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WIRTSCHAFT
„Blitzschnell in die Tiefe“
Next Generation Sequencing (Library Kits)
Produktübersicht
Anbieter/
Hersteller
Name des Kits
Kompatible
NGS-Plattformen
Sonstiges, Besonderheiten, Allgemeines
Active Motif
NOMe-Seq
Illumina
Hoch auflösendes Einzel-Molekül “Nucleosome Occupancy and
Methylome Sequencing” Kit | Simultane Analyse der Besetzung der
DNA mit Nucleosomen und DNA-bindenden Proteinen, sowie des
DNA-Methylierungsprofils | Untersuchung unterschiedlicher
epigenetischer Modifizierungen am gleichen DNA-Strang:
Nukleosom-„Footprint“ im Kontext des DNA-Methylierungsprofils/
Transkriptionsfaktorbindung in Abhängigkeit vom Chromatin-Status
Auf Anfrage
RapidSeq MasterMix Directional mRNA Sample Prep Kit
Illumina
Mit und ohne Aligner | Einfache Arbeitsschritte
Ab 700,-
RapidSeq High Yield Directional mRNA Sample Prep Kit
Illumina
Mit und ohne Aligner | Automationsfähiges Protokoll | Einfache
Arbeitsschritte | Hohe Ausbeute direktionaler NGS-Libraries |
Geeignet für geringe RNA-Mengen und (-Qualität)
Ab 700,-
RapidSeq MasterMix Small
RNA Sample Prep Kit
Illumina
Für die Identifizierung und Quantifizierung von kurzer RNA |
Mit und ohne Aligner | Einfache Arbeitsschritte
Ab 620,-
RapidSeq High Yield Small
RNA Sample Prep Kit
Illumina
Für die Identifizierung und Quantifizierung von kurzer RNA |
Mit und ohne Aligner | Einfache Arbeitsschritte |
Geeignet für geringe RNA-Mengen und (-Qualität)
Ab 620,-
NxSeq DNA Sample Prep Kit 1 Roche 454
100 ng DNA-Template reichen aus | Reduzierte Bildung von Chimären und / false junctions | Schnelles Protokoll
290,- bis 525,-
NxSeq DNA Sample Prep Kit 2 Illumina
s.o.
270,- bis 487,-
NxSeq 40kb Mate-Pair
Cloning Kit
Illumina, 454, Ion Torrent
Für De-Novo-Komplettgenom-Sequenzierung |
Eingebaute Primerbindestellen, keine Adapterligation notwendig |
Bis zu 64% gefilterte Reads
569,- bis
1.869,-
Mint-2 cDNA Synthesis Kit
Adapter/PlugOligos für 454.
SOLiD oder Illumina
Optimierte cDNA-Synthese für Next Generation-Sequencing | Fulllength angereicherter repräsentat. cDNA Pool | Schnelles Protokoll
750,-
Trimmer-2 cDNA
Normalization Kit
All NGS Plattformen
Entfernung häufiger Transkripte aus cDNA-Libraries |
Erhöhte NGS-Effiziens | Keine Trennschritte nötig
630,-
TargetRich CRX Cancer
Research Panel
Illumina
Krebsgen-Panel für Target-Anreicherung | Deckt die zehn am häufig- 1.850,- bis
sten mutierten Krebsgene ab | Custom Design und Service verfügbar 11.950,-
RapidSeq Directional mRNA
Sample Prep Kit
Illumina
Herstellung direktionaler NGS-Libraries | Detektion seltener
Transkripte und Splice-Isoformen | Minimale Setup-Zeit
960,-
RapidSeq Small RNA Sample
Prep Kit
Illumina
FFPE RNA kompatibel | Benötigt nur 100 pg total RNA |
Hands-on-Time unter einer Stunde
760,-
Norgen PCR Purification and
Primer Dimer Removal Kit
Alle NGS-Plattformen
DNA-Fragment-Reinigung für Next Generation-Sequencing |
> 90% Recovery | Größe 100 Bp bis 15.000 Bp
99,- bis 415,-
ScriptSeq Complete Kits
Illumina-Plattformen
Komplette Herstellung von RNA-Seq Libraries in nur einem Tag |
Direktionale Libraries – typischerweise mit weniger als 3% rRNA
Reads | Input ab 100 ng Gesamt-RNA, inklusive FFPE RNA |
Barcode/Index-kompatibel: ScriptSeq-Index-Primer zur Herstellung
von Barcode-Libraries sind separat erhältlich |
Kit enthält RNA-Removal-Komponente (RiboZero)
1.080,- (
6 Reaktionen)
3.960,- (24)
Illumina-Plattformen
Herstellung von Libraries aus miRNA (auch pflanzliche miRNA) und
anderen monophosphorylierten kleinen RNAs; wahlweise auch von
kleinen RNAs, die eine Cap-Struktur bzw. ein 5´Triphosphatende
besitzen | Strang-spezifisches Tagging der RNA ermöglicht
direktionales Sequenzieren | 1-5 µg Gesamt-RNA oder 100 pg Sizeselected RNA können als Startmaterial eingesetzt werden |
Reduziert deutlich die Adapter-Dimere in der Sequenzier-Library
700,- (12
Reaktionen)
Geeignet für alle
Plattformen
Amplifikationskit für die Gesamt-DNA einer einzelnen Zelle |
Robuste und reproduzierbare Reaktionen mit Kontrollkit | Einfaches
homogenes Protokoll zur Vermeidung von Template-Verlusten |
Für lebende oder fixierte Zellen | Für beliebige nachgelagerte
molekulare Analysen incl. NGS
Auf Anfrage
Verschiedene Kits zur Herstel- Illumina
lung von Illumina Libraries
Nähere Details unter www.illumina.com
Auf Anfrage
NEXTflex DNA Sequencing Kit Illumina GAIIx, HiSeq2000/1000 und MiSeqPlattformen
Für 1 µg fragmentierte genomische DNA | Erlaubt Magnet-Beadbasierte Aufreinigungen | Bis zu 96 verschiedene Adapter
erhältlich für Multiplex-Ansätze
330,- (8
Reaktionen)
1.590,- (48)
NEXTflex PCR-free DNA
Sequencing Kit
s.o.
