og HPV-data – med Lab Svar 1.3

Transcription

og HPV-data – med Lab Svar 1.3
Spesifikasjon overføring av cytologi-,
histologi– og HPV-data – med Lab Svar 1.3
Utarbeidet i forbindelse med Masseundersøkelsen mot livmorhalskreft
juni 2015
1
Meldepliktige diagnoser
Alle cervixremisser skal overføres. Dette gjelder uavhengig av pasientens alder eller årsak til at prøven er tatt.
Alle T83XXX.
Forøvrig henvises til Forskrift om innsamling og behandling av helseopplysninger i Kreftregisteret
(Kreftregisterforskriften), fremmet av Sosial- og helsedepartementet og fastsatt ved kgl. Res. 21. desember 2001 §
1-9.
Oversendelse av Laboratoriesvar
Det skal benyttes meldingen ”Lab svar”, versjon 1.3 eller 1.4
http://www.kith.no/templates/kith_WebPage____1018.aspx
Se dokumentet ” Specification Submission of Pathology Reports 20150611.pdf” for hvordan melding skal sendes til
Kreftregisteret.
Detaljert gjennomgang av de forskjellige feltene i filformatet
Spesifikasjonen kan brukes til å innrapportere prøvesvar på følgende måter:
Cytologi: Felles + Cyt
HPV: Felles + HPV
Histologi: Felles + Hist
Cytologi og HPV: Felles + Cyt + HPV
Histologi og HPV: Felles + Hist + HPV
Felles er felter som skal innrapporteres for alle typer prøvesvar, og må være med på alle meldinger. Felles består av
følgende elementer:
-
Type undersøkelse
Laboratorium nummer
Fødselsnummer
Navn
Prøvetakingsdato
Besvart dato
Preparatnummer
2
Felt i KITH
Eksempler og forklaring Kommentarer
Lab Svar 1.3
av koder internt KRG
Internt KRG
Felles
Message/
Verdi angir hvilke typer
Hvis en melding inneholder cytologi
ServReport/
undersøkelser som er
og HPV, eller histologi og HPV,
Patient/
inneholdt i XML.
kommer Id i Investigation-elementet
Type undersøkelse
to ganger.
ResultItem/
Investigation/
Vi godtar koder med ID = 8219.
Id
Kodeverk:
Anatomiskpatologisk
undersøkelse
(Id=8219)
Message/
"12"
Organisasjonsnummer fra
Laboratorium
ServReport/
"01"
enhetsregisteret skal benyttes
nummer
ServProvider/
HCP/
Inst/
Id
Må brukes sammen
med
ved bruk av Lab Svar.
Det gjøres en mapping fra org.nr til
KRGs interne labnr.
Se tabell 1.
Message/
ServReport/
ServProvider/
HCP/
Inst/
TypeId
Kodeverk: 8268
Type identifikator
Kodeverdi: ENH
3
Message/
ServReport/
Lagres kryptert
Patient/
Ved registreringen i den sentrale
databasen kontrolleres at
Fødselsnummer
fødselsdato er en eksisterende dato.
OffId
Ved registreringen i den sentrale
Skal benyttes med:
Message/
databasen kontrolleres at
sjekksifrene er riktige og at personen
ServReport/
er registrert i personregisteret.
Patient/
Dersom fødselsnummeret er
TypeOffId
konstruert (f.eks. for personer som
ikke er bosatt i Norge) må
Kodeverk:
Kodeverk: 8327
Offisiell
sentralenheten behandle remissen
spesielt. I slike tilfeller skal
personnummerdelen settes til
personidentifikasjon
‘99999’.
Godtar kodene:
Konstruerte personnumre skal ikke
-
FNR
DNR
-
HNR
Message/
overføres til sentralenheten.
Lagres ikke
Slektsnavn, Fornavn
Navn
ServReport/
Patient/
Brukes til å verifisere
Name
personopplysninger.
Message/
"20.01.2015"
Dato for prøvetaking hos rekvirent,
Prøve-
ServReport/
hvis ikke oppgitt benytt mottaksdato
takingsdato
Patient/
på laboratorium.
