymo metodų, pagrindinis sunkumas yra tai, kad sunku paveikti visas vėžio ląsteles. Šiuo metu yra keletas pagrindinių vėžio genų terapijos strategijų. Tai p53 ir Rb genų pakeitimas, antisensoriai, „savižudė“ genų terapija, imunoterapija bei vaistų atsparumo genai (multidrug resistance genes). Vienas iš perspektyviausių vėžio genų terapijos būdas yra „savižudė“ genų terapija. Šis būdas išnaudoja sveikų ir vėžinių ląstelių metabolinius skirtumus. Navikas transfekuojamas suicidiniu genu, kurio ekspresijos produktai suaktyvina provaistą. Kaip suicidiniai genai dažniausiai naudojami bakterijų ir virusų genai, pvz. timidino kinazės genas, gaunamas iš herpes simplex virusų. Šio geno produktas gali metabolizuoti provaistą "gancilovir" į citotoksiką, sukeliantį ląstelės mirtį. Jei šiuo genu bus transfekuotos vėžinės ląstelės, tai tik jos ir taps sensitizuotos provaistui. - 41 Kaip nauja navikų gydymo metodika pradeda įsitvirtinti aukščiau minėta elektrogenoterapija, kai DNR suleidžiama tiesiogiai į naviką ir po to jis paveikiamas stipriu elektriniu impulsu, palengvinančiu DNR patekimą į ląstelių vidų. Šis metodas buvo panaudotas B16 melanomos, storosios žarnos karcinomos bei žiurkių gliomai gydyti (Satkauskas ir Saulis, 2004). Sergantieji neurodegeneracinėmis ligomis taip pat gali sulaukti sėkmingo gydymo genų terapijos būdu. 2000 metais Kalifornijos universitete pradėti pirmieji šių ligų genų terapijos klinikiniai tyrimai. Į pacientės, sergančios Alzheimerio liga, smegenis buvo implantuotos genetiškai modifikuotos odos ląstelės, galinčios sintetinti nervų augimo faktorių. Atliekami tyrimai siekiant pritaikyti genų terapiją sergantiesiems Parkinsono liga gydyti. Gydymo tikslams panaudotos dopaminą gaminančios vaisiaus smegenų ląstelės. Kalifornijos universitete genai buvo sėkmingai įterpti į smegenis panaudojant liposomas, padengtas polimeru polietilenglikoliu (PEG). Pastaruoju metu intensyviai tiriamos DNR įterpimo į raumeninį audinį galimybės. Elektropermeabilizacijos būdu įterpus DNR į raumeninus skeleto bei širdies audinius, buvo nustatyta efektyvi genų transfekcija. Skeleto raumuo turi keletą privalumų: jis yra tinkamas audinys somatinei baltymų sintezei, plazmides galima lengvai suleisti tiesiog į raumenį, DNR gali būti episomatinėje būklėje keletą mėnesių, be to raumuo gali sekretuoti baltymus. Šios skeleto raumenų savybės panaudojamos raumenų distrofijai gydyti, DNR vakcinacijai, terapinių baltymų sisteminei sekrecijai įvairių ligų – pavyzdžiui, hemofilijai, eritropoetinei anemijai, virusiniam miokarditui, diabetui ar glomerulonefritui – bei navikų gydymui. Sisteminis genų įterpimas navikų gydymui gali būti tinkamesnis nei aukščiau minėtas tiesioginis DNR įterpimas į naviką, nes tokiu būdu galima gydyti ir metastazes bei navikų likučius po operacijų. Vienas iš genų terapijos taikinių yra labai paplitusios širdies ir kraujagyslių ligos. Šioms ligoms gydyti gali būti taikoma laikina įterptų genų ekspresija. Pavyzdžiui, įterpus kraujagyslių endotelio augimo faktoriaus (KEAF) (angl. VEGF – vascular endothelial growth factor) geną į kiaulės širdies raumenį, buvo stimuliuojamas naujų kraujagyslių susidarymas aplink užblokuotas vainikines arterijas. Kadangi genams įterpti buvo naudojami adenovirusai, imininė sistema juos greitai atpažino ir suardė, t.y. įterptų genų ekspresija buvo trumpalaikė, tačiau pakankama, kad susidarytų naujos kraujagyslės. Jau atliekami klinikiniai I stadijos tyrimai: pacientams, sergantiems širdies ir kraujagyslių ligomis, įterpiamas KEAF genas. Toks gydymo būdas taip pat gali būti taikomas ligoniams, kurių periferinė kraujotaka yra sutrikusi, pavyzdžiui, sergantiems cukriniu diabetu (Yin ir Tang, 2001). Genų terapija, naudojant įvairius augimo faktorių genus, gali būti plačiai pritaikyta ne tik širdies ir kraujagyslių, bet ir kitoms ligoms gydyti. Augimo faktoriams būdingas labai platus fiziologinio aktyvumo spektras, jie dalyvauja daugelio organų (širdies, inkstų, kepenų, skeleto, lytinių liaukų, sausgyslių, odos) augimo ir vystymosi procese. Taigi įterpiant šių faktorių genus į pacientų organizmą, gali būti pasiektas pageidautinas ilgalaikis klinikinis poveikis. Genų, koduojančių augimo faktorius, pavyzdžiui, kaulų morfogenezės baltymus (KMB) (angl. BMP – bone morphogenetic proteins), transformuojantį augimo faktorių-b (angl. transforming growth factor-β – TGF-β), trombocitų augimo faktorių (angl. plateletderived growth factor – PDGF), įterpimas ex vivo ar in vivo būdais gali būti panaudotas osteogenezei skatinti, pavyzdžiui, kaulų