Keine Amplifikationsschritte | Für 500 ng bis 3 µg fragmentierte
genomische DNA | Bis zu 96 verschiedene Adapter erhältlich
für Multiplex-Ansätze
390,- (8)
1.800,- (48)
NEXTflex ChIP-Seq Kit
s.o.
Geeignet für Minimum 1 ng Ausgangsmaterial |
Bis zu 96 verschiedene Adapter erhältlich für Multiplex-Ansätze
330,- (8)
1.590,- (48)
NEXTflex Methyl-Seq Kit
s.o.
Kompatibel mit MeDIP oder MeCAP zur Ermittlung differentiell methy- 390,- (8)
lierter Regionen und zur Quantifizierung des Methylierungsstatus |
1.800,- (48)
Bis zu 96 verschiedene Adapter erhältlich für Multiplex-Ansätze
La Hulpe, Belgien
www.activemotif.com
Kontakt: Matthias Lehne
Tel. +49 176 7074 1430
[email protected]
Amsbio
www.amsbio.com
Kontakt:
Tel. +49 69 779099
[email protected]
BioCat
Heidelberg
www.biocat.com
Kontakt: Elke Gamer
Tel. +49 6221 7141516
[email protected]
Epicentre
(Human/Mouse/Rat)
www.epibio.com
Vertrieb D/A:
Biozym Scientifc
Kontakt: Monika Burbach
Tel. +49 5152 9020
[email protected]
ScriptMiner Small RNA-Seq
www.biozym.com
Library Preparation Kit
Silicon Biosystems
Ampli1 WGA Kit
Bologna, Italien
www.siliconbiosystems.com
Kontakt: ampli1.support@
siliconbiosystems.com
Distribution: Cenibra,
www.cenibra.de
Illumina
San Diego, CA (USA)
www.illumina.com
Bioo Scientific/
HiSS Diagnostics
Austin, TX (USA)
www.biooscientific.com
Freiburg
www.hiss-dx.com
76
Preis
[EUR]
11/2012
WIRTSCHAFT
„Blitzschnell in die Tiefe“
Next Generation Sequencing (Library Kits)
Produktübersicht
Anbieter/
Hersteller
Name des Kits
Kompatible
NGS-Plattformen
Sonstiges, Besonderheiten, Allgemeines
Bioo Scientific/
HiSS Diagnostics
NEXTflex Bisulfite-Seq Kit
Illumina GAIIx, HiSeq2000/1000 und MiSeqPlattformen
Geeignet für RRBS (reduced representation bisulfite sequencing)
390,- (8)
oder genomweite Sequenzierung nach Bisulfitkonvertierung zur
1.800,- (48)
basengenauen Bestimmung der Methylierungsstellen | Bis zu 12 verschiedene methylierte Adapter erhältlich für Multiplex-Ansätze
NEXTflex RNA-Seq Kit
s.o.
Geeignet ab 10 ng poly-A-angereicherte RNA oder rRNAabgereicherte RNA, für längere Fragmente (150 - 250 nt) |
Bis zu 96 verschiedene Adapter erhältlich für Multiplex-Ansätze
NEXTflex Directional RNASeq Kit (dUTP-based)
s.o.
Direktionalität wird durch Einbau von dUTP bei der Zweitstrangsynthese 490,- (8)
2.360,- (48)
und nachfolgenden Verdau des Uridin-enthaltenden Strangs mittels
Uracil-DNA-Glycosylase erreicht | Geeignet ab 10 ng poly-A-angereicherte RNA oder rRNA-abgereicherte RNA, für längere Fragmente (150250 nt) | Bis zu 96 verschiedene Adapter erhältl. f. Multiplex-Ansätze
NEXTflex Directional RNASeq Kit (ligation-based)
s.o.
Direktionalität durch sukzessive Ligation von adenyliertem 3’ Adapter
und 5’ Adapter | Benötigt obligatorisch das NEXTflex Randomized
Adapter Set | Geeignet ab 10 ng poly-A-angereicherte RNA oder
rRNA-abgereicherte RNA, für kürzere Fragmente (50-100 nt) |
Bis zu 48 verschiedene Adapter erhältlich für Multiplex-Ansätze
510,- (8)
1.410,- (24)
2.385,- (48)
NEXTflex Small RNA
Sequencing Kit
s.o.
