dockazalo vsebine - Inštitut za mikrobiologijo in imunologijo
download 
Report Transcription
kazalo vsebine - Inštitut za mikrobiologijo in imunologijo
Univerza v Ljubljani Medicinska fakulteta Inštitut za mikrobiologijo in imunologijo Katedra za mikrobiologijo in imunologijo PRAKTIKUM IZ MIKROBIOLOGIJE IN IMUNOLOGIJE ZA ŠTUDENTE MEDICINE Ljubljana, 2011 Univerza v Ljubljani Medicinska fakulteta Inštitut za mikrobiologijo in imunologijo Katedra za mikrobiologijo in imunologijo PRAKTIKUM IZ MIKROBIOLOGIJE IN IMUNOLOGIJE ZA ŠTUDENTE MEDICINE Glavni urednik prof. dr. Vladimir Kotnik, dr. med. Področni uredniki Bakteriologija: asist. mag. Veronika Križan Hergouth, dr. med., doc. dr. Tadeja Matos, dr. med., prof. dr. Manica Mueller Premru, dr. med., prof. dr. Katja Seme, dr. med. Imunologija: prof. dr. Alojz Ihan, dr. med. Mikologija: doc. dr. Tadeja Matos, dr. med. Parazitologija: prof. dr. Jernej Logar, univ. dipl. biol., asist. dr. Barbara Šoba, univ. dipl. mikr., asist. Miha Skvarč, dr. med. Virologija: doc. dr. Miroslav Petrovec, dr. med. Avtorji prof. dr. Vladimir Kotnik, dr. med., doc. dr. Tadeja Matos, dr. med., asist. mag. Veronika Križan Hergouth, dr. med., doc. dr. Miroslav Petrovec, dr. med., prof. dr. Manica Mueller Premru, dr. med., prof. dr. Katja Seme, dr. med., prof. dr. Eva Ružić Sabljić, dr. med., prof. dr. Jernej Logar, univ. dipl. biol., prof. dr. Alojz Ihan, dr. med., doc. dr. Darja Keše, univ. dipl. biol., asist. znan. sod., strok. svet. dr. Saša Simčič, univ. dipl. kem., asist. dr. Andreja Nataša Kopitar, univ. dipl. biol., asist. Miha Skvarč, dr. med., asist. dr. Barbara Šoba, univ. dipl. mikr., prof. dr. Tatjana Avšič Županc, univ. dipl. biol., asist. strok. svet. dr. Mateja Poljšak Prijatelj, univ. dipl. biol., viš. strok. sod. Vesna Golob, univ. dipl. biol., Polona Maver, dr. med., Mateja Jelen, univ. dipl. mikr., asist. Monika Jevšnik, univ. dipl. mikr., dr. Sanja Stopinšek, univ. dipl. biol., asist. strok. svet. Alenka Andlovic, dr. med., dr. Manca Žolnir Dovč, univ. dipl. biol., asist. strok. sod. Nataša Švent Kučina, dr. med., asist. Samo Jeverica, dr. med., viš. znan. sod. dr. Branka Wraber, univ. dipl. biol. Slike Veronika Strašek, prof. dr. Eva Ružić Sabljić, dr. med., asist. Mateja Pirš, dr. med., Vladimir Drnovšek Recenzenti prof. dr. Marija Gubina, dr. med., prof. dr. Jožica Marin, univ. dipl. biol., prof. dr. Srečko Koren, dr. med. Lektorica Katarina Marin Hribar, prof. Tehnično uredila Mihaela Oberdank Hrastar Tehnični sodelavki Barbara Trtnik, Mrjetka Zupin Založila Univerza v Ljubljani, Medicinska fakulteta, Inštitut za mikrobiologijo in imunologijo, Katedra za mikrobiologijo in imunologijo Tisk Itagraf d. o. o. Računalniško oblikovanje Boex DTP d. o. o. CIP - Kataložni zapis o publikaciji Narodna in univerzitetna knjižnica, Ljubljana 579(075.8)(076.5) 616-097(075.8)(076.5) PRAKTIKUM iz mikrobiologije in imunologije za študente medicine / [avtorji Vladimir Kotnik ... [et al.] ; glavni urednik Vladimir Kotnik ; slike Veronika Strašek ... et al.]. - Ljubljana : Medicinska fakulteta, Inštitut za mikrobiologijo in imunologijo, Katedra za mikrobiologijo in imunologijo, 2011 ISBN 978-961-91159-4-7 1. Kotnik, Vladimir 258504448 Copyright© Katedra za mikrobiologijo in imunologijo 2011 Vse pravica pridržane. Razmnoževanje ali razširjanje delov ali celote te publikacije s katerim koli sredstvom brez pisnega dovoljenja založnika je prepovedano. KAZALO VSEBINE KAZALO VSEBINE SEZNAM KRATIC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 13 UVOD . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 19 POGLAVJE 1 Pravilno in varno delo v mikrobiološkem laboratoriju . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Mikrobiološki laboratorij . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Pravila o varnem delu v mikrobiološkem laboratoriju . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Varnostni ukrepi pri delu v laboratoriju . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Nezgode v mikrobiološkem laboratoriju . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Higiensko umivanje in razkuževanje rok . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Asepsa . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Sterilizacija . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Nadzor učinkovitosti sterilizacijskih postopkov . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Razkuževanje ali dezinfekcija . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 21 23 23 23 24 25 26 26 27 28 POGLAVJE 2 Bakteriologija . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 31 1. VAJA: KOKI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Enterococcus spp. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Moraxella catarrhalis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Neisseria gonorrhoeae . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Neisseria meningitidis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Staphylococcus aureus . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Staphylococcus epidermidis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Streptococcus pyogenes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Streptococcus pneumoniae . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Streptococcus agalactiae . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 33 33 39 43 47 52 58 62 68 73 2. VAJA: BACILI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 77 Bacteroides fragilis in drugi po Gramu negativni anaerobni bacili . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 77 Bordetella pertussis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84 Clostridium perfringens . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 89 Escherichia coli . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 97 Haemophilus influenzae . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 103 Klebsiella pnemoniae . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 108 Listeria monocytogenes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 114 Pseudomonas aeruginosa . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 120 Salmonella Enteritidis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 125 3. VAJA: DRUGE BAKTERIJE . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Borrelia burgdorferi sensu lato . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Campylobacter spp. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Chlamydia trachomatis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Helicobacter pylori. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 130 130 138 143 147 3 PRAK TIKUM IZ MIKROBIOLOGIJE IN IMUNOLOGIJE ZA ŠTUDENTE MEDICINE Legionella spp. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Mycobacterium spp. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Mycoplasma pneumoniae . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Treponema pallidum . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Vibrio cholerae . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 151 157 162 167 172 POGLAVJE 3 Mikologija . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 177 4. VAJA: GLIVE . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Aspergillus spp. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Candida spp. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Cryptococcus neoformans . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Dermatofiti . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 179 180 187 195 202 POGLAVJE 4 Parazitologija . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 209 5. VAJA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Črevesni praživali Giardia intestinalis in Cryptosporidium spp. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Pražival Trichomonas vaginalis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Pražival Toxoplasma gondii . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Krvna, tkivna pražival Plasmodium spp. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Črevesna glista Enterobius vermicularis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Trakulja Taenia solium . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Trakulja Echinococcus spp. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Uši Pediculus humanus spp., Phthirus pubis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 211 211 216 219 223 226 229 232 237 POGLAVJE 5 Virologija . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Uvod v virološko diagnostiko . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Odvzem in transport vzorcev v virološki laboratorij . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Pregled diagnostičnih tehnik v virologiji . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Encimsko-imunska metoda . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Metoda neposredne imunofluorescence (DIF) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Dokazovanje virusnih antigenov s hitrimi testi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Imunohistokemične metode . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Aglutinacija z lateksom . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Osamitev virusov v celični kulturi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Sistemi za osamitev virusa . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Primarne celične kulture . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Diploidne celične kulture . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Trajne celične kulture . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Postopek osamitve in identifikacije virusnega izolata . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Elektronska mikroskopija . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 241 243 243 244 245 245 246 246 246 246 247 247 247 247 248 248 6.1 VAJA: NEPOSREDNO DOKAZOVANJE VIRUSOV . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 250 Metoda elektronske mikroskopije: povzročitelji virusnih gastroenteritisov – rotavirusi, adenovirusi, astrovirusi in kalicivirusi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 250 4 KAZALO VSEBINE Metoda neposredne imunofluorescence (DIF) – dokazovanje virusnih okužb dihal – respiratorni sincicijski virus – RSV . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 254 Izvedba hitrega testa za dokaz antigenov RSV neposredno v kužnini . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 257 6.2 VAJA: SEROLOŠKO DOKAZOVANJE VIRUSNIH OKUŽB . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Metode za dokazovanje specifičnih protiteles . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Metoda posredne imunofluorescence . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Encimsko-imunska metoda (ELISA) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Metoda imunoblot (westernblot) ali imunsko pivnanje . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Nevtralizacijski test . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Reakcija vezave komplementa (RVK) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Inhibicija hemaglutinacije . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Dokazovanje okužbe s hantavirusi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Dokazovanje okužb z virusom Epstein Barr . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Test monospot − izvedba in materiali . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Dokazovanje okužbe s HIV-1 s potrditvenim testom westernblot . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 258 258 258 259 259 260 260 260 261 263 265 267 6.3 VAJA: MOLEKULARNA DIAGNOSTIKA VIRUSOV . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Metode dokazovanja nukleinskih kislin . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Dokazovanje virusnih nukleinskih kislin brez predhodnega pomnoževanja . . . . . . . . . . . . . . Osamitev nukleinskih kislin . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Verižna reakcija s polimerazo (PCR) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Posredne hibridizacijske metode − reverzna hibridizacija . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Testiranje občutljivosti na protivirusna zdravila . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Določanje genotipa virusa hepatitisa C (HCV) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Kvantitativno določanje virusnega bremena pri okužbi s HIV-1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Genotipsko določanje odpornosti citomegalovirusa (CMV) na zdravila . . . . . . . . . . . . . . . . . 271 271 271 271 272 273 273 274 278 280 POGLAVJE 6 Imunologija . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 283 7. VAJA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Imunski sistem . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Celične vrste in podvrste, ki so pomembne za imunski odziv . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Fagocitne celice . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Limfociti . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Kako imunski sistem odstranjuje tuje molekule iz organizma? . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Antigeni CD . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Protitelesa CD, ki jih uporabljamo za opredelitev limfocitov T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Celice T pomagalke in aids . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Ugotavljanje limfocitnih populacij z imunofluorescenčno tehniko . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Analiza imunskih celic s pretočnim citometrom . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Uporaba pretočne citometrije . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Analiza protitelesnega odziva . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Precipitacijske tehnike . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Mikroprecipitacija v kapilari (semikvantitativna metoda – MPK) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Radialna imunodifuzija (RID – kvantitativna tehnika) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Antistreptolizinski test (nevtralizacija hemolize s protitelesi) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Aglutinacija . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 285 285 285 285 286 286 287 287 287 288 288 289 291 292 292 293 294 296 5 PRAK TIKUM IZ MIKROBIOLOGIJE IN IMUNOLOGIJE ZA ŠTUDENTE MEDICINE Encimsko-imunski testi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Indirektna tehnika z označenimi protitelesi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Indirektna tehnika z označenim antigenom . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Določevanje protiteles . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Merjenje pokazateljev vnetja . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Merjenje aktiviranosti komplementnega sistema . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Reakcija lize (uničevanja celic) s komplementom . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Aktivacija komplementnega sistema po alternativni poti . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Določevanje koncentracije odlomka C3d/dg z metodo RIEF (raketna imunoelektroforeza) . . . . Diagnostični primer A: na kromosom X vezana agamaglobulinemija . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Diagnostični primer B: kronična granulomatozna bolezen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Diagnostični primer C: kronična limfocitna levkemija . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Diagnostični primer D: aids . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Opis metod za tehnično izvedbo nalog A, B, C in D . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Analiza diferencialne krvne slike . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Določitev titra protiteles proti tetanusnemu in davičnemu toksinu z MPK . . . . . . . . . . . . . . . Določanje C-reaktivnega proteina v serumu z aglutinacijo . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Limfocitne vrste in podvrste . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Fagocitna in oksidativna zmožnost monocitov in granulocitov v testu fagocitoze s FITC obarvanih E. coli in v testu oksidacije barvila dihidrorodamin 123 . . . . . . . . . . . . . . . Določanje serumskih protiteles razredov IgM, IgA, IgG s testom ELISA . . . . . . . . . . . . . . . . . Razprava A: . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Razprava B: . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Razprava C: . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Razprava D: . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 312 314 316 316 317 317 POGLAVJE 7 Laboratorijske tehnike in materiali . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Osnovni aparati in drugi pripomočki za delo v mikrobiološkem laboratoriju . . . . . . . . . . . . . . . . . . Mikroskop: svetlobni, s temnim poljem, fluorescenčni . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Navodila za mikroskopiranje . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Odvzem in prenos kužnin . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Načini odvzema kužnine . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Prenos kužnin . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Laboratorijske tehnike . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Neposredni razmaz . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Izdelava razmaza iz hemokulture . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Izdelava razmaza sputuma za barvanje po Gramu in vrednotenje mikroskopskega preparata . . Izdelava neposrednega mikroskopskega preparata iz likvorja . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Izdelava razmazov in barvanje bakterij iz čiste kulture . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Tehnike barvanja . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Tehnika barvanja po Gramu . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Tehnika barvanja z metilenskim modrilom . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Tehnika barvanja po Ziehl-Neelsenu . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Tehnika barvanja po Giemsi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Tehnika barvanja debele kaplje krvi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Tehnika barvanja spor po Schaeffer-Fultonu . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Bakteriološka gojišča . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Vrste gojišč . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 319 321 322 324 325 325 326 326 326 327 327 327 327 328 328 329 329 330 331 331 332 332 6 296 297 297 297 298 298 298 300 301 302 303 304 305 306 306 307 307 307 KAZALO VSEBINE Osnovna gojišča . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Obogatena gojišča . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Tioglikolatni bujon . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Krvni agar . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Čokoladni agar . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Agar po Schaedlerju . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Bogatitvena gojišča . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Diferencialna gojišča . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Agar po Drigalskem . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CLED (Cystine, Lactose, Electrolyte Deficient agar) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Selektivna gojišča . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Agar XLD . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CNA Columbia agar . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . MacC (MacConkey agar) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Specialna gojišča . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Agar BG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Karmali agar . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Agar CYA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Kromogena gojišča . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . MRSA kromogeno gojišče . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Zasejavanje kužnin na gojišča . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Postopek zasejavanja iztrebka . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Postopek zasejavanja sputuma . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Hemokultura . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Postopek zasejavanja urina s kvantitativno metodo in določitev koncentracije mikroorganizmov v urinu . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Osamitev bakterij . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Prepoznava (identifikacija) bakterij . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Izdelava čiste kulture iz mešane kulture bakterij . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Postopki za identifikacijo bakterij . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Prepoznava bakterij po fizioloških in biokemičnih lastnostih . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Biokemična identifikacija po Gramu pozitivnih in negativnih kokov . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Dokaz katalaze . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Dokaz oksidaze . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Navzočnost vezane koagulaze . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Navzočnost proste koagulaze . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Deoksiribonukleaza . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Navzočnost hemolize beta ali alfa . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Bacitracinski test . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Optohinski test . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Satelitni fenomen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Test PYR . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Test razgradnje arabinoze . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Fermentacija sladkorjev glukoze in maltoze (Hissovi sladkorji) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Test CAMP . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Biokemična identifikacija po Gramu negativnih bacilov . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Biokemična vrsta . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Test za dokaz razgradnje glukoze, laktoze ali obeh . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Test za dokaz nastanka indola . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 332 333 333 334 334 334 335 335 335 335 335 336 336 336 336 336 337 337 337 337 338 338 338 339 339 339 340 340 340 341 341 342 342 343 343 343 343 344 344 344 345 345 345 346 346 348 348 348 7 PRAK TIKUM IZ MIKROBIOLOGIJE IN IMUNOLOGIJE ZA ŠTUDENTE MEDICINE Test za dokaz razgradnje glukoze − metil rdeče . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Test za dokaz razgradnje glukoze do acetoina − Voges-Proskauer . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Test za dokaz zmožnosti razgradnje citrata – citrat . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Test za dokaz navzočnosti ureaze . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Dokaz gibljivosti bakterij − gojišče po Winkleju . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Komercialni testi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Odčitavanje API 20 E . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Vrednotenje API NH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Ugotavljanje antigenske zgradbe bakterijskega seva . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Serološke metode za dokazovanje bakterijskih okužb . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Določanje občutljivosti bakterij za antibiotike − antibiogram . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Difuzijski antibiogram . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Izdelava difuzijskega antibiograma . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Minimalna inhibitorna koncentracija, določena z metodo difuzijskega gradienta – E-test . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Odčitavanje E-testov . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Dilucijski antibiogram . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Določanje MIK in MBK z dilucijsko metodo . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Določitev laktamaz beta . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Spremni list za mikrobiološke preiskave . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Izbor preparatov medicinsko pomembnih mikrobov . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Izbor preparatov medicinsko pomembnih parazitov . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 348 349 349 349 350 350 350 351 352 352 352 353 354 354 355 355 355 356 357 359 360 Slika 1. Postopek pri prelitju mikrobne kulture, kužnine ali krvi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 24 Slika 2. Postaja za izpiranje oči . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 24 Slika 3. Postopek izpiranja oči . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 24 Slika 4. Pravilno umivanje in razkuževanje rok . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 25 Slika 5. N. gonorrhoeae v brisu uretre, barvano z metilenskim modrilom . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 43 Slika 6. A: N. gonorrhoeae na krvnem agarju. B: N. gonorrhoeae – fermentacija sladkorjev . . . . . . . . . 44 Slika 7. Potek testa za določitev povzročitelja angine . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 65 Slika 8. Odčitavanje rezultatov testa STREP A. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 65 Slika 9. A: Mikroskopska slika B. fragilis; B: Kultura B. fragilis z diskom metronidazola . . . . . . . . . . . 78 Slika 10. Mikroskopska slika mešane okužbe − vzorec iz abscesa . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 78 Slika 11. Bolniku med operacijo aseptično odvzamejo gnoj iz abscesa . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 80 Slika 12. Tipična mikroskopska slika C. perfringens. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 89 Slika 13. Rast na KA; toplo-hladna hemoliza . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 89 Slika 14. Tipična mikroskopska slika C. tetani . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 90 Slika 15. Tipična mikroskopska slika C. botulinum . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 90 Slika 16. Plinska gangrena . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 92 Slika 17. Hitri test za dokaz enterotoksina pri C. difficile . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 95 Slika 18. Izvedba urikulta . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 101 Slika 19. Odčitavanje pozitivnega rezultata urikulta s shemo za oceno števila bakterijskih kolonij . . . . 101 Slika 20. API 20E . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 109 Slika 21. Test API Listeria . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 115 Slika 22. API 20NE . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 121 Slika 23. Restrikcijski vzorci referenčnih borelijskih vrst . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 133 Slika 24. Trak z nanesenimi borelijskimi antigeni: pozitivna kontrola . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 135 Slika 25. B. burgdorferi sensu lato v mikroskopu s temnim poljem . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 135 Slika 26. Elektroforeza pridelka PCR v agaroznem gelu . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 136 8 KAZALO VSEBINE Slika 27. Celična kultura z značilnimi klamidijskimi vključki . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 28. Priprava vzorca za določitev antigenov bakterije H. pylori v iztrebku . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 29. Prikaz pozitivnega, negativnega in neveljavnega rezultata v testu za dokaz antigena H. pylori . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 30. Posredna imunofluorescena: Legionella pneumophila – pozitiven rezultat . . . . . . . . . . . . . . Slika 31. Fotografija značilnih kolonij M. pneumoniae . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 32. Diagnostično pomembne strukture posameznih glivnih rodov . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 33. Teden dni stare kolonije A. fumigatus, A. flavus, A. niger na SABA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 34. A: Aspergillus spp. – konidiofore, vezikule, fialide, konidiji. B: A. fumigatus, obarvan z modrilom . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 35. A: C. albicans, pseudomicelij z značilnimi terminalnimi klamidosporami na koruznem agarju. B: C. albicans na kromogenem gojišču, obarvana zeleno . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 36. C. albicans, kužnina, barvanje po Gramu . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 37. A: M. canis, makrokonidiji, obarvani z modrilom; B: T. mentagrophytes, spiralne hife, obarvane z modrilom . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 38. M. canis, teden dni stara kolonija na dermatofitnem gojišču . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 39. Shema obravnave vzorca blata, poslanega na ugotavljanje okužbe s črevesnimi paraziti . . . Slika 40. Inokulacija kužnine v gojišču »InPouch« . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 41. Shema obravnave vzorca seruma, poslanega za ugotovitev okužbe s parazitom Toxoplasma gondii . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 42. Razporeditev vzorcev za izvedbo indirektnega hemaglutinacijskega testa za kvantitativno določanje protiteles proti Echinococcus spp. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 43. Test westernblot za dokazovanje protiteles proti ehinokoknim antigenom . . . . . . . . . . . . . . Slika 44. Primer pozitivnega in negativnega rezultata pri metodi neposredne imunfluorescence . . . Slika 45. Izvedba hitrega testa za dokaz antigenov RSV . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 46. Dinamika nastajanja specifičnih protiteles pri okužbi z EBV . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 47. Pozitivni in negativni rezultati testa monospot za dokaz okužbe z EBV . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 48. Princip reverzne hibridizacije . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 49. Shematski prikaz genotipizacije HCV . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 50. Določanje odpornosti CMV za protivirusna zdravila . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 51. Neposredna in posredna imunofluorescenčna tehnika . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 52. Prikaz rezultatov pretočne citometrije v obliki točkovnih diagramov . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 53. Shematični prikaz mikroprecipitacije v kapilari . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 54. Shema nanašanja antigenov v testu RID za določanje koncentracije sestavine C3c komplementnega sistema . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 55. Točkast graf za analizo rezultatov C3c . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 56. Izvedba antistreptolizinskega testa (AST) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 57. Aglutinacija s kardiolipinom označenih lateksnih delcev v testu RPR za določanje protiteles pri okužbi z bakterijo Treponema pallidum . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 58. Encimsko-imunski preskus – direktna tehnika . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 59. ELISA – določevanje protiteles . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 60. Izvedba testa za ugotavljanje sestavin, ki so potrebne za aktivacijo komplementnega sistema . . . Slika 61. Shema za izvedbo testa za ugotavljanje dejavnosti komplementnega sistema po alternativni poti . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 62. Slika gela s precipitati C3d/dg . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 63. Preiskovanec A: limfocitne podvrste . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 64. Preiskovanec B: limfocitne podvrste . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 65. Preiskovanec C: limfocitne podvrste . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 66. Preiskovanec D: limfocitne podvrste . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 144 149 150 152 163 179 180 180 187 188 202 203 212 217 220 234 235 257 257 265 265 273 276 282 288 290 293 293 294 295 296 297 298 299 300 301 309 309 310 311 9 PRAK TIKUM IZ MIKROBIOLOGIJE IN IMUNOLOGIJE ZA ŠTUDENTE MEDICINE Slika 67. Preiskovanec A: fagocitna in oksidativna zmožnost monocitov in granulocitov v testu fagocitoze . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 68. Preiskovanec B: fagocitna in oksidativna zmožnost monocitov in granulocitov v testu fagocitoze . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 69. Preiskovanec C: Fagocitna in oksidativna zmožnost monocitov in granulocitov v testu fagocitoze . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 70. Preiskovanec D: Fagocitna in oksidativna zmožnost monocitov in granulocitov v testu fagocitoze . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 71. Shema pipetiranja na mikrotitrsko ploščo . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 72. Avtoklav . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 73. Varnostna komora . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 74. Laboratorijski hladilnik . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 75. Bakteriološki inkubator . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 76. Suhi sterilizator . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 77. Laboratorijska centrifuga . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 78. Bunsenov gorilnik . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 79. Bakteriološke zanke . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 80. Posoda za varno odlaganje kužnih odpadkov . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 81. Deli svetlobnega mikroskopa . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 82. Kaj zmanjšuje učinkovitost razločevanja opazovanih predmetov v svetlobnem mikroskopu? . . Slika 83. Mikroskopiranje z imerzijo . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 84. Bris žrela . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 85. Odvzem brisa uretre pri moškem in brisa cerviksa pri ženski . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 86. Odvzem srednjega curka urina . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 87. Priprava mikroskopskega razmaza . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 88. Barvanje po Gramu . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 89. Oblika in razporeditev bakterij . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 90. Razporeditev bičkov . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 91. Priprava razmaza krvi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 92. Barvanje spor po Schaeffer-Fultonu . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 93. Navadni agar . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 94. Tioglikolatni bujon . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 95. Krvni agar . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 96. Čokoladni agar . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 97. Agar po Schaedlerju . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 98. Različna diferencialna gojišča . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 99. Agar BG (Bordet Gengou) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 100. Kromogeno gojišče za gojenje MRSA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 101. Zasejavanje kužnine na gojišče . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 102. Redčenje vzorca na gojišču . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 103. Priprava ustrezne razredčine urina za kvantitativno urinokulturo . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 104. Zasejavanje in štetje kolonij pri kvantitativni urinokulturi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 105. Priprava čiste kulture . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 106. Značilne oblike bakterijskih kolonij od zgoraj in v prerezu . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 107. Po Gramu pozitivne in po Gramu negativne bakterije . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 108. Značilna rast v bujonu . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 109. Anaerobni lonec . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 110. Dokaz katalaze . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 111. Dokaz oksidaze . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 10 312 313 313 314 315 321 321 321 322 322 322 322 322 322 323 324 324 325 325 326 327 328 329 329 330 331 333 333 334 334 335 336 337 337 338 338 339 339 340 340 341 341 341 342 343 KAZALO VSEBINE Slika 112. Dokaz koagulaze na predmetniku . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 113. Dokaz koagulaze v epruveti . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 114. Hemoliza beta . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 115. Hemoliza alfa . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 116. Satelitni fenomen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 117. Test PYR . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 118. Hissovi sladkorji za dokaz bakterijske vrste Neisseria/Moraxella . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 119. CAMP fenomen, ki je značilen za skupino B beta hemolitičnih streptokokov (S. agalactiae) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 120. Fermentativna (enterobakterije) in oksidativna (nefermentativni po Gramu negativni bacili) razgradnja glukoze . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 121. Značilne reakcije na dvojnem sladkorju . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 122. Gojišče za dokazovanje razgradnje triptofana do indola . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 123. Metil rdeče . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 124. Reakcija Voges-Proskauer . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 125. Gojišče za dokaz citrata kot edinega vira ogljika . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 126. Dokaz navzočnosti ureaze . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 127. Gojišče za ugotavljanje gibljivosti bakterij . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 128. API 20E . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 129. Izdelava difuzijskega antibiograma . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 130. Izdelava difuzijskega antibiograma z avtomatskim polagalcem diskov . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 131. Določanje MIK z E-testom . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 132. Določanje minimalne inhibitorne in minimalne baktericidne koncentracije antibiotika . . . Slika 133. Inaktivacija penicilina z laktamazo beta . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Slika 134. Obrazec spremnega lista . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 343 343 344 344 345 345 345 346 347 348 348 348 349 349 349 350 351 354 354 355 355 356 357 Razpredelnica 1. Pregled sterilizacijskih postopkov . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 27 Razpredelnica 2. Priporočeni temperatura, čas delovanja in tlak pri sterilizaciji s toploto . . . . . . . . . . 27 Razpredelnica 3. Nekatera razkužila in njihovo delovanje . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 29 Razpredelnica 4. Barvilne in biokemične značilnosti Enterococcus spp. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 34 Razpredelnica 5. Razpredelnica za vnos inhibicijskih con za Enterococcus spp. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 37 Razpredelnica 6. Ugotavljanje občutljivosti za vankomicin in teikoplanin . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 37 Razpredelnica 7. Barvilne in biokemične značilnosti M. catarrhalis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 39 Razpredelnica 8. Diagnostična razpredelnica za ugotavljanje biokemičnih značilnosti M. catarrhalis . . 41 Razpredelnica 9. Razpredelnica za vnos inhibicijskih con za antibiogram bakterije S. aureus . . . . . . . 55 Razpredelnica 10. Ugotavljanje občutljivosti za vankomicin in teikoplanin . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 56 Razpredelnica 11. Razpredelnica za vnos inhibicijskih con za antibiogram bakterije S. pyogenes . . . . 67 Razpredelnica 12. Razpredelnica za oceno ustreznosti odvzetega sputuma . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 70 Razpredelnica 13. Razpredelnica za vnos inhibicijskih con za antibiogram bakterije S. pneumoniae . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 71 Razpredelnica 14. Ugotavljanje občutljivosti za penicilin in cepotaksin . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 72 Razpredelnica 15. Razpredelnica za določitev MIK pri neznani anaerobni bakteriji . . . . . . . . . . . . . . . 82 Razpredelnica 16. Kultivacijske in biokemične značilnosti klostridijev . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 91 Razpredelnica 17. Razpredelnica za vpis podatkov za interpretacijo urinokulture . . . . . . . . . . . . . . . . . 99 Razpredelnica 18. Antibiotiki, ki so primerni za zdravljenje okužb, povzročenih z enterobakterijami . . 100 Razpredelnica 19. Ocena kvalitete sputuma . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 105 Razpredelnica 20. Antibiotiki, primerni za zdravljenje okužb s H. influenzae . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 106 Razpredelnica 21. Antibiotiki, primerni za zdravljenje okužb s K. pneumoniae . . . . . . . . . . . . . . . . . . 