suaugimui po įvairių chirurginių intervencijų, stuburo sugijimui, kremzlinio audinio regeneracijai ir kt. (Nakamura ir kt., 2001). - 42 VIII. Elektroporacijos panaudojimas navikų terapijoje Ląstelė yra atvira sistema ir nuolat keičiasi medžiagomis su aplinka. Ląstelės turinį nuo išorės skiria plazminė membrana, atliekanti daugybę fiziologinių funkcijų. Viena iš jų yra barjerinė: membrana suformuoja barjerą apie ląstelę, trukdantį molekulėms ir jonams laisvai judėti į ląstelę ar iš jos. Stipraus elektrinio lauko poveikis padidina membranos pralaidumą jonams ir įvairioms molekulėms. Šis reiškinys vadinamas elektroporacija (Neumann ir Rosenheck, 1972; Weaver ir Chizmadzhev, 1996). Šiuo metu ląstelių elektroporacija plačiai naudojama ląstelės biologijoje, biotechnologijoje ir medicinoje (Gehl, 2003). Vienas iš svarbių ir šiuo metu intensyviai tyrinėjamų elektroporacijos taikymų yra navikų elektrochemoterapija (Mir ir kt., 1991b). Tai lokalus standžių navikų gydymo metodas, susidedantis iš citotoksinio vaisto ir elektrinio impulsinio lauko naudojimo. Elektrinio lauko poveikyje dėl elektroporacijos padidėja navikinių ląstelių membranų pralaidumas, todėl į ląstelių vidų patenka daugiau citotoksinio vaisto molekulių ir taip ženkliai padidinamas jo veiksmingumas (Gehl, 2003; Gothelf ir kt., 2003; Mir ir Orlowski, 1999). Taikant klasikinius chemoterapijos metodus naudojamos labai didelės vaistų dozės, kurios sukelia šalutinius sisteminius efektus (Limper, 2004). Dėl padidėjusio ląstelių membranų pralaidumo kai kurių vaistų dozės gali būti žymiai (iki 1000 ir daugiau kartų) sumažintos, todėl elektrochemoterapija laikoma efektyviu gydymo metodu, tinkamu visiems navikų kamienams (Gehl, 2003). Šiuo metu šis metodas, pirmą kartą pasiūlytas 1991 metais (Mir ir kt., 1991a), yra labai intensyviai tiriamas. Klinikiniai bandymai jau yra atlikti JAV, Prancūzijoje, Slovėnijoje, Danijoje, Japonijoje bei Australijoje. Tikimasi, kad Lietuvoje pirmieji elektrochemoterapijos metodo klinikiniai bandymai bus atlikti 2008 metais. Dažniausiai elektrochemoterapijoje naudojamas citotoksinis vaistas yra bleomicinas, kuriuo gydoma dauguma kietų navikų ir piktybinių limfomų. Šio vaisto citotoksiškumas pasireiškia tik jam patekus į ląstelės vidų. Jis veikia kaip mini endonukleazė – bleomicinui patekus į ląstelės branduolį, vyksta cheminė reakcija, kurios metu skaldoma DNR. Bleomicinas, kaip ir dauguma kitų antivėžinių vaistų, sukelia sunkius pašalinius poveikus, pvz.: yra toksiškas plaučiams (Chandler, 1990). Netoksinis antivėžinių vaistų DNR skaldymo aktyvumo padidinimas įgalintų sumažinti vaisto dozę ir sukeliamus pašalinius efektus. Tai sąlygotų efektyvios chemoterapijos išsivystymą. Bleomicinas pasižymi labai dideliu citotoksiškumu – in vitro nustatyta, kad 200 vaisto molekulių gali nužudyti ląstelę (Tounekti ir kt., 1993). Tačiau jis labai sunkiai praeina pro ląstelių membraną. Elektroporacijos panaudojimas sudaro sąlygas šiam vaistui patekti į citozolį pro membranoje susidariusias poras. Tokiu būdu, bleomicino dozės, reikalingos tokiam pat terapiniam efektyvumui pasiekti, gali būti sumažinamos iki kelių tūkstančių kartų (Mir ir kt., 1991a). Yra daug veiksnių, įtakojančių jos efektyvumą: cheminiai (antinavikinio vaisto cheminė struktūra, jo koncentracija, injekcijos tipas), biologiniai (naviko kamienas, imuninės sistemos įtaka), fizikiniai (elektrinio lauko stipris, impulso trukmė, impulsų kiekis, elektrodų konstrukcija bei jų padėtis naviko atžvilgiu) (Cemazar ir kt., 1998; Mir ir kt., 1998; Ogihara ir Yamaguchi, 2000; Satkauskas ir kt., 2005). Kombinuotas elektrochemoterapinis gydymas gali būti derinamas su imunoterapija, kuri yra pagrįsta modifikatorių, turinčių biologinį atsaką (pvz., interleukinas), naudojimu siekiant padidinti ląstelės šeimininkės imuninį atsaką. Intensyvūs elektroporacijos mechanizmo tyrimai leido VDU Gamtos mokslų fakulteto, biologijos katedros, biofizikinių tyrimų grupės mokslininkams, pradėti elektroporacijos taikymo navikų elektrochemoterapijoje tyrimus (Satkauskas ir kt., 2005). Šie tyrimai atliekami bendradarbiaujant su Genų vektorologijos grupe iš Paryžiaus Gustave-Roussy instituto, vadovaujama dr. L.M. Mir. Pastaroji grupė yra viena iš vedančių laboratorijų Europoje, - 43 tiriant ląstelių elektroporaciją bei taikant ją praktikoje genų terapijoje ir navikų elektrochemoterapijoje. IX. Genetiškai modifikuotų organizmų ir augalų biotechnologijos panaudojimas medicinoje Genetiškai modifikuoti mikroorganizmai, augalai ir gyvūnai (ar jų ląstelės) naudojami gaminant