Für die Sequenzierung von microRNAs, piwi RNAs and anderen
kurzen, nicht-kodierenden RNAs | Bis zu 48 verschiedene Adapter
erhältlich für Multiplex-Ansätze
1.260,- (24)
2.330,- (48)
NEXTflex DNA-Seq Kit for Ion
Torrent
Life Technologies Ion Proton & Ion PGM Sequencer
Für 10 ng - 1 µg fragmentierte genomische DNA |
Erlaubt Aufreinigung mittels Magnet-Beads |
Bis zu 64 verschiedene Adapter erhältlich für Multiplex-Ansätze
170,- (8 )
795,- (48)
NEXTflex DNA-Seq Kit for
SOLiD 5500
Life Technologies SOLiD
5500
s.o.
320,- (8)
1.090,- (48)
NEXTflex DNA-Seq Kit for
SOLiD 4
Life Technologies SOLiD 4
s.o.
320,- (8)
1.090,- (48)
Life Technologies/
Ion Torrent
Ion Xpress Plus Fragment
Library Kit
Ion PGM Sequencer
Ion Proton Sequencer
Herstellung von Libraries für Ion Torrent Sequenzierer | Enzymatisches Zerstückeln und Konstruktion von bis zu 20 DNA Libraries
788,-
San Francisco, CA (USA)
www.iontorrent.com
Ion Plus Fragment Library Kit
s.o.
Für 10 DNA-Library-Konstruktionen
526,-
Ion Plus Library Kit for Library
Builder System
s.o.
Automatische Library-Konstruktion von 13 Ion Torrent-Fragment-Libraries mit Library-Builder
750,-
Ion Xpress Plus Library Kit for
Library Builder System
s.o.
s.o.
1060,-
Ion AmpliSeq Library Kit 2.0
s.o.
Reagenzien für acht Amplifikations- und LibrarykonstruktionsReaktionen
750,-
Ion Total RNA-Seq Kit v2
s.o.
(Fortsetzung,
Kontaktdaten siehe S. 76)
Life Technologies/
Applied Biosystems
Preis
[EUR]
390,- (8)
1.800,- (48)
RNA-basiert Library-Konstruktion von bis zu 12 Proben
1.120,-
TargetSeq Custom Enrichment Ion PGM Sequencer
Kits
Ion Proton Sequencer 5500
SOLiD/W Genetic Analyzers
100Kb - 60MB Anreicherungsskala | High-density Proben Design |
Pre-capture Probenmultiplexing
Auf Anfrage
Ion TargetSeq Exome Kits
s.o.
Selektive, spezifische und wirtschaftliche Anreicherung von Exons
und anderen Regionen des humanen Genoms
Auf Anfrage
5500 SOLiD Mate-Paired
Library Kit
5500 SOLiD/W Genetic
Analyzers
Alle Reagenzien, Säulen und Gele für die Konstruktion von
12 Libraries enthalten
2.130,-
5500 SOLiD/W Genetic
Analyzers
Alle Reagenzien, Enzyme etc. für die Konstruktion von
12 Libraries enthalten
768,-
s.o.
RNA-basierte Library-Konstruktion von bis zu 12 Proben
1.350,-
Für Library-Builder | Minimaler Setup | Bis 13 Libraries pro Lauf
und 26 Libraries pro Tag
916,-
5500 SOLiD Fragment Library
Grand Island, NY (USA)
www.lifetechnologies.com Kit
SOLiD Total RNA-Seq Kit
Library Builder Fragment Core s.o.
Kit
Library Builder Whole
Transcriptome Core Kit
s.o.
s.o.
1.100,-
PureGenome Kits und
Ilumina-kompatible
Plattformen
Ermöglicht die Erstellung von NGS (Next Generation-Sequencing)Bibliotheken in unter zwei Stunden | Liefert bessere Ergebnisse
durch maximale Ausbeute mit weniger Ausgangs-DNA und minimalem Bias | Bietet höhere Genomabdeckung und mehr korrekt
zugeordnete Reads | Verarbeitung von Proben aus praktisch allen
biologischen Flüssigkeiten, Geweben und Gewebeschnitten
Auf Anfrage
www.merckmillipore.com Reagenzien
New England
Biolabs
Alle Illumina-NGSPlattformen
Integrierter NEBNext HiFi 2x Master Mix | Adaptoren und Oligos
separat erhältlich (s. unten) | Magnetic Bead Protokolle 100%
kompatibel mit Automatisierung | Auch als Produkt mit
Einzelkomponenten verfügbar
350,- (12
Reaktionen)
1.400,- (60)
Alle Illumina-NGSPlattformen
Inkl. NGS-optimierter Reverser Transkriptase | Adaptoren, Oligos
und Poly A-Enrichment-Modul separat erhältlich (s. unten) |
Magnetic Bead Protokolle 100% kompatibel mit Automatisierung |
Auch als Produkt mit Einzelkomponenten verfügbar (E6100 S/L)
525,- (12)
2.100,- (60)
Alle Illumina-NGSPlattformen
Integrierter NEBNext HiFi 2x Master Mix zur optimalen Amplifizierung
von Libraries unabhängig vom GC/AT Gehalt | Adaptoren und
Oligos separat erhältlich (s. unten) | Magnetic Bead Protokolle
100% kompatibel mit Automatisierung
285,- (12)
1.140,- (60)
Merck Millipore
NEBNext DNA Library Prep
