Fluorescenčna mikrospektroskopija (FMS) - lokalizacija

Transcription

Fluorescenčna mikrospektroskopija (FMS) - lokalizacija
Fluorescenčna mikrospektroskopija (FMS) lokalizacija molekularnih spektroskopskih informacij
s fluorescenčnim mikroskopom
Janez Štrancar
Laboratorij za biofiziko, IJS / CO NAMASTE
Zakaj je ta slika
netipčna za
navadno
mikroskopijo,
zakaj za
fluorescenčno
mikroskopijo?
Od mikroskopije do fluorescenčne mikroskopije
•
Kontrast!
microscopy
fluorescence microscopy
Pojav fluorescence
Absorbcijski in emisijski spekter
Eksitacija in relaksacija
elektronskih stanj
3
Konfokalna fluorescenčna mikroskopija
•
Optično rezinjenje!
fluorescence microscopy
– Eksitiramo eno optično
ravnino in
– Zajemamo svetlobe iz
ene optične ravnine!
fluorescent confocal microscopy
Fluorescenčna mikrospektroskopija
lokalizacija pri
fiziol. pogojih
3D
microscopy
confocal microscopy
fluorescence microscopy
microspectroscopy
kontrolirano
ozadje
spektralno
občutljiva
detekcija
Fluorescence microspectroscopy (FMS)
Shema FMS
konfokalna
mikroskopija
fluorescenca
spektroskopija
Liquid crystal
tunable filter
EM
Iztok Urbančič
FMS
7
Elementi FMS
Obrnjeni mikroskop
Nikon TE2000-E
• primeren za opazovanje bioloških vzorcev v tekočini
• objektivi 10x, 40x, 100x (oljni in vodni imerzijski)
• motorizirana mizica (ravnina XY)
• motoriziran revolver objektivov (Z)
Iztok Urbančič
FMS
8
Elementi FMS
Obrnjeni mikroskop
Nikon TE2000-E
Obločna svetilka (Xe)
Lambda LS
• nazivna moč 300 W
• 4,5 W izsevane svetlobe, 500 mW v vidnem delu
• zvezen spekter od UV do NIR
• nadomešča nabor več laserjev
Iztok Urbančič
FMS
9
Elementi FMS
Obrnjeni mikroskop
Nikon TE2000-E
Obločna svetilka (Xe)
Lambda LS
Fluorescenčna enota
BD Carv II
nabor
• širokoprepustnih vzbujevalnih in izsevnih filtrov
• in dvobarvnih zrcal
Iztok Urbančič
FMS
10
Elementi FMS
Obrnjeni mikroskop
Nikon TE2000-E
Obločna svetilka (Xe)
Lambda LS
Fluorescenčna enota
BD Carv II
Konfokalna enota
BD Carv II
V primerjavi z laserskim skeniranjem:
• manj „bledenja fluorescence“
• neodvisnost pri izbiri fluorescenčnih barvil
Iztok Urbančič
FMS
11
Elementi FMS
Obrnjeni mikroskop
Nikon TE2000-E
Obločna svetilka (Xe)
Lambda LS
Fluorescenčna enota
BD Carv II
Konfokalna enota
BD Carv II
TK nastavljivi filter
VariSpec
• spektralno območje 400–720 nm
• spektralna širina prepustnosti 10 nm
• korak 1 nm
• odzivni čas 50 ms
Iztok Urbančič
FMS
12
Elementi FMS
Obrnjeni mikroskop
Nikon TE2000-E
Obločna svetilka (Xe)
Lambda LS
Fluorescenčna enota
BD Carv II
Konfokalna enota
BD Carv II
TK nastavljivi filter
VariSpec
EMCCD kamera
QImaging Rolera Mgi+
• ločljivost 512x512, velikost elementov 16 µm
• kvantni izkoristek > 90%
• hitrost snemanja 30 s–1
• temni tok < 0.2 e– (pix s)–1 @–25°C
• elektronsko pomnoževanje signala (do 1000x)
Iztok Urbančič
FMS
13
Elementi FMS
fluorescenčne nanokroglice (50 nm)
Obrnjeni mikroskop
Nikon TE2000-E
Obločna svetilka (Xe)
Lambda LS
Fluorescenčna enota
BD Carv II
Konfokalna enota
BD Carv II
10 µm
TK nastavljivi filter
VariSpec
EMCCD kamera
QImaging Rolera Mgi+
• IR vlakenski laser 1064 nm
• izhodna moč 5 W
• več kot 1000 sočasnih pasti
• preklapljanje med pastmi 100 kHz
Optična pinceta
Aresis Tweez 200si
Iztok Urbančič
• natančnost lege pasti < 1 nm
FMS
14
Zajem in kodiranje krajevno lociranih spektralnih lastnosti
Kam so šli vsi fotoni?