žmogaus insuliną, interferoną, serumo albuminą, antikūnus, augimo faktorius, krešėjimo faktorius, eritropoetiną, interleukiną-2, hormonus, Žmogaus α1- antitripsiną, kitus baltymus ar medžiagas (antrinius metabolitus). Didžioji dalis insulino naudojamo diabeto gydymui yra pagaminama E. coli bakterijų į kurias įkeltas žmogaus insulino genas. Bakterijos yra labai patogus baltymų šaltinis, kadangi jas pigu ir paprasta auginti, jos gali gaminti didelius kiekius svetimo baltymo. Tačiau, bakterijų genetinis kodas, transkripcija ir transliacija skiriasi nuo eukariotinių ląstelių. Bakterijos neturi intronų, neatlieka potransliacinių modifikacijų ir t.t. Todėl dažnai reikalingi žmogui baltymai sintezuojami genetiškai modifikavus būtent eukariotines ląsteles, ar visą organizmą. Tokiu būdu gauti ir gyvūnai – fermentatoriai, kurie reikalingus baltyminius preparatus išskiria su pienu, šlapimu, sperma, į kraują ar audinių ląsteles. Genetiškai modifikuoti gyvūnai gali būti naudijami tiriant įvairias ligas ar jų priežastis. Pavyzdžiui, nustatyta, kad c-Src (tirozinkinazės), katepsino-K (cisteino prroteazės), osteoprotegerino genų delecijos pelėse sukelia osteoporozę. Sukurtos genetiškai modifikuotos pelės, vadinamos onkopelėmis, kurios labiau linkusios sirgti krūties ir limfos vėžiu bei yra naugojamos vaistų ir terapijos tyrimams gydant šiuos du vėžio tipus. Šiuo metu vystoma idėja kurti valgomas vakcinas. Tikimasi sukurti tokius genetiškai modifikuotus augalus, kurie gamintų patogenų baltymus, sukeliančius imuninę reakciją ir tuo pačiu sąlygotų imuniteto susidarymą. Suvalgius tokį modifikuotą vaisių ar daržovę, žmogaus organizme susidarytų imunitetas prieš tam tikras ligas. Taip būtų išvengta skausmingos injekcinės vakcinacijos. Medicininiais tikslais bioreaktoriuose auginamos ir genetiškai nemodifikuotų augalų audinių ar organų kultūros (pavyzdžiui ženšenio šaknys). Šios augalų kultūros gali dideliais kiekiais gaminti antrinius metabolitus, tokius kaip flavanoidai ar karotenoidai, kurie naudojami kaip antioksidantai. Laboratorinis darbas EPITELINIŲ KAMIENINIŲ LĄSTELIŲ IDENTIFIKAVIMAS Teorija Visų epitelinių audinių (pvz. odos epidermio ir epitelinių ląstelių, išklojančių vidinį žarnyno paviršių) bendra savybė yra ta, kad paviršiuje esančios ląstelės nuolat apmiršta, yra pašalinamos ir tada pakeičiamos naujomis. Žmogaus odos viršutinis paviršius yra pašalinamas kiekvieną dieną, o žarnyno epitelio paviršius atsinaujina kas 3-4 dienas. Šis procesas vyksta dėl to, kad epiteliniuose audiniuose yra grupė mažiau diferencijuotų ląstelių (suagusio organizmo kamieninių ląstelių), kurios visą organizmo gyvenimą išsaugo gebėjimą dalintis ir diferencijuotis į specializuotas epitelinių audinių ląsteles. Buvo nustatyta, kad dalinantis kamieninėms epitelinėms ląstelėms susidaro vadinama pereinamų-amplifikuojančių (angl. transit-amplifying) ląstelių grupė, kurios turi didelį proliferacijos potencialą, tačiau pasidalinę tam tikrą kartų skaičių galiausiai diferencijuojasi, suformuodamos specializuotas epitelines ląsteles. Norint nustatyti ar audinyje yra kamieninių ląstelių populiacija, pirmiausiai būtina nustatyti ar tą audinį sudarančios ląstelės pasižymi skirtingu proliferacijos potencialu. Yra trys galimybės: (i) visos ląstelės dalinasi vienodu greičiu, (ii) dalinasi tik nediferencijuotų ląstelių subpopuliacija, arba (iii) audinyje yra du tipai besidalinančių ląstelių: kamieninės ir pereinamos-amplifikuojančios. Populiacijos viduje pastarosios ląstelės gali pasižymėti labai nevienodu proliferacijos pajėgumu, kuris kinta nuo labai didelio iki gebėjimo pasidalinti tik vieną kartą. Dar viena galimybė yra ta, kad populiacijos viduje bus dvi subpopuliacijos su skirtingu proliferacijos pajėgumu, kurias galima atskirti vizualiai pagal susidarančių kolonijų morfologiją. Šiame laboratoriniame darbe jūs izoliuosite pirmines epitelines ląsteles iš pelės pieno liaukų ir nustatysite ar izoliuotų ląstelių populiacijoje yra ląstelių, pasižyminčiu skirtingu proliferacijos pajėgumu. I DALIS: PIRMINIŲ EPITELINIŲ LĄSTELIŲ IZOLIAVIMAS Medžiagos ir tirpalai Terpė audinio suardymui: 1. Sumaišyti (gali būti paruošta prieš dieną): 5µg/ml Insulino (Sigma) Antibiotikai: 600U/ml Nistatino (Sigma), 100U/ml Penicilino/streptomicino (Gibco) 5 µg/ml Gentamicino (Gibco) 1 DMEM-F12 terpė (Sigma) 2. Pridėti 2mg/ml kolagenazės A (Boehringer), 10minučių maišyti šiltoje vandens vonioje (37°C). Steriliai perfiltruoti. DNazės tirpalas: 4 ml DMEM-F12 terpės 2 U/ml DNazės (Sigma) PBS tirpalas (gali būti paruošta prieš