UMR 944 / 7212 – Génétique des virus et pathogenèse des

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UMR 944 / 7212 – Génétique des virus et pathogenèse des
 UMR 944 / 7212 – Génétique des virus et pathogenèse des maladies virales Equipe 5 - Génôme et cancer
Chef d'Equipe : Pr Jean SOULIER
Email: [email protected]
Assistante : Christine Glosek Tél. : 33 (0)1 42 49 99 49
Email: [email protected]
THEMES DE RECHERCHE
La thématique générale du laboratoire est « Evolution clonale, progression
tumorale et rechute dans les leucémies aiguës ». Deux situations cliniques sont
particulièrement étudiées dans l’équipe de recherche :
Oncogenèse des leucémies aiguës lymphoblastiques (LAL)
Les leucémies aiguës lymphoblastiques, particulièrement les LAL-T, résultent de
processus multi-étapes complexes aboutissant à la transformation de progéniteurs
lymphoïdes et ultérieurement à la rechute. A l’aide de criblages moléculaires pangénomes et d’expression de cohortes de leucémies humaines, de nouveaux soustypes oncogéniques ont été identifiés. La comparaison des profils d’expression des
cellules leucémiques et de sous-populations thymiques normales montre
l’activation oncogénique de voies biologiques, thymiques ou ectopiques des LAL-T.
Des modèles in vitro et in vivo, murins et humains, sont développés dans le
laboratoire pour modéliser l’oncogenèse T multi-étape, notamment l’architecture
clonale et les rechutes après traitement.
Oncogenèse dans la maladie de Fanconi, un syndrome d’instabilité
génétique
La maladie de Fanconi est une prédisposition génétique aux insuffisances
médullaires, syndromes myélodysplasiques et leucémies aiguës liée à l’inactivation
constitutionnelle de la voie FA/BRCA. L’hôpital Saint-Louis est le centre français de
référence pour le diagnostic et la prise en charge de cette pathologie. Les
échantillons biologiques des patients sont collectés dans notre laboratoire et des
analyses génétiques et fonctionnelles longitudinales sont effectuées afin
d’appréhender les mécanismes à l’origine de l’évolution clonale hématopoïétique
et de la transformation en MDS/AML dans un contexte d’instabilité génétique. Des
modèles murins (génétiquement modifiés et xénogreffes) de la maladie sont
développés.
L'EQUIPE Jean Soulier,
Dominique Bluteau,
Emmanuelle Clappier,
Raphael Itzykson,
Stéphanie Gachet
Laetitia Laurent
Olivier Bluteau,
Carèle Fedronie
Samuel Quentin,
Nadia Vasquez,
Lucie Hernandez
Danielle Vecchione
Marie Sebert,
Justine Penneroux,
Carine Torset
MD PhD, Team Leader
PhD, EPHE researcher
PharmD, PhD
MD PhD, PI
PhD, Post-Doc
PhD, Post-Doc
PhD, Post-Doc
Ingenior in mouse model
Ingenior in bioinformatics
PhD, scientific officer Fanconi anemia diagnosis lab
Technician Genomics UP7
Technician Cytogenetics UP7
MD, PhD Student
M2 Student
M1 Student
SELECTION DE PUBLICATIONS
Peffault de Latour R, Soulier J. How we diagnose and treat MDS and AML in Fanconi anemia.
Blood. 2016 Mar 28.
Zhang H, Kozono DE, O'Connor KW, Vidal-Cardenas S, Rousseau A, Hamilton A, Moreau L,
Gaudiano EF, Greenberger J, Bagby G, Soulier J, Grompe M, Parmar K, D'Andrea AD. TGF-β
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Vicente C, Schwab C, Broux M, Geerdens E, Degryse S, Demeyer S, Lahortiga I, Elliott A,
Chilton L, La Starza R, Mecucci C, Vandenberghe P, Goulden N, Vora A, Moorman AV, Soulier J,
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Goossens S, Radaelli E, Blanchet O, Durinck K, Van der Meulen J, Peirs S, Taghon T, Tremblay
CS, Costa M, Farhang Ghahremani M, De Medts J, Bartunkova S, Haigh K, Schwab C, Farla N,
Pieters T, Matthijssens F, Van Roy N, Best JA, Deswarte K, Bogaert P, Carmichael C, Rickard A,
Suryani S, Bracken LS, Alserihi R, Canté-Barrett K, Haenebalcke L, Clappier E, Rondou P,
Slowicka K, Huylebroeck D, Goldrath AW, Janzen V, McCormack MP, Lock RB, Curtis DJ,
Harrison C, Berx G, Speleman F, Meijerink JP, Soulier J, Van Vlierberghe P, Haigh JJ.
ZEB2 drives immature T-cell lymphoblastic leukaemia development via enhanced tumourinitiating potential and IL-7 receptor signalling.Nat Commun. 2015 Jan 7;6:5794.