AnalysedSubject/
CollectedSample/
CollectedDate
Message/
"28.01.2015"
Besvart dato hos laboratorium.
ServReport/
Patient/
ResultItem/
InvDate
4
Besvart dato
Message/
ServReport/
"C14-234562"
"V15-012533"
KRG kan ta i mot laboratoriets
interne preparatnummer, og
Patient/
"H15-000456"
omforme til KRGs interne format:
Preparatnummer
AnalysedSubject/
Første tegn er bokstaven “C”, ”V”
IdByServProvider
eller ”H”.
Neste to tegn er årstall. Deretter
bindestrek.
Til slutt angis sekssifret løpenummer
innenfor året. Ledende nuller
benyttes slik at løpenummeret alltid
angis med seks sifre.
CYT
Message/
Godkjente verdier:
KRG foretar en intern mapping av
Årsak til
ServReport/
MU
verdier oppgitt her.
cytologisk
ServReq/
FU
ReasonAsText/
KF
prøve
Heading
MU = 1 - screening (tidligere normale
celleprøver)
Kodeverk:
FU = 2 - symptom (oppgi kliniske
8231 Type tekstsvar
opplysninger)
KF = 3 - oppfølging/kontroll (oppgi
kliniske opplysninger)
Message/
ServReport/
Patient/
"80752"
Kun standardiserte koder ifølge
standardisert cytologiremisse
ResultItem/
benyttes. (NB! Nye koder etter
Bethesta-klassifisering) I helt
ResultItem/
spesielle tilfeller hvor det ikke
TextResult/
eksisterer dekkende
TextCode V=
diagnosekoder ifølge
”Mxxxxx”
standardisert cytologiremisse
kan andre koder (fortrinnsvis
Kodeverk:
ifølge SNOMED) benyttes.
SNOMED (Id=7010)
Anatomisk-
Feltet må alltid fylles ut.
patologiske
Dette feltet angir "den alvorligste"
undersøkelser
diagnosen.
5
Morfologi
(hoveddiagnose)
Message/
ServReport/
"69001"
Patient/
" = kun
Her tillates også koder som ikke er
standardisert på cytologiremissen
Morfologi
(underordnet
hoveddiagnose benyttet
under forutsetning av at tilsvarende
diagnose)
"
ResultItem/
standardiserte koder ikke eksisterer
ResultItem/
og under forutsetning av at
TextResult/
TextCode V=
hoveddiagnose allerede er kodet.
”Mxxxxx”
Kodeverk:
SNOMED (Id=7010)
Anatomiskpatologiske
undersøkelser
Message/
"83000" =
Kun standardiserte koder ifølge
ServReport/
Patient/
konvensjonell
standardisert cytologiremisse
benyttes.
ResultItem/
"83100" =
ResultItem/
væskebasert
prøvetaking
TextResult/
prøvetakning
TextCode V=”Txxxxx” "8x310" =
konvensjonell
Kodeverk:
prøvetakning
SNOMED (Id=7010)
Anatomisk-
"8x312" =
patologiske
prøvetaking
væskebasert
undersøkelser
6
Topografi
Message/
ServReport/
"1" –
etter 1 måned
Kodeverk:
Anbefaling om ny
undersøkelse
(Id = 8272)
"3" –
ServReport/
snarest på cytologiremissen skal det
registreres kode "1".
etter 3 måneder
KITH:
"6" –
etter 6 måneder
S, B (etter behandling) og M01
lagres som etter 1 måned.
Dersom feltet ikke eksisterer, lagres
+
Message/
Antall måneder før
kontrollprøve
I de tilfeller hvor det er krysset av for
CodedComment V =
CYT
Dette feltet gjelder kun for cytologisk
kontrollprøve.
"12" –
etter 12 måneder
prøven med «kontrollprøve skal ikke
tas».
CodedComment
Kodeverk:
Hastegrad
"
" –
Kontrollprøve skal ikke
(Id = 8273)
tas
Message/
"1" = histologisk
Oppfølging av anbefaling om
Histologisk
ServReport/
undersøkelse anbefales
histologisk undersøkelse er legens
undersøkelse
CodedComment V =
HIST
Kodeverk:
ansvar.