dieną): PBS 5% Suagusio jaučio serumas Augimo terpė (gali būti paruošta prieš dieną; ruošiama steriliai laminare): 5 ng/ml Epidermio augimo faktorius (Becton Dickinson) 10 µg/ml Insulinas 5 mg/ml Jaučio serumo albuminas (frakcija V) (Sigma) 5 µg/ml Linoleinės rūgšties komleksas (Sigma) 50 µg/ml Gentamycinas 20U/ml Nistatinas DMEM-F12 terpė 5-10% Kolageno I (pasirinktinai). Pridėjus palikti nemaišant 1 valandą prie 37°C. Privesti pH 7.4 Linoleinės rūgšties komleksas: 1. PBS ištirpinti 5g linoleinės rūgšties-albumino (Sigma L8384) ir 95g jaučio serumo albumino, kad llinoleinės rūgšties koncentracija būtų 2.5 mg/ml. 2. Tirpalą perfiltruoti. Išpilstyti 2ml porcijom ir laikyti prie -20°C. Saugoti nuo šviesos. Jaučio serumo albuminas (JSA) be riebalų rūgščių: 1. Į 250ml standartinės terpės įdėti 50 mg JSA be riebalų rūgščių. 2. 30 min lėtai maišyti (kad neputotų) kambario temperatūroje. 3. Nufiltuoti ir laikyti 40ml porcijom prie -20°C. Dispazės tirpalas: Galima nusipirkti paruoštą naudojimui 1× (Boehringer, kat # 295-825) 2 Tripsino tirpalas: 0.05% tripsino ištirpinto DMEM X2. Lėkštelių padengimas kolagenu (tik ląstelių linijai): 1. 1 ml kolageno tirpalo (2 mg/ml) sumaišyti su 39 ml 0.02 N acto rūgšties (1ml ledinės acto rūgšties ištirpinti 870 ml distiliuoto H2O). 2. Atskietą kolageno tirpalą (50 µg/ml) išpilstykite į lėkšteles. Naudokite bent jau 5 µg/cm2. Taigi 60 mm lėkštelei padengti reikia 3 ml, o 100 mm reikia 8 ml kolageno tirpalo. 3. Inkubuoti 1 valandą kambario temperatūroje. Po to nusiurbti tirpalo perteklių. Perplauti su PBS. Darbo eiga: Ląstelių izoliavimas 1. Pelė patalpinama į CO2 indą arba jai nutraukiamas stuburas. 2. Visa pelė pamerkiama į 70% eatnolį. 3. Steriliais instrumentais išpjaunama trečia, ketvirta ir penkta pieno liakų (PL) poros (pjaunant stengtis kartu neišpjauti raumens ir sausgyslių gabalėlių). Iš ketvirtos liaukų poros pašalinti limfmazgius. 4. PL pamerkiamos į šiltą (37°C) DMEM-F12 terpę. 5. Norint izoliuoti pakankamai ląstelių reikia 5-6 pelių. Išpjovus visas PL jos paguldomos ant plokščio, sterilaus paviršiaus. 6. Naudojant du sterilius skalpelius visos PL yra smulkiai pjaustomos 10-15 minučių. 7. PL homogenates supilamas į 50ml sterilų užsukamą buteliuką (falcon tipo) su šiltu kolagenazės tirpalu. Naudoti 50 ml tirpalo izoliuojant ląsteles iš 6-7 pelių. Jei izoliuojama iš >8 pelių paruošiami du 50 ml kolagenazės tirpalo buteliukai. 8. Inkubuojama 3 valandas prie 37°C nuolat purtant (purtymo dažnis 100 rpm). Ląstelių gryninimas **(tam, kad proceso eigoje būtų prarandama kuo mažiau ląstelių dėl jų prilipimo prie indų ir pipečių sienelių, prieš pradedant sekančius žingsnius rekomenduojama Indus ir pipetes praplauti steriliu PBS + 5% suaugusio jaučio serumo). 1. Po inkubacijos buteliukus su PM homegenatu kolagenazės tirpale centrifuguoti 5min prie 1000 rpm, kambario temperatūroje. 2. Nuosėdas resuspenduoti 4ml DMEM-F12 (2-7 žingsniams naudoti sterilius 50 ml falcon tipo buteliukus). 3. Centrifuguoti 5min prie 800 rpm, kambario temperatūroje. 3 4. Nuosėdas resuspenduoti 4ml DMEM-F12 su 2U/ml DNazės. 5. Švelniai maišyti 2 minutes. 6. Pridėti 4ml DMEM-F12 su 4% naujagimio jaučio serumo (NJS), kad būtų nuslopintas DNazės aktyvumas. 7. Centrifuguoti 10min prie 1000 rpm, kambario temperatūroje. 8. Supernatantą nupilti ir nuosėdas resuspenduoti 7-10ml sterilaus PBS + 5% suaugusio jaučio serumo (SJS). 9. Centrifuguoti 15 sekundžių prie 1500 rpm (spausti “quick spin” mygtuką). Supernatantą nupilti, nuosėdas resuspenduoti 7-10ml sterilaus PBS+ 5% SJS (9-10 žingsniams naudoti sterilius 15 ml buteliukus). 10. Norint gauti gryną ląstelių preparatą 9 žingsnį kartoti 7-8 kartus (turi būti bent 90% epitelinių ląstelių (arba vadinamų ‘organoidų’ sudarytų iš 100 ląstelių), neužterštų eritrocitais ir fibroblastais). Grynumą tikrinti mikroskopu. Tam po 5-6 pakartojimo paimti 10 µl supernatanto ir patikrinti ar supernatante nebeliko ‘organoidų’. Jei nebeliko, galima ląsteles užsėti. Ląstelių auginimas kultūroje 1. Ląstelių koncentracijo suspensijoje skaičiavimas. Išanksto paruošiamas kristalo violeto tirpalas 1:10. Mažame ependorfe lygiais tūriais sumaišomas kristalo violeto tirpalas ir ląstelių suspensija. Ląstelių membranos suardomos vorteksuojant 15-20 sekundžių. Hemocitometru suskaičiuojami branduoliai. Atsižvelgiant į praskiedimą kristalo violetu paskaičiuojama ląstelių koncentracija suspensijoje. 