element
prepustnost
[1]
300 W Xe obločnica
jakost
[W]
fotonski
tok [s–1]
4,5
10+0
1,5
1019
svetlobni vodnik
0,1
4,5
10–1
1,5
1018
vzbujevalni filtri
0,2
9,0
10–2
3,0
1017
konfokalni disk
0,08
7,2
10–3
2,4
1016
objektiv (vstopna odprtina)
0,08
5,7
10–4
1,9
1015
fluorofori (absorpcija, emisija)
(5
10–4)
2,9
10–7
9,7
1011
/ 3D slikovni element („voxel“)
6
10–7
1,7
10–14
5,7
104
objektiv (NA, n)
0,3
5,2
10–15
1,7
104
izsevni filtri
0,7
3,6
10–15
1,2
104
TK filter
0,02
8,0
10–17
2,4
102
kamera (γ ⇒ ADCe)
(0,02)
4,8
101
Iztok Urbančič
FMS
[(pix s)–1]
:
:
[ADCe (pix s)–1]
Ciljano porazdeljevanje označevalcev
•
Od lastnosti označevalcev je odvisno, kje se le ti porazdeljujejo!
A
10 µm B
C
D
E
F
Preverjamo stabilnost vezave označevalcev
•
•
Akumulirane titan oksidne nanocevke v MCF7 celicah (rak dojke) po 1 dnevu, sprane s
PBS
Vezan in prost Alexa označevalec imata vrha emisijskega spektra razmaknjena za 8 nm
emmision-maximum-coding FMS image
emmision spectra of the two
states of the same probe
Identificiramo delce manjše od resolucije mikroskopije
Akumulirani polistirenski nanodelci v MCF7 celicah (rak dojke) po 1 dnevu
Kolokalizacija z doma-sintetiziranim membranskim označevalcem , ki ima vrh
emisijskega spektra zamaknjen za 40 nm glede na vrh spektra označevalca na
nanodelcih
Intenziteta fluorescence (a.u.)
•
•
Nanodelci
Membranska proba
500
slika, ki kodira
intenziteto
slika, ki kodira vrh
emisijskega spektra
550
Valovna dolžina (nm)
600
Emisijski spekter
obeh označevalcev
membranski
označevalec
Opazujemo časovno odvisne pojave, kot je zlivanje membran
•
Zaradi zlivanja membrane liposomov s plazemsko membrano, s okoli
fluorescenčnih označevalcev spreminja koncentracija holesterola, ki vpliva na
strukturiranost membrane, ta pa se odraža na vrhu emisijskega spektra
5 µm
5 min
10 min
15 min
Razglednica za spomin
Koncept FMS
Barvno kodiranje
spektralnih lastnosti
Detekcija nanodelcev preko
spektralnega kontrasta
Detekcija lokalnega
molekularnega okolja
Projektna skupina
Laboratorij za biofiziko @ F5.IJS, FFA.UNI-LJ, CO NAMASTE
Darija Jurašin
Ivan Kvasić
Stane Pajk
Janez Mravljak
Alma Mehle
Ajasja Ljubetič
Iztok Urbančič
Maja Garvas
Daniele Biglino
Zoran Arsov
Marjeta Šentjurc
Jana Mlakar
Jure Zdovc
Slavko Pečar
Tilen Koklič
http://lbf.ijs.si
http://www.conamaste.si
Janez Štrancar