Helexomsekvensering för utredning av patienter med misstänkta

Transcription

Helexomsekvensering för utredning av patienter med misstänkta
Information till inremitterande läkare:
Helexomsekvensering för utredning av patienter med
misstänkta primära immundefekter.
I samarbete med Science for Life Laboratory (SciLifeLab) kan Klinisk immunologi, Karolinska
Universitetslaboratoriet, Huddinge erbjuda helexomsekvensering för utredning av patienter med
primära immunbrister. Analysen omfattar ca 305 gener i vilka det finns kända sjukdomsorsakande
mutationer. Genlistan uppdateras kontinuerligt. Hela exomet sekvenseras, men endast generna på
listan analyseras för förekomst av sjukdomsorsakande mutationer. I de situationer då ingen känd
mutation kan påvisas, men misstanken om immundefekt är mycket stark, kan resterande exom
analyseras på forskningsbasis. För att göra detta kräver vi särskilt samtycke från patienten (se bifogad
blankett).
Inkommande remisser kommer att diskuteras vid en särskild rond där bedömningen görs av kliniska
immunologer, barnläkare och immunbristläkare, innan provet skickas till SciLifeLab för sekvensering.
Detta görs för att undvika sekvensering i fall, där sannolikheten för monogenetiskt orsakad
immunbrist är låg. Undantag görs för akuta fall, såsom misstänkt SCID.
Inför ronden önskar vi få information om hereditet, detaljerad infektionsdiagnostik samt resultat från
immunbristutredning t.ex. immunglobulinanalyser och cellulärimmunologiska analyser. Om
kompletterande information eller utökade analyser behövs kommer vi att kontakta inremitterade
läkare. Ronden kommer att rekommendera eller avråda exomsekvensering av immunbristgener. Om
ett prov går till analys, diskuteras resultatet i gruppen innan ett svar formuleras. Om en mutation
identifieras, bör resultatet verifieras med Sangersekvensering utförd på ett nytt prov från patienten.
Observera att all kommunikation med patienten sker endast via remitterande läkare.
Provtagning:
5 ml EDTA-blod
Svarstid:
6-8 veckor
Pris: Helexomsekvensering drygt 35 000 SEK
Sangersekvensering
drygt 6 000 SEK
Prov och remiss med efterfrågad anamnestisk information samt uppgifter om utredningsresultat
skickas till Klinisk immunologi, F79, Karolinska Universitetslaboratoriet, Huddinge, 141 86 Stockholm.
Telefon: 08-585 813 70.
Analysansvarig:
Dr Per Marits
Bedömningsgrupp:
Dr Per Marits, Dr Mikael Sundin, Dr Brigitta Omazic, Doc Ann-Charlotte
Wikström, Prof Ola Winqvist, Dr Anna-Carin Norlin, Doc Dan
Hauzenberger , Dr Jakob Nilsson, Prof Edvard Smith, Doc Mehmet
Uzunel och Fil Dr Sarah Thunberg