2. Ląstelių užsėjimas. Rekomenduojamas ląstelių užsėjimo tankis yra 50 000 ląstelių/cm2 (pvz. 2×106 ląstelių/100 mm lėkštelėje, 12 šulinėlių lėkštelės su 5-10 ‘organoidais’ šulinėlyje su 1 ml augimo terpės). Pridėti 2% SJS ir 5-10% kolageno I (pastarojo galima ir nedėti, nes sunku pašalinti kolageną persėjant ląsteles) ir leisti ląstelėms prisitvirtinti prie lėkštelės dugno. Po 1-2 dienų nupilti terpę su SJS ir pridėti terpės be serumo. Jeigu lėkštelėje vis dar yra daug fibroblastų galima 5-10 min pridėti dispazės (Boehringer) ir tik tada terpės be serumo. Ląstelės išgyvena 8-9 dienas, bet terpė turi būti keičiama kas 2-3 dienos. 3. Ląstelių diferenciacijos stimuliavimas. Norint stimuliuoti epitelinių ląstelių diferenciaciją naudoti keratinus (keratiną 8, 18, 19 epitelinėms ląstelėms ir keratiną 5, 14 mioepitelinėms). Audinio saugojimas: 1. Audinys turi būti švarus, limfmazgiai pašalinti. 2. Audinys sukarpomas į 1mm dydžio gabalėlius. 4 3. Audinys pamerkiamas į tirpalą sudarytą iš: 10% DMSO ir 90% NJS (arba DMEM-F12 terpėje su 7% DMSO ir 2% SJS). Išpilstyti į kriogeninius ependorfinius mėgintuvėlius. 4. Audinio ruošinius užšaldyti 1°C/min greičiu naudojant Nalgene šaldymo įrenginį (kat# 51000001) pripildytą izopropanolio. Saugoti prie -70°C kelis mėnesius. 5. Audinys atšildomas greitai pamerkiant ependorfinius mėgintuvėlius su audiniu į 37°C vandens vonią. Vienam mililitrui audinio ruošinio pridėti 9ml augimo terpės DMEM + 2% NJS. Ląstelių saugojimas: 1. Ląstelėms padengus visą lėkštelės dugną jas atskirti nuo dugno naudojant dispazę. 2. Ląstelių suspensiją sumaišyti su DMEM-F12 + 2% serumo. Centrifuguoti 5min. prie 1000 rpm, supernatantą nupilti. 3. Resuspenduoti nuosėdas terpėje su 10% DMSO, 90% NJS (arba DMEM-F12 terpėje su 7% DMSO ir 2% SJS). Išpilstyti į kriogeninius ependorfinius mėgintuvėlius. 4. Ląstelių ruošinius užšaldyti 1°C/min greičiu naudojant Nalgene šaldymo įrenginį (kat# 51000001) pripildytą izopropanolio. Saugoti prie -80°C. 5. Ląstelių suspensija atšildoma greitai pamerkiant ependorfinius mėgintuvėlius su audiniu į 37°C vandens vonią. Ląstelių suspensiją atskiesti pridedant iki 6 tūrių augimo terpės. Centrifuguoti 5 min prie 100 rpm. Supernatantą nupilti, resuspenduoti augimo terpėje ir ląsteles pasėti (ląsteles iš vieno ependorfo į 100 mm diametro lėkštelę. II DALIS: PROLIFERACIJOS HETEROGENIŠKUMO IR KOLONIJŲ FORMAVIMO EFEKTYVUMO NUSTATYMAS Įranga, medžiagos ir tirpalai Lėkštelės ląstelių kultivavimui (6 cm diametro) 10 mg/ml Jaučio serumo albumino (frakcija V) tirpalas PBS, steriliai perfiltruotas Ekstraląstelinės matricos baltymų tirpalai PBS lėkštelių padengimui (pasirinktinai): 100 µg/ml Fibronektinas 20 µg/ml Kolagenas I 100 µg/ml kolagenas IV 25 µg/ml lamininas (iš Engelbreth-Holm-Swarm sarkomos (Sigma)) Augimo terpė (žr. aukščiau) Šviežiai izoliuotos epitelinės ląstelės arba subkonfluentinės epitelinių ląstelių kultūros 0.05% (s/t) Tripsino + 0.02% (s/t) EDTA tirpalas (Gibco) 5 1% Rodanilo mėlio tirpalas: atskirai ištirpinti 2g rodamino ir 2g Nilo mėlio 50 ml distiliuoto vandens, perfiltruoti per Whatman filtrą ir sumaišyti. Darbo eiga: Lėkštelių padengimas ekstraląstelinės matricos baltymais 1. Lėkštelės yra padengiamos pridedant 3 ml ekstraląstelinės matricos baltymų tirpalo. Stengtis, kad tirpalas padengtų visą lėkštelės paviršių. Inkubuojama per naktį prie 4°C drėgnoje aplinkoje, arba 1 valandą prie 37°C. 2. Jaučio serumo albumino tirpalą denatūruoti karščiu, pakaitinant 0.5 ml tirpalo porciją 3 min. prie 80°C. Atšaldyti ant ledų ir atskiesti su PBS iki 0.5 mg/ml jaučio serumo albumino. 3. Pasibaigus inkubacijai, ekstraląstelinės matricos baltymų tirpalo perteklių nusiurbti iš lėkštelių. Perplauti 3 kartus su PBS. 4. Nespecifinę adheziją užblokuoti pridedant 0.5 mg/ml jaučio serumo albumino tirpalo ir inkubuojant 1 valandą prie 37°C. 5. Perplauti 2 kartus su PBS. Pridėti 2 ml terpės be serumo (pvz. DMEM) ir padėti šiltai (37°C). Proliferacijos heterogeniškumo ir kolonijų formavimo efektyvumo (KFE) nustatymas 1. Nusiurbti terpę iš lėkštelių su subkonfluentinėm epitelinių ląstelių kultūrom. Nuplauti 2 kartus su PBS ir inkubuoti su tripsinu/EDTA 5-15 min. prie 37°C. Mikroskopu tikrinti ląsteles kas 5 min., kol ląstelės pilnai atsiskiria nuo lėkštelės dugno. 2. Tripsinizuotas ląsteles (arba šviežiai izoliuotas ląsteles), supilti į 15 ml centrifuginį mėgintuvėlį. 3. Tripsiną inhibuoti pridedant tripsino inhibitoriaus iš sojos pupelių (1 mg/ml, Sigma). Centrifuguoti 5 min prie 170 g. 4. Supernatantą nupilti, nuosėdas resuspenduoti 5 ml epitelinių ląstelių augimo terpėje. Suskaičiuoti ląsteles hemocitometru. 