" " = ingen anbefaling
Det lagres ingen tidsanbefaling for
om histologisk
undersøkelse.
undersøkelse
Anbefaling om ny
undersøkelse
KITH:
(Id = 8272)
Histologisk undersøkelse
Hvis elementet finnes anbefales det
Ellers er det ingen anbefaling.
7
Message/
ServReport/
"411342689”
Requester/
Identifikasjon av rekvirerende lege.
Fortrinnsvis HPRNR.
Rekvirentkode
Lokale rekvirentkoder kan benyttes.
HCP/
Inst/
HCPerson/
Id
Må brukes sammen
med:
Message/
ServReport/
Requester/
HCP/
Inst/
HCPerson/
TypeId
Kodeverk: 8268
Type identifikator
Message/
"1" = HPV-test
Parameteren angir om cytologen
HPV-test
ServReport/
anbefales.
anbefaler en HPV-test på grunnlag
anbefales
CodedComment V =
HPV
av cytologien (”1”) eller ikke (”0”).
"0" = HPV-test
anbefales ikke.
Kodeverk:
Anbefaling om ny
undersøkelse
(Id = 8272)
8
HPV
Message/
Godkjente verdier:
KRG foretar en intern mapping av
Årsak til cytologisk
ServReport/
MU
verdier oppgitt her.
prøve
ServReq/
FU
ReasonAsText/
KF
Heading
MU = 1 - screening (tidligere normale
celleprøver)
Kodeverk:
FU = 2 - symptom (oppgi kliniske
8231 Type tekstsvar
opplysninger)
KF = 3 - oppfølging/kontroll (oppgi
kliniske opplysninger)
Message/
"01"
Feltet angir hva slags type HPV-test
ServReport/
som er benyttet. For å se hvilken test
Patient/
som korresponderer med hvilket
nummer, se tabell 2.
ResultItem/
Investigation/
Testtype
Det gjøres en sjekk på om
Comment
HPV-testtype er en gyldig og
godkjent HPV-test.
Message/
"0" = Negativ
Dersom det er testet positivt for
ServReport/
"1" = Positiv
minst en HPV-type skal verdien
Patient/
ResultItem/
"9" = Uegnet
være 1.
Dersom det ikke er testet positivt for
ResultItem/
noen HPV-typer skal verdien være 0.
TextResult/
TextCode
SNOMED koder
E00040
E33450
M0900H
Kodeverk:
SNOMED (Id=7010)
Anatomiskpatologiske
undersøkelser
9
Test-resultat
Message/
ServReport/
"16"
HPV-type det er testet positivt for.
Hvis det er testet positivt for én
Patient/
HPV-type registreres denne her og
ResultItem/
HPV-type 2-8 har tomt innhold.
HPV-type 1
ResultItem/
TextResult/
TextResultValue
Hvis det er testet positivt for to
HPV-typer registreres en HPV-type i
HPV-type 1, og den andre HPV-
Eks. HPV16
typen i HPV-type 2.
HPV-type 3-8 har da tomt innhold.
Osv.
Hvis SNOMED kode brukes for å
trekke ut HPV-type kan det gjøres på
bakgrunn av disse
SNOMED kodene:
E33416 (HPV16)
E33418 (HPV18)
E334xx hvor de to siste sifrene
angir HPV-type
Andre høy risk HPV typer (for
eksempel med Cobas testen)
HR
KITH:
Feltet kan repeteres så mange
ganger som ønskelig, men det vil
maksimalt bli lagret 8 genotyper.
Det er kun HPV typer det har blitt
testet positivt for, som lagres hos
KRG.
10
HPV-type 2-8
HIST
Message/
"80702"
ServReport/
Patient/
Kun standardiserte koder ifølge
Kvalitetsmanualen benyttes.
ResultItem/
I helt spesielle tilfeller hvor det
ikke eksisterer dekkende
ResultItem/
diagnosekoder ifølge
TextResult/
standardisert histologiremisse
TextCode V=
kan andre koder (fortrinnsvis
”Mxxxxx”
ifølge SNOMED) benyttes.