Master Mix Set for Illumina
Frankfurt
www.neb-online.de
Kontakt: Tel 0800 246 5227 NEBNext mRNA Library Prep
Master Mix Set for Illumina
(kostenfrei in DE)
Tel. 00800 246 52277
(kostenfrei in AT)
[email protected]
NEBNext ChIP-Seq Library
Prep Master Mix Set for
Illumina
11/2012
77
WIRTSCHAFT
„Blitzschnell in die Tiefe“
Next Generation Sequencing (Library Kits)
Produktübersicht
Anbieter/
Hersteller
Name des Kits
New England
Biolabs
NEBNext Multiplex Small RNA Alle Illumina-NGSLibrary Prep Set for Illumina
Plattformen
Inklusive Adaptoren und 12plex Barcode-Primer | „Single Tube“-Re- 1.470,- (24)
aktion ohne Aufreinigungsschritte für erhöhte Ausbeuten und schnel- 4.998,- (96)
lere Protokolle | Substanzielle Reduzierung von unerwünschten
Adaptor-Dimeren | Optional: Strang-spezifische mRNA-Sequenzierung
NEBNext Small RNA Library
Prep Set for Illumina
Inklusive Adaptoren und Single Plex-Primer | Ideal für „Home Brew“
Barcode-Systeme | „Single Tube“-Reaktion ohne Aufreinigungsschritte für erhöhte Ausbeuten und schnellere Protokolle |
Substantielle Reduzierung von unerwünschten Adaptor-Dimeren
1.200,- (24)
4.080,- (96)
NEBNext Singleplex Oligos for Alle Illumina-NGSIllumina
Plattformen
Single Plex-Adaptor und -Primer für Illumina-Plattformen |
Reduzierte Adaptor-Dimerisierung | Erhöhte Library-Ausbeuten
und Ligationseffizienz | Kompatibel mit DNA, RNA und ChIP SeqApplikationen | Ideal für „Home Brew“ Barcode-Systeme
54,- (24)
243,- (96)
NEBNext Multiplex Oligos for
Illumina (Index Primer Set 1)
Alle Illumina-NGSPlattformen
Multiplex-Primer und -Adaptor für Illumina-Plattformen |
Index-Primer 1-12 | Reduzierte Adaptor-Dimerisierung |
Erhöhte Library-Ausbeuten und Ligationseffizienz |
Kompatibel mit DNA, RNA und ChIP Seq-Applikationen
132,- (24)
480,- (96)
NEBNext Multiplex Oligos for
Illumina (Index Primer Set 2)
Alle Illumina-NGSPlattformen
Multiplex-Primer und Adaptor für Illumina-Plattformen |
Indexprimer 13-27 | Reduzierte Adaptor-Dimerisierung |
Erhöhte Library-Ausbeuten und Ligationseffizienz |
Kompatibel mit DNA, RNA und ChIP Seq-Applikationen
132,- (24)
480,- (96)
NEBNext High-Fidelity 2X PCR Alle Illumina-NGSMaster Mix
Plattformen
Optimiert für fehlerfreie Amplifikation für Illumina-NGS-Libraries |
Exzellente Amplifikation unabhängig von AT/GC Gehalt |
Zuverlässiger und NGS-optimierter Master-Mix
90,- (50)
360,- (200)
NEBNext DNA Library Prep
Master Mix Set for 454
Roche 454 Genome
Sequencer FLX GS Junior
Reduzierte Hands On-Time | Zeit- und Geld-Ersparnis durch das
Master-Mix-Format
300,- (10)
1.200,- (50)
NEBNext Quick DNA Library
Prep Master Mix Set for 454
Roche 454 Genome
Sequencer FLX GS Junior
Auch als Produkt mit Einzelkomponenten verfügbar
300,- (10)
1.200,- (50)
NEBNext mRNA Library Prep
Master Mix Set for 454
Roche 454 Genome
Sequencer FLX GS Junior
Inkl. NGS-optimiertem cDNA und Library-Modul | Praktische und
zuverlässige Master-Mix-Formulierung | Auch als Produkt mit
Einzelkomponenten verfügbar
475,- (10)
1.900,- (50)
NEBNext DNA Library Prep
Master Mix Set for SOLiD
Life Technologies SOLiD 3, Zeit- und Geld-Ersparnis durch das Master-Mix-Format
SOLiD 4, SOLiD 5500 (dA-Tailing Module separat erhältl.)
NEBNext mRNA Library Prep
Master Mix for SOLiD
Life Technologies SOLiD 3,
SOLiD 4, SOLiD 5500
Inkl. NGS-optimierter Reverser Transkriptase
NEBNext Small RNA Library
Prep Reagent Set for SOLiD
Life Technologies SOLiD 3,
SOLiD 4, SOLiD 5500
Inklusive Adaptoren und 12plex Barcode-Primer | „Single Tube“-Reak- 600,- (10)
tion ohne Aufreinigungsschritte für erhöhte Ausbeuten und schnellere 2.400,- (50)
Protokolle | Substanzielle Reduzierung von unerwünschten AdaptorDimeren | Optional: Strang-spezifische mRNA-Sequenzierung
NEBNext ChIP-Seq Library
Prep Master Mix Set for
SOLiD
Life Technologies SOLiD 3, Zuverlässige Master-Mix-Formulierung mit schnellen Protokollen
SOLiD 4, SOLiD 5500 (dA-Tailing Module separat erhältl.)