5. Lėkštelėje pasėti 103-104 ląstelių, bent po 3 lėkšteles kiekvienai pasirinktai ląstelių koncentracijai. Auginti 14 dienų prie 37°C, augimo terpę keisti 3 kartus per savaitę. 6. Po 14 dienų ląsteles nuplauti PBS ir fiksuoti 3.7% formalfehidu 10 min. kambario temperatūroje. 7. Lėkštelės nuplauti distiliuotu H2O ir dažyti 30 min. pridėjus 3 ml rodanilo mėlio. 8. Lėkštelės nuplauti tekančiu H2O ir išdžiovinti. 9. Naudojantis mikroskopu suskaičiuoti kolonijas, kuriose yra ≥32 ląstelės. KFE paskaičiuojamas pagal formulę: 6 KFE = LT ⋅ 100% LK kur LT – užsėtų ląstelių skaičius, LK – suformuotų kolonijų skaičius. 10. Paskaičiuojama, kiek skirtingų tipų kolonijų susidarė, jeigu aiškiai matomi morfologiniai skirtumai. Galimi trys kolonijų tipai: didelės (sudarytos iš kamieninių ląstelių), mažos (sudarytos iš pereinamų-amplifikuojančių ląstelių), ir labai mažos (dar vadinamos abortyvinėmis, kurios yra sudarytos iš pilnai diferencijuotų ląstelių, turinčių labai ribotą potencialą dalintis). Sub-klonuojant dideles kolonijas susidaro daug didelių kolonijų, kelios mažos ir kelios abortyvinės kolonijos, sub-klonuojant mažas – susidaro dauguma tokių pat mažų ir kelio abortyvinės, sub-klonuojant abortyvines kolonijas naujų kolonijų visai nesusidaro. 7 - 51 - X. PRAKTINIS DARBAS Elektrogenoterapija TIKSLAS Susipažinti su elektrogenoterapijos principais bei metodika. UŽDUOTIS Ištirti fluorescentinių dažų patekimą į pelių hepatomos MH-A22 ir Kinijos žiurkėno kiaušidžių ląsteles pro poras, suformuotas jų membranoje stipraus elektrinio lauko impulsu. Įvertinti susiformavusių nanoporų dydį. DARBO PRIEMONĖS: 1. Elektroporatorius, 2. Eksperimetinė kamera, 3. Fluorescentinis mikroskopas. REAGENTAI, LĄSTELĖS: Tirpalai ir reagentai Fiziologinis tirpalas (0,9% NaCl) (Balkanpharma-Troyan AD, Troyan, Bulgarija). Augimo terpė pelių hepatomos ir Kinijos žiurkėno kiaušidžių (CHO) ląstelėms ruošiama iš: Dulbecco‘s modifikuotos Eagle‘s terpės - DMEM (Produktas Nr. D5546, Sigma-Aldrich, Chemie GmbH, Steinheim, Vokietija), 10% embrioninio jaučio serumo - FBS (F7524, SigmaAldrich, Chemie GmbH, Steinheim, Vokietija), 1% L – Glutamino tirpalo (G7513, SigmaAldrich, Chemie GmbH, Steinheim, Vokietija), 100 U/ml penicilino ir 100 µl streptomicino antibiotikų (P0781, Sigma-Aldrich, Chemie GmbH, Steinheim, Vokietija). Ląstelių elektroporacijos terpės: Minimum essential medium Eagle (M8167, Sigma-Aldrich, Chemie GmbH, Steinheim, Vokietija). Pelių hepatomos ląstelių MH-A22 linijos bei Kinijos žiurkėno kiaušidžių (CHO) ląstelės auginamos monosluoksniu steriliuose 25 cm2 (60-75 ml tūrio) flakonuose (Greiner Bio-One, GmbH, Frickenhausen, Vokietija) su 5 ml augimo terpės. Flakonėliai su ląstelių kultūra laikomi inkubatoriuje su vandens marškinėliais IR AutoFlow Water-Jacketed Incubator NU-2500E (NuAire, Inc., Plymouth, JAV), kurio pagalba sudaryta 37 oC drėgna, 5% CO2 aplinka. Flakonėlio dangtelis paliekamas prasuktas tam, kad į flakonėlio vidų galėtų patekti CO2, reikalingas augimo terpės pH pusiausvyros palaikymui. Augimo terpėje yra visos pagrindinės medžiagos, reikalingos ląstelių kultūros augimui: amino rūgščių, vitaminų, druskų, hormonų ir augimo faktorių (FBS), energijos šaltinis (L–glutaminas) ir antibiotikų - 52 (penicilinas ir streptomicinas) infekcijos profilaktikai. Siekiant apsaugoti auginamą ląstelių kultūrą nuo infekcijos, dirbama steriliomis sąlygomis vertikalaus srauto laminare Aura Vertical S.D.4 (Bioair Instruments, S.r.l., Siziano, Italija) ir naudojamos sterilios priemonės (antgaliai automatinėms pipetėms, mėgintuvėliai ir kt.). Prieš eksperimentą įvertinamas užaugęs ląstelių monosluoksnis, terpės spalva ir drumstumas. Augant ląstelių kultūrai, gali būti stebimas terpės spalvos pasikeitimas iš rausvos į geltoną, nes reaguoja terpėje esantis indikatorius – fenolio raudonasis, parodantis terpės parūgštėjimą. Ląstelių monosluoksnis, esantis flakonėlyje, apžiūrimas invertuotu mikroskopu (Nikon Eclipse TS 100, Tokijus, Japonija). Pelių hepatomos MH-A22 ir Kinijos žiurkėno kiaušidžių ląstelių suspensijos paruošimas Ląstelių suspensija ruošiama iš užaugusių ląstelių monosluoksnio. Nupilama augimo terpė. Ląstelių sluoksnis užpilamas 1 ml 0.25% tripsino-0.02% EDTA tirpalo (Produktas Nr. T4049, Sigma-Aldrich, Chemie GmbH, Steinheim, Vokietija), kad nuplauti seną terpę ir žuvusias ląsteles. Jis iš karto išpilamas. Tada ląstelių sluoksnis užpilamas 2 ml (60-75 ml tūrio flakonui) tripsino/EDTA tirpalu ir paliekamas 2 – 10 min kol ląstelių monosluoksnis pilnai atsiskirs nuo flakonėlio sienelės. Po to ląstelių suspensija papildoma 4 ml augimo terpės tam, kad sustabdytų