Identifiering och kvantifiering av protein
Transcription
Identifiering och kvantifiering av protein
Ill. Klaas 1978. Wikimedia Commons Laboration i kemi Illustrationen ovan visar gelfiltrering av två ämnen med olika molekylstorlek. Säkerhet Identifiering och kvantifiering I experimentet påvisas först protein med hjälp av natriumhydroxid och kopparsulfat (Biuretprov), därefter används gelfiltrering med sephadexgel för att separera protein efter storlek. Biuretprovet är en färgreaktion som beror på att kopparjoner reagerar med peptidbindningar i alkalisk lösning och bildar ett violett/blått molekylkomplex. Sephadex är en polysackarid som sväller i vatten till ett tredimensionellt nätverk och bildar en gel. Vid tillverkningen av Sephadex utgår man från polysackariden dextran som bildas av bakterien Leuconostoc mesenteroides. Gelfiltrering fungerar som en omvänd sil. De största partiklarna går igenom snabbast. Mindre molekyler tränger in i nätverket och fastnar, medan större molekyler passerar nätverket snabbast. Fundera på vilket resultat man kan förvänta sig baserat på den information som ges av läraren och som finns i läroboken. Koppar är en tungmetall, som samlas upp i lämpligt kärl. 2 M NaOH är frätande. Vid stänk i ögonen av NaOH finns risk för bestående synskada och blindhet. Del 1 Material Kemikaler • • • • • • • • • • Utförande 1. Gör en proteinlösning genom att röra ner en spatel albumin i 25 cm3 destillerat vatten. 2. Häll lite av provlösningen i ett provrör. Tillsätt 10 droppar NaOH-lösning och ett par droppar CuSO4-lösning. Skaka. 3. Vilken färg visar lösningen? 4. Krossa några blötlagda ärtor i en mortel med lite vatten. Överför blandningen till ett provrör och gör Biuretprovet enligt punkt 2. Innehåller ärtorna protein? NaOH-lösning (ca 2 mol/dm3) CuSO4-lösning (ca 0,5 mol/dm3) albumin blötlagda ärtor spatel provrör liten bägare mätglas dropprör mortel och pistill Laborationen har utarbetats av Kemilärarnas resurscentrum, 2014. Projektet genomförs med stöd av Skolverket, se www.bioresurs.uu.se/Vuxenwebben Del 2 Material Kemikaler • • • • • • • • • • • pasteurpipett av glas bomull sephadexgel-lösning, G25 plastpipett (er) ca 4 cm silikonslang påsklämma mikrotiterplatta NaOH-lösning (ca 2 mol/dm3) NaCl-lösning (ca 0,15 mol/dm3) CuSO4-lösning (ca 0,5 mol/dm3) lättmjölk (utspädd) Utförande 1. För ner en bomullstuss i pasteurpipetten och tryck försiktigt ihop den med en glasstav. Det ska bildas ett lager av ca 1-2 cm bomull längst ner i pipetten. Fäst pasteurpipetten i ett stativ. 2. Fäst en kort gummislang i pasteurpipettens nedre öppning. 3. Skaka försiktigt bägaren med sephadexgel-lösning och sug upp vätskan med plastpipett. 4. Spruta försiktigt ned lösningen i pastuerpipetten och låt överskottsvätskan rinna igenom. Stoppa vätskeflödet strax innan vätskeytan når gelfasen. Reglera flödet med en påsklämma, som fästs på slangen vid den nedre öppningen, 5. Fortsätt att packa gelen tills gelpelarens höjd når upp till cirka halva pastuerpipetten. 6. Använd plastpipett och skölj igenom gelen med NaCl-lösning genom att fylla pasteurpipetten upp till kanten och låta lösningen rinna ut. Obs! Gelen får inte bli torr – anBomull vänd klämman för att stanna flödet strax innan vätskan når gelens yta. 7. Tillsätt sex droppar utspädd mjölk till gelen. Öppna klämman och låt dropparna sjunka in i gelen. Gummislang 8. Fyll kolonnen med NaCl-lösning och samla upp vätskan som kommer ut med hjälp av med pås mikrotiterplattan, ca 2-3 droppar per brunn. klämma 9. Tillsätt en droppe av vardera NaOH- och CuSO4-lösning till varje brunn. Vad händer? 10. Ställ in mikrovågsugnen på LÅG effekt och kör mikrotiterplattan tills färgförändring inträffat (ca 15-45 sek). Vilka iakttagelser kan man göra? Resultat och utvärdering 1. Stämde dina förväntningar inför laborationen med resultatet? Om inte, förklara varför. Begrepp att känna till efter genomförd laboration 2. Analysera det praktiska utförandet. Hur fungerar stegen i del 1 och 2 och vilken betydelse har de? 3. Ange eventuella felkällor. 4. Diskutera säkerhetsaspekterna. 5. Föreslå några nya frågeställningar och situationer när dessa laborationer kan användas. Proteinstrukturer Denaturering Mjölkproteiner Proteinrika livsmedel Biurettest Gelfiltrering baserad på storlek (Sephadex) Laborationen har utarbetats av Kemilärarnas resurscentrum, 2014. Projektet genomförs med stöd av Skolverket, se www.bioresurs.uu.se/Vuxenwebben