Morfologi
(hoveddiagnose)
Feltet må alltid fylles ut.
Kodeverk:
SNOMED (Id=7010)
Anatomisk-
Dette feltet angir "den alvorligste"
patologiske
og "grov dysplasi" kode "grov
diagnose. F.eks. vil man ved "HPV"
dysplasi" som hoveddiagnose.
undersøkelser
Message/
"76700"
ServReport/
Patient/
"
" = kun
Her tillates også koder som ikke er
standardisert i Kvalitetsmanualen
ResultItem/
under forutsetning av at tilsvarende
standardiserte koder ikke eksisterer
ResultItem/
og under forutsetning av at
TextResult/
hoveddiagnose allerede er kodet.
hoveddiagnose benyttet
TextCode V=
”Mxxxxx”
Kodeverk:
SNOMED (Id=7010)
Anatomiskpatologiske
undersøkelser
11
Morfologi
(underordnet
diagnose)
Message/
ServReport/
”76701”
Patient/
” = kun
Her tillates også koder som ikke er
standardisert i Kvalitetsmanualen
Morfologi
(Underordnet
hoveddiagnose benyttet
under forutsetning av at tilsvarende
diagnose 2)
”
ResultItem/
standardiserte koder ikke eksisterer
ResultItem/
og under forutsetning av at
TextResult/
TextCode V=
hoveddiagnose allerede er kodet.
”Mxxxxx”
Kodeverk:
SNOMED (Id=7010)
Anatomiskpatologiske
undersøkelser
Message/
"83000"
ServReport/
"83010"
Patient/
"83030"
ResultItem/
ResultItem/
TextResult/
TextCode V=”Txxxxx”
#
Kun standardiserte koder.
# anbefalt koder
"83100"
"83110"
#
"83150"
"83200"
"83210"
"83220"
#
Kodeverk:
"83300"
SNOMED (Id=7010)
Anatomisk-
"83320"
patologiske
"83500"
undersøkelser
"83700"
#
"83701"
#
"83400"
12
Topografi
Message/
ServReport/
"411342689”
Requester/
Identifikasjon av rekvirerende lege.
Fortrinnsvis HPRNR.
Lokale rekvirentkoder kan benyttes.
HCP/
Inst/
HCPerson/
Id
Må brukes sammen
med:
Message/
ServReport/
Requester/
HCP/
Inst/
HCPerson/
TypeId
Kodeverk: 8268
Type identifikator
Eksempler
Koding av ‘Type undersøkelse’ når XML inneholder resultater fra cytologi og HPV-test:
<Investigation>
<Id V="C" S="2.16.578.1.12.4.1.1.8219" DN="Cytologisk undersøkelse" />
<Id V="HPV" S="2.16.578.1.12.4.1.1.8219" DN="HPV-test" />
</Investigation>
Koding av ‘Type undersøkelse’ når XML inneholder resultater fra histologi og HPV-test:
<Investigation>
<Id V="A" S="2.16.578.1.12.4.1.1.8219" DN="Histologisk undersøkelse" />
<Id V="HPV" S="2.16.578.1.12.4.1.1.8219" DN="HPV-test" />
</Investigation>
Eksempel på koding av ‘Antall måneder før cytologisk kontrollprøve’:
<CodedComment V="CYT" S="2.16.578.1.12.4.1.1.8272"
DN="Ny cytologiprøve anbefales" />
<CodedComment V="M01" S="2.16.578.1.12.4.1.1.8273"
13
Rekvirentkode
DN="Etter 1 måned" />
Koding av anbefaling av ‘Histologisk undersøkelse’:
<CodedComment V="HIST" S="2.16.578.1.12.4.1.1.8272"
DN="Histologisk undersøkelse anbefales" />
Koding av ‘HPV-test anbefales’:
<CodedComment V="HPV" S="2.16.578.1.12.4.1.1.8272"
DN="HPV-test anbefales" />
Eksempel på koding av HPV testtype og HPV-genotype:
<ResultItem>
<TextResult>