(Fortsetzung,
Kontaktdaten siehe S. 78)
78
Kompatible
NGS-Plattformen
Alle Illumina-NGSPlattformen
Sonstiges, Besonderheiten, Allgemeines
Preis
[EUR]
375,- (10)
1.500,- (50)
550,- (10)
2.200,- (50)
310,- (10)
1.240,- (50)
NEBNext Multiplex Small RNA Life Technologies SOLiD 3,
Library Prep Set for SOLiD
SOLiD 4, SOLiD 5500
Inklusive Adaptoren und 12plex Barcode-Primer | „Single Tube“-Reak- 2.240,- (32)
tion ohne Aufreinigungsschritte für erhöhte Ausbeuten und schnellere
Protokolle | Substantielle Reduzierung von unerwünschten AdaptorDimeren | Optional: Strang-spezifische mRNA-Sequenzierung
NEBNext Fast DNA Library
Prep Set for Ion Torrent
Life Technologies Ion
Torrent PGM
Zuverlässige Master-Mix-Formulierung mit schnellen Protokollen
195,- (10)
790,- (50)
NEBNext Fast DNA Frag. &
Library Prep Set f. Ion Torrent
Life Technologies Ion
Torrent PGM
Zuverlässige Master-Mix-Formulierung mit schnellen Protokollen |
Inklusive NEBNext DNA-Fragmentation-Master-Mix
235,- (10)
940,- (50)
NEBNext End Repair Module
Multi-Plattform
Größtmögliche Flexibilität durch Modulsystem | Einfache Anpassung
an Ihren Workflow | Plattformübergreifend einsetzbar
85,- (20)
340,- (100)
NEBNext dA-Tailing Module
Multi-Plattform
s.o.
100,- (20)
400,- (100)
NEBNext Quick Ligation
Module
Multi-Plattform
s.o.
300,- (20)
1.200,- (100)
NEBNext Fill-In and ssDNA
Isolation Module
Multi-Plattform
s.o.
75,- (20)
300,- (100)
NEBNext mRNA Second
Strand Synthesis Module
Multi-Plattform
s.o.
295,- (20)
1.180,- (100)
NEBNext RNase III RNA
Fragmentation Module
Multi-Plattform
Größtmögliche Flexibilität durch Modulsystem | Einfache Anpassung
an Ihren Workflow | Plattformübergreifend einsetzbar | Optimal bei
direkter Ligation der Fragmente an ssDNA- oder ssRNA-Adaptoren
70,- (100)
NEBNext Magnesium RNA
Fragmentation Module
Multi-Plattform
Größtmögliche Flexibilität durch Modulsystem | Einfache Anpassung
an Ihren Workflow | Plattformübergreifend einsetzbar | Optimal bei
subsequenter reverser Transkription und anschließender Ligation der
dsDNA an Adaptoren
45,- (200)
NEBNext Poly(A) mRNA
Magnetic Isolation Module
Multi-Plattform
Größtmögliche Flexibilität durch Modulsystem | Einfache Anpassung 67,- (24)
an Ihren Workflow | Plattformübergreifend einsetzbar | Optimiert für 242,- (96)
Hochdurchsatz-Anwendungen und Elution in kleinen Volumina
11/2012
WIRTSCHAFT
„Blitzschnell in die Tiefe“
Next Generation Sequencing (Library Kits)
Produktübersicht
Anbieter/
Hersteller
Name des Kits
Kompatible
NGS-Plattformen
Sonstiges, Besonderheiten, Allgemeines
Roche Diagnostics
Deutschland
GS FLX Titanium Rapid Library
Prep Kit
Für GS FLX, GS FLX+ und
GS Junior
1 Kit für die Preparation von 12 Shotgun-Libraries für die Sequenzierung mit dem GS FLX, GSFLX+ oder GS Junior-System
1.490,-
Mannheim
www.roche-appliedscience.com
Kontakt:
Tel. 00800 73783623 (DE)
service.sequencing@
roche.com
GS FLX Titanium Rapid Library
MID Adaptors Kit
Für GS FLX, GS FLX+ und
GS Junior
1 Set mit 12 verschiedenen MIDs | Multi-Identifier (MID) dienen als
Barcode, um verschiedene Libraries zu markieren, zu amplifizieren
und gemeinsam zu sequenzieren
1.495,-
GS GType HLA MR Primer Set
Für GS FLX, GS FLX+ und
GS Junior
1 Set mit HLA-Primern (4 PCR-Platten, 40 Reaktionen) für Medium Re- 500,solution HLA-Typing | Set mit spezifischen PCR-Primern, die polymorphe Regionen des Human Leukocyte Antigens (HLA) abdecken |
Die Primer sind in PCR-Platten vorgelegt
GS GType HLA HR Primer Set
Für GS FLX, GS FLX+ und
GS Junior
1 Set mit HLA-Primern (4 PCR-Platten, 40 Reakt.), die zusammen m. MR- 500,Primern f. High Resolution HLA-Typing verwendet werden | Set m. spezifischen PCR-Primern, die polymorphe Regionen des Human Leukocyte
Antigens (HLA) abdecken | Die Primer sind in PCR-Platten vorgelegt
GS GType RUNX1 Primer Set
Für GS FLX, GS FLX+ und
GS Junior
1 Set mit spezifischen RUNX1-Primern (4 PCR-Platten , 48 Reakt.) | Set 800,mit spezif. PCR-Primern, die als Marker für die Charakterisierung v. verschiedenen Leukämien dienen | Primer sind in PCR-Platten vorgelegt