tripsino veiklą. Viskas buvo perpilama į 15 ml talpos mėgintuvėlį ir centrifuguojama 5 min 1000 aps/min greičiu centrifugoje (OPN-3YXL4, Rusija). Supernatantas nupilamas, o iš nusėdusių ląstelių ruošiama suspensija elektroporacijai (Saulis ir kt., 2007), ląsteles suspenduojant Minimum essential medium Eagle terpėje (M8167, Sigma-Aldrich, Chemie GmbH, Steinheim, Vokietija). Paruošta 1,2·106 ląstelių/ml suspensija elektroporuojama 20-30 min. bėgyje. Ląstelių tankis apskaičiuojamas Neubauerio hemocitometro (Neubauer improved, Heinz Herenz Medizinalbedarf, Hamburgas, Vokietija) pagalba, nudažant jas tripano mėliu. Tam, 10 µl terpės su ląstelėmis įlašinama į 90 µl 0,4% tripano mėlio dažų tirpalą (T-8154, Sigma-Aldrich co Ltd., Irvine, UK) ir gerai sumaišoma. Paruošus Neubauer kamerą ir įdėjus lašą nudažytos ląstelių suspensijos, ląstelės suskaičiuojamos naudojant invertuotą mikroskopą Eclipse TS 100 (Nikon, Tokijus, Japonija). - 53 TYRIMO METODIKA Formuojant membranose, jų nanoporas ląstelių suspensija veikiama stačiakampiais stipraus elektrinio lauko impulsais (2 pav.). Tam naudojamas elektroporatorius, sukonstruotas VDU Biologijos katedros Biofizikinių tyrimų laboratorijoje. Šis įrenginys yra pritaikytas elektroporacijos in vitro ir elektrochemoterapijos in vivo tiriamiesiems darbams. generuoti stačiakampius Jis gali impulsus, kurių skaičius gali kisti nuo 1 iki 1000, 2 pav. Įrenginio nanoporų formavimui ląstelių membranose scema. impulsų amplitudė – iki 1200 V, trukmė – nuo 20 µs iki 2 ms. Naudojami plokšteliniai nerūdijančio plieno elektrodai. Jų ilgis 20 mm o plotis – 8 mm. Atstumas tarp elektrodų – 2 mm. Elektroporuojant tarp šių elektrodų įdedamas 50 µl ląstelių suspensijos lašelis. Eksperimentai atliekami kambario temperatūroje. Genų patekimą į ląsteles galima stebėti tiriant baltymo, koduojamo įvedamu genu, ekspresiją. Tam labai gerai tinka fluorescuojantį baltymą – green-fluorescent protein – koduojantis genas (Dujardin ir kt., 2001). Tačiau baltymo ekspresija užtrunka. Metodo esmę galima pademonstruoti stebint kitokių molekulių patekimą į ląsteles, pavyzdžiui savaime fluorescuojančių molekulių (pvz. liuciferio geltonojo (Elia ir kt., 1991)) ar tokių, kurių fluorescencija smarkiai padidėja, joms prisijungus prie DNR ar RNR (pvz. propido jodido (Wouters ir kt., 2001)). Stebėjimai atliekami fluorescentiniu mikroskopu. Ląstelių membranose susiformavusių porų dydį galima įvertinti palyginant duomenis gautus naudojant skirtingo dydžio molekules. Naudojama dažai: propido jodidas (Mr = 660 Da) ir liuciferio geltonasis (Mr = 570). - 54 Literatūra 1. (2000) Electrochemotherapy, Electrogenetherapy, and Transdermal Drug Delivery, Humana Press Inc., Totowa, NJ. 2. Auer D., Brandner G., and Bodemer W. Dielectric breakdown of the red blood cell membrane and uptake of SV 40 DNA and mammalian cell RNA, Naturwissenschaften, 63 (1976) 391. 3. Batiuškaitė D (2003) 'Standžių navikų elektrochemoterapinio efektyvumo priklausomybės nuo elektrinio lauko charakteristikų tyrimas.' 2003. Kaunas, VDU. 4. Cemazar M., Miklavcic D., and Sersa G. Intrinsic sensitivity of tumor cells to bleomycin as an indicator of tumor response to electrochemotherapy, Jpn. J. Cancer Res., 89 (1998) 328-333. 5. Chandler D.B. Possible mechanisms of bleomycin-induced fibrosis, Clin. Chest. Med., 11 (1990) 21-30. 6. Chu G., Hayakawa H., and Berg P. Electroporation for the efficient transfection of mammalian cells with DNA, Nucleic Acids Res., 15 (1987) 1311-1326. 7. Dujardin N., Van Der S.P., and Preat V. Topical gene transfer into rat skin using electroporation, Pharm. Res., 18 (2001) 61-66. 8. Elia M.C., Motyka L.E., and Stamato T.D. Electrotransfer of [32P]NAD allows labeling of ADP-ribosylated proteins in intact Chinese hamster ovary cells, Anal. Biochem., 192 (1991) 329-333. 9. Gehl J. Electroporation: theory and methods, perspectives for drug delivery, gene therapy and research, Acta Physiol. Scand., 177 (2003) 437-447. 10. Gothelf A., Mir L.M., and Gehl J. Electrochemotherapy: results of cancer treatment using enhanced delivery of bleomycin by electroporation, Cancer Treat Rev, 29 (2003) 371-387. 11. Hanna E., Zhang X., Woodlis J., Breau R., Suen J., and Li S. Intramuscular electroporation delivery of IL-12 gene for treatment of squamous cell carcinoma located at distant site, Cancer Gene Ther., 8 (2001) 151-157. 