<TextResultValue>Positiv</TextResultValue>
</TextResult>
<Investigation>
<Id V="HPV16" DN="HPV_16 "
S="2.16.578.1.12.4.1.1.8212" OT="HPV 16" />
</Investigation>
<Comment>Cobas==11</Comment>
</ResultItem>
Tabell 1 Mapping KRG labnummer - Organisasjonsnummer
Patologi laboratorier
Nummer
Organisasjonsnummer
Lab for patologi
Oslo Universitets sykehus OUS
02
Furst (Lab. for patologi A/S) cytologi og histologi
03
Gades Institutt
Haukeland sykehus
983974724
07
Avd. for patologi
St. Olavs Hospital
08
Avd. for patologi
Molde Sjukehus
10
Unilabs Laboratoriemedisin AS (Gynlab)
11
Avd. for patologi
Sykehuset Østfold Fredrikstad
12
Patologisk-Anatomisk Avdeling
Universitetssykehuset i Nord-Norge UNN
13
Avd. for patologi
Sykehuset Telemark
14
Avd. for patologi
Sykehuset Innlandet, Lillehammer
15
14
Avd. for patologi
Vestre Viken, Drammen sykehus
16
Avd. for patologi
Ålesund Sykehus
17
Avd. for patologi
Nordlandssykehuset, Bodø
18
Avd. for patologi
Stavanger universitetssykehus SUS
19
Avd. for patologi
Sykehuset Sørlandet, Kristiansand
20
Avd. for patologi
Akershus universitetssykehus (Ahus)
21
Avd. for patologi
Sykehuset i Vestfold
23
Avdeling for patologi,
26
Førde sentralsjukehus
Avdeling for patologi,
34
Haugesund sjukehus
Mikrobiologi laboratorier
Nummer
Avd for mikrobiologi
Oslo Universitets sykehus OUS
31
Avd for mikrobiologi
Oslo Universitets sykehus OUS
32
Fürst, Molekylærbiologisk avd
36
Avd. for mikrobiologi
Haukeland sykehus
37
Avd. for mikrobiologi
St. Olavs Hospital
38
Avd. for mikrobiologi
Molde Sjukehus
40
Avd. for mikrobiologi
Sykehuset Østfold Fredrikstad
42
Avd. for mikrobiologi
Universitetssykehuset i Nord-Norge
43
Telelab
44
Avd. for mikrobiologi
Sykehuset Innlandet, Lillehammer
45
Avd. for mikrobiologi
Sykehuset Buskerud
46
15
Avd. for mikrobiologi
Ålesund Sykehus
47
Avd. for mikrobiologi
Nordlandssykehuset, Bodø
48
Avd. for mikrobiologi
Stavanger universitetssykehus
49
Avd. for mikrobiologi
Sykehuset Sørlandet, Kristiansand
50
Avd. for mikrobiologi
Akershus universitetssykehus (Ahus)
51
Avd. for mikrobiologi
Sykehuset i Vestfold
53
16
Tabell 2 Mapping HPV-testtype
Nummer
HPV-testtype
01
HCII
02
HCIII
03
PreTect HPV-Proofer, NORCHIP
04
Amplicor, Roche Diagnostics
05
PCR- primer, må oppgis første gang
06
Real time PCR
07
Ventana Inform HPV (ISH)
08
ISH andre, må oppgis første gang
09
PAP 13 Tele-lab
11
Cobas
12
Abbott RealTime High Risk HPV
13
BD Onclarity HPV Assay
Hvis man benytter andre tester enn de nevnt overfor, må man kontakte Gry Baadstrand Skare ([email protected])
eller Randi Waage ([email protected]) for å få tildelt nummer.
Hvilke HPV-tester som til enhver tid kan benyttes i Masseundersøkelsen mot livmorhalskreft finnes på Kreftregisterets
nettside:
http://www.kreftregisteret.no/no/Forebyggende/Masseundersokelsen-mot-livmorhalskreft/Helsepersonell/Flytdiagram/
17