GS GType TET2/CBL/KRAS
Primer Set
Für GS FLX, GS FLX+ und
GS Junior
1 Set mit spezifischen TET2, CBL und KRAS-Primern (4 PCR-Platten,
12 Reaktionen) | Set mit spezifischen PCR-Primern, die als Marker
für die Charakterisierung von verschiedenen Leukämien dienen |
Die Primer sind in PCR-Platten vorgelegt
800,-
SMARTer Ultra Low RNA Kit
for Illumina Sequencing
Illumina GA II, HiSeq,
HiScanSQ und My Seq
Geräte
Amplifikation von Full Length-cDNA |
Transkriptom Analyse mit 10 pg Gesamt-RNA |
Single-Tube-Protokoll
1.398,- (10
Reaktionen)
8.900,- (100)
Clontech/
Takara Bio Europe
www.clontech.com
Kontakt:
Tel. 0800 182 5178 (DE)
Tel. 0800 563629 (CH)
Tel. 0800 296 141 (AT)
Preis
[EUR]
[email protected]
[email protected]
Next Generation Sequencing (Geräte)
Produktübersicht
Anbieter/
Hersteller
Name des SequenzierungsGeräts
Technik
Leseweiten |
Datenmenge pro Lauf
Sonstiges, Besonderheiten,
Allgemeines
Fluidigm
Access Array
System
Herstellung von AmpliconLibraries von höchster Qualität mit geringem
Arbeitsaufwand | Kompatibel mit allen üblichen
Sequenziersystemen
Microfluidik-Plattform, die 48 Proben
mit jeweils 48 Primersets kombiniert
| Dabei werden 2.304 PCR-Reaktionen mit weniger als 50 ng DNA
pro Probe simultan in einem Lauf
durchgeführt
Entwickelt für Targeted Resequencing |
Offene Plattform , unterstützt alle Spezies
und Sequenzieranwendungen | Flexiblität:
Kompatibilität zu den meistbenutzten
Sequenzierplattformen | Geringere Kosten pro
Probe ermöglichen große Studien
Auf Anfrage
HiSeq 1000
Sequenzierung durch
Synthese | Reversible
Farbstoff-Terminatoren
2 x 100 Bp | 300 GB
--
Auf Anfrage
HighSeq 2000
s.o.
2 x 100 Bp | 600 GB
--
Auf Anfrage
HighSeq 1500
s.o.
Schneller Lauf: 2 x 150 Bp; 60 GB |
Hoher Output: 2 x 100 Bp; 300 GB
--
Auf Anfrage
HighSeq 2500
s.o.
Schneller Lauf: 2 x 150 Bp; 120 GB |
Hoher Output: 2 x 100 Bp; 600 GB
--
Auf Anfrage
MiSeq
s.o.
2 x 250 Bp | 7,5-8,5 GB
--
Auf Anfrage
Genome
Analyzer IIx
s.o.
2 x 150 Bp | 95 GB
--
Auf Anfrage
HiScanSQ
s.o.
San Francisco, CA (USA)
www.fluidigm.com
Illumina
San Diego, CA (USA)
www.illumina.com
Life Technologies/
Applied Biosystems
Grand Island, NY (USA)
www.lifetechnologies.com
Ion Torrent
(Life Technologies)
San Francisco, CA (USA)
www.iontorrent.com
11/2012
Preis
[EUR]
2 x 100 Bp | 150 GB
--
Auf Anfrage
5500 W Series Ligation-basierte
Genetic
Sequenzierung (Wildfire
Analyzer
Technology)
75 Bp |
paired end 50 x 50 (Dezember 2012),
mate pair 2 x 60 (Dezember 2012) bis
zu 380 Gb pro Lauf
Pay-per-lane und Application-per-lane-Sequenzierung | Direkte library amplification auf
Flowchip in 2 Stunden | 36 Exome pro Lauf bei
100x Coverage | 96 Barcodierung verfügbar |
Upgrade auf “Wildfire”-Konfiguration für 5500
Series Genetic Analyzer möglich
Auf Anfrage
Library Builder System
Automation von 5500 SOLiD
System, Wildfire und
Halbleiter-Sequenzierung
Stellt bis zu 13 Libraries pro Tag her
Halbautomatisches System, das DNA-Fragment
und RNA-Libraries generiert | Kompatibel mit
Ion Torrent, SOLiD und Wildfire Chemie | Einfacher Upgrade auf DNA- and RNA-Reinigung
28.947,-
Ion PGM
Sequencer
Halbleiter-Sequenzierung
400 Bp Leseweite |
10 MB (Ion 314 chip) in 2-3 h
100 MB (Ion 316 chip) in 2-3 h
1000 MB (Ion 318chip) in 2-3 h
Benchtop-Sequenzierer | Drei Chip-Optionen
(kleinster Chip 10Mb) | Benötigt keine Optik |
Mehrheit der Basen bei Q30 | Lokale und
Cloud-basierte Datenanalyse
72.500,incl. Server
79
WIRTSCHAFT
„Blitzschnell in die Tiefe“
Next Generation Sequencing (Geräte)
Produktübersicht
Anbieter/
Hersteller
Name des SequenzierungsGeräts
Technik
Leseweiten |
Datenmenge pro Lauf
Sonstiges, Besonderheiten,
Allgemeines
Ion Torrent
(Life Technologies)
Ion Proton
Sequencer
Halbleiter-Sequenzierung
Gegenwärtig 200 Bp |
bis zu 10 Gb (PI Chip) in 2-3 h,
~60 Gb (PII Chip, verfügbar
ab Anfang 2013),
~120 Gb (PIII Chip, verfügbar 2013)
Seit Oktober 2012 auf dem Markt | Schnelle
209.800,Benchtop-Sequenzierung von Genomen | Je
(inkl.