12. Heller R., Jaroszeski M., Atkin A., Moradpour D., Gilbert R., Wands J., and Nicolau C. In vivo gene electroinjection and expression in rat liver, FEBS Lett., 389 (1996) 225228. - 55 13. Kuriyama S., Mitoro A., Tsujinoue H., Nakatani T., Yoshiji H., Tsujimoto T., Yamazaki M., and Fukui H. Particle-mediated gene transfer into murine livers using a newly developed gene gun, Gene Ther., 7 (2000) 1132-1136. 14. Limper A.H. Chemotherapy-induced lung disease, Clin. Chest Med., 25 (2004) 53-64. 15. Mann S.G. and King L.A. Efficient transfection of insect cells with baculovirus DNA using electroporation, J. Gen. Virol., 70 ( Pt 12) (1989) 3501-3505. 16. Meilhoc E., Masson J.M., and Teissie J. High efficiency transformation of intact yeast cells by electric field pulses, Biotechnology (N Y), 8 (1990) 223-227. 17. Mir L.M., Belehradek M., Domenge C., Orlowski S., Poddevin B., Belehradek J., Schwaab G., Luboinski B., and Paoletti C. [Electrochemotherapy, a new antitumor treatment: first clinical trial], C R Acad Sci III, 313 (1991a) 613-618. 18. Mir L.M., Glass L.F., Sersa G., Teissie J., Domenge C., Miklavcic D., Jaroszeski M.J., Orlowski S., Reintgen D.S., Rudolf Z., Belehradek M., Gilbert R., Rols M.P., Belehradek J., Bachaud J.M., DeConti R., Stabuc B., Cemazar M., Coninx P., and Heller R. Effective treatment of cutaneous and subcutaneous malignant tumours by electrochemotherapy, Br J Cancer, 77 (1998) 2336-2342. 19. Mir L.M. and Orlowski S. Mechanisms of electrochemotherapy, Advanced Drug Delivery Reviews, 35 (1999) 107-118. 20. Mir L.M., Orlowski S., Belehradek J., and Paoletti C. Electrochemotherapy: potentiation of antitumor effect of bleomycin by local electric pulses, Eur. J. Cancer, 27 (1991b) 68-72. 21. Nakamura H., Isaka Y., Tsujie M., Akagi Y., Sudo T., Ohno N., Imai E., and Hori M. Electroporation-mediated PDGF receptor-IgG chimera gene transfer ameliorates experimental glomerulonephritis, Kidney Int., 59 (2001) 2134-2145. 22. Neumann E. and Rosenheck K. Permeability changes induced by electric impulses in vesicular membranes, J. Membr. Biol., 10 (1972) 279-290. 23. Neumann E., Schaefer-Ridder M., Wang Y., and Hofschneider P.H. Gene transfer into mouse lyoma cells by electroporation in high electric fields, EMBO J., 1 (1982) 841845. 24. Ogihara M. and Yamaguchi O. Potentiation of effects of anticancer agents by local electric pulses in murine bladder cancer, Urol. Res., 28 (2000) 391-397. 25. Prausnitz M.R. and Banga A.K. Assesing the potential of skin electroporation for the delivery of protein- and gene-based drugs, TibTech., 177 (1998) 408-412. - 56 26. Satkauskas S., Batiuskaite D., Salomskaite-Davalgiene S., and Venslauskas M.S. Effectiveness of tumor electrochemotherapy as a function of electric pulse strength and duration, Bioelectrochemistry, 65 (2005) 105-111. 27. Satkauskas S. and Saulis G. Electroporation as a tool for biotechnology and medicine with specific emphasize on its application for drug and gene delivery. Review, Veterinarija ir zootechnika, 28 (2004) 74-81. 28. Satoh Y., Hatakeyama K., Kohama K., Kobayashi M., Kurusu Y., and Yukawa H. Electrotransformation of intact cells of Brevibacterium flavum MJ-233, J. Ind. Microbiol., 5 (1990) 159-165. 29. Saulis G. and Satkauskas S. Electroporation of biological membranes, Veterinarija ir zootechnika, 28 (2004) 82-88. 30. Saulis G., Satkauskas S., and Praneviciute R. Determination of cell electroporation from the release of intracellular potassium ions, Anal. Biochem., 360 (2007) 273-281. 31. Titomirov A.V., Sukharev S., and Kistanova E. In vivo electroporation and stable transformation of skin cells of newborn mice by plasmid DNA, Biochim. Biophys. Acta, 1088 (1991) 131-134. 32. Tounekti O., Pron G., Belehradek J., Jr., and Mir L.M. Bleomycin, an apoptosismimetic drug that induces two types of cell death depending on the number of molecules internalized, Cancer Res., 53 (1993) 5462-5469. 33. Vieželienė D. Genų terapija, Biomedicina, 76 (2001) 67-69. 34. Vieželienė D. Genų terapija, Biomedicina, 77 (2002) 78-80. 35. Weaver J.C. and Chizmadzhev Y.A. Theory of electroporation: A review, Bioelectrochem. Bioenerg., 41 (1996) 135-160. 36. Wells D.J. Gene therapy progress and prospects: electroporation and other physical methods, Gene Ther., 11 (2004) 1363-1369. 37. Wouters P.C., Bos A.P., and Ueckert J. Membrane permeabilization in relation to inactivation kinetics of Lactobacillus species due to pulsed electric fields, Appl. Environ. Microbiol., 67 (2001) 3092-3101. 38. Yin D. and Tang J.G. Gene therapy for streptozotocin-induced diabetic mice by electroporational transfer of naked human insulin precursor DNA into skeletal muscle in vivo, FEBS Lett., 495 (2001) 16-20.