112 Razpredelnica 22. Ugotavljanje navzočnosti laktamaze beta razširjenega spektra (ESBL) . . . . . . . . . 112 11 PRAK TIKUM IZ MIKROBIOLOGIJE IN IMUNOLOGIJE ZA ŠTUDENTE MEDICINE Razpredelnica 23. Biokemični testi značilni za razlikovanje listerij . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Razpredelnica 24. Kultivacija likvorja . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Razpredelnica 25. Razpredelnica za identifikacijo listerij . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Razpredelnica 26. Razpredelnica za ugotavljanje kvalitete sputuma . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Razpredelnica 27. Razpredelnica z antibiotiki, ki so primerni za zdravljenje okužb z nefermentativnimi bakterijami . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Razpredelnica 28. Kauffmann-Whiteova razpredelnica antigenske zgradbe bakterij iz taksonomske vrste Salmonella enterica subsp. enterica . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Razpredelnica 29. Biokemična identifikacija kampilobaktrov . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Razpredelnica 30. Razpredelnica za vnos rezultatov testiranja Campylobacter spp. na odpornost za antibiotike . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Razpredelnica 31. Koncentracije in količine reagentov, potrebnih za izvedbo testa PCR za dokaz Mycoplasma pneumoniae . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Razpredelnica 32. Značilnosti netreponemskih in treponemskih testov . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Razpredelnica 33. Razpredelnica za ugotavljanje občutljivosti za antimikotik . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Razpredelnica 34. Značilnosti različnih vrst kvasovk . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Razpredelnica 35. Fiziološke značilnosti kvasovk, API 20C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Razpredelnica 36. Razpredelnica za ugotavljanje MIK za antimikotike . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Razpredelnica 37. Fiziološke značilnosti kvasovk, API 20C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Razpredelnica 38. Razpredelnica za ugotavljanje MIK za antimikotike flukonazol, vorikonazol, amfotericin in caspofungin . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Razpredelnica 39. Razdelitev dermatofitov glede na naravno nahajališče . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Razpredelnica 40. Najpogostejši povzročitelji gastroenteritisov . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Razpredelnica 41. Danes znani tipi hantavirusov . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Razpredelnica 42. Rezultat dokazovanja specifičnih protiteles proti virusu Epstein Barr (primer 1) . . . Razpredelnica 43. Rezultat dokazovanja specifičnih protiteles proti virusu Epstein Barr (primer 2) . . . Razpredelnica 44. Rezultat dokazovanja specifičnih protiteles proti virusu Epstein Barr (primer 3) . . . Razpredelnica 45. Virusne beljakovine, nanesene na nitrocelulozno membrano testa westernblot, za dokaz okužbe s HIV . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Razpredelnica 46. Interpretacija testa westernblot za dokaz okužbe s HIV . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Razpredelnica 47. Poročilo rezultatov potrditvenega testa westernblot za dokaz okužbe s HIV . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Razpredelnica 48. Poročilo rezultatov genotipizacije HCV . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Razpredelnica 49. Najpomembnejše molekule (antigeni), ki jih odkrivamo za opredeljevanje limfocitnih populacij . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Razpredelnica 50. Normalne vrednosti limfocitnih populacij pri zdravih odraslih ljudeh . . . . . . . . . Razpredelnica 51. Spremembe aktivnosti in koncentracije posameznih sestavin komplementnega sistema pri nekaterih boleznih . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Razpredelnica 52. Predvidene normalne vrednosti za test ugotavljanja fagocitne in oksidativne zmožnosti . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Razpredelnica 53. Povečava, potrebna za opazovanje različnih mikrobov . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Razpredelnica 54. Shema za identifikacijo po Gramu pozitivnih in po Gramu negativnih kokov . . . . . Razpredelnica 55. Shema za identifikacijo po Gramu negativnih bacilov – enterobakterij . . . . . . . . . Razpredelnica 56. Različne enterobakterije razgrajujejo različne substrate . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Razpredelnica 57. Interpretacija rezultatov testa API NH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Razpredelnica 58. Antibiotiki, ki jih lahko testiramo pri po gramu pozitivnih in negativnih bakterijah . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Razpredelnica 59. Nekatere bakterije in bolezni, ki jih le-te povzročajo . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 12 115 117 117 122 123 128 139 141 165 168 184 189 191 192 199 200 202 250 261 266 266 267 268 269 270 277 288 290 301 312 324 342 346 347 352 353 358 S E Z N A M K R AT I C Seznam kratic AHFITC (anti human FITC) – s FITC obarvana protitelesa proti človeškim imunoglobulinom aids (acquired immune deficiency syndrome) – sindrom pridobljene imunske pomanjkljivosti AP (Alternative Pathway) – alternativna pot aktivacije komplementnega sistema API (Analytical Profile Index Systems) – komercialni testi za dokazovanje bakterijskih povzročiteljev bolezni API 20E – diagnostični sistem za identifikacijo po Gramu negativnih enterobakterij API NH – diagnostični sistem za identifikacijo po Gramu negativnih enterobakterij ARS – akutni retrovirusni sindrom AST – antistreptolizinski test ATCC (American Type Culture Collection) – zbirka trajnih celičnih linij BAL – bronhoalveolarna lavaža BCYE (Buffered Charcoal Yeast Extract) – obogateno in selektivno gojišče za legionele bDNA (branched-chain) – razvejana DNA BG (Bordet Gengou) – agar za gojenje bakterije Bordetella pertussis BSA (Bovine Serum Albumin) – goveji serumski albumin CagA – citotoksični protein – encim, značilen za bakterijo Helicobacter pylori CAMP (Christie Atkins Munch-Peterson) – test za identifikacijo beta hemolitičnih steptokokov skupine B CAPD (Continous Ambulatory Peritoneal Dialysis) – peritonealna dializa CCD (Charge Coupled Device) – fotoelektrična kamera CD (Cluster of Differentiation) – monoklonska protitelesa proti antigenom na limfocitih, tudi antigeni na limfocitih CDC (Center for Disease Control) – center za nalezljive bolezni – najbolj znani iz Atlante v ZDA CDV – cidofovir NK – naravne celice ubijalke CFW – fluorescenčno barvilo (kalkofluor belo, angl. CalcouFluor White, CFW) CLED (Cystine, Lactose, Electrolyte Deficient agar) – agar za izvedbo kvantitativne urinokulture CLSI (Clinical and Laboratory Standards Institute) – zbirka mednarodnih mikrobioloških standardov CMV – citomegalovirus CNA (Columbia