nach Chip drei Durchsatzoptionen | Einfache Se- Server)
quenzierungs-Chemie | Exom & Genomsequenzierung in 2-4 stündigen Sequenzierungs-Läufen
Ion Chef
System
Automation der HalbleiterSequenzierung
Automatische Templat-Herstellung
und Chip Beladung
Lieferbar ab 2013
Auf Anfrage
Roche Diagnostics
Deutschland
GS FLX+
System
Hochparallele Pyrosequenzierung
Lange Reads ideal für Transkriptom-Sequenzierung, Metagenom-Analysen und AmpliconSequenzierung | Genauigkeit |
Einfache Bioinformatik
Auf Anfrage
Mannheim
www.roche-appliedscience.com
Kontakt:
Tel. 00800-73783623
service.sequencing@
roche.com
Lange Leseweiten, 700 Basen Modal
Read Length | 1 Mio Reads pro
Lauf mit 700 Mb Durchsatz
GS Junior
System
Hochparallele
Pyrosequenzierung
Lange Leseweiten, 500 Basen Modal
Read Length | 100.000 Reads pro
Lauf mit 40 Mb Durchsatz
Benchtop System | Lange Reads ideal für
De-Novo-Sequenzierung oder Resequenzierung
von Mikroorganismen, Transkriptom-Sequenzierung, Metagenom Analysen und AmpliconSequenzierung | 99.99% Genauigkeit |
Einfache Bioinformatik
Auf Anfrage
(Fortsetzung, Kontaktdaten siehe S. 81)
Next Generation Sequencing (Service)
Preis
[EUR]
Produktübersicht
Anbieter/
Hersteller
Verfügbare
Anwendungen
NGS-Plattformen
Sonstiges, Besonderheiten, Allgemeines
Active Motif
Illumina HiSeq
ChIP-Seq, MeDIP-Seq, hMeDIP
Seq, MethylCollectorUltra-Seq,
Targeted Next-Gen Bisulfite Seq
Kompletter Anfang-bis-Ende Service | Inkl. Chromatin-IP/(h)MeDIP, 3.550,- bis 6.000,MBD-Protein-Präzipitation | Inkl. strenger Qualitätskontrollen |
(je Probe)
Inkl. Next Gen-Sequenzierung | Inkl. gründlicher Datenanalyse
Illumina
shRNA Screens mit gepoolten
shRNA Libraries
Kompatible, barcodierte Libraries | Kompletter Service beinhaltet:
Barcode-Amplifikation und Enumeration, HT-Sequenzierung
(Illumina), Sequenz-Datenanalyse
Roche GS FLX |
Illumina HiSeq 2000 |
PacBio RS
De novo-Sequenzierung | ReSequenzierung | Targeted (re)sequencing | Methylom- / Epigenom-Studien | ChIP-Seq |
De-Novo-Sequenzierung & ReSequenzierung eukaryotischer /
prokaryotischer cDNA |
SmallRNA / microRNA
All-in-one Services: Probenvorbereitung, Sequenzierung und Bioin- Auf Anfrage
formatik | Anbieter von Multiplattform-Sequenzierstrategien; u.a.
auch Hybridstrategien unter Verwendung der Plattformen PacBio RS
und Roche GS FLX für lange Contigs | Zertifizierter Serviceanbieter:
ISO 9001:2000, CSPro (Illumina), CSP (Agilent Technologies), Illumina
HiSeq 2000- und Roche GS FLX-Plattformen akkreditiert durch die
DAkkS nach ISO/IEC17025 | Vollautomatisierte und LIMS-gesteuerte
Arbeitsabläufe, Probenprozessierung mit Barcode-Labels
HiSeq2000
gDNA Sequencing, Gene Regulation Analysis, Sequencing-Based
Transcriptome Analysis, SNP Discovery and Structural Variation
Analysis, Cytogenetic Analysis,
DNA-Protein Interaction Analysis,
Exome Enrichment, SequencingBased Methylation Analysis, etc.