Peirs S, Matthijssens F, Goossens S, Van de Walle I, Ruggero K, de Bock CE, Degryse S,
Canté-Barrett K, Briot D, Clappier E, Lammens T, De Moerloose B, Benoit Y, Poppe B, Meijerink
JP, Cools J, Soulier J, Rabbitts TH, Taghon T, Speleman F, Van Vlierberghe P. ABT-199
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Clappier E, Porcu M, Lahortiga I, Lucà R, Yan J, Hulselmans G, Vranckx H, Vandepoel R,
Sweron B, Jacobs K, Mentens N, Wlodarska I, Cauwelier B, Cloos J, Soulier J, Uyttebroeck A,
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Homminga I, Pieters R, Langerak AW, de Rooi JJ, Stubbs A, Verstegen M, Vuerhard M, BuijsGladdines J, Kooi C, Klous P, van Vlierberghe P, Ferrando AA, Cayuela JM, Verhaaf B, Beverloo
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Quentin S, Cuccuini W, Ceccaldi R, Nibourel O, Pondarre C, Pagès MP, Vasquez N, Dubois
d'Enghien C, Larghero J, Peffault de Latour R, Rocha V, Dalle JH, Schneider P, Michallet M,
Michel G, Baruchel A, Sigaux F, Gluckman E, Leblanc T, Stoppa-Lyonnet D, Preudhomme C,
Socié G, Soulier J. Myelodysplasia and leukemia of Fanconi anemia are associated with a
specific pattern of genomic abnormalities that includes cryptic RUNX1/AML1 lesions. Blood
2011; 117(15):e161-70.
Ceccaldi R, Briot D, Larghero J, Vasquez N, Dubois d’Enghien C, Chamousset D, Noguera ME,
Waisfisz, Hermine O, Pondarre C, Leblanc T, Gluckman E, Joenje H, Stoppa-Lyonnet D, Socié
G, Soulier J. Spontaneous abrogation of a DNA damage checkpoint has clinical benefit but
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for ASH meeting Educational book).
De Keersmaecker K, Real PJ, Gatta GD, Palomero T, Sulis ML, Tosello V, Van Vlierberghe P,
Barnes K, Castillo M, Sole X, Hadler M, Lenz J, Aplan PD, Kelliher M, Kee BL, Pandolfi PP,
Kappes D, Gounari F, Petrie H, Van der Meulen J, Speleman F, Paietta E, Racevskis J, Wiernik
PH, Rowe JM, Soulier J, Avran D, Cavé H, Dastugue N, Raimondi S, Meijerink JP, Cordon-Cardo
C, Califano A, Ferrando AA. Nat Med 2010; 16(11):1321-7.
Kleppe M, Lahortiga I, El Chaar T, De Keersmaecker K, Mentens N, Graux C, Van Roosbroeck
K, Ferrando AA, Langerak AW, Meijerink JP, Sigaux F, Haferlach T, Wlodarska I, Vandenberghe
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lymphoblastic leukaemia, Nat Genet 2010;42(6):530-5. *co-corresponding authors
Cavazzana-Calvo M, Payen E, Negre O, Wang G, Hehir K, Fusil F, Down J, Denaro M, Brady T,
Westerman K, Cavallesco R, Gillet-Legrand B, Caccavelli L, Sgarra R, Maouche-Chrétien L,
Bernaudin F, Girot R, Dorazio R, Mulder GJ, Polack A, Bank A, Soulier J, Larghero J, Kabbara N,
Dalle B, Gourmel B, Socie G, Chrétien S, Cartier N, Aubourg P, Fischer A, Cornetta K,
Galacteros F, Beuzard Y, Gluckman E, Bushman F, Hacein-Bey-Abina S, Leboulch P.
Transfusion independence and HMGA2 activation after gene therapy of human β-thalassaemia.
Nature 2010;467(7313):318-22.
Nibourel O, Kosmider O, Cheok M, Boissel N, Renneville A, Philippe N, Dombret H, Dreyfus F,
Quesnel B, Geffroy S, Quentin S, Roche-Lestienne C, Cayuela JM, Roumier C, Fenaux P,
Vainchenker W, Bernard OA, Soulier J, Fontenay M, Preudhomme C. Incidence and prognostic
value of TET2 alterations in de novo acute myeloid leukemia (AML) achieving complete
remission. Blood 2010;116(7):1132-5.
Van Vlierberghe P, Palomero T, Khiabanian H, Van der Meulen J, Castillo M, Van Roy N, De
Moerloose B, Philippé J, González-García S, Toribio ML, Taghon T, Zuurbier L, Cauwelier B,
Harrison CJ, Schwab C, Pisecker M, Strehl S, Langerak AW, Gecz J, Sonneveld E, Pieters R,
Paietta E, Rowe JM, Wiernik PH, Benoit Y, Soulier J, Poppe B, Yao X, Cordon-Cardo C, Meijerink
J, Rabadan R, Speleman F, Ferrando A. PHF6 mutations in T-cell acute lymphoblastic leukemia.
Nat Genet 2010;42(4):338-42.
Lecourt S, Vanneaux V, Leblanc T, Leroux G, Ternaux B, Benbunan M, Chomienne C, Baruchel
A, Marolleau JP, Gluckman E, Socié G, Soulier J, Larghero J. Bone marrow microenvironment in
Fanconi Anemia: a prospective functional study in a cohort of Fanconi Anemia patients. Stem
Cells Dev 2010;19:203-208.