agar) – selektivno gojišče, ki omogoča rast po Gramu pozitivnih bakterij CPU – citopatogeni učinek CRP – C-reaktivni protein CT – računalniška tomografija CTXФ – lizogeni bakteriofag CVK – centralni venski kateter CYA (Charcoal Yeast Agar) – agar, ki omogoča rast legionelam ČA – čokoladni agar 13 PRAK TIKUM IZ MIKROBIOLOGIJE IN IMUNOLOGIJE ZA ŠTUDENTE MEDICINE DIF – direktni (neposredni) imunofluorescenčni test DKS – diferencialna krvna slika DNK – deoksiribonukleinska kislina dNTP – deoksiribonukleotid DOB – virus Dobrava DRIG – agar po Drigalskem EAEC – enteroagregativna E. coli EBV – virus Epstein Barr ECACC (European Collection (Agency) of Cell Cultures) – zbirka trajnih celičnih linij – podobno kot v ZDA ATCC EDTA (Ethylene Diamine Tetraacetic Acid) – antikoagulans – helator kalcijevih in magnezijevih ionov EGTA (Ethylene Glycol Tetraacetic Acid) – helator kalcijevih in magnezijevih ionov, vendar z mnogo večjo afiniteto do kalcijevih ionov kot EDTA EHEC – enterohemoragična E. coli EIA ali ELISA (Enzyme Immuno Assay ali Enzyme Linked Immunosorbent Assay) – encimsko imunski test EIEC – enteroinvazivna E. coli EIT – encimsko-imunski test EM – elektronska mikroskopija env – gen, ki kodira ovojnično virusno beljakovino EPEC – enteropatogena E. coli ESBL (Extended Spectrum Beta Lactamases) – enterobakterije z razširjenim spektrom laktamaz beta ETEC – enterotoksigena E. coli FALS (Forward Angle Light Scatter) – detektor v pretočnem citometru, ki meri svetlobo v smeri izvora FITC – FluoresceinIzoTioCianat FOS – foskarnet FSC (Forward SCatter) – ime za os v histogramu FSC-SSC na kateri so prikazani dogodki, ki jih zazna detektor FALS FTA – ABS (Fluorescent Treponemal Antibody – ABSorption) – imunofluorescenčni test za dokazovanje protiteles proti bakteriji Treponema pallidum gag – strukturna virusna beljakovina GAS-PAK – sistem za gojenje anaerobnih bakterij GCV – ganciklovir HAART (Highly Active Antiretroviral Therapy) – način medikamentoznega zdravljenja okužbe s HIV HBV – virus hepatitisa B HCV – virus hepatitisa C HIV – virus pridobljene imunske pomanjkljivosti HLA (Human Leukocyte Antigens) – antigeni poglavitnega sistema tkivne skladnosti pri človeku 14 S E Z N A M K R AT I C HLAR (High-Level Aminoglycoside Resistance) – povečana odpornost proti aminoglikozidom HMRS – hemoragična mrzlica z renalnim sindromom HPS – hantavirusni pljučni sindrom HPV – humani papiloma virus I – (Indeterminate) – nedoločljivo IFT – imunofluorescenčni test IgA – imunoglobulin razreda A IgG – imunoglobulin razreda G IgM – imunoglobulin razreda M IHA – indirektni (posredni) hemaglutinacijski test IIF – indirektni (posredni) imunofluorescenčni test KA – krvni agar KIA (Kligler Iron Agar) – agar za gojenje enteričnih, po Gramu negativnih bakterij KLL – kronična limfocitna levkemija KNS – za koagulazo negativni stafilokoki KOPB – kronična obstruktivna pljučna bolezen KRA – koruzni agar LCR (Ligase Chain Reaction) – metoda pomnoževanja z verižno rekacijo z ligazo LGV – LimfoGranuloma Venerum – spolno prenosljiva bolezen LIA (Line Immuno Assay) – molekularni test za dokaz protiteles proti rekombinantnim antigenom npr. T. pallidum LOS – LipoOligoSaharid M (Membrane protein) – membranski protein, pomemben za razlikovanje streptokokov MAC (Membrane Attack Complex) – tudi terminalni kompleks ali C5b-9 – končna faza ubijanja celic s komplementom MacC (MacConkey agar) – selektivno in diferencialno gojišče, ki omogoča rast po Gramu negativnim bakterijam, zavira pa rast po Gramu pozitivnih bakterij MBK – minimalna baktericidna koncentracija MGB (Minor Groove Binder) – hibridizacijska sonda za označevanje na novo nastale DNK v reakciji PCR MH – gojišče Mueller – Hinton MIK – minimalna inhibitorna koncentracija MKP – modificirno Kelly – Pettenkoferjevo gojišče za gojenje borelij MOMP (Major Outer Membrane Protein) – poglavitna beljakovina zunanje ovojnice pri C. trachomatis MPK – mikroprecipitacije v kapilari MR – metil rdeče MRSA (Methicillin-Resistant S. aureus) – proti meticilinu odporen S. aureus NAD – nikotinamid adenin dinukleotid 15 PRAK TIKUM IZ MIKROBIOLOGIJE IN IMUNOLOGIJE ZA ŠTUDENTE MEDICINE NASBA (Nucleic Acid Sequence Based Amplification) – metoda, primerna za odkrivanje okužbe s HIV – alternativa PCR NCAM (Neural Cell Adhesion Molecule) izoforma adhezijske molekule živčnih celic na naravnih celicah ubijalkah NS – (Non Susceptible) – ni občutljiv ORSAB – MRSA kromogeno gojišče PAF – protein akutne faze vnetja PBS – fosfatni pufer PCR – verižna reakcija s polimerazo PE (PhycoErythrin) – rdeče fluorescirajoče barvilo PFGE (Pulsed-Field Gel Electrophoresis) – metoda elektroforeze v utripajočem električnem polju pol – gen, ki kodira virusni encim PTLD – posttransplantacijska limfoproliferativna bolezen PUU – virus Puumala PYR (L-pirolidonil-beta-naftilamid) – test za dokaz enterokokov RALS (Right Angle Light Scatter) – detektor v pretočnem citometru, ki meri lomljeno svetlobo RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism) – polimorfizem restrikcijskega odseka RIA (Radio Immuno Assay) – radioimunski preskus RID – radialna imunodifuzija RIEF – raketna imunoelektroforeza RNK – ribonukleinska kislina ROS (Reactive Oxidative Species) – reaktivne kisikove zvrsti, pomembne za oksidativni način ubijanja mikrobov v fagocitih RPR (Rapid Plasma Reagin) – test za odkrivanje antikardiolipinskih protiteles pri sifilisu RSV– respiratorni sincicijski virus RT-PCR – pomnoževanje nukleinskih kislin z verižno reakcijo s polimerazo v realnem času RVK – reakcija vezave komplementa S – (Susceptible) –občutljiv S-DD – (Susceptible – Dose Dependent) – občutljiv, odvisen od doze SCID (Severe Combined Immune Deficiency) – težka kombinirana imunska pomanjkljivost SDA (Strand Displacement Assay) – metoda pomnoževanja z verižno rekacijo SEO – virus Seoul SLE – sistemski lupus eritematosus SN – virus Sin Nombre SSC (Side SCatter) – ime za os v histogramu FSC-SSC, na kateri so prikazani dogodki, ki jih zazna detektor RALS STREP A – hitri test za dokaz antigena S. pyogenes TCBS – gojišče (Tiosulfat, Citrat, žolčne soli (Bile), Saharoza) 16 S E Z N A M K R AT I C TCR – T-celični receptorji TEM – transmisijska elektronska mikroskopija tio – tioglikolatni bujon TMA – metoda pomnoževanja nukleinskih kislin – pomnoževanje s transkripcijo TMB – tetrametil benzidin TPHA – test pasivne hemaglutinacije za določitev protiteles proti bakteriji Treponema pallidum UZ – ultrazvok VacA – vakuolizirajoči toksin – encim, značilen za bakterijo Helicobacter pylori – povzroča nastanek vakuol v epitelijskih celicah želodca VDRL (Veneral Disease Research Laboratories) – kardiolipinski test za dokaz sifilisa, ekvivalenten testu RPR (Rapid Plasma Reagin) VP (Voges-Proskauer) – test za dokaz razgradnje glukoze do acetoina VRE (Vancomycin-Resistant Enterococcus) – enterokok, odporen za vankomicin VTM – virusni transportni medij WB – test westernblot XLD (Xylose, Lysin, Deoxycholate agar) – gojišče, ki omogoča rast salmonel, zavira rast po Gramu pozitivnih bakterij 17