Library-Konstruktion für Next Generation Sequencing |
Bioinformatik | NGS Libraries, DNA-Libraries |
RNA Libraries HiSeq2000 Sequencing (1 x 50, 1 x 100,
2 x 100 Basenpaare)
Ab 110,- (NGS)
Ab 310,- (DNA)
Ab 2.100,- (1x50)
Ab 2.600,- (1x100)
Ab 3.200,- (2x100)
Roche 454 (GS Junior,
GS FLX, GS FLX+),
Illumina (MiSeq),
Ion Torrent (PGM)
Metagenomics, Targeted
Resequencing (Amplikon- und
Hybridisierungs-basiertes Target
Enrichment), Whole Genome
Resequencing, De novoSequencing
Detailliertere Metagenomics-Analyse der in den untersuchten
Proben vorhandenen Spezies mittels GS FLX+-Technologie |
Persönlicher Projektmanager | Outsourcing in Teilen oder als
kompletter Workflow möglich, von der DNA-Isolierung bis hin zur
bioinformatischen Datenauswertung | Auswahl der passenden
NGS-Plattform, je nach Applikation und Projektumfang
Auf Anfrage
Roche 454,
illumina HiSeq2000,
illumina MiSeq
Alle Standardanwendungen inkl.
16S Analysis, Metagenomics,
Mitochondriale Genome, Genotypisierung, Amplikon-basierte
Target-Resequenzierung
DNA- / RNA-Extraktion (niederer und hoher Durchsatz) |
96/384/1536 Format (multicopy, medium & high throughput) |
Biobanking | KASPTM-Genotypisierung
Applikationsabhängig
MiSeq
Krebspanel, Multiplexed PCR
Amplicon Sequencing, Targeted
Resequencing, Hybrid Capture,
etc.
Illumina Cancer Panel Reference Lab | NGS Library Construction
Service | Bioinformatik
Ab 1.290,- (1 x
50 Bp; 850 Mb)
ab 1.590,- (2 x
150 Bp; 5,1 Gb)
1.850,- (2 x 250 Bp;
8,5 Gb)
La Hulpe, Belgien
www.activemotif.com
Kontakt: Bianca Garms
Tel. +49 173 63 240 90
[email protected]
BioCat
Heidelberg
www.biocat.com
Kontakt: Elke Gamer
Tel. +49 6221 7141516
[email protected]
GATC Biotech
Konstanz
www.gatc-biotech.com
Kontakt:
Tel. +49 7531 81600
customerservice@
gatc-biotech.com
GENterprise
Mainz
www.genterprise.de
Kontakt:
Tel. +49 6131 392 3287
[email protected]
IMGM Laboratories
Martinsried
Kontakt:
Tel. +49 89 895578 40
[email protected]
LGC Genomics /
KBioscience
www.lgcgenomics.com
Kontakt:
Tel. +49 30 5304 2200
[email protected]
StarSEQ
Mainz
www.starseq.com
Kontakt:
Tel. +49 6131 392 3287
[email protected]
80
Preis
[EUR]
2.000,- (Cell pellet)
11/2012
WIRTSCHAFT
In Laborjournal 11/2012 fehlten in der Produktübersicht „Next Generation Sequencing” die Produkte der Firma Peqlab. Hier sind sie:
„Blitzschnell in die Tiefe“
Next Generation Sequencing (Library Kits)
Produktübersicht
Anbieter/
Hersteller
Name des Kits
Kompatible
NGS-Plattformen
Sonstiges, Besonderheiten, Allgemeines
Peqlab
Biotechnologie
KAPA Library Prep
Alle Illumina NGS-Plattformen
Enthält alle Enzyme und Reaktionspuffer
Auf Anfrage
KAPA Library Prep Real-Time
Illumina
Enthält alle Enzyme und Reaktionspuffer
Auf Anfrage
Erlangen
www.peqlab.com
Kontakt: Florian Bundis
Tel. +49 9131 6107020
[email protected]
KAPAHiFi Library Amp
Alle NGS-Plattformen
Antikörperbasierte HotStart Proofreading-DNA-Polymerase
Auf Anfrage
KAPAHiFi Library Amp Real-Time Alle NGS-Plattformen
Wie oben, aber Amplifikation über Proofreading-Real-Time-PCR Auf Anfrage
KAPAHiFi Uracil+
Alle NGS-Plattformen
Uraciltolerante Proofreading-DNA-Polymerasen
KAPA Library Quant Illumina
Illumina
Auf Real Time-PCR basier. Quantifizierung v. NGS-Bibliotheken Auf Anfrage
KAPA Library Quant 454
FLX/Lib-A
Roche 454 FLX- u. 454 Titanium Ampli- s.o.
con-Bibliotheken mit Lib-A-Adaptern
Auf Anfrage
454 Roche 454 Titanium-Bibliotheken mit s.o.
Lib-L-Adaptern
Auf Anfrage
KAPA Library
Titanium/Lib-L
11/2012
Preis
[EUR]
Quant
Auf Anfrage
KAPA Library Quant SOLiD
ABI SOLiD
s.o.
Auf Anfrage
KAPA Library Quant Ion Torrent
Ion Torrent PGM und Proton
s.o.
Auf Anfrage
81